259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0921 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_0921  thioredoxin domain-containing protein  100 
 
 		 301 aa  584  1e-166  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.460441 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1704  thioredoxin domain protein  53.9 
 
 		 310 aa  295  7e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.143587 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3886  Thioredoxin domain protein  46.45 
 
 		 312 aa  209  4e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.54182  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28500  thioredoxin  43.82 
 
 		 299 aa  204  1e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.173246 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6079  thioredoxin domain protein  46.27 
 
 		 326 aa  197  3e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0675  thioredoxin domain-containing protein  41.31 
 
 		 297 aa  195  1e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.357396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3607  thioredoxin domain-containing protein  44.68 
 
 		 300 aa  194  1e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.150797 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2392  putative thioredoxin  47.85 
 
 		 309 aa  194  2e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0364  putative thioredoxin  42.36 
 
 		 320 aa  192  5e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.163537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3988  thioredoxin domain-containing protein  46.89 
 
 		 300 aa  190  2e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000709703 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1925  Thioredoxin domain-containing protein  41.15 
 
 		 299 aa  188  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1276  thioredoxin domain protein  41.48 
 
 		 337 aa  174  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1333  Thioredoxin domain protein  41.64 
 
 		 311 aa  171  1e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1954  Thioredoxin domain protein  38.93 
 
 		 313 aa  166  4e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0686118  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3683  thioredoxin-related  45.49 
 
 		 329 aa  164  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.418332  normal  0.641891 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4105  Thioredoxin domain protein  41.95 
 
 		 321 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.118303  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1048  thioredoxin domain-containing protein  42 
 
 		 331 aa  162  7e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.157412  normal  0.991017 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1282  Thioredoxin domain  42.44 
 
 		 319 aa  155  1e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00790933  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1804  thioredoxin domain-containing protein  35.99 
 
 		 314 aa  147  3e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3862  thioredoxin domain-containing protein  35.31 
 
 		 299 aa  140  3e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3936  thioredoxin domain-containing protein  35.31 
 
 		 299 aa  140  3e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3848  thioredoxin domain-containing protein  35.31 
 
 		 299 aa  140  3e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00807359 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1268  Thioredoxin domain protein  36.77 
 
 		 323 aa  136  4e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2342  thioredoxin domain-containing protein  34.65 
 
 		 298 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.299917  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2422  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.02 
 
 		 319 aa  133  3e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11356  thioredoxin  33.66 
 
 		 304 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000675127  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1092  Thioredoxin domain protein  40 
 
 		 310 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.509026  normal  0.582988 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2327  thioredoxin domain protein  34.2 
 
 		 334 aa  126  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000128937 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2594  thioredoxin domain-containing protein  34.78 
 
 		 339 aa  125  7e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.238157  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19060  thioredoxin domain-containing protein  35.57 
 
 		 299 aa  125  8.000000000000001e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.595284  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4303  thioredoxin domain-containing protein  32.34 
 
 		 297 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.408854  normal  0.611787 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1730  putative thioredoxin domain-containing protein  34.43 
 
 		 313 aa  119  4.9999999999999996e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09500  thioredoxin domain-containing protein  33.24 
 
 		 346 aa  118  9.999999999999999e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.460116  normal  0.88242 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3098  thioredoxin  38.49 
 
 		 333 aa  108  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000000032408  hitchhiker  0.0000022841 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0664  Thioredoxin domain protein  32.98 
 
 		 282 aa  103  4e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000362321  hitchhiker  0.00000255831 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0318  thioredoxin  29.33 
 
 		 287 aa  100  4e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4464  thioredoxin  30.54 
 
 		 302 aa  99.4  6e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.980457  hitchhiker  0.00575685 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08240  thioredoxin domain-containing protein  34.98 
 
 		 324 aa  96.7  4e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0835  thioredoxin  28.57 
 
 		 304 aa  95.9  8e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0466449 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2254  Thioredoxin domain  28.24 
 
 		 338 aa  94.7  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.708544  normal  0.526752 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2527  thioredoxin  28.47 
 
 		 293 aa  95.5  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01872  thioredoxin  28.42 
 
 		 285 aa  94  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10300  thioredoxin domain-containing protein  33.09 
 
 		 313 aa  93.6  4e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0073  thioredoxin-related  27.09 
 
 		 336 aa  93.2  5e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0246134 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5188  thioredoxin  30.07 
 
 		 302 aa  93.2  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4099  thioredoxin  25.08 
 
 		 324 aa  92.8  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.809641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1818  thioredoxin  25.87 
 
 		 293 aa  92.4  7e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0314014 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0266  thioredoxin  30.9 
 
 		 301 aa  92.8  7e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2636  thioredoxin  31.18 
 
 		 280 aa  92  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2914  thioredoxin  32.38 
 
 		 285 aa  91.3  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3035  thioredoxin-related  27.46 
 
 		 274 aa  89.7  5e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1305  thioredoxin  33.46 
 
 		 235 aa  89.7  5e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.277929  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4590  thioredoxin  27.4 
 
 		 304 aa  89.4  7e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.315091 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3775  thioredoxin  24.07 
 
 		 324 aa  89.4  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.467472 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3023  putative thioredoxin  29.9 
 
 		 289 aa  89  9e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1269  putative thioredoxin  29.9 
 
 		 289 aa  89  9e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.204367 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3161  thioredoxin domain-containing protein  29.9 
 
 		 289 aa  89  9e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.324735  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3045  thioredoxin  26.4 
 
 		 330 aa  89  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2371  thioredoxin domain-containing protein  28.67 
 
 		 303 aa  87.4  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.880736 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0081  thioredoxin-related  27.24 
 
 		 310 aa  87.4  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0422  thioredoxin-related  28.81 
 
 		 306 aa  86.7  4e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3667  thioredoxin domain-containing protein  27.84 
 
 		 298 aa  86.3  6e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1982  thioredoxin  29.15 
 
 		 317 aa  86.3  6e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00653306  normal  0.106397 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0822  thioredoxin  28.42 
 
 		 310 aa  85.9  8e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.606093  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0943  thioredoxin domain-containing protein  31.23 
 
 		 286 aa  85.5  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3711  thioredoxin-related  26.25 
 
 		 312 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3272  thioredoxin  24.38 
 
 		 326 aa  84.7  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.315754  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3331  thioredoxin  30.6 
 
 		 287 aa  84.7  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.108459  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0560  Thioredoxin domain protein  25.96 
 
 		 272 aa  84  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0577  thioredoxin domain protein  25.96 
 
 		 272 aa  84  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2127  thioredoxin domain-containing protein  26.73 
 
 		 311 aa  83.2  0.000000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1865  thioredoxin  27.27 
 
 		 306 aa  83.6  0.000000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.938725 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0893  thioredoxin  26.35 
 
 		 324 aa  82.8  0.000000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0519  thioredoxin  30.99 
 
 		 280 aa  81.6  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0139  hypothetical protein  26.11 
 
 		 340 aa  81.3  0.00000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0886  putative thioredoxin protein  28.82 
 
 		 287 aa  81.3  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3284  thioredoxin  25.25 
 
 		 320 aa  80.5  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0837  thioredoxin  26.01 
 
 		 329 aa  80.5  0.00000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24068  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1041  thioredoxin  26.94 
 
 		 289 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0296  thioredoxin  26.54 
 
 		 306 aa  80.5  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0166723 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0054  thioredoxin domain-containing protein  25.83 
 
 		 311 aa  80.1  0.00000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.621806 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1307  thioredoxin  28.92 
 
 		 286 aa  79.7  0.00000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.334323  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4245  thioredoxin  24.07 
 
 		 334 aa  79.7  0.00000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.902531  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1374  thioredoxin  27.37 
 
 		 286 aa  79.7  0.00000000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.187591  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2208  Thioredoxin domain  26.76 
 
 		 300 aa  79.7  0.00000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.210633  normal  0.190287 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3232  thioredoxin domain-containing protein  26.83 
 
 		 285 aa  79.3  0.00000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.941804  normal  0.328637 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2526  Thioredoxin domain  26.89 
 
 		 302 aa  79.3  0.00000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2251  thioredoxin domain-containing protein  26.89 
 
 		 302 aa  79  0.00000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.285443 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1489  thioredoxin domain-containing protein  25.51 
 
 		 304 aa  79  0.00000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.481302  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0796  thioredoxin  27.62 
 
 		 281 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0505807  normal  0.147714 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2894  thioredoxin  26.1 
 
 		 304 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.225286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0198  thioredoxin  26.95 
 
 		 326 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0779  putative thioredoxin protein  27.6 
 
 		 280 aa  77.4  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.297357  decreased coverage  0.00262303 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0139  thioredoxin  25.17 
 
 		 304 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.115095  normal  0.47686 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0743  thioredoxin  24.83 
 
 		 282 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.328705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0726  thioredoxin  26.26 
 
 		 281 aa  77  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0681266  normal  0.772091 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1312  thioredoxin  26.82 
 
 		 302 aa  77  0.0000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.968155  hitchhiker  0.00158392 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1535  thioredoxin  23.34 
 
 		 269 aa  76.3  0.0000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000141662  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11340  putative thioredoxin  27.27 
 
 		 289 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000384652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3219  thioredoxin  26.48 
 
 		 282 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>