126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_19060 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_19060  thioredoxin domain-containing protein  100 
 
 		 299 aa  572  1.0000000000000001e-162  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.595284  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2327  thioredoxin domain protein  41.91 
 
 		 334 aa  175  8e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000128937 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2594  thioredoxin domain-containing protein  38.68 
 
 		 339 aa  171  1e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.238157  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2422  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  40.84 
 
 		 319 aa  171  2e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09500  thioredoxin domain-containing protein  34.93 
 
 		 346 aa  163  4.0000000000000004e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.460116  normal  0.88242 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10300  thioredoxin domain-containing protein  39.8 
 
 		 313 aa  160  3e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1730  putative thioredoxin domain-containing protein  37.74 
 
 		 313 aa  155  6e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1092  Thioredoxin domain protein  38.73 
 
 		 310 aa  146  3e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.509026  normal  0.582988 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1333  Thioredoxin domain protein  37.42 
 
 		 311 aa  145  7.0000000000000006e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1704  thioredoxin domain protein  35 
 
 		 310 aa  143  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.143587 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1804  thioredoxin domain-containing protein  38.85 
 
 		 314 aa  142  9e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0921  thioredoxin domain-containing protein  35.91 
 
 		 301 aa  138  1e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.460441 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0139  hypothetical protein  32.58 
 
 		 340 aa  136  3.0000000000000003e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2392  putative thioredoxin  37.05 
 
 		 309 aa  132  5e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08240  thioredoxin domain-containing protein  39.92 
 
 		 324 aa  129  6e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1276  thioredoxin domain protein  32.16 
 
 		 337 aa  128  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3886  Thioredoxin domain protein  34.64 
 
 		 312 aa  124  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.54182  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28500  thioredoxin  33.57 
 
 		 299 aa  124  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.173246 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1282  Thioredoxin domain  39.64 
 
 		 319 aa  122  8e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00790933  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0675  thioredoxin domain-containing protein  32.37 
 
 		 297 aa  120  3e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.357396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6079  thioredoxin domain protein  35.93 
 
 		 326 aa  120  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0364  putative thioredoxin  34.25 
 
 		 320 aa  117  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.163537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1925  Thioredoxin domain-containing protein  31.54 
 
 		 299 aa  112  9e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1117  thioredoxin-related protein  34.33 
 
 		 324 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1954  Thioredoxin domain protein  33.48 
 
 		 313 aa  106  4e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0686118  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4105  Thioredoxin domain protein  33.99 
 
 		 321 aa  99.4  6e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.118303  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3607  thioredoxin domain-containing protein  32.78 
 
 		 300 aa  99  9e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.150797 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3988  thioredoxin domain-containing protein  35.75 
 
 		 300 aa  95.5  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000709703 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1048  thioredoxin domain-containing protein  37.25 
 
 		 331 aa  94.4  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.157412  normal  0.991017 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11356  thioredoxin  30.28 
 
 		 304 aa  93.2  4e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000675127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3862  thioredoxin domain-containing protein  33.11 
 
 		 299 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3936  thioredoxin domain-containing protein  33.11 
 
 		 299 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3848  thioredoxin domain-containing protein  33.11 
 
 		 299 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00807359 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2342  thioredoxin domain-containing protein  31.99 
 
 		 298 aa  89.7  5e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.299917  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3683  thioredoxin-related  31.44 
 
 		 329 aa  89.7  6e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.418332  normal  0.641891 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4303  thioredoxin domain-containing protein  30.1 
 
 		 297 aa  82.8  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.408854  normal  0.611787 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0266  thioredoxin  27.89 
 
 		 301 aa  76.3  0.0000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3284  thioredoxin  26.53 
 
 		 320 aa  75.5  0.0000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4245  thioredoxin  25.42 
 
 		 334 aa  73.6  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.902531  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3667  thioredoxin domain-containing protein  27.03 
 
 		 298 aa  73.2  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4099  thioredoxin  24.57 
 
 		 324 aa  73.2  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.809641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2127  thioredoxin domain-containing protein  27.53 
 
 		 311 aa  70.5  0.00000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0837  thioredoxin  26.53 
 
 		 329 aa  70.5  0.00000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24068  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3331  thioredoxin  27.68 
 
 		 287 aa  69.7  0.00000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.108459  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0893  thioredoxin  26.79 
 
 		 324 aa  67.8  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3775  thioredoxin  23.21 
 
 		 324 aa  67.8  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.467472 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2254  Thioredoxin domain  24.41 
 
 		 338 aa  67.4  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.708544  normal  0.526752 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3098  thioredoxin  34.08 
 
 		 333 aa  66.2  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000000032408  hitchhiker  0.0000022841 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4464  thioredoxin  24.23 
 
 		 302 aa  66.2  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.980457  hitchhiker  0.00575685 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1268  Thioredoxin domain protein  29.51 
 
 		 323 aa  66.2  0.0000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0456  thioredoxin  22.86 
 
 		 306 aa  65.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.666195  normal  0.0589835 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2894  thioredoxin  25.65 
 
 		 304 aa  65.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.225286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0835  thioredoxin  27.22 
 
 		 304 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0466449 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4590  thioredoxin  27.3 
 
 		 304 aa  63.5  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.315091 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0296  thioredoxin  22.9 
 
 		 306 aa  62.8  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0166723 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0054  thioredoxin domain-containing protein  25.6 
 
 		 311 aa  62.4  0.000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.621806 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0422  thioredoxin-related  25.63 
 
 		 306 aa  62  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1865  thioredoxin  26.21 
 
 		 306 aa  61.2  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.938725 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2371  thioredoxin domain-containing protein  24.83 
 
 		 303 aa  60.8  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.880736 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0035  thioredoxin domain protein  26.16 
 
 		 303 aa  60.1  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000613737 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3711  thioredoxin-related  23.1 
 
 		 312 aa  59.7  0.00000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0139  thioredoxin  24.03 
 
 		 304 aa  60.1  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.115095  normal  0.47686 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1489  thioredoxin domain-containing protein  23.7 
 
 		 304 aa  59.7  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.481302  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0306  putative thioredoxin  21.2 
 
 		 305 aa  59.3  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.351153 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0081  thioredoxin-related  23.91 
 
 		 310 aa  59.3  0.00000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1982  thioredoxin  24.83 
 
 		 317 aa  58.5  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00653306  normal  0.106397 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3272  thioredoxin  24.14 
 
 		 326 aa  58.2  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.315754  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0318  thioredoxin  26.9 
 
 		 287 aa  58.2  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0268  thioredoxin  22.22 
 
 		 306 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.223768  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5188  thioredoxin  24.75 
 
 		 302 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0943  thioredoxin domain-containing protein  28.67 
 
 		 286 aa  57  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2938  thioredoxin  24.75 
 
 		 315 aa  57  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3045  thioredoxin  22.3 
 
 		 330 aa  55.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3035  thioredoxin-related  22.78 
 
 		 274 aa  54.3  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1547  thioredoxin  24.77 
 
 		 302 aa  53.9  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  hitchhiker  0.00479598 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0571  protein YbbN  26.83 
 
 		 284 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0531  protein YbbN  26.83 
 
 		 284 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.735174  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0541  protein YbbN  26.83 
 
 		 284 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0427  protein YbbN  26.83 
 
 		 284 aa  53.5  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0596  protein YbbN  26.83 
 
 		 284 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00443  predicted thioredoxin domain-containing protein  26.83 
 
 		 284 aa  52.8  0.000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3118  Thioredoxin domain protein  26.83 
 
 		 284 aa  52.8  0.000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3124  thioredoxin domain-containing protein  26.83 
 
 		 284 aa  52.8  0.000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000112242 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00448  hypothetical protein  26.83 
 
 		 284 aa  52.8  0.000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0845  hypothetical protein  23.18 
 
 		 282 aa  52  0.00001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1312  thioredoxin  26.22 
 
 		 302 aa  52  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.968155  hitchhiker  0.00158392 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2527  thioredoxin  27.05 
 
 		 293 aa  52  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1052  Thioredoxin domain protein  26.8 
 
 		 286 aa  51.2  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.846317  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1539  thioredoxin domain-containing protein  29.76 
 
 		 287 aa  50.8  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0176064  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2102  thioredoxin  25.17 
 
 		 291 aa  50.4  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2636  thioredoxin  25.33 
 
 		 280 aa  50.1  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3007  Thioredoxin domain protein  24.91 
 
 		 286 aa  50.1  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3023  putative thioredoxin  24.41 
 
 		 289 aa  49.3  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1269  putative thioredoxin  24.41 
 
 		 289 aa  49.3  0.00009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.204367 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3161  thioredoxin domain-containing protein  24.41 
 
 		 289 aa  49.3  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.324735  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004149  thioredoxin domain-containing protein  30.06 
 
 		 284 aa  49.3  0.00009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1818  thioredoxin  26.03 
 
 		 293 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0314014 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0612  thioredoxin domain-containing protein  25.44 
 
 		 293 aa  48.5  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.557632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0568  thioredoxin domain protein  25.44 
 
 		 293 aa  48.5  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0551  thioredoxin domain protein  25.44 
 
 		 293 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>