More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2127 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_2127  thioredoxin domain-containing protein  100 
 
 		 311 aa  614  1e-175  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2254  Thioredoxin domain  60.54 
 
 		 338 aa  350  2e-95  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.708544  normal  0.526752 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0054  thioredoxin domain-containing protein  44.67 
 
 		 311 aa  241  1e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.621806 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4099  thioredoxin  44.41 
 
 		 324 aa  237  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.809641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1982  thioredoxin  46.8 
 
 		 317 aa  235  6e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00653306  normal  0.106397 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0456  thioredoxin  40.71 
 
 		 306 aa  235  7e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.666195  normal  0.0589835 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0296  thioredoxin  42.52 
 
 		 306 aa  235  8e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0166723 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0268  thioredoxin  41.53 
 
 		 306 aa  233  3e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.223768  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3045  thioredoxin  42.17 
 
 		 330 aa  233  3e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0081  thioredoxin-related  43.38 
 
 		 310 aa  232  7.000000000000001e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3775  thioredoxin  43.73 
 
 		 324 aa  232  7.000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.467472 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0306  putative thioredoxin  41.67 
 
 		 305 aa  229  4e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.351153 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0035  thioredoxin domain protein  40.19 
 
 		 303 aa  228  9e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000613737 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3272  thioredoxin  44 
 
 		 326 aa  227  2e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.315754  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1312  thioredoxin  45.82 
 
 		 302 aa  225  7e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.968155  hitchhiker  0.00158392 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2371  thioredoxin domain-containing protein  45.05 
 
 		 303 aa  225  9e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.880736 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4245  thioredoxin  41.22 
 
 		 334 aa  223  3e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.902531  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0422  thioredoxin-related  41.3 
 
 		 306 aa  219  3e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1865  thioredoxin  44.77 
 
 		 306 aa  218  8.999999999999998e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.938725 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5188  thioredoxin  41.61 
 
 		 302 aa  218  1e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3711  thioredoxin-related  44.15 
 
 		 312 aa  217  2e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0073  thioredoxin-related  42.72 
 
 		 336 aa  216  2.9999999999999998e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0246134 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0264  thioredoxin-related  43.88 
 
 		 305 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.569758 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2208  Thioredoxin domain  45.64 
 
 		 300 aa  212  7.999999999999999e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.210633  normal  0.190287 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2792  thioredoxin  46.67 
 
 		 307 aa  211  9e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.336164  normal  0.284427 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3284  thioredoxin  43.16 
 
 		 320 aa  211  1e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4464  thioredoxin  40.58 
 
 		 302 aa  210  2e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.980457  hitchhiker  0.00575685 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2526  Thioredoxin domain  45.27 
 
 		 302 aa  209  4e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2251  thioredoxin domain-containing protein  45.27 
 
 		 302 aa  209  5e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.285443 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0893  thioredoxin  42.9 
 
 		 324 aa  207  1e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2894  thioredoxin  43.25 
 
 		 304 aa  207  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.225286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0837  thioredoxin  42.57 
 
 		 329 aa  206  3e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24068  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1489  thioredoxin domain-containing protein  42.91 
 
 		 304 aa  203  2e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.481302  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0139  thioredoxin  42.91 
 
 		 304 aa  203  3e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.115095  normal  0.47686 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0835  thioredoxin  39.74 
 
 		 304 aa  199  6e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0466449 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4590  thioredoxin  41.89 
 
 		 304 aa  194  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.315091 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2938  thioredoxin  40.55 
 
 		 315 aa  194  1e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3667  thioredoxin domain-containing protein  40.48 
 
 		 298 aa  176  3e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0318  thioredoxin  35.91 
 
 		 287 aa  166  5e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0266  thioredoxin  37.33 
 
 		 301 aa  160  3e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2527  thioredoxin  37.79 
 
 		 293 aa  156  4e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3035  thioredoxin-related  36.01 
 
 		 274 aa  156  5.0000000000000005e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5898  thioredoxin  39.25 
 
 		 282 aa  152  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.769716  normal  0.516195 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1755  thioredoxin  33.33 
 
 		 287 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0267329  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0545  thioredoxin  33.79 
 
 		 290 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0719  thioredoxin  37.8 
 
 		 282 aa  146  3e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0060777  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0664  Thioredoxin domain protein  36.58 
 
 		 282 aa  145  7.0000000000000006e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000362321  hitchhiker  0.00000255831 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0730  thioredoxin  39.46 
 
 		 282 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2485  thioredoxin  37.84 
 
 		 282 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.194267 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2636  thioredoxin  37.32 
 
 		 280 aa  144  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2665  thioredoxin-related  36.86 
 
 		 303 aa  144  1e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2614  thioredoxin  37.84 
 
 		 282 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0510  thioredoxin  33.11 
 
 		 290 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0675  thioredoxin domain-containing protein  35.1 
 
 		 297 aa  143  4e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.357396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2590  thioredoxin  38.23 
 
 		 282 aa  142  5e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2566  thioredoxin  38.91 
 
 		 282 aa  142  5e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0661  thioredoxin domain-containing protein  37.67 
 
 		 301 aa  142  7e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1818  thioredoxin  35.02 
 
 		 293 aa  142  8e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0314014 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3219  thioredoxin  36.95 
 
 		 282 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0903  thioredoxin  36.77 
 
 		 282 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0519  thioredoxin  37.17 
 
 		 280 aa  142  9.999999999999999e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0556  thioredoxin  32.76 
 
 		 290 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0906  thioredoxin  36.77 
 
 		 282 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1276  thioredoxin domain protein  34.69 
 
 		 337 aa  141  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1955  thioredoxin  38.57 
 
 		 282 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180401  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0563  thioredoxin  32.42 
 
 		 290 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0743  thioredoxin  37.2 
 
 		 282 aa  140  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.328705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0516  thioredoxin  35.06 
 
 		 282 aa  140  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.695523 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3232  thioredoxin domain-containing protein  33.56 
 
 		 285 aa  139  6e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.941804  normal  0.328637 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0686  thioredoxin  32.65 
 
 		 290 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0198  thioredoxin  33.22 
 
 		 326 aa  139  8.999999999999999e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3331  thioredoxin  30.72 
 
 		 287 aa  138  1e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.108459  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1063  thioredoxin  37.33 
 
 		 918 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.460797  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0993  thioredoxin  37.45 
 
 		 318 aa  137  3.0000000000000003e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.766287 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2125  thioredoxin  35.37 
 
 		 286 aa  136  4e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4466  thioredoxin  32.31 
 
 		 290 aa  135  9e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1547  thioredoxin  37.5 
 
 		 302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  hitchhiker  0.00479598 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1041  thioredoxin  33.22 
 
 		 289 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1331  putative thioredoxin  30.14 
 
 		 285 aa  133  5e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0822  thioredoxin  35.71 
 
 		 310 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.606093  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3279  thioredoxin  33.77 
 
 		 302 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2376  thioredoxin-related  33.68 
 
 		 286 aa  129  4.0000000000000003e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.036483  normal  0.757224 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5023  thioredoxin  32.54 
 
 		 290 aa  129  6e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.929168  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0779  putative thioredoxin protein  34.66 
 
 		 280 aa  129  9.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.297357  decreased coverage  0.00262303 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3931  thioredoxin  33.44 
 
 		 302 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11340  putative thioredoxin  33.56 
 
 		 289 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000384652  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06670  Thioredoxin protein  32.89 
 
 		 289 aa  127  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.697288  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2848  thioredoxin, putative  32.25 
 
 		 289 aa  127  3e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.126765  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2469  thioredoxin  32.25 
 
 		 289 aa  127  3e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.744001  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0796  thioredoxin  34.16 
 
 		 281 aa  126  6e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0505807  normal  0.147714 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1199  thioredoxin  30.14 
 
 		 268 aa  124  1e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0450617 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0603  thioredoxin domain-containing protein  30.1 
 
 		 287 aa  122  5e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0802586  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1307  thioredoxin  33.45 
 
 		 286 aa  122  7e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.334323  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1374  thioredoxin  34.13 
 
 		 286 aa  122  7e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.187591  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1595  thioredoxin  28.86 
 
 		 287 aa  122  8e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.385204  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3683  thioredoxin-related  31.49 
 
 		 329 aa  122  8e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.418332  normal  0.641891 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2102  thioredoxin  31.8 
 
 		 291 aa  121  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2914  thioredoxin  32.32 
 
 		 285 aa  121  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0886  putative thioredoxin protein  32.99 
 
 		 287 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0560  Thioredoxin domain protein  30.43 
 
 		 272 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>