More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2864 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_2864  thioredoxin domain-containing protein  100 
 
 
272 aa  556  1e-157  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.499317  normal  0.13279 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5272  Thioredoxin domain protein  54.28 
 
 
272 aa  316  3e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.127007 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0560  Thioredoxin domain protein  50.55 
 
 
272 aa  297  1e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0577  thioredoxin domain protein  50.55 
 
 
272 aa  297  1e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1535  thioredoxin  44.91 
 
 
269 aa  237  2e-61  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000141662  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1038  thioredoxin  32.82 
 
 
277 aa  153  4e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0979  thioredoxin domain-containing protein  31.68 
 
 
263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.248497  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0318  thioredoxin  31.8 
 
 
287 aa  144  2e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2125  thioredoxin  33.81 
 
 
286 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3232  thioredoxin domain-containing protein  33.09 
 
 
285 aa  140  3e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.941804  normal  0.328637 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3035  thioredoxin-related  29.67 
 
 
274 aa  139  4.999999999999999e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2527  thioredoxin  31.36 
 
 
293 aa  139  4.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1755  thioredoxin  32.27 
 
 
287 aa  138  8.999999999999999e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0267329  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2469  thioredoxin  32.51 
 
 
289 aa  138  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.744001  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2848  thioredoxin, putative  32.51 
 
 
289 aa  138  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.126765  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0603  thioredoxin domain-containing protein  32.27 
 
 
287 aa  137  2e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0802586  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1818  thioredoxin  31.12 
 
 
293 aa  132  6e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0314014 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1041  thioredoxin  30.85 
 
 
289 aa  132  6e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11340  putative thioredoxin  31.21 
 
 
289 aa  132  6e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000384652  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2614  thioredoxin family protein  29.92 
 
 
271 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0686  thioredoxin  29.82 
 
 
290 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1452  thioredoxin  31.03 
 
 
272 aa  129  4.0000000000000003e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0664  Thioredoxin domain protein  30.77 
 
 
282 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000362321  hitchhiker  0.00000255831 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2102  thioredoxin  30.96 
 
 
291 aa  129  7.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0822  thioredoxin  31.5 
 
 
310 aa  129  8.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.606093  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0943  thioredoxin domain-containing protein  29.54 
 
 
286 aa  128  1.0000000000000001e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0545  thioredoxin  30.66 
 
 
290 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2376  thioredoxin-related  32.17 
 
 
286 aa  126  5e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.036483  normal  0.757224 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0510  thioredoxin  29.97 
 
 
290 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1093  thioredoxin  30.08 
 
 
268 aa  125  9e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0251638  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1467  thioredoxin  30.68 
 
 
268 aa  124  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0519  thioredoxin  29.6 
 
 
280 aa  124  1e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2636  thioredoxin  32 
 
 
280 aa  124  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0563  thioredoxin  30.28 
 
 
290 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3861  thioredoxin  30.32 
 
 
290 aa  124  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.339067  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1229  thioredoxin  29.37 
 
 
268 aa  123  4e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.223518 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1199  thioredoxin  32.82 
 
 
268 aa  122  6e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0450617 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1595  thioredoxin  31.8 
 
 
287 aa  122  8e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.385204  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06670  Thioredoxin protein  30.5 
 
 
289 aa  121  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.697288  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1547  thioredoxin  30.36 
 
 
302 aa  120  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  hitchhiker  0.00479598 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0556  thioredoxin  29.58 
 
 
290 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0730  thioredoxin  30.43 
 
 
282 aa  120  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3331  thioredoxin  27.37 
 
 
287 aa  120  3e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.108459  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5898  thioredoxin  30.43 
 
 
282 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.769716  normal  0.516195 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2485  thioredoxin  30.43 
 
 
282 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.194267 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2614  thioredoxin  30.43 
 
 
282 aa  119  7e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4466  thioredoxin  30.22 
 
 
290 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01872  thioredoxin  33.33 
 
 
285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1374  thioredoxin  33.22 
 
 
286 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.187591  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1307  thioredoxin  32.51 
 
 
286 aa  116  3e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.334323  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5023  thioredoxin  28.82 
 
 
290 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.929168  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2590  thioredoxin  31.16 
 
 
282 aa  115  5e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282691  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0268  thioredoxin  27.21 
 
 
306 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.223768  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4245  thioredoxin  27.62 
 
 
334 aa  114  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.902531  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1955  thioredoxin  30.43 
 
 
282 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180401  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4099  thioredoxin  27.18 
 
 
324 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.809641  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2566  thioredoxin  30.43 
 
 
282 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3284  thioredoxin  27.37 
 
 
320 aa  113  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3045  thioredoxin  27.02 
 
 
330 aa  112  4.0000000000000004e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3775  thioredoxin  27.5 
 
 
324 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.467472 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0893  thioredoxin  26.04 
 
 
324 aa  112  5e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3886  Thioredoxin domain protein  28.28 
 
 
312 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.54182  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0837  thioredoxin  26.04 
 
 
329 aa  111  1.0000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24068  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0779  putative thioredoxin protein  30.18 
 
 
280 aa  110  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.297357  decreased coverage  0.00262303 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0835  thioredoxin  29.75 
 
 
304 aa  110  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0466449 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3931  thioredoxin  29.63 
 
 
302 aa  110  3e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3279  thioredoxin  29.63 
 
 
302 aa  109  5e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0456  thioredoxin  25.8 
 
 
306 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.666195  normal  0.0589835 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0675  thioredoxin domain-containing protein  25.09 
 
 
297 aa  108  8.000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.357396  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3219  thioredoxin  28.99 
 
 
282 aa  108  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0886  putative thioredoxin protein  29.78 
 
 
287 aa  108  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0661  thioredoxin domain-containing protein  29.54 
 
 
301 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0906  thioredoxin  29.54 
 
 
282 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0296  thioredoxin  26.15 
 
 
306 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0166723 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1331  putative thioredoxin  27.66 
 
 
285 aa  107  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0903  thioredoxin  29.54 
 
 
282 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2127  thioredoxin domain-containing protein  28.04 
 
 
311 aa  107  3e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3683  thioredoxin-related  46.6 
 
 
329 aa  107  3e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.418332  normal  0.641891 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0198  thioredoxin  27.33 
 
 
326 aa  106  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5188  thioredoxin  25.71 
 
 
302 aa  107  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0516  thioredoxin  29.39 
 
 
282 aa  106  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.695523 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2914  thioredoxin  50 
 
 
285 aa  105  7e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0265  thioredoxin  51.06 
 
 
110 aa  105  8e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.28448  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2208  Thioredoxin domain  25.69 
 
 
300 aa  105  9e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.210633  normal  0.190287 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3988  thioredoxin domain-containing protein  35.57 
 
 
300 aa  104  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000709703 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0796  thioredoxin  27.89 
 
 
281 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0505807  normal  0.147714 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0726  thioredoxin  27.55 
 
 
281 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0681266  normal  0.772091 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3667  thioredoxin domain-containing protein  24.04 
 
 
298 aa  103  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0743  thioredoxin  28.11 
 
 
282 aa  103  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.328705  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3607  thioredoxin domain-containing protein  35.1 
 
 
300 aa  103  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.150797 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1063  thioredoxin  29.75 
 
 
918 aa  103  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.460797  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4105  Thioredoxin domain protein  44.23 
 
 
321 aa  103  4e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.118303  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1048  thioredoxin domain-containing protein  27.59 
 
 
331 aa  102  6e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.157412  normal  0.991017 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1982  thioredoxin  27.5 
 
 
317 aa  102  6e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00653306  normal  0.106397 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1276  thioredoxin domain protein  43.69 
 
 
337 aa  101  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2526  Thioredoxin domain  25.69 
 
 
302 aa  100  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2251  thioredoxin domain-containing protein  25.69 
 
 
302 aa  100  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.285443 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0422  thioredoxin-related  25.62 
 
 
306 aa  100  3e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3272  thioredoxin  25.44 
 
 
326 aa  100  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.315754  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1305  thioredoxin  31.14 
 
 
235 aa  100  4e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.277929  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>