More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3272 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_3272  thioredoxin  100 
 
 		 326 aa  651    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.315754  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3284  thioredoxin  59.21 
 
 		 320 aa  378  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0893  thioredoxin  58.58 
 
 		 324 aa  375  1e-103  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0837  thioredoxin  58.28 
 
 		 329 aa  375  1e-103  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24068  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3045  thioredoxin  54.49 
 
 		 330 aa  352  2.9999999999999997e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0456  thioredoxin  58.42 
 
 		 306 aa  348  8e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.666195  normal  0.0589835 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3775  thioredoxin  53.47 
 
 		 324 aa  345  6e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.467472 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0306  putative thioredoxin  57.97 
 
 		 305 aa  343  2e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.351153 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4099  thioredoxin  52.57 
 
 		 324 aa  342  5.999999999999999e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.809641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0296  thioredoxin  56.77 
 
 		 306 aa  339  5e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0166723 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0268  thioredoxin  57.68 
 
 		 306 aa  338  7e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.223768  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5188  thioredoxin  58.54 
 
 		 302 aa  337  9.999999999999999e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2208  Thioredoxin domain  58.19 
 
 		 300 aa  331  1e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.210633  normal  0.190287 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4464  thioredoxin  59.23 
 
 		 302 aa  331  1e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.980457  hitchhiker  0.00575685 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4245  thioredoxin  51.34 
 
 		 334 aa  330  2e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.902531  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2526  Thioredoxin domain  57.81 
 
 		 302 aa  325  8.000000000000001e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2251  thioredoxin domain-containing protein  57.81 
 
 		 302 aa  325  8.000000000000001e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.285443 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0264  thioredoxin-related  57.63 
 
 		 305 aa  319  3e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.569758 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0835  thioredoxin  58.05 
 
 		 304 aa  319  3e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0466449 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0081  thioredoxin-related  52.17 
 
 		 310 aa  305  7e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1982  thioredoxin  54.74 
 
 		 317 aa  301  1e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00653306  normal  0.106397 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1312  thioredoxin  58.82 
 
 		 302 aa  300  3e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.968155  hitchhiker  0.00158392 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1865  thioredoxin  53.29 
 
 		 306 aa  297  2e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.938725 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0073  thioredoxin-related  53 
 
 		 336 aa  291  1e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0246134 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2792  thioredoxin  51.09 
 
 		 307 aa  283  3.0000000000000004e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.336164  normal  0.284427 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0422  thioredoxin-related  49.31 
 
 		 306 aa  265  1e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0035  thioredoxin domain protein  46.44 
 
 		 303 aa  263  4e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000613737 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2938  thioredoxin  48.5 
 
 		 315 aa  254  2.0000000000000002e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2254  Thioredoxin domain  48.47 
 
 		 338 aa  251  1e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.708544  normal  0.526752 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0139  thioredoxin  46.18 
 
 		 304 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.115095  normal  0.47686 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1489  thioredoxin domain-containing protein  46.18 
 
 		 304 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.481302  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3711  thioredoxin-related  45.67 
 
 		 312 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2894  thioredoxin  47.18 
 
 		 304 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.225286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4590  thioredoxin  49.14 
 
 		 304 aa  241  1e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.315091 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2371  thioredoxin domain-containing protein  46.51 
 
 		 303 aa  234  2.0000000000000002e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.880736 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2127  thioredoxin domain-containing protein  43.33 
 
 		 311 aa  232  7.000000000000001e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0054  thioredoxin domain-containing protein  41.55 
 
 		 311 aa  224  2e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.621806 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3035  thioredoxin-related  41.84 
 
 		 274 aa  202  7e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3667  thioredoxin domain-containing protein  40.62 
 
 		 298 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3219  thioredoxin  40.41 
 
 		 282 aa  192  8e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2636  thioredoxin  36.88 
 
 		 280 aa  189  4e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3331  thioredoxin  37.72 
 
 		 287 aa  189  5e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.108459  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0318  thioredoxin  36.46 
 
 		 287 aa  188  1e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0266  thioredoxin  39.08 
 
 		 301 aa  187  2e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0743  thioredoxin  39.66 
 
 		 282 aa  183  3e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.328705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0822  thioredoxin  35.46 
 
 		 310 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.606093  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0779  putative thioredoxin protein  37.76 
 
 		 280 aa  179  7e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.297357  decreased coverage  0.00262303 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2527  thioredoxin  40.61 
 
 		 293 aa  179  8e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0516  thioredoxin  39.72 
 
 		 282 aa  178  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.695523 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0519  thioredoxin  39.64 
 
 		 280 aa  176  5e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5898  thioredoxin  38.65 
 
 		 282 aa  175  9e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.769716  normal  0.516195 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1818  thioredoxin  39.86 
 
 		 293 aa  175  9.999999999999999e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0314014 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0563  thioredoxin  37.02 
 
 		 290 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0726  thioredoxin  36.46 
 
 		 281 aa  170  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0681266  normal  0.772091 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2485  thioredoxin  37.94 
 
 		 282 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.194267 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2614  thioredoxin  37.94 
 
 		 282 aa  170  3e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1041  thioredoxin  36.68 
 
 		 289 aa  169  6e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0686  thioredoxin  36.33 
 
 		 290 aa  169  7e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0796  thioredoxin  35.21 
 
 		 281 aa  169  8e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0505807  normal  0.147714 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3279  thioredoxin  37 
 
 		 302 aa  167  2e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0545  thioredoxin  36.46 
 
 		 290 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0730  thioredoxin  37.23 
 
 		 282 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3861  thioredoxin  37.41 
 
 		 290 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.339067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1755  thioredoxin  36.68 
 
 		 287 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0267329  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0556  thioredoxin  35.42 
 
 		 290 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3931  thioredoxin  36.67 
 
 		 302 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3232  thioredoxin domain-containing protein  34.86 
 
 		 285 aa  164  2.0000000000000002e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.941804  normal  0.328637 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0510  thioredoxin  35.76 
 
 		 290 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2566  thioredoxin  37.59 
 
 		 282 aa  163  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2665  thioredoxin-related  37.98 
 
 		 303 aa  163  4.0000000000000004e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4466  thioredoxin  37.02 
 
 		 290 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0661  thioredoxin domain-containing protein  38.87 
 
 		 301 aa  162  6e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0903  thioredoxin  38.87 
 
 		 282 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0906  thioredoxin  38.87 
 
 		 282 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1955  thioredoxin  37.23 
 
 		 282 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180401  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11340  putative thioredoxin  36.68 
 
 		 289 aa  162  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000384652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2590  thioredoxin  36.88 
 
 		 282 aa  159  5e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1063  thioredoxin  38.87 
 
 		 918 aa  159  9e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.460797  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1547  thioredoxin  36.18 
 
 		 302 aa  156  4e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  hitchhiker  0.00479598 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0943  thioredoxin domain-containing protein  34.97 
 
 		 286 aa  156  6e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4561  thioredoxin  36.67 
 
 		 302 aa  155  9e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.712523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2376  thioredoxin-related  35.76 
 
 		 286 aa  155  1e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.036483  normal  0.757224 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4628  thioredoxin  32.79 
 
 		 341 aa  154  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00581  Thioredoxin domain-containing protein  31.96 
 
 		 289 aa  154  2.9999999999999998e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0198  thioredoxin  35.02 
 
 		 326 aa  153  4e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5023  thioredoxin  34.38 
 
 		 290 aa  153  5e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.929168  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0664  Thioredoxin domain protein  37.37 
 
 		 282 aa  153  5e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000362321  hitchhiker  0.00000255831 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2102  thioredoxin  33.79 
 
 		 291 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1276  thioredoxin domain protein  35.74 
 
 		 337 aa  151  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0719  thioredoxin  37 
 
 		 282 aa  151  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0060777  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0886  putative thioredoxin protein  34.75 
 
 		 287 aa  150  3e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0294  putative thioredoxin protein  36.74 
 
 		 314 aa  150  3e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.918989  normal  0.0369237 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06670  Thioredoxin protein  34.51 
 
 		 289 aa  149  5e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.697288  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0993  thioredoxin  38.76 
 
 		 318 aa  149  7e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.766287 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0675  thioredoxin domain-containing protein  34.01 
 
 		 297 aa  149  7e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.357396  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5094  thioredoxin  33.75 
 
 		 306 aa  149  8e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.443129  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1595  thioredoxin  30.18 
 
 		 287 aa  143  4e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.385204  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1305  thioredoxin  32.03 
 
 		 235 aa  140  3.9999999999999997e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.277929  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1467  thioredoxin  33.69 
 
 		 268 aa  139  7e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1331  putative thioredoxin  29.25 
 
 		 285 aa  138  2e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>