More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1452 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1452  thioredoxin  100 
 
 		 272 aa  551  1e-156  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1038  thioredoxin  44.4 
 
 		 277 aa  226  3e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2614  thioredoxin family protein  40.44 
 
 		 271 aa  205  5e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1093  thioredoxin  36.67 
 
 		 268 aa  204  2e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0251638  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0979  thioredoxin domain-containing protein  39.69 
 
 		 263 aa  203  2e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.248497  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1467  thioredoxin  37.88 
 
 		 268 aa  192  3e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1199  thioredoxin  39.63 
 
 		 268 aa  189  2.9999999999999997e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0450617 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1229  thioredoxin  37.23 
 
 		 268 aa  177  1e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.223518 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0265  thioredoxin  61.39 
 
 		 110 aa  149  7e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.28448  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1818  thioredoxin  32.99 
 
 		 293 aa  144  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0314014 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1755  thioredoxin  34.93 
 
 		 287 aa  142  7e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0267329  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2848  thioredoxin, putative  32.62 
 
 		 289 aa  142  8e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.126765  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2469  thioredoxin  32.62 
 
 		 289 aa  142  8e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.744001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0545  thioredoxin  34.53 
 
 		 290 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0510  thioredoxin  34.17 
 
 		 290 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0822  thioredoxin  33.33 
 
 		 310 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.606093  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3035  thioredoxin-related  34.44 
 
 		 274 aa  140  3e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0556  thioredoxin  34.56 
 
 		 290 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2636  thioredoxin  33.69 
 
 		 280 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0318  thioredoxin  33.94 
 
 		 287 aa  139  3.9999999999999997e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0664  Thioredoxin domain protein  39.77 
 
 		 282 aa  139  4.999999999999999e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000362321  hitchhiker  0.00000255831 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0563  thioredoxin  34.17 
 
 		 290 aa  139  6e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2527  thioredoxin  33.1 
 
 		 293 aa  139  7e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0519  thioredoxin  34.72 
 
 		 280 aa  137  1e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2864  thioredoxin domain-containing protein  31.03 
 
 		 272 aa  138  1e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.499317  normal  0.13279 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5898  thioredoxin  33.22 
 
 		 282 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.769716  normal  0.516195 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2125  thioredoxin  35.07 
 
 		 286 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2376  thioredoxin-related  34.62 
 
 		 286 aa  136  4e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.036483  normal  0.757224 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3232  thioredoxin domain-containing protein  32.17 
 
 		 285 aa  136  4e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.941804  normal  0.328637 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0675  thioredoxin domain-containing protein  42.68 
 
 		 297 aa  136  4e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.357396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1547  thioredoxin  35.69 
 
 		 302 aa  135  5e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  hitchhiker  0.00479598 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3279  thioredoxin  37.59 
 
 		 302 aa  135  5e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2102  thioredoxin  32.83 
 
 		 291 aa  134  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1535  thioredoxin  29.37 
 
 		 269 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000141662  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4466  thioredoxin  32.22 
 
 		 290 aa  133  3e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3931  thioredoxin  37.59 
 
 		 302 aa  133  3e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2485  thioredoxin  33.92 
 
 		 282 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.194267 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0686  thioredoxin  32.35 
 
 		 290 aa  132  5e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0943  thioredoxin domain-containing protein  42.67 
 
 		 286 aa  132  6.999999999999999e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3219  thioredoxin  47.14 
 
 		 282 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0743  thioredoxin  47.14 
 
 		 282 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.328705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2614  thioredoxin  34.62 
 
 		 282 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0730  thioredoxin  34.27 
 
 		 282 aa  132  9e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5023  thioredoxin  31.69 
 
 		 290 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.929168  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3331  thioredoxin  30.11 
 
 		 287 aa  131  1.0000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.108459  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3861  thioredoxin  30.99 
 
 		 290 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.339067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0726  thioredoxin  47.1 
 
 		 281 aa  130  3e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0681266  normal  0.772091 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2566  thioredoxin  36.21 
 
 		 282 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3886  Thioredoxin domain protein  42.94 
 
 		 312 aa  129  6e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.54182  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2590  thioredoxin  55.66 
 
 		 282 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1955  thioredoxin  55.66 
 
 		 282 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180401  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0796  thioredoxin  46.38 
 
 		 281 aa  128  8.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0505807  normal  0.147714 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0603  thioredoxin domain-containing protein  29.96 
 
 		 287 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0802586  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0516  thioredoxin  45.71 
 
 		 282 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.695523 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0906  thioredoxin  53.7 
 
 		 282 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0903  thioredoxin  53.7 
 
 		 282 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0661  thioredoxin domain-containing protein  52.78 
 
 		 301 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0719  thioredoxin  53.7 
 
 		 282 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0060777  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11340  putative thioredoxin  30.21 
 
 		 289 aa  125  5e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000384652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0560  Thioredoxin domain protein  27.07 
 
 		 272 aa  125  7e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0577  thioredoxin domain protein  27.07 
 
 		 272 aa  125  7e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4561  thioredoxin  55.34 
 
 		 302 aa  125  8.000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.712523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1063  thioredoxin  53.85 
 
 		 918 aa  125  9e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.460797  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1041  thioredoxin  30.9 
 
 		 289 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00581  Thioredoxin domain-containing protein  41.38 
 
 		 289 aa  124  1e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01872  thioredoxin  34.66 
 
 		 285 aa  124  2e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3775  thioredoxin  32.98 
 
 		 324 aa  123  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.467472 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0779  putative thioredoxin protein  48.21 
 
 		 280 aa  123  3e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.297357  decreased coverage  0.00262303 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1331  putative thioredoxin  30.22 
 
 		 285 aa  123  3e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4099  thioredoxin  32.98 
 
 		 324 aa  123  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.809641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0198  thioredoxin  36 
 
 		 326 aa  122  7e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1048  thioredoxin domain-containing protein  46.62 
 
 		 331 aa  122  7e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.157412  normal  0.991017 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3683  thioredoxin-related  51 
 
 		 329 aa  121  9.999999999999999e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.418332  normal  0.641891 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28500  thioredoxin  52.04 
 
 		 299 aa  120  1.9999999999999998e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.173246 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3045  thioredoxin  31.14 
 
 		 330 aa  120  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5272  Thioredoxin domain protein  28.52 
 
 		 272 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.127007 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1595  thioredoxin  29.32 
 
 		 287 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.385204  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2914  thioredoxin  51.43 
 
 		 285 aa  119  3.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0993  thioredoxin  51.46 
 
 		 318 aa  118  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.766287 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3583  thioredoxin  54.74 
 
 		 149 aa  117  3e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.029416  normal  0.0374075 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4628  thioredoxin  51 
 
 		 341 aa  116  5e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1954  Thioredoxin domain protein  39.13 
 
 		 313 aa  115  6.9999999999999995e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0686118  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4105  Thioredoxin domain protein  50 
 
 		 321 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.118303  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06670  Thioredoxin protein  29.86 
 
 		 289 aa  114  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.697288  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1276  thioredoxin domain protein  48.6 
 
 		 337 aa  113  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3472  thioredoxin  46.79 
 
 		 246 aa  113  4.0000000000000004e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.110554  normal  0.0143649 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0294  putative thioredoxin protein  30.77 
 
 		 314 aa  112  5e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.918989  normal  0.0369237 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0364  thioredoxin domain-containing protein  43.93 
 
 		 312 aa  112  9e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000110184 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3284  thioredoxin  30.51 
 
 		 320 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4464  thioredoxin  40.4 
 
 		 302 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.980457  hitchhiker  0.00575685 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3988  thioredoxin domain-containing protein  50 
 
 		 300 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000709703 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5094  thioredoxin  47.17 
 
 		 306 aa  110  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.443129  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3607  thioredoxin domain-containing protein  50 
 
 		 300 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.150797 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0422  thioredoxin-related  38.99 
 
 		 306 aa  110  4.0000000000000004e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0156  thioredoxin  47.96 
 
 		 106 aa  109  5e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.534304 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0893  thioredoxin  31.54 
 
 		 324 aa  109  6e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1150  thioredoxin  46 
 
 		 109 aa  108  8.000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000755865  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4245  thioredoxin  28.52 
 
 		 334 aa  108  9.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.902531  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2606  putative thioredoxin-like protein  47.12 
 
 		 136 aa  108  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.888104  normal  0.656305 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1052  Thioredoxin domain protein  30.11 
 
 		 286 aa  108  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.846317  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>