More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2422 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_2422  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 319 aa  612  9.999999999999999e-175  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1730  putative thioredoxin domain-containing protein  56.11 
 
 		 313 aa  310  2.9999999999999997e-83  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10300  thioredoxin domain-containing protein  57.14 
 
 		 313 aa  278  1e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1092  Thioredoxin domain protein  57.47 
 
 		 310 aa  267  1e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.509026  normal  0.582988 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2594  thioredoxin domain-containing protein  44.96 
 
 		 339 aa  239  2.9999999999999997e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.238157  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2327  thioredoxin domain protein  42.65 
 
 		 334 aa  220  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000128937 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1333  Thioredoxin domain protein  45.96 
 
 		 311 aa  216  2.9999999999999998e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1282  Thioredoxin domain  46.5 
 
 		 319 aa  200  1.9999999999999998e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00790933  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09500  thioredoxin domain-containing protein  41.45 
 
 		 346 aa  192  5e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.460116  normal  0.88242 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0139  hypothetical protein  34.52 
 
 		 340 aa  190  4e-47  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19060  thioredoxin domain-containing protein  43 
 
 		 299 aa  177  2e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.595284  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1117  thioredoxin-related protein  41.78 
 
 		 324 aa  176  6e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1276  thioredoxin domain protein  39.08 
 
 		 337 aa  175  8e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3886  Thioredoxin domain protein  38.08 
 
 		 312 aa  172  5e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.54182  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1804  thioredoxin domain-containing protein  43.48 
 
 		 314 aa  172  5.999999999999999e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08240  thioredoxin domain-containing protein  42.95 
 
 		 324 aa  168  1e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1704  thioredoxin domain protein  39.56 
 
 		 310 aa  168  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.143587 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0675  thioredoxin domain-containing protein  36.66 
 
 		 297 aa  155  1e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.357396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2392  putative thioredoxin  38.65 
 
 		 309 aa  150  3e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28500  thioredoxin  36.49 
 
 		 299 aa  149  5e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.173246 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3607  thioredoxin domain-containing protein  39.37 
 
 		 300 aa  145  6e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.150797 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1925  Thioredoxin domain-containing protein  35.69 
 
 		 299 aa  145  9e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0921  thioredoxin domain-containing protein  37.31 
 
 		 301 aa  142  7e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.460441 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3988  thioredoxin domain-containing protein  38.73 
 
 		 300 aa  142  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000709703 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6079  thioredoxin domain protein  40 
 
 		 326 aa  141  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0364  putative thioredoxin  35.33 
 
 		 320 aa  136  4e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.163537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2342  thioredoxin domain-containing protein  37.94 
 
 		 298 aa  135  9e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.299917  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1954  Thioredoxin domain protein  33.93 
 
 		 313 aa  132  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0686118  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4105  Thioredoxin domain protein  37.5 
 
 		 321 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.118303  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1268  Thioredoxin domain protein  38.67 
 
 		 323 aa  127  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3848  thioredoxin domain-containing protein  37.34 
 
 		 299 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00807359 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3862  thioredoxin domain-containing protein  37.34 
 
 		 299 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3936  thioredoxin domain-containing protein  37.34 
 
 		 299 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3683  thioredoxin-related  34.81 
 
 		 329 aa  115  8.999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.418332  normal  0.641891 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4303  thioredoxin domain-containing protein  37.54 
 
 		 297 aa  112  8.000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.408854  normal  0.611787 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1048  thioredoxin domain-containing protein  36.51 
 
 		 331 aa  110  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.157412  normal  0.991017 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11356  thioredoxin  31.96 
 
 		 304 aa  106  5e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000675127  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4099  thioredoxin  24.84 
 
 		 324 aa  100  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.809641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3711  thioredoxin-related  27.83 
 
 		 312 aa  99  9e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3775  thioredoxin  24.53 
 
 		 324 aa  99  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.467472 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4245  thioredoxin  26.03 
 
 		 334 aa  97.4  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.902531  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1818  thioredoxin  28.72 
 
 		 293 aa  95.5  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0314014 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3331  thioredoxin  28.87 
 
 		 287 aa  93.2  5e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.108459  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4590  thioredoxin  27.33 
 
 		 304 aa  92.4  8e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.315091 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2527  thioredoxin  29.31 
 
 		 293 aa  92  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0318  thioredoxin  32.33 
 
 		 287 aa  92  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0266  thioredoxin  31.85 
 
 		 301 aa  91.7  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1547  thioredoxin  28.99 
 
 		 302 aa  91.7  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  hitchhiker  0.00479598 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0796  thioredoxin  29.55 
 
 		 281 aa  89.4  8e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0505807  normal  0.147714 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00443  predicted thioredoxin domain-containing protein  28.62 
 
 		 284 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3118  Thioredoxin domain protein  28.62 
 
 		 284 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3124  thioredoxin domain-containing protein  28.62 
 
 		 284 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000112242 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0571  protein YbbN  28.62 
 
 		 284 aa  89  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0541  protein YbbN  28.62 
 
 		 284 aa  89  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0596  protein YbbN  28.62 
 
 		 284 aa  89  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0531  protein YbbN  28.62 
 
 		 284 aa  89  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.735174  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0568  thioredoxin domain protein  28.33 
 
 		 293 aa  88.6  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0427  protein YbbN  28.62 
 
 		 284 aa  89  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3232  thioredoxin domain-containing protein  26.73 
 
 		 285 aa  88.6  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.941804  normal  0.328637 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00448  hypothetical protein  28.62 
 
 		 284 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0886  putative thioredoxin protein  30.88 
 
 		 287 aa  87.8  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3195  Thioredoxin domain protein  43.81 
 
 		 286 aa  88.2  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.64186  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0612  thioredoxin domain-containing protein  28.33 
 
 		 293 aa  87.8  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.557632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0558  thioredoxin domain protein  28.33 
 
 		 293 aa  88.2  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0553  thioredoxin domain-containing protein  28.33 
 
 		 293 aa  87.8  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0943  thioredoxin domain-containing protein  32.19 
 
 		 286 aa  88.2  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0966  thioredoxin domain-containing protein  28.72 
 
 		 284 aa  86.7  4e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0726  thioredoxin  28.18 
 
 		 281 aa  86.7  5e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0681266  normal  0.772091 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0779  putative thioredoxin protein  28.87 
 
 		 280 aa  86.3  6e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.297357  decreased coverage  0.00262303 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3279  thioredoxin  42.31 
 
 		 302 aa  85.9  8e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0551  thioredoxin domain protein  27.99 
 
 		 293 aa  85.5  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0835  thioredoxin  25.6 
 
 		 304 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0466449 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4464  thioredoxin  26.95 
 
 		 302 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.980457  hitchhiker  0.00575685 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1155  thioredoxin domain-containing protein  29.73 
 
 		 294 aa  85.5  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.155818  hitchhiker  0.00000315771 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0845  hypothetical protein  27.08 
 
 		 282 aa  84.3  0.000000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1120  Thioredoxin domain protein  40.95 
 
 		 286 aa  85.1  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.597878  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3023  putative thioredoxin  28.52 
 
 		 289 aa  84  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3161  thioredoxin domain-containing protein  28.52 
 
 		 289 aa  84  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.324735  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1269  putative thioredoxin  28.52 
 
 		 289 aa  84  0.000000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.204367 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1041  thioredoxin  29.01 
 
 		 289 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1052  Thioredoxin domain protein  28.97 
 
 		 286 aa  83.6  0.000000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.846317  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4561  thioredoxin  41.35 
 
 		 302 aa  83.6  0.000000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.712523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3931  thioredoxin  41.35 
 
 		 302 aa  83.2  0.000000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0054  thioredoxin domain-containing protein  28.81 
 
 		 311 aa  82.4  0.000000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.621806 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3045  thioredoxin  25.91 
 
 		 330 aa  82.4  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0563  thioredoxin  27.72 
 
 		 290 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00581  Thioredoxin domain-containing protein  36.69 
 
 		 289 aa  80.5  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0664  Thioredoxin domain protein  40.57 
 
 		 282 aa  80.1  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000362321  hitchhiker  0.00000255831 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2371  thioredoxin domain-containing protein  29.8 
 
 		 303 aa  80.1  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.880736 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3007  Thioredoxin domain protein  39.05 
 
 		 286 aa  80.1  0.00000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0556  thioredoxin  28.57 
 
 		 290 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5188  thioredoxin  26.28 
 
 		 302 aa  79.7  0.00000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2376  thioredoxin-related  38.68 
 
 		 286 aa  79.7  0.00000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.036483  normal  0.757224 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1331  putative thioredoxin  27.46 
 
 		 285 aa  79.3  0.00000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11340  putative thioredoxin  30.51 
 
 		 289 aa  79.3  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000384652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2102  thioredoxin  30.34 
 
 		 291 aa  79  0.00000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0198  thioredoxin  28.38 
 
 		 326 aa  79  0.00000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2938  thioredoxin  24.84 
 
 		 315 aa  79  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2894  thioredoxin  27.27 
 
 		 304 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.225286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2254  Thioredoxin domain  26.5 
 
 		 338 aa  77.8  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.708544  normal  0.526752 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>