More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2371 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008686  Pden_2371  thioredoxin domain-containing protein  100 
 
 
303 aa  601  1.0000000000000001e-171  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.880736 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0035  thioredoxin domain protein  68.42 
 
 
303 aa  412  1e-114  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000613737 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0422  thioredoxin-related  67.65 
 
 
306 aa  389  1e-107  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2894  thioredoxin  69.84 
 
 
304 aa  386  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.225286  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0139  thioredoxin  67.87 
 
 
304 aa  378  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.115095  normal  0.47686 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1489  thioredoxin domain-containing protein  67.54 
 
 
304 aa  378  1e-104  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.481302  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0054  thioredoxin domain-containing protein  63.18 
 
 
311 aa  357  9.999999999999999e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.621806 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1982  thioredoxin  53.29 
 
 
317 aa  287  1e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00653306  normal  0.106397 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0456  thioredoxin  48.04 
 
 
306 aa  280  2e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.666195  normal  0.0589835 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0306  putative thioredoxin  48.8 
 
 
305 aa  279  5e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.351153 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0296  thioredoxin  48.37 
 
 
306 aa  278  1e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0166723 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0268  thioredoxin  47.04 
 
 
306 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.223768  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4464  thioredoxin  48.84 
 
 
302 aa  259  4e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.980457  hitchhiker  0.00575685 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3711  thioredoxin-related  45.82 
 
 
312 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5188  thioredoxin  47.49 
 
 
302 aa  257  2e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1865  thioredoxin  49.66 
 
 
306 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.938725 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3272  thioredoxin  47.06 
 
 
326 aa  253  2.0000000000000002e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.315754  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2938  thioredoxin  44.08 
 
 
315 aa  253  2.0000000000000002e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2254  Thioredoxin domain  49.15 
 
 
338 aa  251  1e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.708544  normal  0.526752 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2127  thioredoxin domain-containing protein  45.33 
 
 
311 aa  248  1e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2208  Thioredoxin domain  47.99 
 
 
300 aa  247  2e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.210633  normal  0.190287 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0081  thioredoxin-related  43.04 
 
 
310 aa  246  3e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1312  thioredoxin  49.83 
 
 
302 aa  244  9.999999999999999e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.968155  hitchhiker  0.00158392 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2251  thioredoxin domain-containing protein  47.08 
 
 
302 aa  243  3e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.285443 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3284  thioredoxin  45.03 
 
 
320 aa  241  1e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2526  Thioredoxin domain  46.75 
 
 
302 aa  241  1e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0835  thioredoxin  49.31 
 
 
304 aa  239  4e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0466449 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0073  thioredoxin-related  44.84 
 
 
336 aa  236  3e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0246134 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0264  thioredoxin-related  44 
 
 
305 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.569758 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3045  thioredoxin  40.47 
 
 
330 aa  232  4.0000000000000004e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0893  thioredoxin  44.97 
 
 
324 aa  232  5e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0837  thioredoxin  44.3 
 
 
329 aa  231  1e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24068  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4590  thioredoxin  46.6 
 
 
304 aa  229  3e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.315091 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2792  thioredoxin  46.95 
 
 
307 aa  229  4e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.336164  normal  0.284427 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3775  thioredoxin  41.38 
 
 
324 aa  224  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.467472 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4099  thioredoxin  41.03 
 
 
324 aa  224  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.809641  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4245  thioredoxin  39.12 
 
 
334 aa  222  6e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.902531  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0266  thioredoxin  45.96 
 
 
301 aa  211  2e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3667  thioredoxin domain-containing protein  43.36 
 
 
298 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2665  thioredoxin-related  43.87 
 
 
303 aa  196  6e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0743  thioredoxin  41.96 
 
 
282 aa  192  7e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.328705  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3219  thioredoxin  40.91 
 
 
282 aa  191  9e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0516  thioredoxin  42.11 
 
 
282 aa  187  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.695523 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2485  thioredoxin  40.78 
 
 
282 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.194267 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2614  thioredoxin  40.78 
 
 
282 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3279  thioredoxin  37.54 
 
 
302 aa  178  1e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0318  thioredoxin  36.71 
 
 
287 aa  176  4e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5898  thioredoxin  39.01 
 
 
282 aa  175  7e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.769716  normal  0.516195 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2636  thioredoxin  39.3 
 
 
280 aa  175  8e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3931  thioredoxin  37.21 
 
 
302 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0730  thioredoxin  39.36 
 
 
282 aa  171  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2566  thioredoxin  38.65 
 
 
282 aa  170  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0198  thioredoxin  35.18 
 
 
326 aa  169  4e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1955  thioredoxin  38.65 
 
 
282 aa  169  6e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180401  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1547  thioredoxin  35.1 
 
 
302 aa  166  5e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  hitchhiker  0.00479598 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0661  thioredoxin domain-containing protein  38.87 
 
 
301 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0726  thioredoxin  36.36 
 
 
281 aa  165  8e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0681266  normal  0.772091 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0906  thioredoxin  38.87 
 
 
282 aa  165  9e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0903  thioredoxin  38.87 
 
 
282 aa  165  9e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1818  thioredoxin  38.11 
 
 
293 aa  164  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0314014 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2590  thioredoxin  39.44 
 
 
282 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282691  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1755  thioredoxin  34.39 
 
 
287 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0267329  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0719  thioredoxin  38.52 
 
 
282 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0060777  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0563  thioredoxin  36.59 
 
 
290 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0822  thioredoxin  34.63 
 
 
310 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.606093  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0796  thioredoxin  36.36 
 
 
281 aa  163  3e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0505807  normal  0.147714 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1041  thioredoxin  37.37 
 
 
289 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2527  thioredoxin  36.01 
 
 
293 aa  162  6e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4628  thioredoxin  32.47 
 
 
341 aa  161  1e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0779  putative thioredoxin protein  37.24 
 
 
280 aa  160  3e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.297357  decreased coverage  0.00262303 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0943  thioredoxin domain-containing protein  34.74 
 
 
286 aa  160  3e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1063  thioredoxin  38.6 
 
 
918 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.460797  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0510  thioredoxin  35.31 
 
 
290 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06670  Thioredoxin protein  36.71 
 
 
289 aa  157  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.697288  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0556  thioredoxin  35.31 
 
 
290 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0686  thioredoxin  34.62 
 
 
290 aa  157  3e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4466  thioredoxin  34.97 
 
 
290 aa  157  3e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11340  putative thioredoxin  37.72 
 
 
289 aa  156  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000384652  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4561  thioredoxin  33.89 
 
 
302 aa  155  6e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.712523  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1374  thioredoxin  34.95 
 
 
286 aa  155  8e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.187591  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0545  thioredoxin  34.62 
 
 
290 aa  155  9e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1307  thioredoxin  34.27 
 
 
286 aa  155  1e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.334323  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5023  thioredoxin  34.95 
 
 
290 aa  154  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.929168  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3035  thioredoxin-related  34.39 
 
 
274 aa  154  2e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0519  thioredoxin  37.1 
 
 
280 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2914  thioredoxin  36.01 
 
 
285 aa  151  1e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28500  thioredoxin  37.79 
 
 
299 aa  150  2e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.173246 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2102  thioredoxin  33.9 
 
 
291 aa  150  3e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2376  thioredoxin-related  35.92 
 
 
286 aa  150  4e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.036483  normal  0.757224 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1276  thioredoxin domain protein  34.01 
 
 
337 aa  149  5e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0664  Thioredoxin domain protein  36.11 
 
 
282 aa  149  7e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000362321  hitchhiker  0.00000255831 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3861  thioredoxin  35 
 
 
290 aa  149  8e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.339067  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3331  thioredoxin  30.88 
 
 
287 aa  148  1.0000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.108459  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0993  thioredoxin  33.94 
 
 
318 aa  147  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.766287 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3232  thioredoxin domain-containing protein  31.36 
 
 
285 aa  147  3e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.941804  normal  0.328637 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2125  thioredoxin  34.95 
 
 
286 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2469  thioredoxin  35.89 
 
 
289 aa  145  9e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.744001  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2848  thioredoxin, putative  35.89 
 
 
289 aa  145  9e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.126765  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0364  thioredoxin domain-containing protein  34.62 
 
 
312 aa  144  1e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000110184 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5094  thioredoxin  34.43 
 
 
306 aa  142  7e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.443129  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>