More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3886 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_3886  Thioredoxin domain protein  100 
 
 		 312 aa  619  1e-176  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.54182  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28500  thioredoxin  52.36 
 
 		 299 aa  271  1e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.173246 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1276  thioredoxin domain protein  50.36 
 
 		 337 aa  254  1.0000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0675  thioredoxin domain-containing protein  48.44 
 
 		 297 aa  241  1e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.357396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3988  thioredoxin domain-containing protein  48.29 
 
 		 300 aa  226  3e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000709703 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3607  thioredoxin domain-containing protein  48.44 
 
 		 300 aa  225  6e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.150797 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0921  thioredoxin domain-containing protein  46.77 
 
 		 301 aa  220  3e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.460441 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4105  Thioredoxin domain protein  50.48 
 
 		 321 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.118303  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1925  Thioredoxin domain-containing protein  45.35 
 
 		 299 aa  215  9.999999999999999e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2392  putative thioredoxin  45.6 
 
 		 309 aa  209  4e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0364  putative thioredoxin  42.25 
 
 		 320 aa  208  9e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.163537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1704  thioredoxin domain protein  40.81 
 
 		 310 aa  205  6e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.143587 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6079  thioredoxin domain protein  46.35 
 
 		 326 aa  205  9e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1954  Thioredoxin domain protein  43.38 
 
 		 313 aa  202  8e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0686118  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1048  thioredoxin domain-containing protein  48.05 
 
 		 331 aa  192  7e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.157412  normal  0.991017 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3683  thioredoxin-related  47.27 
 
 		 329 aa  187  2e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.418332  normal  0.641891 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1333  Thioredoxin domain protein  40.82 
 
 		 311 aa  187  2e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1730  putative thioredoxin domain-containing protein  37.89 
 
 		 313 aa  172  6.999999999999999e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1282  Thioredoxin domain  44.09 
 
 		 319 aa  166  4e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00790933  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1818  thioredoxin  39.06 
 
 		 293 aa  166  5e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0314014 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3775  thioredoxin  34.75 
 
 		 324 aa  161  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.467472 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2527  thioredoxin  39.06 
 
 		 293 aa  160  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4099  thioredoxin  34.43 
 
 		 324 aa  161  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.809641  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1092  Thioredoxin domain protein  42.21 
 
 		 310 aa  159  5e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.509026  normal  0.582988 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11356  thioredoxin  35.64 
 
 		 304 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000675127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4245  thioredoxin  33.88 
 
 		 334 aa  152  5e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.902531  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1804  thioredoxin domain-containing protein  37.38 
 
 		 314 aa  152  8.999999999999999e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2254  Thioredoxin domain  34.75 
 
 		 338 aa  147  2.0000000000000003e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.708544  normal  0.526752 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3862  thioredoxin domain-containing protein  41.2 
 
 		 299 aa  146  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3848  thioredoxin domain-containing protein  41.2 
 
 		 299 aa  146  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00807359 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3936  thioredoxin domain-containing protein  41.2 
 
 		 299 aa  146  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1268  Thioredoxin domain protein  37.63 
 
 		 323 aa  146  5e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3045  thioredoxin  32.67 
 
 		 330 aa  145  8.000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2342  thioredoxin domain-containing protein  38.11 
 
 		 298 aa  144  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.299917  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0726  thioredoxin  36.49 
 
 		 281 aa  143  3e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0681266  normal  0.772091 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2422  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.84 
 
 		 319 aa  144  3e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10300  thioredoxin domain-containing protein  35.65 
 
 		 313 aa  142  6e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3098  thioredoxin  42.64 
 
 		 333 aa  142  6e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000000032408  hitchhiker  0.0000022841 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2636  thioredoxin  37.09 
 
 		 280 aa  141  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3232  thioredoxin domain-containing protein  34.03 
 
 		 285 aa  142  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.941804  normal  0.328637 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0796  thioredoxin  37.19 
 
 		 281 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0505807  normal  0.147714 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4303  thioredoxin domain-containing protein  38.58 
 
 		 297 aa  140  3e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.408854  normal  0.611787 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2594  thioredoxin domain-containing protein  33.84 
 
 		 339 aa  140  3.9999999999999997e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.238157  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0456  thioredoxin  33.66 
 
 		 306 aa  139  7e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.666195  normal  0.0589835 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3219  thioredoxin  35.41 
 
 		 282 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0296  thioredoxin  34.32 
 
 		 306 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0166723 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0779  putative thioredoxin protein  36.11 
 
 		 280 aa  137  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.297357  decreased coverage  0.00262303 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0268  thioredoxin  32.4 
 
 		 306 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.223768  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5188  thioredoxin  34.52 
 
 		 302 aa  135  9e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3284  thioredoxin  34.08 
 
 		 320 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0422  thioredoxin-related  33.11 
 
 		 306 aa  134  1.9999999999999998e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0743  thioredoxin  34.43 
 
 		 282 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.328705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2327  thioredoxin domain protein  34.67 
 
 		 334 aa  134  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000128937 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0822  thioredoxin  34.19 
 
 		 310 aa  134  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.606093  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4464  thioredoxin  32.48 
 
 		 302 aa  133  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.980457  hitchhiker  0.00575685 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0893  thioredoxin  34.41 
 
 		 324 aa  133  3.9999999999999996e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0306  putative thioredoxin  32.05 
 
 		 305 aa  133  5e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.351153 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0664  Thioredoxin domain protein  34.95 
 
 		 282 aa  132  6.999999999999999e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000362321  hitchhiker  0.00000255831 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1865  thioredoxin  34.41 
 
 		 306 aa  132  7.999999999999999e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.938725 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0318  thioredoxin  35.4 
 
 		 287 aa  132  9e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0837  thioredoxin  34.08 
 
 		 329 aa  131  2.0000000000000002e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24068  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2894  thioredoxin  32.66 
 
 		 304 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.225286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0835  thioredoxin  32.08 
 
 		 304 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0466449 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0054  thioredoxin domain-containing protein  31.37 
 
 		 311 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.621806 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3279  thioredoxin  31.82 
 
 		 302 aa  126  5e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08240  thioredoxin domain-containing protein  34.04 
 
 		 324 aa  126  5e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0139  thioredoxin  31.68 
 
 		 304 aa  125  7e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.115095  normal  0.47686 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2376  thioredoxin-related  33.33 
 
 		 286 aa  125  8.000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.036483  normal  0.757224 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0577  thioredoxin domain protein  31.01 
 
 		 272 aa  125  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0560  Thioredoxin domain protein  31.01 
 
 		 272 aa  125  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1452  thioredoxin  50.43 
 
 		 272 aa  125  1e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4590  thioredoxin  33.44 
 
 		 304 aa  124  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.315091 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1982  thioredoxin  33.91 
 
 		 317 aa  124  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00653306  normal  0.106397 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2208  Thioredoxin domain  34.29 
 
 		 300 aa  124  3e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.210633  normal  0.190287 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1535  thioredoxin  31.67 
 
 		 269 aa  124  3e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000141662  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1489  thioredoxin domain-containing protein  31.02 
 
 		 304 aa  124  3e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.481302  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3931  thioredoxin  31.49 
 
 		 302 aa  123  4e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2914  thioredoxin  54.63 
 
 		 285 aa  122  7e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09500  thioredoxin domain-containing protein  34.19 
 
 		 346 aa  122  7e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.460116  normal  0.88242 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2251  thioredoxin domain-containing protein  34.43 
 
 		 302 aa  122  8e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.285443 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0519  thioredoxin  34.28 
 
 		 280 aa  122  9e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2526  Thioredoxin domain  34.43 
 
 		 302 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01872  thioredoxin  32.63 
 
 		 285 aa  121  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2864  thioredoxin domain-containing protein  30.1 
 
 		 272 aa  120  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.499317  normal  0.13279 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3331  thioredoxin  32.07 
 
 		 287 aa  121  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.108459  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0943  thioredoxin domain-containing protein  34.97 
 
 		 286 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1305  thioredoxin  34.2 
 
 		 235 aa  120  3e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.277929  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0266  thioredoxin  34.01 
 
 		 301 aa  120  3e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2371  thioredoxin domain-containing protein  32.39 
 
 		 303 aa  120  3e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.880736 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0081  thioredoxin-related  34.7 
 
 		 310 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3667  thioredoxin domain-containing protein  31.65 
 
 		 298 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0035  thioredoxin domain protein  33.77 
 
 		 303 aa  119  7e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000613737 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1755  thioredoxin  31.71 
 
 		 287 aa  118  9.999999999999999e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0267329  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3272  thioredoxin  31.72 
 
 		 326 aa  118  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.315754  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00581  Thioredoxin domain-containing protein  31.34 
 
 		 289 aa  117  3e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5094  thioredoxin  28.99 
 
 		 306 aa  116  3.9999999999999997e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.443129  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19060  thioredoxin domain-containing protein  33.98 
 
 		 299 aa  117  3.9999999999999997e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.595284  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1467  thioredoxin  30.74 
 
 		 268 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0264  thioredoxin-related  31.23 
 
 		 305 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.569758 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1547  thioredoxin  30.09 
 
 		 302 aa  115  6.9999999999999995e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  hitchhiker  0.00479598 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>