More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1038 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1038  thioredoxin  100 
 
 		 277 aa  556  1e-157  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2614  thioredoxin family protein  52.04 
 
 		 271 aa  267  2e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1093  thioredoxin  49.25 
 
 		 268 aa  257  2e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0251638  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0979  thioredoxin domain-containing protein  51.72 
 
 		 263 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.248497  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1467  thioredoxin  47.92 
 
 		 268 aa  251  8.000000000000001e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1229  thioredoxin  47.51 
 
 		 268 aa  228  8e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.223518 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1199  thioredoxin  44.91 
 
 		 268 aa  218  1e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0450617 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1452  thioredoxin  44.57 
 
 		 272 aa  210  2e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0664  Thioredoxin domain protein  42.12 
 
 		 282 aa  190  2.9999999999999997e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000362321  hitchhiker  0.00000255831 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0822  thioredoxin  39.1 
 
 		 310 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.606093  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3232  thioredoxin domain-containing protein  36.92 
 
 		 285 aa  176  3e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.941804  normal  0.328637 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1535  thioredoxin  36.12 
 
 		 269 aa  174  9.999999999999999e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000141662  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2636  thioredoxin  36.76 
 
 		 280 aa  171  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0730  thioredoxin  37.45 
 
 		 282 aa  168  9e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2469  thioredoxin  36.21 
 
 		 289 aa  167  2e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.744001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2848  thioredoxin, putative  36.21 
 
 		 289 aa  167  2e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.126765  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0726  thioredoxin  35.59 
 
 		 281 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0681266  normal  0.772091 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5898  thioredoxin  37.63 
 
 		 282 aa  166  5e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.769716  normal  0.516195 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0796  thioredoxin  37.13 
 
 		 281 aa  165  8e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0505807  normal  0.147714 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1755  thioredoxin  34.91 
 
 		 287 aa  163  2.0000000000000002e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0267329  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2590  thioredoxin  37.63 
 
 		 282 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1955  thioredoxin  37.82 
 
 		 282 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180401  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2566  thioredoxin  37.63 
 
 		 282 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0516  thioredoxin  35.13 
 
 		 282 aa  162  6e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.695523 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2527  thioredoxin  38.46 
 
 		 293 aa  162  7e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0661  thioredoxin domain-containing protein  36.2 
 
 		 301 aa  160  1e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0779  putative thioredoxin protein  36.26 
 
 		 280 aa  160  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.297357  decreased coverage  0.00262303 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2485  thioredoxin  35.84 
 
 		 282 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.194267 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0603  thioredoxin domain-containing protein  36.84 
 
 		 287 aa  160  2e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0802586  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0560  Thioredoxin domain protein  30.37 
 
 		 272 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0903  thioredoxin  36.2 
 
 		 282 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0577  thioredoxin domain protein  30.37 
 
 		 272 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2614  thioredoxin  35.84 
 
 		 282 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0906  thioredoxin  36.2 
 
 		 282 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3219  thioredoxin  34.66 
 
 		 282 aa  160  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0510  thioredoxin  35.02 
 
 		 290 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4245  thioredoxin  37.32 
 
 		 334 aa  159  6e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.902531  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0556  thioredoxin  34.98 
 
 		 290 aa  159  6e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3775  thioredoxin  35.44 
 
 		 324 aa  158  8e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.467472 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0545  thioredoxin  35.74 
 
 		 290 aa  158  9e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1818  thioredoxin  34.27 
 
 		 293 aa  158  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0314014 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0719  thioredoxin  36.92 
 
 		 282 aa  158  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0060777  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0563  thioredoxin  34.28 
 
 		 290 aa  157  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0265  thioredoxin  68.63 
 
 		 110 aa  157  2e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.28448  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3035  thioredoxin-related  36.07 
 
 		 274 aa  157  2e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3045  thioredoxin  35.94 
 
 		 330 aa  157  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1041  thioredoxin  36.24 
 
 		 289 aa  157  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1063  thioredoxin  36.2 
 
 		 918 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.460797  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0743  thioredoxin  34.97 
 
 		 282 aa  155  9e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.328705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11340  putative thioredoxin  34.83 
 
 		 289 aa  155  9e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000384652  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4099  thioredoxin  34.51 
 
 		 324 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.809641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2864  thioredoxin domain-containing protein  32.82 
 
 		 272 aa  153  4e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.499317  normal  0.13279 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2125  thioredoxin  35.21 
 
 		 286 aa  151  1e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06670  Thioredoxin protein  35.76 
 
 		 289 aa  150  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.697288  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5023  thioredoxin  35 
 
 		 290 aa  150  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.929168  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4464  thioredoxin  35.25 
 
 		 302 aa  149  6e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.980457  hitchhiker  0.00575685 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3861  thioredoxin  34.17 
 
 		 290 aa  149  7e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.339067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0519  thioredoxin  37.31 
 
 		 280 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1547  thioredoxin  35.82 
 
 		 302 aa  146  4.0000000000000006e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  hitchhiker  0.00479598 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5272  Thioredoxin domain protein  32.72 
 
 		 272 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.127007 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0837  thioredoxin  35.21 
 
 		 329 aa  144  1e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24068  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0318  thioredoxin  34.63 
 
 		 287 aa  144  1e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0893  thioredoxin  35.21 
 
 		 324 aa  144  2e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0686  thioredoxin  32.19 
 
 		 290 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5188  thioredoxin  34.4 
 
 		 302 aa  144  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0456  thioredoxin  34.38 
 
 		 306 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.666195  normal  0.0589835 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2376  thioredoxin-related  36.33 
 
 		 286 aa  141  9.999999999999999e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.036483  normal  0.757224 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3284  thioredoxin  32.5 
 
 		 320 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0296  thioredoxin  33.44 
 
 		 306 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0166723 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1865  thioredoxin  34.69 
 
 		 306 aa  138  7.999999999999999e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.938725 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0835  thioredoxin  34.14 
 
 		 304 aa  138  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0466449 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4466  thioredoxin  32.19 
 
 		 290 aa  137  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0268  thioredoxin  31.8 
 
 		 306 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.223768  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0886  putative thioredoxin protein  36.04 
 
 		 287 aa  135  5e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0675  thioredoxin domain-containing protein  31.36 
 
 		 297 aa  135  8e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.357396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3279  thioredoxin  33.82 
 
 		 302 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0306  putative thioredoxin  32.29 
 
 		 305 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.351153 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0198  thioredoxin  30.8 
 
 		 326 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3931  thioredoxin  33.46 
 
 		 302 aa  132  9e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2938  thioredoxin  33.44 
 
 		 315 aa  131  1.0000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0943  thioredoxin domain-containing protein  31.1 
 
 		 286 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2102  thioredoxin  33.11 
 
 		 291 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4105  Thioredoxin domain protein  32.75 
 
 		 321 aa  130  3e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.118303  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0081  thioredoxin-related  33.11 
 
 		 310 aa  130  3e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3331  thioredoxin  30.5 
 
 		 287 aa  129  5.0000000000000004e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.108459  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4561  thioredoxin  31.97 
 
 		 302 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.712523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0422  thioredoxin-related  32.99 
 
 		 306 aa  126  4.0000000000000003e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1305  thioredoxin  43.37 
 
 		 235 aa  126  5e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.277929  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1312  thioredoxin  33.94 
 
 		 302 aa  125  6e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.968155  hitchhiker  0.00158392 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0054  thioredoxin domain-containing protein  32.88 
 
 		 311 aa  125  7e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.621806 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3472  thioredoxin  44.64 
 
 		 246 aa  123  3e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.110554  normal  0.0143649 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1982  thioredoxin  31.29 
 
 		 317 aa  123  3e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00653306  normal  0.106397 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2894  thioredoxin  30.74 
 
 		 304 aa  123  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.225286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1048  thioredoxin domain-containing protein  33.46 
 
 		 331 aa  123  4e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.157412  normal  0.991017 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0294  putative thioredoxin protein  34.88 
 
 		 314 aa  123  4e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.918989  normal  0.0369237 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3607  thioredoxin domain-containing protein  43.03 
 
 		 300 aa  122  5e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.150797 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1595  thioredoxin  30.18 
 
 		 287 aa  122  6e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.385204  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0035  thioredoxin domain protein  32.86 
 
 		 303 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000613737 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0364  thioredoxin domain-containing protein  32.84 
 
 		 312 aa  120  3e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000110184 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2127  thioredoxin domain-containing protein  31.65 
 
 		 311 aa  120  3e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>