More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0886 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0886  putative thioredoxin protein  100 
 
 		 287 aa  576  1.0000000000000001e-163  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3331  thioredoxin  35.19 
 
 		 287 aa  182  6e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.108459  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0796  thioredoxin  37.86 
 
 		 281 aa  172  5.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0505807  normal  0.147714 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3035  thioredoxin-related  38.97 
 
 		 274 aa  170  3e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1755  thioredoxin  34.49 
 
 		 287 aa  166  4e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0267329  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0519  thioredoxin  38.25 
 
 		 280 aa  165  8e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0726  thioredoxin  36.79 
 
 		 281 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0681266  normal  0.772091 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2125  thioredoxin  34.15 
 
 		 286 aa  163  3e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1595  thioredoxin  32.98 
 
 		 287 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.385204  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0603  thioredoxin domain-containing protein  33.1 
 
 		 287 aa  161  1e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0802586  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0779  putative thioredoxin protein  38.41 
 
 		 280 aa  159  5e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.297357  decreased coverage  0.00262303 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0318  thioredoxin  35.54 
 
 		 287 aa  157  2e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2469  thioredoxin  34.02 
 
 		 289 aa  149  5e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.744001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2848  thioredoxin, putative  34.02 
 
 		 289 aa  149  5e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.126765  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3775  thioredoxin  34.26 
 
 		 324 aa  145  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.467472 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3861  thioredoxin  32.99 
 
 		 290 aa  145  9e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.339067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3232  thioredoxin domain-containing protein  31.47 
 
 		 285 aa  144  2e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.941804  normal  0.328637 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1041  thioredoxin  33.45 
 
 		 289 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4099  thioredoxin  33.91 
 
 		 324 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.809641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3272  thioredoxin  34.4 
 
 		 326 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.315754  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06670  Thioredoxin protein  33.79 
 
 		 289 aa  139  4.999999999999999e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.697288  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3219  thioredoxin  33.45 
 
 		 282 aa  139  6e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0510  thioredoxin  32.88 
 
 		 290 aa  139  7e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0563  thioredoxin  33.22 
 
 		 290 aa  138  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0545  thioredoxin  32.54 
 
 		 290 aa  138  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11340  putative thioredoxin  33.79 
 
 		 289 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000384652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0822  thioredoxin  34.38 
 
 		 310 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.606093  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1038  thioredoxin  36.04 
 
 		 277 aa  135  5e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0516  thioredoxin  34.98 
 
 		 282 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.695523 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0456  thioredoxin  33.22 
 
 		 306 aa  135  8e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.666195  normal  0.0589835 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5188  thioredoxin  32.38 
 
 		 302 aa  135  8e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0686  thioredoxin  31.62 
 
 		 290 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0943  thioredoxin domain-containing protein  29.97 
 
 		 286 aa  135  9.999999999999999e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3284  thioredoxin  32.52 
 
 		 320 aa  133  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0743  thioredoxin  33.1 
 
 		 282 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.328705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4464  thioredoxin  33.1 
 
 		 302 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.980457  hitchhiker  0.00575685 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0556  thioredoxin  32.09 
 
 		 290 aa  132  5e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4466  thioredoxin  32.09 
 
 		 290 aa  132  5e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2376  thioredoxin-related  34.34 
 
 		 286 aa  132  7.999999999999999e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.036483  normal  0.757224 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0893  thioredoxin  32.52 
 
 		 324 aa  131  1.0000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5023  thioredoxin  31.36 
 
 		 290 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.929168  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4245  thioredoxin  30.21 
 
 		 334 aa  131  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.902531  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2636  thioredoxin  34.15 
 
 		 280 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1818  thioredoxin  37.11 
 
 		 293 aa  130  3e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0314014 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1955  thioredoxin  31.91 
 
 		 282 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180401  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1331  putative thioredoxin  30.66 
 
 		 285 aa  129  6e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3667  thioredoxin domain-containing protein  32.98 
 
 		 298 aa  129  7.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0837  thioredoxin  31.82 
 
 		 329 aa  129  8.000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24068  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2485  thioredoxin  31.56 
 
 		 282 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.194267 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0296  thioredoxin  32.52 
 
 		 306 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0166723 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2614  thioredoxin  31.56 
 
 		 282 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5898  thioredoxin  31.91 
 
 		 282 aa  126  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.769716  normal  0.516195 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2566  thioredoxin  31.56 
 
 		 282 aa  126  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3045  thioredoxin  31.71 
 
 		 330 aa  126  4.0000000000000003e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2526  Thioredoxin domain  33.92 
 
 		 302 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2254  Thioredoxin domain  35.64 
 
 		 338 aa  125  5e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.708544  normal  0.526752 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2102  thioredoxin  32.03 
 
 		 291 aa  125  6e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2938  thioredoxin  32.52 
 
 		 315 aa  125  8.000000000000001e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1982  thioredoxin  32.38 
 
 		 317 aa  124  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00653306  normal  0.106397 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0730  thioredoxin  30.85 
 
 		 282 aa  123  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2251  thioredoxin domain-containing protein  33.57 
 
 		 302 aa  123  4e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.285443 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3279  thioredoxin  30.98 
 
 		 302 aa  123  4e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2208  Thioredoxin domain  33.22 
 
 		 300 aa  122  5e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.210633  normal  0.190287 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2527  thioredoxin  35.74 
 
 		 293 aa  122  5e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0661  thioredoxin domain-containing protein  32.62 
 
 		 301 aa  122  6e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0906  thioredoxin  32.62 
 
 		 282 aa  122  7e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0903  thioredoxin  32.62 
 
 		 282 aa  122  7e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1547  thioredoxin  32.32 
 
 		 302 aa  121  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  hitchhiker  0.00479598 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1312  thioredoxin  34.74 
 
 		 302 aa  121  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.968155  hitchhiker  0.00158392 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2590  thioredoxin  30.85 
 
 		 282 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1535  thioredoxin  28.11 
 
 		 269 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000141662  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0306  putative thioredoxin  29.97 
 
 		 305 aa  120  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.351153 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0979  thioredoxin domain-containing protein  31.75 
 
 		 263 aa  120  3e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.248497  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0268  thioredoxin  31.47 
 
 		 306 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.223768  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2614  thioredoxin family protein  32.12 
 
 		 271 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2127  thioredoxin domain-containing protein  32.99 
 
 		 311 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3931  thioredoxin  30.64 
 
 		 302 aa  119  4.9999999999999996e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0577  thioredoxin domain protein  29.97 
 
 		 272 aa  119  6e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0560  Thioredoxin domain protein  29.97 
 
 		 272 aa  119  6e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0719  thioredoxin  32.62 
 
 		 282 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0060777  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00581  Thioredoxin domain-containing protein  27.76 
 
 		 289 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0198  thioredoxin  28.81 
 
 		 326 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0081  thioredoxin-related  31.96 
 
 		 310 aa  117  3e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0035  thioredoxin domain protein  30.28 
 
 		 303 aa  116  5e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000613737 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1063  thioredoxin  32.62 
 
 		 918 aa  115  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.460797  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0835  thioredoxin  31.67 
 
 		 304 aa  115  6e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0466449 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0364  thioredoxin domain-containing protein  30.87 
 
 		 312 aa  114  1.0000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000110184 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0422  thioredoxin-related  29.82 
 
 		 306 aa  115  1.0000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01872  thioredoxin  33.92 
 
 		 285 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1467  thioredoxin  30.18 
 
 		 268 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1374  thioredoxin  33.1 
 
 		 286 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.187591  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3023  putative thioredoxin  30.18 
 
 		 289 aa  113  4.0000000000000004e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1307  thioredoxin  32.75 
 
 		 286 aa  113  4.0000000000000004e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.334323  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3161  thioredoxin domain-containing protein  30.18 
 
 		 289 aa  113  4.0000000000000004e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.324735  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1269  putative thioredoxin  30.18 
 
 		 289 aa  113  4.0000000000000004e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.204367 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1199  thioredoxin  31.56 
 
 		 268 aa  112  7.000000000000001e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0450617 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2914  thioredoxin  33.22 
 
 		 285 aa  112  8.000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3711  thioredoxin-related  32.87 
 
 		 312 aa  112  9e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0664  Thioredoxin domain protein  34.48 
 
 		 282 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000362321  hitchhiker  0.00000255831 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1859  thioredoxin domain-containing protein  28.62 
 
 		 283 aa  109  4.0000000000000004e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.145875  normal  0.127398 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>