More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_28500 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_28500  thioredoxin  100 
 
 		 299 aa  588  1e-167  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.173246 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6079  thioredoxin domain protein  61.65 
 
 		 326 aa  303  3.0000000000000004e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3886  Thioredoxin domain protein  52.36 
 
 		 312 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.54182  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1954  Thioredoxin domain protein  52.45 
 
 		 313 aa  258  9e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0686118  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3607  thioredoxin domain-containing protein  51.58 
 
 		 300 aa  253  3e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.150797 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3988  thioredoxin domain-containing protein  54.51 
 
 		 300 aa  249  3e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000709703 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4105  Thioredoxin domain protein  51.67 
 
 		 321 aa  242  5e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.118303  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1925  Thioredoxin domain-containing protein  49.06 
 
 		 299 aa  241  1e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0675  thioredoxin domain-containing protein  44.52 
 
 		 297 aa  232  6e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.357396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1704  thioredoxin domain protein  44.67 
 
 		 310 aa  221  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.143587 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1268  Thioredoxin domain protein  47.22 
 
 		 323 aa  217  2e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1276  thioredoxin domain protein  42.91 
 
 		 337 aa  214  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1048  thioredoxin domain-containing protein  48.16 
 
 		 331 aa  211  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.157412  normal  0.991017 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2342  thioredoxin domain-containing protein  44.48 
 
 		 298 aa  207  2e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.299917  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11356  thioredoxin  43.19 
 
 		 304 aa  207  2e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000675127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3848  thioredoxin domain-containing protein  46.24 
 
 		 299 aa  206  4e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00807359 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3862  thioredoxin domain-containing protein  46.24 
 
 		 299 aa  206  4e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3936  thioredoxin domain-containing protein  46.24 
 
 		 299 aa  206  4e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0921  thioredoxin domain-containing protein  42.33 
 
 		 301 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.460441 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3683  thioredoxin-related  44.81 
 
 		 329 aa  195  7e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.418332  normal  0.641891 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4303  thioredoxin domain-containing protein  43.56 
 
 		 297 aa  194  2e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.408854  normal  0.611787 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1333  Thioredoxin domain protein  44.25 
 
 		 311 aa  186  4e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2527  thioredoxin  37.25 
 
 		 293 aa  179  4e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3098  thioredoxin  47.58 
 
 		 333 aa  175  9.999999999999999e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000000032408  hitchhiker  0.0000022841 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0364  putative thioredoxin  38.73 
 
 		 320 aa  169  4e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.163537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1818  thioredoxin  34.95 
 
 		 293 aa  169  7e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0314014 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2327  thioredoxin domain protein  39.03 
 
 		 334 aa  164  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000128937 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2594  thioredoxin domain-containing protein  37.54 
 
 		 339 aa  162  6e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.238157  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1092  Thioredoxin domain protein  42.91 
 
 		 310 aa  161  1e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.509026  normal  0.582988 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3232  thioredoxin domain-containing protein  33.45 
 
 		 285 aa  158  9e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.941804  normal  0.328637 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2392  putative thioredoxin  43.91 
 
 		 309 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4245  thioredoxin  32.56 
 
 		 334 aa  151  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.902531  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4464  thioredoxin  33 
 
 		 302 aa  149  4e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.980457  hitchhiker  0.00575685 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1982  thioredoxin  33.77 
 
 		 317 aa  147  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00653306  normal  0.106397 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0822  thioredoxin  35.48 
 
 		 310 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.606093  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0726  thioredoxin  34.89 
 
 		 281 aa  147  3e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0681266  normal  0.772091 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5188  thioredoxin  34.55 
 
 		 302 aa  147  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0779  putative thioredoxin protein  37.59 
 
 		 280 aa  145  9e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.297357  decreased coverage  0.00262303 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2636  thioredoxin  37.86 
 
 		 280 aa  144  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0796  thioredoxin  35.36 
 
 		 281 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0505807  normal  0.147714 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0835  thioredoxin  32.48 
 
 		 304 aa  144  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0466449 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1730  putative thioredoxin domain-containing protein  39.15 
 
 		 313 aa  144  2e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0519  thioredoxin  37.72 
 
 		 280 aa  143  3e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0661  thioredoxin domain-containing protein  35.52 
 
 		 301 aa  143  4e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5898  thioredoxin  36.46 
 
 		 282 aa  142  6e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.769716  normal  0.516195 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0664  Thioredoxin domain protein  43.89 
 
 		 282 aa  142  6e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000362321  hitchhiker  0.00000255831 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0903  thioredoxin  35.76 
 
 		 282 aa  142  8e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0906  thioredoxin  35.76 
 
 		 282 aa  142  8e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1804  thioredoxin domain-containing protein  36.86 
 
 		 314 aa  142  9e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2371  thioredoxin domain-containing protein  35.57 
 
 		 303 aa  141  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.880736 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0893  thioredoxin  32.48 
 
 		 324 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3775  thioredoxin  30.92 
 
 		 324 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.467472 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0318  thioredoxin  34.16 
 
 		 287 aa  140  3e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0516  thioredoxin  33.55 
 
 		 282 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.695523 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1063  thioredoxin  35.52 
 
 		 918 aa  139  6e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.460797  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4099  thioredoxin  33.11 
 
 		 324 aa  139  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.809641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3284  thioredoxin  32.82 
 
 		 320 aa  139  6e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0837  thioredoxin  31.79 
 
 		 329 aa  139  7e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24068  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0456  thioredoxin  31.95 
 
 		 306 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.666195  normal  0.0589835 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3219  thioredoxin  33.56 
 
 		 282 aa  138  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0306  putative thioredoxin  31.56 
 
 		 305 aa  138  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.351153 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0268  thioredoxin  31.63 
 
 		 306 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.223768  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2590  thioredoxin  34.88 
 
 		 282 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2485  thioredoxin  34.84 
 
 		 282 aa  136  4e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.194267 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0266  thioredoxin  34.35 
 
 		 301 aa  136  5e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2614  thioredoxin  34.84 
 
 		 282 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1865  thioredoxin  33.33 
 
 		 306 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.938725 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2566  thioredoxin  34.88 
 
 		 282 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2914  thioredoxin  59.62 
 
 		 285 aa  135  8e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3045  thioredoxin  32 
 
 		 330 aa  135  8e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1955  thioredoxin  34.88 
 
 		 282 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180401  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01872  thioredoxin  33.92 
 
 		 285 aa  134  9.999999999999999e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4590  thioredoxin  32.78 
 
 		 304 aa  134  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.315091 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00581  Thioredoxin domain-containing protein  41.28 
 
 		 289 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0719  thioredoxin  35.31 
 
 		 282 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0060777  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0296  thioredoxin  32.27 
 
 		 306 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0166723 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0422  thioredoxin-related  34.6 
 
 		 306 aa  134  1.9999999999999998e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0081  thioredoxin-related  32.79 
 
 		 310 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0054  thioredoxin domain-containing protein  32.76 
 
 		 311 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.621806 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0730  thioredoxin  34.02 
 
 		 282 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2251  thioredoxin domain-containing protein  34.49 
 
 		 302 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.285443 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0743  thioredoxin  30.92 
 
 		 282 aa  130  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.328705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1547  thioredoxin  37.6 
 
 		 302 aa  129  6e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  hitchhiker  0.00479598 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2526  Thioredoxin domain  34.81 
 
 		 302 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09500  thioredoxin domain-containing protein  35.14 
 
 		 346 aa  128  1.0000000000000001e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.460116  normal  0.88242 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0035  thioredoxin domain protein  34.21 
 
 		 303 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000613737 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10300  thioredoxin domain-containing protein  36.86 
 
 		 313 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2894  thioredoxin  32.18 
 
 		 304 aa  127  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.225286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2208  Thioredoxin domain  33.66 
 
 		 300 aa  127  3e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.210633  normal  0.190287 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1041  thioredoxin  33.11 
 
 		 289 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3272  thioredoxin  30.9 
 
 		 326 aa  125  6e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.315754  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1312  thioredoxin  32.56 
 
 		 302 aa  125  7e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.968155  hitchhiker  0.00158392 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0264  thioredoxin-related  31.46 
 
 		 305 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.569758 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1535  thioredoxin  29.55 
 
 		 269 aa  125  1e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000141662  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0556  thioredoxin  31.53 
 
 		 290 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0563  thioredoxin  31.53 
 
 		 290 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0510  thioredoxin  31.19 
 
 		 290 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1282  Thioredoxin domain  40.15 
 
 		 319 aa  124  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00790933  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1305  thioredoxin  33.08 
 
 		 235 aa  123  3e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.277929  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0943  thioredoxin domain-containing protein  33.33 
 
 		 286 aa  123  3e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>