More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1093 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1093  thioredoxin  100 
 
 		 268 aa  551  1e-156  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0251638  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0979  thioredoxin domain-containing protein  57.47 
 
 		 263 aa  315  5e-85  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.248497  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1199  thioredoxin  54.85 
 
 		 268 aa  301  8.000000000000001e-81  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0450617 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1229  thioredoxin  57.09 
 
 		 268 aa  296  2e-79  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.223518 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1467  thioredoxin  52.61 
 
 		 268 aa  293  2e-78  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1038  thioredoxin  49.25 
 
 		 277 aa  257  1e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2614  thioredoxin family protein  42.96 
 
 		 271 aa  230  2e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1452  thioredoxin  36.67 
 
 		 272 aa  191  1e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0664  Thioredoxin domain protein  32.71 
 
 		 282 aa  152  5e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000362321  hitchhiker  0.00000255831 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1535  thioredoxin  34.35 
 
 		 269 aa  151  1e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000141662  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3232  thioredoxin domain-containing protein  31.41 
 
 		 285 aa  150  2e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.941804  normal  0.328637 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0822  thioredoxin  32.26 
 
 		 310 aa  149  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.606093  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1818  thioredoxin  31.02 
 
 		 293 aa  149  4e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0314014 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2527  thioredoxin  31.09 
 
 		 293 aa  144  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2636  thioredoxin  32.36 
 
 		 280 aa  144  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3035  thioredoxin-related  32.25 
 
 		 274 aa  143  3e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2469  thioredoxin  32.61 
 
 		 289 aa  142  8e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.744001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2848  thioredoxin, putative  32.61 
 
 		 289 aa  142  8e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.126765  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0318  thioredoxin  30.71 
 
 		 287 aa  141  9e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0686  thioredoxin  30.77 
 
 		 290 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1041  thioredoxin  31.56 
 
 		 289 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0265  thioredoxin  57.28 
 
 		 110 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.28448  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0779  putative thioredoxin protein  32.62 
 
 		 280 aa  137  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.297357  decreased coverage  0.00262303 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11340  putative thioredoxin  30.5 
 
 		 289 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000384652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2125  thioredoxin  32.14 
 
 		 286 aa  136  4e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3775  thioredoxin  31.23 
 
 		 324 aa  135  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.467472 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3861  thioredoxin  30.9 
 
 		 290 aa  135  8e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.339067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0519  thioredoxin  31.71 
 
 		 280 aa  135  8e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5898  thioredoxin  30.96 
 
 		 282 aa  133  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.769716  normal  0.516195 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0906  thioredoxin  31.32 
 
 		 282 aa  133  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0903  thioredoxin  31.32 
 
 		 282 aa  133  3e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0661  thioredoxin domain-containing protein  31.32 
 
 		 301 aa  133  3e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2485  thioredoxin  30.6 
 
 		 282 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.194267 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2614  thioredoxin  30.6 
 
 		 282 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0796  thioredoxin  31.52 
 
 		 281 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0505807  normal  0.147714 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4099  thioredoxin  31.12 
 
 		 324 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.809641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0726  thioredoxin  31.48 
 
 		 281 aa  129  6e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0681266  normal  0.772091 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0719  thioredoxin  32.03 
 
 		 282 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0060777  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4466  thioredoxin  30.58 
 
 		 290 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1063  thioredoxin  31.32 
 
 		 918 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.460797  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0730  thioredoxin  31.47 
 
 		 282 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5023  thioredoxin  31.34 
 
 		 290 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.929168  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1755  thioredoxin  29.39 
 
 		 287 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0267329  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0837  thioredoxin  32.19 
 
 		 329 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24068  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4245  thioredoxin  30.56 
 
 		 334 aa  126  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.902531  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4464  thioredoxin  30.36 
 
 		 302 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.980457  hitchhiker  0.00575685 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3045  thioredoxin  31.12 
 
 		 330 aa  125  5e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0893  thioredoxin  31.85 
 
 		 324 aa  125  8.000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2864  thioredoxin domain-containing protein  30.08 
 
 		 272 aa  125  8.000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.499317  normal  0.13279 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5188  thioredoxin  31.12 
 
 		 302 aa  124  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0563  thioredoxin  29.12 
 
 		 290 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0510  thioredoxin  29.12 
 
 		 290 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2590  thioredoxin  30.6 
 
 		 282 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282691  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06670  Thioredoxin protein  31.14 
 
 		 289 aa  123  3e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.697288  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2566  thioredoxin  30.56 
 
 		 282 aa  123  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1955  thioredoxin  30.96 
 
 		 282 aa  123  4e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180401  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0556  thioredoxin  29.68 
 
 		 290 aa  122  5e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0577  thioredoxin domain protein  25.64 
 
 		 272 aa  122  5e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0545  thioredoxin  28.17 
 
 		 290 aa  122  5e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0560  Thioredoxin domain protein  25.64 
 
 		 272 aa  122  5e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3219  thioredoxin  30.14 
 
 		 282 aa  122  6e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0743  thioredoxin  29.79 
 
 		 282 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.328705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1982  thioredoxin  29.23 
 
 		 317 aa  121  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00653306  normal  0.106397 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0516  thioredoxin  29.82 
 
 		 282 aa  120  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.695523 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0456  thioredoxin  29.72 
 
 		 306 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.666195  normal  0.0589835 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3272  thioredoxin  29.41 
 
 		 326 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.315754  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0603  thioredoxin domain-containing protein  30.25 
 
 		 287 aa  119  6e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0802586  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0268  thioredoxin  30.31 
 
 		 306 aa  119  7e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.223768  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2102  thioredoxin  29.51 
 
 		 291 aa  118  9e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4590  thioredoxin  30.63 
 
 		 304 aa  118  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.315091 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5272  Thioredoxin domain protein  29.37 
 
 		 272 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.127007 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2376  thioredoxin-related  29.23 
 
 		 286 aa  116  3e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.036483  normal  0.757224 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1312  thioredoxin  29.55 
 
 		 302 aa  115  6e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.968155  hitchhiker  0.00158392 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1865  thioredoxin  31.1 
 
 		 306 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.938725 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0296  thioredoxin  29.72 
 
 		 306 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0166723 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0675  thioredoxin domain-containing protein  28.78 
 
 		 297 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.357396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3331  thioredoxin  26.79 
 
 		 287 aa  112  5e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.108459  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0835  thioredoxin  39.35 
 
 		 304 aa  112  6e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0466449 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3284  thioredoxin  29.49 
 
 		 320 aa  112  6e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1547  thioredoxin  28.25 
 
 		 302 aa  111  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  hitchhiker  0.00479598 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01872  thioredoxin  29.6 
 
 		 285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28500  thioredoxin  36.97 
 
 		 299 aa  110  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.173246 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0081  thioredoxin-related  29.21 
 
 		 310 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1374  thioredoxin  31.41 
 
 		 286 aa  110  3e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.187591  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0886  putative thioredoxin protein  29.82 
 
 		 287 aa  108  9.000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1331  putative thioredoxin  35.06 
 
 		 285 aa  107  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3607  thioredoxin domain-containing protein  48.42 
 
 		 300 aa  107  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.150797 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1307  thioredoxin  31.41 
 
 		 286 aa  107  2e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.334323  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3711  thioredoxin-related  27.72 
 
 		 312 aa  107  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3683  thioredoxin-related  42.27 
 
 		 329 aa  107  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.418332  normal  0.641891 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2938  thioredoxin  29.79 
 
 		 315 aa  107  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3472  thioredoxin  30.83 
 
 		 246 aa  106  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.110554  normal  0.0143649 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0306  putative thioredoxin  28.67 
 
 		 305 aa  106  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.351153 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3988  thioredoxin domain-containing protein  47.37 
 
 		 300 aa  106  5e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000709703 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7798  thioredoxin  48.28 
 
 		 146 aa  104  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.449565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0264  thioredoxin-related  28.07 
 
 		 305 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.569758 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3582  thioredoxin  46.3 
 
 		 107 aa  105  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.968394  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3279  thioredoxin  26.49 
 
 		 302 aa  104  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0943  thioredoxin domain-containing protein  26.91 
 
 		 286 aa  103  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  46.32 
 
 		 107 aa  103  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>