More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0726 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_0726  thioredoxin  100 
 
 		 281 aa  568  1e-161  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0681266  normal  0.772091 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0796  thioredoxin  96.8 
 
 		 281 aa  554  1e-157  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0505807  normal  0.147714 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0779  putative thioredoxin protein  84.34 
 
 		 280 aa  481  1e-135  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.297357  decreased coverage  0.00262303 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2636  thioredoxin  61.57 
 
 		 280 aa  348  5e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0822  thioredoxin  60.85 
 
 		 310 aa  343  2e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.606093  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3219  thioredoxin  57.5 
 
 		 282 aa  315  5e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0743  thioredoxin  57.86 
 
 		 282 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.328705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0516  thioredoxin  57.3 
 
 		 282 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.695523 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2485  thioredoxin  53.74 
 
 		 282 aa  295  6e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.194267 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2614  thioredoxin  53.74 
 
 		 282 aa  295  8e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5898  thioredoxin  53.38 
 
 		 282 aa  291  1e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.769716  normal  0.516195 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0730  thioredoxin  52.31 
 
 		 282 aa  281  8.000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0906  thioredoxin  53.02 
 
 		 282 aa  277  1e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0903  thioredoxin  53.02 
 
 		 282 aa  277  1e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1955  thioredoxin  53.38 
 
 		 282 aa  277  1e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180401  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2566  thioredoxin  53.38 
 
 		 282 aa  277  1e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0661  thioredoxin domain-containing protein  52.67 
 
 		 301 aa  276  2e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1063  thioredoxin  52.78 
 
 		 918 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.460797  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2590  thioredoxin  52.67 
 
 		 282 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0719  thioredoxin  52.67 
 
 		 282 aa  273  3e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0060777  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0519  thioredoxin  46.62 
 
 		 280 aa  227  2e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0294  putative thioredoxin protein  43.73 
 
 		 314 aa  211  2e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.918989  normal  0.0369237 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3232  thioredoxin domain-containing protein  41.37 
 
 		 285 aa  206  4e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.941804  normal  0.328637 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1818  thioredoxin  42.05 
 
 		 293 aa  203  2e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0314014 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1547  thioredoxin  42.07 
 
 		 302 aa  202  6e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  hitchhiker  0.00479598 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3279  thioredoxin  43.33 
 
 		 302 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1312  thioredoxin  43.31 
 
 		 302 aa  201  1.9999999999999998e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.968155  hitchhiker  0.00158392 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4561  thioredoxin  40.47 
 
 		 302 aa  199  6e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.712523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2527  thioredoxin  41.84 
 
 		 293 aa  198  7e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3931  thioredoxin  42.96 
 
 		 302 aa  198  7.999999999999999e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0198  thioredoxin  39.13 
 
 		 326 aa  198  9e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2469  thioredoxin  38.08 
 
 		 289 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.744001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2848  thioredoxin, putative  38.08 
 
 		 289 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.126765  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4464  thioredoxin  40.07 
 
 		 302 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.980457  hitchhiker  0.00575685 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0364  thioredoxin domain-containing protein  42.75 
 
 		 312 aa  196  5.000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000110184 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2938  thioredoxin  40.28 
 
 		 315 aa  194  1e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2496  thioredoxin  49.56 
 
 		 229 aa  193  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.109876  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5188  thioredoxin  40.07 
 
 		 302 aa  192  5e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1755  thioredoxin  35.13 
 
 		 287 aa  189  5.999999999999999e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0267329  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0306  putative thioredoxin  36.93 
 
 		 305 aa  187  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.351153 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3045  thioredoxin  37.5 
 
 		 330 aa  185  8e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5094  thioredoxin  36.63 
 
 		 306 aa  182  8.000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.443129  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00581  Thioredoxin domain-containing protein  36.43 
 
 		 289 aa  179  2.9999999999999997e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2526  Thioredoxin domain  38.46 
 
 		 302 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2251  thioredoxin domain-containing protein  38.11 
 
 		 302 aa  175  7e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.285443 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3284  thioredoxin  37.24 
 
 		 320 aa  174  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4099  thioredoxin  35.76 
 
 		 324 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.809641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4628  thioredoxin  35.14 
 
 		 341 aa  173  2.9999999999999996e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0456  thioredoxin  36.59 
 
 		 306 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.666195  normal  0.0589835 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3775  thioredoxin  35.42 
 
 		 324 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.467472 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0318  thioredoxin  39.79 
 
 		 287 aa  173  3.9999999999999995e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0893  thioredoxin  37.89 
 
 		 324 aa  172  7.999999999999999e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0268  thioredoxin  36.24 
 
 		 306 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.223768  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1982  thioredoxin  39.31 
 
 		 317 aa  171  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00653306  normal  0.106397 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0664  Thioredoxin domain protein  40.7 
 
 		 282 aa  170  3e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000362321  hitchhiker  0.00000255831 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0837  thioredoxin  37.54 
 
 		 329 aa  169  3e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24068  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2208  Thioredoxin domain  37.06 
 
 		 300 aa  169  3e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.210633  normal  0.190287 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4245  thioredoxin  37.46 
 
 		 334 aa  170  3e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.902531  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1535  thioredoxin  35.34 
 
 		 269 aa  169  5e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000141662  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0296  thioredoxin  36.36 
 
 		 306 aa  169  6e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0166723 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0081  thioredoxin-related  36.64 
 
 		 310 aa  169  6e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0603  thioredoxin domain-containing protein  33.21 
 
 		 287 aa  167  1e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0802586  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1038  thioredoxin  35.59 
 
 		 277 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4590  thioredoxin  38.6 
 
 		 304 aa  166  5e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.315091 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2614  thioredoxin family protein  36.75 
 
 		 271 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1041  thioredoxin  36.97 
 
 		 289 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3864  thioredoxin domain-containing protein  36.27 
 
 		 295 aa  165  8e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0886  putative thioredoxin protein  36.79 
 
 		 287 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0835  thioredoxin  37.1 
 
 		 304 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0466449 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11340  putative thioredoxin  36.97 
 
 		 289 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000384652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1865  thioredoxin  37.94 
 
 		 306 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.938725 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3272  thioredoxin  36.01 
 
 		 326 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.315754  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0993  thioredoxin  37.13 
 
 		 318 aa  163  3e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.766287 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2125  thioredoxin  37.05 
 
 		 286 aa  163  3e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3331  thioredoxin  31.54 
 
 		 287 aa  162  5.0000000000000005e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.108459  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0686  thioredoxin  34.52 
 
 		 290 aa  162  6e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4466  thioredoxin  35.23 
 
 		 290 aa  162  7e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0054  thioredoxin domain-containing protein  36.27 
 
 		 311 aa  161  1e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.621806 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2894  thioredoxin  34.86 
 
 		 304 aa  161  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.225286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0035  thioredoxin domain protein  35.96 
 
 		 303 aa  160  2e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000613737 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2102  thioredoxin  35.61 
 
 		 291 aa  160  2e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0422  thioredoxin-related  35.29 
 
 		 306 aa  160  2e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0563  thioredoxin  36.36 
 
 		 290 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2376  thioredoxin-related  35.44 
 
 		 286 aa  159  4e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.036483  normal  0.757224 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0943  thioredoxin domain-containing protein  35.48 
 
 		 286 aa  159  5e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3035  thioredoxin-related  38.55 
 
 		 274 aa  157  1e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2371  thioredoxin domain-containing protein  33.92 
 
 		 303 aa  156  3e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.880736 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1331  putative thioredoxin  33.45 
 
 		 285 aa  156  4e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1489  thioredoxin domain-containing protein  33.8 
 
 		 304 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.481302  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5023  thioredoxin  34.86 
 
 		 290 aa  155  6e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.929168  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3711  thioredoxin-related  35.21 
 
 		 312 aa  155  7e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0264  thioredoxin-related  36.01 
 
 		 305 aa  155  7e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.569758 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0139  thioredoxin  33.8 
 
 		 304 aa  155  7e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.115095  normal  0.47686 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0510  thioredoxin  34.15 
 
 		 290 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0556  thioredoxin  35.36 
 
 		 290 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3861  thioredoxin  35.4 
 
 		 290 aa  152  5e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.339067  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06670  Thioredoxin protein  35.54 
 
 		 289 aa  152  7e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.697288  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0545  thioredoxin  34.15 
 
 		 290 aa  152  7e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0073  thioredoxin-related  35.27 
 
 		 336 aa  151  1e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0246134 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2792  thioredoxin  36.86 
 
 		 307 aa  149  4e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.336164  normal  0.284427 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>