More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5094 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_5094  thioredoxin  100 
 
 		 306 aa  614  1e-175  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.443129  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3279  thioredoxin  70.92 
 
 		 302 aa  437  9.999999999999999e-123  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3931  thioredoxin  70.59 
 
 		 302 aa  436  1e-121  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1547  thioredoxin  65.03 
 
 		 302 aa  414  9.999999999999999e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  hitchhiker  0.00479598 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0198  thioredoxin  65.03 
 
 		 326 aa  402  1e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4561  thioredoxin  68.95 
 
 		 302 aa  402  1e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.712523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4628  thioredoxin  63.73 
 
 		 341 aa  395  1e-109  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3864  thioredoxin domain-containing protein  61.76 
 
 		 295 aa  362  3e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0364  thioredoxin domain-containing protein  59.62 
 
 		 312 aa  331  1e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000110184 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0294  putative thioredoxin protein  53.77 
 
 		 314 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.918989  normal  0.0369237 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0993  thioredoxin  47.96 
 
 		 318 aa  278  1e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.766287 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2485  thioredoxin  39.07 
 
 		 282 aa  205  6e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.194267 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0661  thioredoxin domain-containing protein  40.52 
 
 		 301 aa  204  1e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2636  thioredoxin  39.14 
 
 		 280 aa  204  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2614  thioredoxin  38.74 
 
 		 282 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0906  thioredoxin  40.52 
 
 		 282 aa  203  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0903  thioredoxin  40.52 
 
 		 282 aa  203  3e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1063  thioredoxin  40.52 
 
 		 918 aa  202  7e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.460797  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0779  putative thioredoxin protein  39.93 
 
 		 280 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.297357  decreased coverage  0.00262303 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5898  thioredoxin  39.6 
 
 		 282 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.769716  normal  0.516195 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3219  thioredoxin  38.76 
 
 		 282 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0730  thioredoxin  41.06 
 
 		 282 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0516  thioredoxin  39.29 
 
 		 282 aa  192  4e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.695523 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0743  thioredoxin  38.89 
 
 		 282 aa  191  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.328705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0726  thioredoxin  38.36 
 
 		 281 aa  191  1e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0681266  normal  0.772091 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0822  thioredoxin  37.29 
 
 		 310 aa  191  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.606093  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2590  thioredoxin  40.59 
 
 		 282 aa  189  5e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2566  thioredoxin  40.07 
 
 		 282 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0796  thioredoxin  37.7 
 
 		 281 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0505807  normal  0.147714 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1955  thioredoxin  40.07 
 
 		 282 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180401  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0719  thioredoxin  38.24 
 
 		 282 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0060777  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3331  thioredoxin  33.55 
 
 		 287 aa  174  1.9999999999999998e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.108459  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0563  thioredoxin  34.8 
 
 		 290 aa  165  9e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0318  thioredoxin  34.44 
 
 		 287 aa  163  3e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0296  thioredoxin  35.71 
 
 		 306 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0166723 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2376  thioredoxin-related  37.05 
 
 		 286 aa  160  2e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.036483  normal  0.757224 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0306  putative thioredoxin  34.74 
 
 		 305 aa  160  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.351153 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0519  thioredoxin  36.01 
 
 		 280 aa  159  4e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2469  thioredoxin  34.97 
 
 		 289 aa  159  6e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.744001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2848  thioredoxin, putative  34.97 
 
 		 289 aa  159  6e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.126765  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0456  thioredoxin  35.26 
 
 		 306 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.666195  normal  0.0589835 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0510  thioredoxin  32.3 
 
 		 290 aa  156  4e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0268  thioredoxin  34.94 
 
 		 306 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.223768  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0545  thioredoxin  32.61 
 
 		 290 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0686  thioredoxin  33.44 
 
 		 290 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1331  putative thioredoxin  33.66 
 
 		 285 aa  154  2e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4464  thioredoxin  31.91 
 
 		 302 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.980457  hitchhiker  0.00575685 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0422  thioredoxin-related  33.12 
 
 		 306 aa  153  4e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0556  thioredoxin  33.12 
 
 		 290 aa  152  5e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1041  thioredoxin  32.69 
 
 		 289 aa  152  5e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3861  thioredoxin  32.04 
 
 		 290 aa  151  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.339067  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0893  thioredoxin  34.42 
 
 		 324 aa  151  1e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3035  thioredoxin-related  35.55 
 
 		 274 aa  151  1e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0081  thioredoxin-related  34.19 
 
 		 310 aa  151  1e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1755  thioredoxin  32.61 
 
 		 287 aa  151  1e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0267329  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2894  thioredoxin  33.55 
 
 		 304 aa  150  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.225286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4466  thioredoxin  33.11 
 
 		 290 aa  150  4e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3272  thioredoxin  33.44 
 
 		 326 aa  149  4e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.315754  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06670  Thioredoxin protein  32.81 
 
 		 289 aa  149  7e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.697288  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0837  thioredoxin  34.09 
 
 		 329 aa  149  7e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24068  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11340  putative thioredoxin  33.01 
 
 		 289 aa  149  8e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000384652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00581  Thioredoxin domain-containing protein  31.58 
 
 		 289 aa  147  2.0000000000000003e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0054  thioredoxin domain-containing protein  32.8 
 
 		 311 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.621806 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1865  thioredoxin  33.33 
 
 		 306 aa  146  3e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.938725 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1982  thioredoxin  33.33 
 
 		 317 aa  146  4.0000000000000006e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00653306  normal  0.106397 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2125  thioredoxin  32.46 
 
 		 286 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5188  thioredoxin  33.22 
 
 		 302 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0943  thioredoxin domain-containing protein  32.67 
 
 		 286 aa  145  9e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3284  thioredoxin  34.3 
 
 		 320 aa  145  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0835  thioredoxin  35.2 
 
 		 304 aa  144  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0466449 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2938  thioredoxin  32.47 
 
 		 315 aa  145  1e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2914  thioredoxin  35.18 
 
 		 285 aa  144  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3232  thioredoxin domain-containing protein  30.72 
 
 		 285 aa  144  2e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.941804  normal  0.328637 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3775  thioredoxin  32.69 
 
 		 324 aa  143  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.467472 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0073  thioredoxin-related  35.37 
 
 		 336 aa  142  6e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0246134 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5023  thioredoxin  30.97 
 
 		 290 aa  142  6e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.929168  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3045  thioredoxin  30.62 
 
 		 330 aa  142  8e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0035  thioredoxin domain protein  31.58 
 
 		 303 aa  141  9.999999999999999e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000613737 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1307  thioredoxin  33.22 
 
 		 286 aa  141  9.999999999999999e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.334323  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1374  thioredoxin  32.46 
 
 		 286 aa  141  1.9999999999999998e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.187591  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4590  thioredoxin  34.54 
 
 		 304 aa  140  3e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.315091 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4099  thioredoxin  31.95 
 
 		 324 aa  139  7e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.809641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2371  thioredoxin domain-containing protein  35.08 
 
 		 303 aa  138  8.999999999999999e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.880736 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0139  thioredoxin  33.88 
 
 		 304 aa  138  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.115095  normal  0.47686 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2527  thioredoxin  33.58 
 
 		 293 aa  138  1e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1489  thioredoxin domain-containing protein  33.55 
 
 		 304 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.481302  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1312  thioredoxin  32.7 
 
 		 302 aa  137  3.0000000000000003e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.968155  hitchhiker  0.00158392 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4245  thioredoxin  29.34 
 
 		 334 aa  136  4e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.902531  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0264  thioredoxin-related  33.88 
 
 		 305 aa  135  8e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.569758 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1818  thioredoxin  33.58 
 
 		 293 aa  135  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0314014 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2254  Thioredoxin domain  33.01 
 
 		 338 aa  135  9.999999999999999e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.708544  normal  0.526752 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2792  thioredoxin  35.91 
 
 		 307 aa  135  9.999999999999999e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.336164  normal  0.284427 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2251  thioredoxin domain-containing protein  33.55 
 
 		 302 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.285443 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0603  thioredoxin domain-containing protein  30.94 
 
 		 287 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0802586  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2208  Thioredoxin domain  33.22 
 
 		 300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.210633  normal  0.190287 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2526  Thioredoxin domain  33.55 
 
 		 302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2102  thioredoxin  30.29 
 
 		 291 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2496  thioredoxin  36.78 
 
 		 229 aa  129  6e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.109876  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28500  thioredoxin  42.11 
 
 		 299 aa  128  1.0000000000000001e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.173246 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1535  thioredoxin  28.57 
 
 		 269 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000141662  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>