More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4590 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_4590  thioredoxin  100 
 
 		 304 aa  605  9.999999999999999e-173  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.315091 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0306  putative thioredoxin  52.53 
 
 		 305 aa  293  3e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.351153 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2938  thioredoxin  52.23 
 
 		 315 aa  288  1e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3775  thioredoxin  49.66 
 
 		 324 aa  278  7e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.467472 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0296  thioredoxin  51.9 
 
 		 306 aa  276  2e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0166723 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0422  thioredoxin-related  52.78 
 
 		 306 aa  276  4e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0456  thioredoxin  50.87 
 
 		 306 aa  276  4e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.666195  normal  0.0589835 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4099  thioredoxin  48.97 
 
 		 324 aa  276  4e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.809641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0268  thioredoxin  52.25 
 
 		 306 aa  275  5e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.223768  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0081  thioredoxin-related  48.25 
 
 		 310 aa  272  6e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4245  thioredoxin  49.31 
 
 		 334 aa  271  7e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.902531  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1982  thioredoxin  51.05 
 
 		 317 aa  269  2.9999999999999997e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00653306  normal  0.106397 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5188  thioredoxin  49.49 
 
 		 302 aa  269  4e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1312  thioredoxin  54.55 
 
 		 302 aa  267  2e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.968155  hitchhiker  0.00158392 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3284  thioredoxin  48.67 
 
 		 320 aa  266  2e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0893  thioredoxin  48.48 
 
 		 324 aa  262  4e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0837  thioredoxin  48.48 
 
 		 329 aa  262  6e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24068  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2208  Thioredoxin domain  51.72 
 
 		 300 aa  261  1e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.210633  normal  0.190287 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4464  thioredoxin  49.83 
 
 		 302 aa  260  2e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.980457  hitchhiker  0.00575685 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2251  thioredoxin domain-containing protein  50.5 
 
 		 302 aa  260  2e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.285443 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0264  thioredoxin-related  50.68 
 
 		 305 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.569758 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3045  thioredoxin  48.1 
 
 		 330 aa  259  6e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2526  Thioredoxin domain  50.17 
 
 		 302 aa  258  8e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0035  thioredoxin domain protein  47.46 
 
 		 303 aa  256  5e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000613737 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3272  thioredoxin  49.14 
 
 		 326 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.315754  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2894  thioredoxin  46.75 
 
 		 304 aa  252  6e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.225286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0835  thioredoxin  50 
 
 		 304 aa  250  2e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0466449 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2254  Thioredoxin domain  49.16 
 
 		 338 aa  249  3e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.708544  normal  0.526752 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0073  thioredoxin-related  49.83 
 
 		 336 aa  248  9e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0246134 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1489  thioredoxin domain-containing protein  46.75 
 
 		 304 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.481302  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0139  thioredoxin  46.43 
 
 		 304 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.115095  normal  0.47686 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3711  thioredoxin-related  45.85 
 
 		 312 aa  237  2e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2371  thioredoxin domain-containing protein  46.94 
 
 		 303 aa  232  5e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.880736 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1865  thioredoxin  44.52 
 
 		 306 aa  226  2e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.938725 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2792  thioredoxin  45.92 
 
 		 307 aa  224  2e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.336164  normal  0.284427 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0054  thioredoxin domain-containing protein  46.44 
 
 		 311 aa  223  2e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.621806 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2127  thioredoxin domain-containing protein  42.23 
 
 		 311 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3667  thioredoxin domain-containing protein  42.36 
 
 		 298 aa  209  6e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0266  thioredoxin  44.01 
 
 		 301 aa  199  5e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2665  thioredoxin-related  47.04 
 
 		 303 aa  197  3e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1818  thioredoxin  40.55 
 
 		 293 aa  185  7e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0314014 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0519  thioredoxin  40.49 
 
 		 280 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0726  thioredoxin  38.95 
 
 		 281 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0681266  normal  0.772091 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0796  thioredoxin  38.6 
 
 		 281 aa  182  6e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0505807  normal  0.147714 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3219  thioredoxin  39.51 
 
 		 282 aa  178  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2485  thioredoxin  39.16 
 
 		 282 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.194267 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2614  thioredoxin  39.16 
 
 		 282 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5898  thioredoxin  39.16 
 
 		 282 aa  176  4e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.769716  normal  0.516195 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0516  thioredoxin  39.16 
 
 		 282 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.695523 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2527  thioredoxin  38.49 
 
 		 293 aa  172  7.999999999999999e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0822  thioredoxin  36.84 
 
 		 310 aa  169  5e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.606093  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0743  thioredoxin  38.6 
 
 		 282 aa  169  7e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.328705  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0779  putative thioredoxin protein  37.54 
 
 		 280 aa  167  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.297357  decreased coverage  0.00262303 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1755  thioredoxin  34.62 
 
 		 287 aa  167  1e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0267329  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2636  thioredoxin  39.66 
 
 		 280 aa  168  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0730  thioredoxin  37.41 
 
 		 282 aa  167  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0661  thioredoxin domain-containing protein  36.93 
 
 		 301 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2566  thioredoxin  38.46 
 
 		 282 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0903  thioredoxin  38.81 
 
 		 282 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0906  thioredoxin  38.81 
 
 		 282 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1955  thioredoxin  38.11 
 
 		 282 aa  165  9e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180401  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1063  thioredoxin  38.81 
 
 		 918 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.460797  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0719  thioredoxin  38.25 
 
 		 282 aa  162  7e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0060777  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2590  thioredoxin  37.06 
 
 		 282 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0664  Thioredoxin domain protein  37.28 
 
 		 282 aa  161  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000362321  hitchhiker  0.00000255831 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1547  thioredoxin  37.87 
 
 		 302 aa  161  1e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  hitchhiker  0.00479598 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1925  Thioredoxin domain-containing protein  36.71 
 
 		 299 aa  160  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3331  thioredoxin  32.65 
 
 		 287 aa  157  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.108459  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0318  thioredoxin  34.02 
 
 		 287 aa  156  3e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0686  thioredoxin  33.56 
 
 		 290 aa  156  4e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1276  thioredoxin domain protein  35.74 
 
 		 337 aa  155  6e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3279  thioredoxin  37.09 
 
 		 302 aa  155  8e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3931  thioredoxin  35.67 
 
 		 302 aa  152  5.9999999999999996e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3232  thioredoxin domain-containing protein  34.49 
 
 		 285 aa  151  1e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.941804  normal  0.328637 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5023  thioredoxin  34.02 
 
 		 290 aa  150  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.929168  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4561  thioredoxin  37.29 
 
 		 302 aa  150  2e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.712523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0556  thioredoxin  34.95 
 
 		 290 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4466  thioredoxin  34.13 
 
 		 290 aa  149  7e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0563  thioredoxin  34.35 
 
 		 290 aa  149  8e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0545  thioredoxin  34.38 
 
 		 290 aa  148  9e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3035  thioredoxin-related  34.77 
 
 		 274 aa  148  9e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0198  thioredoxin  35.76 
 
 		 326 aa  147  3e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0993  thioredoxin  38.72 
 
 		 318 aa  146  5e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.766287 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4628  thioredoxin  34 
 
 		 341 aa  145  6e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3988  thioredoxin domain-containing protein  44.44 
 
 		 300 aa  145  9e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000709703 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0510  thioredoxin  33.68 
 
 		 290 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28500  thioredoxin  33.11 
 
 		 299 aa  144  1e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.173246 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1041  thioredoxin  33.79 
 
 		 289 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1305  thioredoxin  34.29 
 
 		 235 aa  144  2e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.277929  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0675  thioredoxin domain-containing protein  34 
 
 		 297 aa  144  2e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.357396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3607  thioredoxin domain-containing protein  44.71 
 
 		 300 aa  142  5e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.150797 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2376  thioredoxin-related  33.1 
 
 		 286 aa  142  9.999999999999999e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.036483  normal  0.757224 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5094  thioredoxin  34.54 
 
 		 306 aa  141  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.443129  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06670  Thioredoxin protein  33.9 
 
 		 289 aa  139  3.9999999999999997e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.697288  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00581  Thioredoxin domain-containing protein  30.69 
 
 		 289 aa  139  3.9999999999999997e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11340  putative thioredoxin  34.14 
 
 		 289 aa  139  7e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000384652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0943  thioredoxin domain-containing protein  34.25 
 
 		 286 aa  138  1e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0603  thioredoxin domain-containing protein  31.38 
 
 		 287 aa  137  2e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0802586  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3864  thioredoxin domain-containing protein  34.21 
 
 		 295 aa  137  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2848  thioredoxin, putative  34.01 
 
 		 289 aa  136  4e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.126765  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>