More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_1374 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_1374  thioredoxin  100 
 
 		 286 aa  575  1.0000000000000001e-163  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.187591  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1307  thioredoxin  97.55 
 
 		 286 aa  537  9.999999999999999e-153  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.334323  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01872  thioredoxin  65.38 
 
 		 285 aa  337  9.999999999999999e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2914  thioredoxin  61.54 
 
 		 285 aa  318  9e-86  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1755  thioredoxin  42.66 
 
 		 287 aa  210  2e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0267329  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0510  thioredoxin  41.78 
 
 		 290 aa  192  6e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0545  thioredoxin  41.78 
 
 		 290 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0318  thioredoxin  37.15 
 
 		 287 aa  189  5e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3331  thioredoxin  35.19 
 
 		 287 aa  185  7e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.108459  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0556  thioredoxin  40.75 
 
 		 290 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0563  thioredoxin  40.14 
 
 		 290 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06670  Thioredoxin protein  38.38 
 
 		 289 aa  179  5.999999999999999e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.697288  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1041  thioredoxin  39.06 
 
 		 289 aa  178  8e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0519  thioredoxin  41.3 
 
 		 280 aa  177  1e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1547  thioredoxin  37.21 
 
 		 302 aa  177  2e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  hitchhiker  0.00479598 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0686  thioredoxin  37.41 
 
 		 290 aa  176  3e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2848  thioredoxin, putative  37.76 
 
 		 289 aa  176  3e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.126765  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3279  thioredoxin  35.97 
 
 		 302 aa  176  3e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2469  thioredoxin  37.76 
 
 		 289 aa  176  3e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.744001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3861  thioredoxin  38.7 
 
 		 290 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.339067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3931  thioredoxin  35.64 
 
 		 302 aa  173  2.9999999999999996e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2125  thioredoxin  38.33 
 
 		 286 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4466  thioredoxin  36.95 
 
 		 290 aa  172  5e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5023  thioredoxin  37.71 
 
 		 290 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.929168  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3035  thioredoxin-related  39.21 
 
 		 274 aa  171  1e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11340  putative thioredoxin  39.14 
 
 		 289 aa  171  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000384652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3219  thioredoxin  39.24 
 
 		 282 aa  171  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0603  thioredoxin domain-containing protein  33.69 
 
 		 287 aa  169  5e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0802586  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2636  thioredoxin  38.99 
 
 		 280 aa  169  5e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5898  thioredoxin  39.02 
 
 		 282 aa  168  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.769716  normal  0.516195 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0743  thioredoxin  39.08 
 
 		 282 aa  167  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.328705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0943  thioredoxin domain-containing protein  36.52 
 
 		 286 aa  167  2e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2485  thioredoxin  37.98 
 
 		 282 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.194267 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2614  thioredoxin  37.98 
 
 		 282 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0516  thioredoxin  39.58 
 
 		 282 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.695523 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4561  thioredoxin  34.98 
 
 		 302 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.712523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0661  thioredoxin domain-containing protein  38.79 
 
 		 301 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0903  thioredoxin  38.79 
 
 		 282 aa  162  7e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0906  thioredoxin  38.79 
 
 		 282 aa  162  7e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0822  thioredoxin  37.05 
 
 		 310 aa  161  9e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.606093  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0730  thioredoxin  36.95 
 
 		 282 aa  161  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2102  thioredoxin  35.23 
 
 		 291 aa  160  2e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4628  thioredoxin  33.22 
 
 		 341 aa  160  3e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0719  thioredoxin  38.08 
 
 		 282 aa  159  6e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0060777  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1595  thioredoxin  32.42 
 
 		 287 aa  158  9e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.385204  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0422  thioredoxin-related  34.97 
 
 		 306 aa  158  9e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1955  thioredoxin  39.22 
 
 		 282 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180401  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2566  thioredoxin  39.22 
 
 		 282 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1063  thioredoxin  38.79 
 
 		 918 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.460797  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2590  thioredoxin  38.87 
 
 		 282 aa  156  4e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1535  thioredoxin  34.26 
 
 		 269 aa  154  2e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000141662  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0796  thioredoxin  35.82 
 
 		 281 aa  153  4e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0505807  normal  0.147714 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0779  putative thioredoxin protein  35.25 
 
 		 280 aa  151  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.297357  decreased coverage  0.00262303 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0198  thioredoxin  33.44 
 
 		 326 aa  150  2e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0294  putative thioredoxin protein  33.86 
 
 		 314 aa  149  5e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.918989  normal  0.0369237 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0035  thioredoxin domain protein  32.29 
 
 		 303 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000613737 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2527  thioredoxin  34.93 
 
 		 293 aa  147  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2938  thioredoxin  34.48 
 
 		 315 aa  146  4.0000000000000006e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0364  thioredoxin domain-containing protein  33.44 
 
 		 312 aa  145  6e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000110184 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3775  thioredoxin  34.69 
 
 		 324 aa  145  6e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.467472 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0726  thioredoxin  33.57 
 
 		 281 aa  145  7.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0681266  normal  0.772091 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00581  Thioredoxin domain-containing protein  32.54 
 
 		 289 aa  144  1e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2371  thioredoxin domain-containing protein  33.79 
 
 		 303 aa  145  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.880736 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0993  thioredoxin  33.23 
 
 		 318 aa  145  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.766287 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2376  thioredoxin-related  37.54 
 
 		 286 aa  144  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.036483  normal  0.757224 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1331  putative thioredoxin  32.16 
 
 		 285 aa  144  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5094  thioredoxin  32.25 
 
 		 306 aa  142  5e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.443129  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1052  Thioredoxin domain protein  34.13 
 
 		 286 aa  142  5e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.846317  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5188  thioredoxin  33.22 
 
 		 302 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1859  thioredoxin domain-containing protein  31.51 
 
 		 283 aa  141  9.999999999999999e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.145875  normal  0.127398 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4245  thioredoxin  32.76 
 
 		 334 aa  140  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.902531  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1818  thioredoxin  33 
 
 		 293 aa  140  3e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0314014 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3232  thioredoxin domain-containing protein  32.75 
 
 		 285 aa  139  4.999999999999999e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.941804  normal  0.328637 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4464  thioredoxin  33.33 
 
 		 302 aa  139  7e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.980457  hitchhiker  0.00575685 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4099  thioredoxin  33.33 
 
 		 324 aa  139  7e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.809641  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0893  thioredoxin  35.62 
 
 		 324 aa  138  1e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0266  thioredoxin  33.68 
 
 		 301 aa  137  3.0000000000000003e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0837  thioredoxin  35.27 
 
 		 329 aa  136  4e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24068  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1925  Thioredoxin domain-containing protein  33.45 
 
 		 299 aa  135  7.000000000000001e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3272  thioredoxin  31.23 
 
 		 326 aa  135  8e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.315754  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3864  thioredoxin domain-containing protein  31.89 
 
 		 295 aa  135  9e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0835  thioredoxin  33.33 
 
 		 304 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0466449 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1982  thioredoxin  32.53 
 
 		 317 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00653306  normal  0.106397 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3045  thioredoxin  32.64 
 
 		 330 aa  133  3.9999999999999996e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1305  thioredoxin  44.71 
 
 		 235 aa  132  5e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.277929  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1489  thioredoxin domain-containing protein  31.58 
 
 		 304 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.481302  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0456  thioredoxin  31.14 
 
 		 306 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.666195  normal  0.0589835 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2894  thioredoxin  31.58 
 
 		 304 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.225286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3284  thioredoxin  34.71 
 
 		 320 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0054  thioredoxin domain-containing protein  31.4 
 
 		 311 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.621806 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3007  Thioredoxin domain protein  32.53 
 
 		 286 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0139  thioredoxin  31.23 
 
 		 304 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.115095  normal  0.47686 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0577  thioredoxin domain protein  31.49 
 
 		 272 aa  128  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0560  Thioredoxin domain protein  31.49 
 
 		 272 aa  128  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0541  protein YbbN  32.54 
 
 		 284 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0531  protein YbbN  32.54 
 
 		 284 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.735174  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0596  protein YbbN  32.54 
 
 		 284 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0664  Thioredoxin domain protein  34.6 
 
 		 282 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000362321  hitchhiker  0.00000255831 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0571  protein YbbN  32.54 
 
 		 284 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0427  protein YbbN  32.54 
 
 		 284 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>