More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2938 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2938  thioredoxin  100 
 
 
315 aa  626  1e-178  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1312  thioredoxin  54.03 
 
 
302 aa  282  5.000000000000001e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.968155  hitchhiker  0.00158392 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0296  thioredoxin  47.42 
 
 
306 aa  261  1e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0166723 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4590  thioredoxin  51.55 
 
 
304 aa  260  2e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.315091 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0456  thioredoxin  47.28 
 
 
306 aa  258  1e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.666195  normal  0.0589835 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0035  thioredoxin domain protein  44.92 
 
 
303 aa  254  1.0000000000000001e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000613737 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0306  putative thioredoxin  44.93 
 
 
305 aa  253  3e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.351153 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3284  thioredoxin  47.97 
 
 
320 aa  252  6e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5188  thioredoxin  48.62 
 
 
302 aa  250  2e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3272  thioredoxin  48.15 
 
 
326 aa  248  1e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.315754  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0835  thioredoxin  49.83 
 
 
304 aa  247  2e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0466449 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0268  thioredoxin  43.95 
 
 
306 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.223768  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4464  thioredoxin  48.28 
 
 
302 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.980457  hitchhiker  0.00575685 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0422  thioredoxin-related  43.94 
 
 
306 aa  245  6.999999999999999e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2251  thioredoxin domain-containing protein  48.81 
 
 
302 aa  245  8e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.285443 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2894  thioredoxin  48.64 
 
 
304 aa  245  8e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.225286  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2526  Thioredoxin domain  48.46 
 
 
302 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1489  thioredoxin domain-containing protein  48.3 
 
 
304 aa  242  6e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.481302  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0139  thioredoxin  48.3 
 
 
304 aa  241  9e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.115095  normal  0.47686 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2208  Thioredoxin domain  47.97 
 
 
300 aa  241  1e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.210633  normal  0.190287 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0893  thioredoxin  43.96 
 
 
324 aa  236  4e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0081  thioredoxin-related  44.37 
 
 
310 aa  236  4e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1982  thioredoxin  46.15 
 
 
317 aa  236  4e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00653306  normal  0.106397 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0073  thioredoxin-related  43.79 
 
 
336 aa  231  8.000000000000001e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0246134 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0837  thioredoxin  42.95 
 
 
329 aa  231  9e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24068  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3045  thioredoxin  44.33 
 
 
330 aa  230  2e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2371  thioredoxin domain-containing protein  44.08 
 
 
303 aa  228  1e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.880736 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4245  thioredoxin  42.76 
 
 
334 aa  226  4e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.902531  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0264  thioredoxin-related  43.23 
 
 
305 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.569758 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3775  thioredoxin  41.32 
 
 
324 aa  224  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.467472 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0054  thioredoxin domain-containing protein  42.42 
 
 
311 aa  222  4.9999999999999996e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.621806 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3711  thioredoxin-related  44.59 
 
 
312 aa  220  3e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4099  thioredoxin  40.38 
 
 
324 aa  219  5e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.809641  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2792  thioredoxin  46.1 
 
 
307 aa  213  2.9999999999999995e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.336164  normal  0.284427 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2254  Thioredoxin domain  44.75 
 
 
338 aa  213  3.9999999999999995e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.708544  normal  0.526752 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1865  thioredoxin  42.96 
 
 
306 aa  200  3e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.938725 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0796  thioredoxin  40.28 
 
 
281 aa  195  1e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0505807  normal  0.147714 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2127  thioredoxin domain-containing protein  40.55 
 
 
311 aa  194  1e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2527  thioredoxin  39.93 
 
 
293 aa  195  1e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0726  thioredoxin  40.28 
 
 
281 aa  194  2e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0681266  normal  0.772091 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1818  thioredoxin  40.62 
 
 
293 aa  189  5e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0314014 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3667  thioredoxin domain-containing protein  39.52 
 
 
298 aa  186  5e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3219  thioredoxin  38.68 
 
 
282 aa  183  3e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0743  thioredoxin  38.54 
 
 
282 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.328705  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0779  putative thioredoxin protein  39.62 
 
 
280 aa  178  8e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.297357  decreased coverage  0.00262303 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0822  thioredoxin  37.32 
 
 
310 aa  178  8e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.606093  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2636  thioredoxin  39.08 
 
 
280 aa  179  8e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5898  thioredoxin  38.11 
 
 
282 aa  178  9e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.769716  normal  0.516195 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2485  thioredoxin  37.76 
 
 
282 aa  178  9e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.194267 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2614  thioredoxin  37.76 
 
 
282 aa  178  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0266  thioredoxin  39.58 
 
 
301 aa  174  9.999999999999999e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0730  thioredoxin  37.41 
 
 
282 aa  171  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0516  thioredoxin  38.11 
 
 
282 aa  170  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.695523 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2665  thioredoxin-related  41.87 
 
 
303 aa  170  3e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3232  thioredoxin domain-containing protein  38.65 
 
 
285 aa  168  1e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.941804  normal  0.328637 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1547  thioredoxin  37.7 
 
 
302 aa  166  2.9999999999999998e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  hitchhiker  0.00479598 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1955  thioredoxin  35.66 
 
 
282 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180401  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2566  thioredoxin  35.66 
 
 
282 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2590  thioredoxin  35.66 
 
 
282 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282691  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0519  thioredoxin  38.99 
 
 
280 aa  163  3e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0661  thioredoxin domain-containing protein  34.33 
 
 
301 aa  162  7e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0903  thioredoxin  34.33 
 
 
282 aa  161  1e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0906  thioredoxin  34.33 
 
 
282 aa  161  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1063  thioredoxin  36.9 
 
 
918 aa  158  9e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.460797  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1305  thioredoxin  46.55 
 
 
235 aa  157  2e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.277929  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0664  Thioredoxin domain protein  35.97 
 
 
282 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000362321  hitchhiker  0.00000255831 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1755  thioredoxin  32.52 
 
 
287 aa  152  8.999999999999999e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0267329  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2376  thioredoxin-related  35.42 
 
 
286 aa  152  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.036483  normal  0.757224 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0719  thioredoxin  33.33 
 
 
282 aa  151  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0060777  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3035  thioredoxin-related  34.64 
 
 
274 aa  149  6e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0318  thioredoxin  32.76 
 
 
287 aa  148  2.0000000000000003e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1307  thioredoxin  35.17 
 
 
286 aa  145  9e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.334323  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2848  thioredoxin, putative  36.88 
 
 
289 aa  145  9e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.126765  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2469  thioredoxin  36.88 
 
 
289 aa  145  9e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.744001  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2914  thioredoxin  33.91 
 
 
285 aa  145  1e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3279  thioredoxin  32.67 
 
 
302 aa  145  1e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4561  thioredoxin  33.89 
 
 
302 aa  144  3e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.712523  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1374  thioredoxin  34.48 
 
 
286 aa  142  6e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.187591  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0294  putative thioredoxin protein  33.96 
 
 
314 aa  142  7e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.918989  normal  0.0369237 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3331  thioredoxin  31.14 
 
 
287 aa  142  8e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.108459  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3931  thioredoxin  32.34 
 
 
302 aa  142  8e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1276  thioredoxin domain protein  35.16 
 
 
337 aa  142  9e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2102  thioredoxin  32.4 
 
 
291 aa  142  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1041  thioredoxin  33.8 
 
 
289 aa  140  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06670  Thioredoxin protein  34.15 
 
 
289 aa  140  3e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.697288  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5094  thioredoxin  31.82 
 
 
306 aa  138  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.443129  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4628  thioredoxin  30.13 
 
 
341 aa  137  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0993  thioredoxin  34.52 
 
 
318 aa  136  4e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.766287 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11340  putative thioredoxin  34.15 
 
 
289 aa  136  5e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000384652  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0943  thioredoxin domain-containing protein  31.71 
 
 
286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0686  thioredoxin  31.94 
 
 
290 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5023  thioredoxin  31.25 
 
 
290 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.929168  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0198  thioredoxin  31.54 
 
 
326 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0510  thioredoxin  33.1 
 
 
290 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1038  thioredoxin  33.44 
 
 
277 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01872  thioredoxin  33.22 
 
 
285 aa  130  3e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3861  thioredoxin  31.06 
 
 
290 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.339067  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1535  thioredoxin  29.11 
 
 
269 aa  129  5.0000000000000004e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000141662  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0556  thioredoxin  32.4 
 
 
290 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0545  thioredoxin  32.75 
 
 
290 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>