234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0364 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0364  putative thioredoxin  100 
 
 		 320 aa  630  1e-180  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.163537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2392  putative thioredoxin  53.12 
 
 		 309 aa  253  3e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1704  thioredoxin domain protein  41.85 
 
 		 310 aa  210  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.143587 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3886  Thioredoxin domain protein  42.25 
 
 		 312 aa  208  9e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.54182  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0921  thioredoxin domain-containing protein  43.22 
 
 		 301 aa  206  4e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.460441 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28500  thioredoxin  39.72 
 
 		 299 aa  185  8e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.173246 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6079  thioredoxin domain protein  40.43 
 
 		 326 aa  184  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1954  Thioredoxin domain protein  38.57 
 
 		 313 aa  166  6.9999999999999995e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0686118  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0675  thioredoxin domain-containing protein  34.97 
 
 		 297 aa  159  6e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.357396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1925  Thioredoxin domain-containing protein  36.79 
 
 		 299 aa  159  8e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1333  Thioredoxin domain protein  37.19 
 
 		 311 aa  152  5.9999999999999996e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1276  thioredoxin domain protein  34.74 
 
 		 337 aa  149  7e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1804  thioredoxin domain-containing protein  40.64 
 
 		 314 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3607  thioredoxin domain-containing protein  40 
 
 		 300 aa  146  4.0000000000000006e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.150797 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3988  thioredoxin domain-containing protein  39.19 
 
 		 300 aa  145  6e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000709703 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1092  Thioredoxin domain protein  39.18 
 
 		 310 aa  145  8.000000000000001e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.509026  normal  0.582988 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4105  Thioredoxin domain protein  41.07 
 
 		 321 aa  144  3e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.118303  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09500  thioredoxin domain-containing protein  37.71 
 
 		 346 aa  143  5e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.460116  normal  0.88242 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1730  putative thioredoxin domain-containing protein  37.11 
 
 		 313 aa  142  7e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2327  thioredoxin domain protein  37.81 
 
 		 334 aa  141  9.999999999999999e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000128937 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1282  Thioredoxin domain  41.18 
 
 		 319 aa  137  3.0000000000000003e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00790933  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2594  thioredoxin domain-containing protein  35.31 
 
 		 339 aa  133  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.238157  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1048  thioredoxin domain-containing protein  34.96 
 
 		 331 aa  128  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.157412  normal  0.991017 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2422  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.6 
 
 		 319 aa  124  3e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1268  Thioredoxin domain protein  33.55 
 
 		 323 aa  118  9.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10300  thioredoxin domain-containing protein  33.69 
 
 		 313 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3683  thioredoxin-related  34.04 
 
 		 329 aa  116  6e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.418332  normal  0.641891 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3098  thioredoxin  38.27 
 
 		 333 aa  115  7.999999999999999e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000000032408  hitchhiker  0.0000022841 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11356  thioredoxin  30.49 
 
 		 304 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000675127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2342  thioredoxin domain-containing protein  35.56 
 
 		 298 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.299917  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0139  hypothetical protein  31.97 
 
 		 340 aa  113  4.0000000000000004e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19060  thioredoxin domain-containing protein  35.79 
 
 		 299 aa  113  4.0000000000000004e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.595284  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3862  thioredoxin domain-containing protein  31.06 
 
 		 299 aa  109  5e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3936  thioredoxin domain-containing protein  31.06 
 
 		 299 aa  109  5e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3848  thioredoxin domain-containing protein  31.06 
 
 		 299 aa  109  5e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00807359 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4303  thioredoxin domain-containing protein  34.5 
 
 		 297 aa  102  9e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.408854  normal  0.611787 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08240  thioredoxin domain-containing protein  35.22 
 
 		 324 aa  93.2  5e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0422  thioredoxin-related  28.47 
 
 		 306 aa  86.3  6e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0318  thioredoxin  27.55 
 
 		 287 aa  85.5  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1818  thioredoxin  27.78 
 
 		 293 aa  85.5  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0314014 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2527  thioredoxin  27.4 
 
 		 293 aa  83.2  0.000000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1117  thioredoxin-related protein  29.62 
 
 		 324 aa  80.1  0.00000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0664  Thioredoxin domain protein  36.63 
 
 		 282 aa  78.2  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000362321  hitchhiker  0.00000255831 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3232  thioredoxin domain-containing protein  24.51 
 
 		 285 aa  76.3  0.0000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.941804  normal  0.328637 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4464  thioredoxin  27.65 
 
 		 302 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.980457  hitchhiker  0.00575685 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5188  thioredoxin  29.65 
 
 		 302 aa  73.2  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4245  thioredoxin  25.65 
 
 		 334 aa  72.8  0.000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.902531  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0560  Thioredoxin domain protein  25.59 
 
 		 272 aa  72.8  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3331  thioredoxin  25.77 
 
 		 287 aa  72.4  0.000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.108459  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0577  thioredoxin domain protein  25.59 
 
 		 272 aa  72.8  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0558  thioredoxin domain protein  28.24 
 
 		 293 aa  71.2  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1041  thioredoxin  27.4 
 
 		 289 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2914  thioredoxin  33.6 
 
 		 285 aa  70.5  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1305  thioredoxin  28.37 
 
 		 235 aa  70.5  0.00000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.277929  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0519  thioredoxin  29.72 
 
 		 280 aa  70.1  0.00000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0296  thioredoxin  24.84 
 
 		 306 aa  70.1  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0166723 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0266  thioredoxin  27.33 
 
 		 301 aa  69.3  0.00000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3775  thioredoxin  23.97 
 
 		 324 aa  68.9  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.467472 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0612  thioredoxin domain-containing protein  27.91 
 
 		 293 aa  68.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.557632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0568  thioredoxin domain protein  27.91 
 
 		 293 aa  68.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1374  thioredoxin  27.72 
 
 		 286 aa  68.9  0.0000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.187591  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4099  thioredoxin  23.97 
 
 		 324 aa  68.9  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.809641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3045  thioredoxin  26.35 
 
 		 330 aa  68.9  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0553  thioredoxin domain-containing protein  27.91 
 
 		 293 aa  68.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1307  thioredoxin  26.99 
 
 		 286 aa  67.8  0.0000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.334323  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0551  thioredoxin domain protein  27.91 
 
 		 293 aa  68.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3035  thioredoxin-related  26.95 
 
 		 274 aa  67.8  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6432  thioredoxin  36.52 
 
 		 160 aa  67.4  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.432921 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0268  thioredoxin  25.89 
 
 		 306 aa  66.6  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.223768  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1269  putative thioredoxin  26.42 
 
 		 289 aa  66.2  0.0000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.204367 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0556  thioredoxin  26.37 
 
 		 290 aa  66.2  0.0000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3023  putative thioredoxin  26.42 
 
 		 289 aa  66.2  0.0000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3161  thioredoxin domain-containing protein  26.42 
 
 		 289 aa  66.2  0.0000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.324735  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1467  thioredoxin  23.38 
 
 		 268 aa  66.2  0.0000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1155  thioredoxin domain-containing protein  27.97 
 
 		 294 aa  65.9  0.0000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.155818  hitchhiker  0.00000315771 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06670  Thioredoxin protein  28.14 
 
 		 289 aa  65.9  0.0000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.697288  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0686  thioredoxin  24.91 
 
 		 290 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3284  thioredoxin  27.74 
 
 		 320 aa  65.1  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0456  thioredoxin  24.44 
 
 		 306 aa  65.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.666195  normal  0.0589835 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0541  protein YbbN  27.78 
 
 		 284 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11340  putative thioredoxin  25.77 
 
 		 289 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000384652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0571  protein YbbN  27.78 
 
 		 284 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0596  protein YbbN  27.78 
 
 		 284 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0531  protein YbbN  27.78 
 
 		 284 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.735174  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0427  protein YbbN  27.78 
 
 		 284 aa  65.9  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0796  thioredoxin  25.18 
 
 		 281 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0505807  normal  0.147714 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0198  thioredoxin  25.94 
 
 		 326 aa  63.9  0.000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00581  Thioredoxin domain-containing protein  25.26 
 
 		 289 aa  63.5  0.000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4628  thioredoxin  24.17 
 
 		 341 aa  63.2  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1547  thioredoxin  26.4 
 
 		 302 aa  63.2  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  hitchhiker  0.00479598 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00443  predicted thioredoxin domain-containing protein  27.43 
 
 		 284 aa  63.2  0.000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3118  Thioredoxin domain protein  27.43 
 
 		 284 aa  63.2  0.000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3124  thioredoxin domain-containing protein  27.43 
 
 		 284 aa  63.2  0.000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000112242 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01872  thioredoxin  25.17 
 
 		 285 aa  63.2  0.000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00448  hypothetical protein  27.43 
 
 		 284 aa  63.2  0.000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0510  thioredoxin  26.12 
 
 		 290 aa  63.2  0.000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0943  thioredoxin domain-containing protein  26.19 
 
 		 286 aa  62.8  0.000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0035  thioredoxin domain protein  26.57 
 
 		 303 aa  62.8  0.000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000613737 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2636  thioredoxin  27.52 
 
 		 280 aa  62.8  0.000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1452  thioredoxin  29.36 
 
 		 272 aa  62.4  0.000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>