More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6079 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6079  thioredoxin domain protein  100 
 
 		 326 aa  622  1e-177  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28500  thioredoxin  60.36 
 
 		 299 aa  320  9.999999999999999e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.173246 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1954  Thioredoxin domain protein  48.87 
 
 		 313 aa  227  2e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0686118  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1925  Thioredoxin domain-containing protein  46.44 
 
 		 299 aa  227  2e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11356  thioredoxin  45.45 
 
 		 304 aa  223  4e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000675127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1704  thioredoxin domain protein  41.85 
 
 		 310 aa  215  9e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.143587 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3607  thioredoxin domain-containing protein  46.93 
 
 		 300 aa  213  3.9999999999999995e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.150797 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2342  thioredoxin domain-containing protein  46.67 
 
 		 298 aa  213  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.299917  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0675  thioredoxin domain-containing protein  42.72 
 
 		 297 aa  212  7e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.357396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3988  thioredoxin domain-containing protein  47.12 
 
 		 300 aa  212  7.999999999999999e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000709703 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3886  Thioredoxin domain protein  42.9 
 
 		 312 aa  209  4e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.54182  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3848  thioredoxin domain-containing protein  45.02 
 
 		 299 aa  207  3e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00807359 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3862  thioredoxin domain-containing protein  45.02 
 
 		 299 aa  207  3e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3936  thioredoxin domain-containing protein  45.02 
 
 		 299 aa  207  3e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4105  Thioredoxin domain protein  46.95 
 
 		 321 aa  206  4e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.118303  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0921  thioredoxin domain-containing protein  44.16 
 
 		 301 aa  206  5e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.460441 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1268  Thioredoxin domain protein  45.45 
 
 		 323 aa  205  7e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4303  thioredoxin domain-containing protein  43.64 
 
 		 297 aa  196  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.408854  normal  0.611787 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3098  thioredoxin  52.16 
 
 		 333 aa  191  2e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000000032408  hitchhiker  0.0000022841 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1048  thioredoxin domain-containing protein  46.25 
 
 		 331 aa  188  1e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.157412  normal  0.991017 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1276  thioredoxin domain protein  42.8 
 
 		 337 aa  180  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2594  thioredoxin domain-containing protein  40.12 
 
 		 339 aa  180  2.9999999999999997e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.238157  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0364  putative thioredoxin  39.76 
 
 		 320 aa  176  5e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.163537  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1333  Thioredoxin domain protein  40.57 
 
 		 311 aa  174  1.9999999999999998e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3683  thioredoxin-related  43.45 
 
 		 329 aa  168  1e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.418332  normal  0.641891 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2327  thioredoxin domain protein  39.58 
 
 		 334 aa  168  1e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000128937 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1092  Thioredoxin domain protein  44.09 
 
 		 310 aa  159  9e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.509026  normal  0.582988 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1730  putative thioredoxin domain-containing protein  39.31 
 
 		 313 aa  153  2.9999999999999998e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2392  putative thioredoxin  41.64 
 
 		 309 aa  145  1e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1804  thioredoxin domain-containing protein  40.43 
 
 		 314 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09500  thioredoxin domain-containing protein  36.09 
 
 		 346 aa  133  3.9999999999999996e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.460116  normal  0.88242 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2527  thioredoxin  31.67 
 
 		 293 aa  130  3e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1818  thioredoxin  34.75 
 
 		 293 aa  130  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0314014 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10300  thioredoxin domain-containing protein  37.89 
 
 		 313 aa  129  5.0000000000000004e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2422  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.86 
 
 		 319 aa  127  4.0000000000000003e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1282  Thioredoxin domain  37.65 
 
 		 319 aa  125  8.000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00790933  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2636  thioredoxin  36.52 
 
 		 280 aa  124  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19060  thioredoxin domain-containing protein  36.26 
 
 		 299 aa  123  6e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.595284  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0835  thioredoxin  29.52 
 
 		 304 aa  120  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0466449 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3775  thioredoxin  30.69 
 
 		 324 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.467472 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4464  thioredoxin  28.75 
 
 		 302 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.980457  hitchhiker  0.00575685 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0726  thioredoxin  33.69 
 
 		 281 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0681266  normal  0.772091 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0796  thioredoxin  32.74 
 
 		 281 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0505807  normal  0.147714 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4245  thioredoxin  29.47 
 
 		 334 aa  117  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.902531  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0318  thioredoxin  32.39 
 
 		 287 aa  117  3e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0779  putative thioredoxin protein  35.19 
 
 		 280 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.297357  decreased coverage  0.00262303 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0139  hypothetical protein  29.5 
 
 		 340 aa  114  3e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4099  thioredoxin  30.03 
 
 		 324 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.809641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3232  thioredoxin domain-containing protein  29.82 
 
 		 285 aa  112  6e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.941804  normal  0.328637 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5188  thioredoxin  30.03 
 
 		 302 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0686  thioredoxin  31.05 
 
 		 290 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1041  thioredoxin  32.78 
 
 		 289 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4466  thioredoxin  31.05 
 
 		 290 aa  109  6e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0556  thioredoxin  31.02 
 
 		 290 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0510  thioredoxin  29.7 
 
 		 290 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0822  thioredoxin  28.09 
 
 		 310 aa  107  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.606093  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0563  thioredoxin  30.69 
 
 		 290 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0661  thioredoxin domain-containing protein  33.68 
 
 		 301 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0519  thioredoxin  34.38 
 
 		 280 aa  106  4e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0906  thioredoxin  33.68 
 
 		 282 aa  107  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0545  thioredoxin  30.03 
 
 		 290 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3045  thioredoxin  28.25 
 
 		 330 aa  107  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11340  putative thioredoxin  32.45 
 
 		 289 aa  107  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000384652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0903  thioredoxin  33.68 
 
 		 282 aa  107  4e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2590  thioredoxin  31.8 
 
 		 282 aa  106  6e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5023  thioredoxin  31.46 
 
 		 290 aa  105  9e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.929168  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1063  thioredoxin  33.68 
 
 		 918 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.460797  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5898  thioredoxin  31.91 
 
 		 282 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.769716  normal  0.516195 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0296  thioredoxin  30.25 
 
 		 306 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0166723 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1955  thioredoxin  31.8 
 
 		 282 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180401  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0730  thioredoxin  33.8 
 
 		 282 aa  105  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1982  thioredoxin  31.34 
 
 		 317 aa  105  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00653306  normal  0.106397 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2566  thioredoxin  31.8 
 
 		 282 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2485  thioredoxin  31.25 
 
 		 282 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.194267 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0664  Thioredoxin domain protein  35.63 
 
 		 282 aa  103  4e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000362321  hitchhiker  0.00000255831 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2614  thioredoxin  31.25 
 
 		 282 aa  103  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3284  thioredoxin  29.27 
 
 		 320 aa  103  4e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0719  thioredoxin  34.02 
 
 		 282 aa  103  5e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0060777  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4590  thioredoxin  28.8 
 
 		 304 aa  103  5e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.315091 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00581  Thioredoxin domain-containing protein  29.51 
 
 		 289 aa  103  5e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1229  thioredoxin  25.27 
 
 		 268 aa  102  6e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.223518 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1038  thioredoxin  28.72 
 
 		 277 aa  102  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08240  thioredoxin domain-containing protein  33.45 
 
 		 324 aa  100  2e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0456  thioredoxin  28.48 
 
 		 306 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.666195  normal  0.0589835 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0306  putative thioredoxin  27.48 
 
 		 305 aa  101  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.351153 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0422  thioredoxin-related  32.3 
 
 		 306 aa  100  3e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1467  thioredoxin  28.78 
 
 		 268 aa  100  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0054  thioredoxin domain-containing protein  29.35 
 
 		 311 aa  100  3e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.621806 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06670  Thioredoxin protein  29.61 
 
 		 289 aa  99.8  5e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.697288  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0081  thioredoxin-related  30.72 
 
 		 310 aa  99.8  6e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3331  thioredoxin  28.97 
 
 		 287 aa  99.8  6e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.108459  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3861  thioredoxin  30.29 
 
 		 290 aa  99.8  7e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.339067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1312  thioredoxin  28.15 
 
 		 302 aa  99  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.968155  hitchhiker  0.00158392 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1155  thioredoxin domain-containing protein  29.47 
 
 		 294 aa  97.8  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.155818  hitchhiker  0.00000315771 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0603  thioredoxin domain-containing protein  28.42 
 
 		 287 aa  97.8  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0802586  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3219  thioredoxin  29.08 
 
 		 282 aa  97.8  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2251  thioredoxin domain-containing protein  29.02 
 
 		 302 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.285443 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2526  Thioredoxin domain  29.02 
 
 		 302 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0035  thioredoxin domain protein  30.1 
 
 		 303 aa  97.4  3e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000613737 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0268  thioredoxin  27.07 
 
 		 306 aa  95.9  8e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.223768  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>