More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0265 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0265  thioredoxin  100 
 
 		 110 aa  226  1e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.28448  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1038  thioredoxin  68.63 
 
 		 277 aa  157  5e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1452  thioredoxin  61.39 
 
 		 272 aa  148  3e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1818  thioredoxin  63.46 
 
 		 293 aa  147  6e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0314014 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2527  thioredoxin  64.65 
 
 		 293 aa  142  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0979  thioredoxin domain-containing protein  64.08 
 
 		 263 aa  141  4e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.248497  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0822  thioredoxin  58.82 
 
 		 310 aa  140  8e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.606093  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0664  Thioredoxin domain protein  55.77 
 
 		 282 aa  140  8e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000362321  hitchhiker  0.00000255831 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1093  thioredoxin  57.28 
 
 		 268 aa  139  9.999999999999999e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0251638  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2614  thioredoxin family protein  60.4 
 
 		 271 aa  134  3.0000000000000003e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2636  thioredoxin  58.42 
 
 		 280 aa  134  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2848  thioredoxin, putative  59.41 
 
 		 289 aa  134  5e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.126765  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2469  thioredoxin  59.41 
 
 		 289 aa  134  5e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.744001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1229  thioredoxin  57.28 
 
 		 268 aa  132  9.999999999999999e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.223518 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0779  putative thioredoxin protein  56.86 
 
 		 280 aa  131  3.9999999999999996e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.297357  decreased coverage  0.00262303 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0519  thioredoxin  59.8 
 
 		 280 aa  130  5e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0726  thioredoxin  54.9 
 
 		 281 aa  128  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0681266  normal  0.772091 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3232  thioredoxin domain-containing protein  56.57 
 
 		 285 aa  129  2.0000000000000002e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.941804  normal  0.328637 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1467  thioredoxin  57.58 
 
 		 268 aa  128  3e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0796  thioredoxin  53.92 
 
 		 281 aa  128  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0505807  normal  0.147714 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0730  thioredoxin  54.46 
 
 		 282 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0661  thioredoxin domain-containing protein  55.88 
 
 		 301 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0903  thioredoxin  55.88 
 
 		 282 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0906  thioredoxin  55.88 
 
 		 282 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2485  thioredoxin  54.46 
 
 		 282 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.194267 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0516  thioredoxin  57 
 
 		 282 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.695523 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2614  thioredoxin  54.46 
 
 		 282 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1535  thioredoxin  56.57 
 
 		 269 aa  125  1.0000000000000001e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000141662  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5898  thioredoxin  55.45 
 
 		 282 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.769716  normal  0.516195 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0318  thioredoxin  54.81 
 
 		 287 aa  124  3e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3219  thioredoxin  55 
 
 		 282 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0719  thioredoxin  54.9 
 
 		 282 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0060777  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0743  thioredoxin  55 
 
 		 282 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.328705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2376  thioredoxin-related  55.88 
 
 		 286 aa  124  5e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.036483  normal  0.757224 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2590  thioredoxin  55.56 
 
 		 282 aa  124  6e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1955  thioredoxin  55.56 
 
 		 282 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180401  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2566  thioredoxin  55.56 
 
 		 282 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1063  thioredoxin  55.88 
 
 		 918 aa  123  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.460797  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1547  thioredoxin  54.46 
 
 		 302 aa  122  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  hitchhiker  0.00479598 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28500  thioredoxin  58.33 
 
 		 299 aa  122  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.173246 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1199  thioredoxin  51.49 
 
 		 268 aa  122  2e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0450617 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4561  thioredoxin  55.45 
 
 		 302 aa  120  5e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.712523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0675  thioredoxin domain-containing protein  53.12 
 
 		 297 aa  120  6e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.357396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1755  thioredoxin  54.08 
 
 		 287 aa  120  7e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0267329  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3279  thioredoxin  53.47 
 
 		 302 aa  120  8e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2125  thioredoxin  50.98 
 
 		 286 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3931  thioredoxin  52.48 
 
 		 302 aa  117  3.9999999999999996e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1305  thioredoxin  52.53 
 
 		 235 aa  117  4.9999999999999996e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.277929  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3035  thioredoxin-related  50 
 
 		 274 aa  117  7e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3331  thioredoxin  48.04 
 
 		 287 aa  117  7e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.108459  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2914  thioredoxin  51.55 
 
 		 285 aa  115  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1312  thioredoxin  50.51 
 
 		 302 aa  115  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.968155  hitchhiker  0.00158392 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0893  thioredoxin  50.51 
 
 		 324 aa  115  1.9999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4099  thioredoxin  50.5 
 
 		 324 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.809641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0198  thioredoxin  50.51 
 
 		 326 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3775  thioredoxin  50.5 
 
 		 324 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.467472 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0943  thioredoxin domain-containing protein  48.11 
 
 		 286 aa  115  1.9999999999999998e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3472  thioredoxin  55.56 
 
 		 246 aa  115  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.110554  normal  0.0143649 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2102  thioredoxin  50.96 
 
 		 291 aa  115  3e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3861  thioredoxin  50 
 
 		 290 aa  115  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.339067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0993  thioredoxin  50.5 
 
 		 318 aa  114  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.766287 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0686  thioredoxin  46.53 
 
 		 290 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0603  thioredoxin domain-containing protein  49.02 
 
 		 287 aa  114  3.9999999999999997e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0802586  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3284  thioredoxin  49.49 
 
 		 320 aa  114  5e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4245  thioredoxin  48.51 
 
 		 334 aa  114  6e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.902531  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0621  thioredoxin  52.04 
 
 		 108 aa  114  6e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000184635  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3241  thioredoxin  51.02 
 
 		 107 aa  113  6.9999999999999995e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0294  putative thioredoxin protein  49.04 
 
 		 314 aa  113  6.9999999999999995e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.918989  normal  0.0369237 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0837  thioredoxin  49.49 
 
 		 329 aa  113  7.999999999999999e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24068  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01872  thioredoxin  51.52 
 
 		 285 aa  113  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  45.92 
 
 		 107 aa  112  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3022  thioredoxin  48.98 
 
 		 108 aa  113  1.0000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  47.96 
 
 		 107 aa  112  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2938  thioredoxin  51.04 
 
 		 315 aa  112  2.0000000000000002e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0560  Thioredoxin domain protein  48.96 
 
 		 272 aa  111  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0364  thioredoxin domain-containing protein  49.51 
 
 		 312 aa  111  3e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000110184 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  46.94 
 
 		 107 aa  111  3e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0577  thioredoxin domain protein  48.96 
 
 		 272 aa  111  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1982  thioredoxin  47.57 
 
 		 317 aa  111  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00653306  normal  0.106397 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1865  thioredoxin  49.51 
 
 		 306 aa  110  4.0000000000000004e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.938725 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3582  thioredoxin  48.98 
 
 		 107 aa  111  4.0000000000000004e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.968394  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3500  thioredoxin  47 
 
 		 107 aa  111  4.0000000000000004e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0510  thioredoxin  48.54 
 
 		 290 aa  110  5e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0563  thioredoxin  48.54 
 
 		 290 aa  110  5e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3045  thioredoxin  45.54 
 
 		 330 aa  110  5e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5023  thioredoxin  49.06 
 
 		 290 aa  110  5e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.929168  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0835  thioredoxin  48.48 
 
 		 304 aa  110  5e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0466449 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0156  thioredoxin  50.53 
 
 		 106 aa  110  5e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.534304 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0556  thioredoxin  48.54 
 
 		 290 aa  110  5e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0373  thioredoxin  51.06 
 
 		 105 aa  110  5e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3378  thioredoxin  50 
 
 		 107 aa  110  5e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5188  thioredoxin  45.63 
 
 		 302 aa  110  6e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1048  thioredoxin domain-containing protein  51.04 
 
 		 331 aa  110  6e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.157412  normal  0.991017 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0545  thioredoxin  48.54 
 
 		 290 aa  110  6e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4464  thioredoxin  45.63 
 
 		 302 aa  110  7.000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.980457  hitchhiker  0.00575685 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3988  thioredoxin domain-containing protein  53.68 
 
 		 300 aa  110  7.000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000709703 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0813  thioredoxin  45.92 
 
 		 109 aa  110  8.000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1331  putative thioredoxin  48.54 
 
 		 285 aa  110  8.000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  45.92 
 
 		 107 aa  110  9e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4628  thioredoxin  48.45 
 
 		 341 aa  110  9e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>