More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0294 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0294  putative thioredoxin protein  100 
 
 		 314 aa  617  1e-176  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.918989  normal  0.0369237 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0364  thioredoxin domain-containing protein  66.56 
 
 		 312 aa  373  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000110184 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1547  thioredoxin  52.2 
 
 		 302 aa  306  2.0000000000000002e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  hitchhiker  0.00479598 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5094  thioredoxin  52.83 
 
 		 306 aa  306  3e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.443129  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4561  thioredoxin  54.4 
 
 		 302 aa  305  7e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.712523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3279  thioredoxin  52.96 
 
 		 302 aa  303  3.0000000000000004e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3931  thioredoxin  52.65 
 
 		 302 aa  300  2e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0198  thioredoxin  49.37 
 
 		 326 aa  288  1e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4628  thioredoxin  47.04 
 
 		 341 aa  268  1e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0993  thioredoxin  51.23 
 
 		 318 aa  266  2.9999999999999995e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.766287 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3864  thioredoxin domain-containing protein  46.08 
 
 		 295 aa  244  1.9999999999999999e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0796  thioredoxin  44.8 
 
 		 281 aa  217  2e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0505807  normal  0.147714 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0726  thioredoxin  44.8 
 
 		 281 aa  217  2e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0681266  normal  0.772091 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2485  thioredoxin  40.95 
 
 		 282 aa  211  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.194267 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5898  thioredoxin  41.59 
 
 		 282 aa  210  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.769716  normal  0.516195 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2636  thioredoxin  43.07 
 
 		 280 aa  211  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2614  thioredoxin  40.63 
 
 		 282 aa  209  4e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0661  thioredoxin domain-containing protein  43.93 
 
 		 301 aa  209  6e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0903  thioredoxin  43.93 
 
 		 282 aa  208  9e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0906  thioredoxin  43.93 
 
 		 282 aa  208  9e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0822  thioredoxin  41.37 
 
 		 310 aa  207  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.606093  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3219  thioredoxin  42.5 
 
 		 282 aa  207  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1063  thioredoxin  43.93 
 
 		 918 aa  206  4e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.460797  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0779  putative thioredoxin protein  44 
 
 		 280 aa  205  9e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.297357  decreased coverage  0.00262303 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0730  thioredoxin  41.59 
 
 		 282 aa  204  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0719  thioredoxin  42.5 
 
 		 282 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0060777  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0743  thioredoxin  42.5 
 
 		 282 aa  196  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.328705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1955  thioredoxin  41.72 
 
 		 282 aa  195  7e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180401  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2566  thioredoxin  41.72 
 
 		 282 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0516  thioredoxin  42.14 
 
 		 282 aa  193  4e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.695523 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2590  thioredoxin  41.08 
 
 		 282 aa  188  8e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4464  thioredoxin  39.1 
 
 		 302 aa  176  3e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.980457  hitchhiker  0.00575685 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5188  thioredoxin  39.05 
 
 		 302 aa  172  7.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0519  thioredoxin  40.74 
 
 		 280 aa  172  9e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0306  putative thioredoxin  38.66 
 
 		 305 aa  171  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.351153 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3045  thioredoxin  35.56 
 
 		 330 aa  168  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4099  thioredoxin  37.81 
 
 		 324 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.809641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0456  thioredoxin  37.92 
 
 		 306 aa  165  8e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.666195  normal  0.0589835 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3232  thioredoxin domain-containing protein  34.08 
 
 		 285 aa  165  9e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.941804  normal  0.328637 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0837  thioredoxin  37.06 
 
 		 329 aa  165  1.0000000000000001e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24068  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0893  thioredoxin  37.06 
 
 		 324 aa  165  1.0000000000000001e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3775  thioredoxin  37.23 
 
 		 324 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.467472 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3284  thioredoxin  36.94 
 
 		 320 aa  163  3e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0318  thioredoxin  34.18 
 
 		 287 aa  163  3e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1982  thioredoxin  36.19 
 
 		 317 aa  163  4.0000000000000004e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00653306  normal  0.106397 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0268  thioredoxin  36.94 
 
 		 306 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.223768  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2376  thioredoxin-related  39.48 
 
 		 286 aa  159  7e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.036483  normal  0.757224 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0943  thioredoxin domain-containing protein  37.28 
 
 		 286 aa  159  8e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2848  thioredoxin, putative  35.13 
 
 		 289 aa  158  9e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.126765  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2469  thioredoxin  35.13 
 
 		 289 aa  158  9e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.744001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1865  thioredoxin  37.34 
 
 		 306 aa  158  1e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.938725 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3331  thioredoxin  33.81 
 
 		 287 aa  157  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.108459  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0296  thioredoxin  37.17 
 
 		 306 aa  155  6e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0166723 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0422  thioredoxin-related  35.56 
 
 		 306 aa  155  8e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1755  thioredoxin  34.81 
 
 		 287 aa  154  1e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0267329  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4245  thioredoxin  33.54 
 
 		 334 aa  151  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.902531  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2938  thioredoxin  36 
 
 		 315 aa  150  3e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3272  thioredoxin  36.74 
 
 		 326 aa  149  5e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.315754  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1331  putative thioredoxin  36 
 
 		 285 aa  149  8e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1041  thioredoxin  35.92 
 
 		 289 aa  148  9e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0264  thioredoxin-related  35.44 
 
 		 305 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.569758 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1374  thioredoxin  34.39 
 
 		 286 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.187591  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3035  thioredoxin-related  34.3 
 
 		 274 aa  147  3e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2526  Thioredoxin domain  38.58 
 
 		 302 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11340  putative thioredoxin  36.62 
 
 		 289 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000384652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2527  thioredoxin  36.79 
 
 		 293 aa  144  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0054  thioredoxin domain-containing protein  34.18 
 
 		 311 aa  144  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.621806 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1307  thioredoxin  33.44 
 
 		 286 aa  143  3e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.334323  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0081  thioredoxin-related  33.83 
 
 		 310 aa  143  3e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2251  thioredoxin domain-containing protein  38.2 
 
 		 302 aa  143  4e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.285443 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0835  thioredoxin  37.45 
 
 		 304 aa  142  5e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0466449 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2208  Thioredoxin domain  39.63 
 
 		 300 aa  142  6e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.210633  normal  0.190287 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2914  thioredoxin  37.09 
 
 		 285 aa  142  7e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3861  thioredoxin  36.23 
 
 		 290 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.339067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1818  thioredoxin  36 
 
 		 293 aa  141  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0314014 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0686  thioredoxin  31.46 
 
 		 290 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5023  thioredoxin  34.6 
 
 		 290 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.929168  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0073  thioredoxin-related  36.3 
 
 		 336 aa  139  7e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0246134 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1312  thioredoxin  36.5 
 
 		 302 aa  139  7e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.968155  hitchhiker  0.00158392 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1595  thioredoxin  29.34 
 
 		 287 aa  138  1e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.385204  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01872  thioredoxin  37.16 
 
 		 285 aa  138  1e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2894  thioredoxin  32.18 
 
 		 304 aa  137  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.225286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2371  thioredoxin domain-containing protein  33.76 
 
 		 303 aa  137  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.880736 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4466  thioredoxin  33.57 
 
 		 290 aa  136  4e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2125  thioredoxin  33.64 
 
 		 286 aa  136  4e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1038  thioredoxin  35.59 
 
 		 277 aa  136  4e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3711  thioredoxin-related  34.2 
 
 		 312 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00581  Thioredoxin domain-containing protein  31.87 
 
 		 289 aa  135  6.0000000000000005e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0603  thioredoxin domain-containing protein  32.47 
 
 		 287 aa  133  3.9999999999999996e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0802586  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3667  thioredoxin domain-containing protein  33.8 
 
 		 298 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2496  thioredoxin  39.82 
 
 		 229 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.109876  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2254  Thioredoxin domain  34.03 
 
 		 338 aa  129  4.0000000000000003e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.708544  normal  0.526752 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0966  thioredoxin domain-containing protein  35.21 
 
 		 284 aa  129  5.0000000000000004e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0035  thioredoxin domain protein  35.36 
 
 		 303 aa  129  6e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000613737 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0510  thioredoxin  30.86 
 
 		 290 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06670  Thioredoxin protein  33.45 
 
 		 289 aa  129  8.000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.697288  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1535  thioredoxin  28.89 
 
 		 269 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000141662  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0563  thioredoxin  33.8 
 
 		 290 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0266  thioredoxin  34.67 
 
 		 301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4590  thioredoxin  36.63 
 
 		 304 aa  127  3e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.315091 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>