More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2342 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_2342  thioredoxin domain-containing protein  100 
 
 		 298 aa  584  1e-166  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.299917  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4303  thioredoxin domain-containing protein  80.87 
 
 		 297 aa  431  1e-120  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.408854  normal  0.611787 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3848  thioredoxin domain-containing protein  74.92 
 
 		 299 aa  394  1e-108  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00807359 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3862  thioredoxin domain-containing protein  74.92 
 
 		 299 aa  394  1e-108  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3936  thioredoxin domain-containing protein  74.92 
 
 		 299 aa  394  1e-108  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11356  thioredoxin  62.95 
 
 		 304 aa  345  4e-94  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000675127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28500  thioredoxin  45.99 
 
 		 299 aa  225  6e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.173246 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1954  Thioredoxin domain protein  45.38 
 
 		 313 aa  213  4.9999999999999996e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0686118  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6079  thioredoxin domain protein  48.51 
 
 		 326 aa  208  7e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1268  Thioredoxin domain protein  45.21 
 
 		 323 aa  201  9.999999999999999e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1925  Thioredoxin domain-containing protein  36.73 
 
 		 299 aa  174  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3988  thioredoxin domain-containing protein  42.32 
 
 		 300 aa  172  7.999999999999999e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000709703 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4105  Thioredoxin domain protein  42.72 
 
 		 321 aa  171  2e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.118303  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1704  thioredoxin domain protein  36.77 
 
 		 310 aa  169  5e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.143587 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3607  thioredoxin domain-containing protein  40 
 
 		 300 aa  167  1e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.150797 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1333  Thioredoxin domain protein  41.9 
 
 		 311 aa  167  2e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0675  thioredoxin domain-containing protein  36.7 
 
 		 297 aa  155  1e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.357396  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1092  Thioredoxin domain protein  38.83 
 
 		 310 aa  154  2e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.509026  normal  0.582988 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1276  thioredoxin domain protein  35.16 
 
 		 337 aa  150  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2594  thioredoxin domain-containing protein  34.64 
 
 		 339 aa  149  5e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.238157  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3886  Thioredoxin domain protein  38.11 
 
 		 312 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.54182  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2327  thioredoxin domain protein  35.85 
 
 		 334 aa  145  9e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000128937 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0921  thioredoxin domain-containing protein  34.65 
 
 		 301 aa  145  1e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.460441 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1048  thioredoxin domain-containing protein  40.16 
 
 		 331 aa  138  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.157412  normal  0.991017 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3683  thioredoxin-related  37.87 
 
 		 329 aa  131  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.418332  normal  0.641891 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1730  putative thioredoxin domain-containing protein  34.11 
 
 		 313 aa  126  4.0000000000000003e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10300  thioredoxin domain-containing protein  35.11 
 
 		 313 aa  123  4e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2422  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.33 
 
 		 319 aa  122  5e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1804  thioredoxin domain-containing protein  33.77 
 
 		 314 aa  121  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1282  Thioredoxin domain  37.5 
 
 		 319 aa  120  3e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00790933  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0364  putative thioredoxin  34.39 
 
 		 320 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.163537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09500  thioredoxin domain-containing protein  31.98 
 
 		 346 aa  115  1.0000000000000001e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.460116  normal  0.88242 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4245  thioredoxin  29.25 
 
 		 334 aa  111  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.902531  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3045  thioredoxin  27.67 
 
 		 330 aa  106  5e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4464  thioredoxin  27.76 
 
 		 302 aa  104  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.980457  hitchhiker  0.00575685 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0139  hypothetical protein  30.06 
 
 		 340 aa  104  2e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0726  thioredoxin  30.47 
 
 		 281 aa  102  5e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0681266  normal  0.772091 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0796  thioredoxin  30.11 
 
 		 281 aa  101  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0505807  normal  0.147714 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2527  thioredoxin  28.43 
 
 		 293 aa  100  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2636  thioredoxin  31.53 
 
 		 280 aa  100  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1117  thioredoxin-related protein  31.46 
 
 		 324 aa  100  4e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0822  thioredoxin  29.83 
 
 		 310 aa  97.4  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.606093  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1818  thioredoxin  28.81 
 
 		 293 aa  97.8  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0314014 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0779  putative thioredoxin protein  31.72 
 
 		 280 aa  97.1  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.297357  decreased coverage  0.00262303 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4099  thioredoxin  25.51 
 
 		 324 aa  92.4  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.809641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19060  thioredoxin domain-containing protein  31.44 
 
 		 299 aa  92  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.595284  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5188  thioredoxin  28.04 
 
 		 302 aa  92  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3098  thioredoxin  37.31 
 
 		 333 aa  90.9  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000000032408  hitchhiker  0.0000022841 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3775  thioredoxin  24.49 
 
 		 324 aa  91.3  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.467472 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0664  Thioredoxin domain protein  38.98 
 
 		 282 aa  90.1  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000362321  hitchhiker  0.00000255831 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3219  thioredoxin  28.62 
 
 		 282 aa  89.4  7e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1041  thioredoxin  29.45 
 
 		 289 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08240  thioredoxin domain-containing protein  30.1 
 
 		 324 aa  87.8  2e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1547  thioredoxin  34.16 
 
 		 302 aa  86.7  4e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  hitchhiker  0.00479598 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0686  thioredoxin  29.86 
 
 		 290 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2251  thioredoxin domain-containing protein  28.62 
 
 		 302 aa  86.3  6e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.285443 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2526  Thioredoxin domain  27.97 
 
 		 302 aa  85.9  7e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0743  thioredoxin  30.66 
 
 		 282 aa  85.9  7e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.328705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4466  thioredoxin  29.02 
 
 		 290 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1489  thioredoxin domain-containing protein  28.29 
 
 		 304 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.481302  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3711  thioredoxin-related  33.7 
 
 		 312 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0516  thioredoxin  28.52 
 
 		 282 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.695523 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0422  thioredoxin-related  27.21 
 
 		 306 aa  83.6  0.000000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1865  thioredoxin  25.31 
 
 		 306 aa  83.6  0.000000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.938725 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3023  putative thioredoxin  25.94 
 
 		 289 aa  83.2  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3161  thioredoxin domain-containing protein  25.94 
 
 		 289 aa  83.2  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.324735  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1269  putative thioredoxin  25.94 
 
 		 289 aa  83.2  0.000000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.204367 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2392  putative thioredoxin  33.33 
 
 		 309 aa  82.4  0.000000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0035  thioredoxin domain protein  27.61 
 
 		 303 aa  82.4  0.000000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000613737 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0510  thioredoxin  25.25 
 
 		 290 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2894  thioredoxin  28.29 
 
 		 304 aa  82  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.225286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11340  putative thioredoxin  28.67 
 
 		 289 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000384652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0139  thioredoxin  27.63 
 
 		 304 aa  82  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.115095  normal  0.47686 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0456  thioredoxin  27.21 
 
 		 306 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.666195  normal  0.0589835 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3272  thioredoxin  24.73 
 
 		 326 aa  80.9  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.315754  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0296  thioredoxin  27.21 
 
 		 306 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0166723 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2208  Thioredoxin domain  26.85 
 
 		 300 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.210633  normal  0.190287 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1052  Thioredoxin domain protein  39.05 
 
 		 286 aa  80.5  0.00000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.846317  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0054  thioredoxin domain-containing protein  27.09 
 
 		 311 aa  80.5  0.00000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.621806 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3284  thioredoxin  26.51 
 
 		 320 aa  79.7  0.00000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0545  thioredoxin  24.92 
 
 		 290 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1155  thioredoxin domain-containing protein  32.37 
 
 		 294 aa  79.3  0.00000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.155818  hitchhiker  0.00000315771 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0571  protein YbbN  30 
 
 		 284 aa  79  0.00000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0558  thioredoxin domain protein  28.1 
 
 		 293 aa  79  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0531  protein YbbN  30 
 
 		 284 aa  79  0.00000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.735174  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0966  thioredoxin domain-containing protein  31.47 
 
 		 284 aa  79  0.00000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0427  protein YbbN  30 
 
 		 284 aa  79  0.00000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0553  thioredoxin domain-containing protein  28.1 
 
 		 293 aa  79  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0541  protein YbbN  30 
 
 		 284 aa  79  0.00000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0612  thioredoxin domain-containing protein  28.1 
 
 		 293 aa  79  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.557632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0596  protein YbbN  30 
 
 		 284 aa  79  0.00000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0568  thioredoxin domain protein  28.1 
 
 		 293 aa  79  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0563  thioredoxin  24.58 
 
 		 290 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1955  thioredoxin  29.47 
 
 		 282 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180401  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2938  thioredoxin  28.47 
 
 		 315 aa  79  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2566  thioredoxin  29.47 
 
 		 282 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0551  thioredoxin domain protein  28.1 
 
 		 293 aa  79  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0730  thioredoxin  30.53 
 
 		 282 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06670  Thioredoxin protein  27.34 
 
 		 289 aa  78.6  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.697288  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5898  thioredoxin  30.42 
 
 		 282 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.769716  normal  0.516195 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>