More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1229 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_1229  thioredoxin  100 
 
 		 268 aa  540  1e-153  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.223518 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1093  thioredoxin  57.09 
 
 		 268 aa  314  9.999999999999999e-85  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0251638  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0979  thioredoxin domain-containing protein  54.96 
 
 		 263 aa  299  4e-80  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.248497  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1467  thioredoxin  53.99 
 
 		 268 aa  298  9e-80  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1199  thioredoxin  52.47 
 
 		 268 aa  276  3e-73  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0450617 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1038  thioredoxin  47.51 
 
 		 277 aa  239  5e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2614  thioredoxin family protein  44.7 
 
 		 271 aa  219  3e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1452  thioredoxin  37.23 
 
 		 272 aa  168  8e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0686  thioredoxin  34.66 
 
 		 290 aa  160  3e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2527  thioredoxin  34.94 
 
 		 293 aa  157  1e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1818  thioredoxin  33.33 
 
 		 293 aa  154  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0314014 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2848  thioredoxin, putative  36.46 
 
 		 289 aa  152  5e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.126765  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2469  thioredoxin  36.46 
 
 		 289 aa  152  5e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.744001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0903  thioredoxin  34.53 
 
 		 282 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0661  thioredoxin domain-containing protein  34.53 
 
 		 301 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0906  thioredoxin  34.53 
 
 		 282 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1535  thioredoxin  33.85 
 
 		 269 aa  146  3e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000141662  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2485  thioredoxin  34.18 
 
 		 282 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.194267 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4466  thioredoxin  33.58 
 
 		 290 aa  145  6e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2614  thioredoxin  34.18 
 
 		 282 aa  145  6e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0664  Thioredoxin domain protein  34.51 
 
 		 282 aa  145  7.0000000000000006e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000362321  hitchhiker  0.00000255831 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0719  thioredoxin  35.25 
 
 		 282 aa  144  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0060777  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1063  thioredoxin  34.96 
 
 		 918 aa  143  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.460797  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5898  thioredoxin  33.45 
 
 		 282 aa  142  5e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.769716  normal  0.516195 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0822  thioredoxin  33.33 
 
 		 310 aa  142  6e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.606093  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1041  thioredoxin  33.57 
 
 		 289 aa  142  7e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0796  thioredoxin  31.07 
 
 		 281 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0505807  normal  0.147714 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0779  putative thioredoxin protein  32.16 
 
 		 280 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.297357  decreased coverage  0.00262303 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3861  thioredoxin  33.45 
 
 		 290 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.339067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0545  thioredoxin  31.65 
 
 		 290 aa  139  6e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2636  thioredoxin  32.85 
 
 		 280 aa  138  7.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0510  thioredoxin  31.65 
 
 		 290 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11340  putative thioredoxin  32.26 
 
 		 289 aa  137  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000384652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3219  thioredoxin  32.72 
 
 		 282 aa  137  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0730  thioredoxin  34.53 
 
 		 282 aa  137  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0726  thioredoxin  31.07 
 
 		 281 aa  136  4e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0681266  normal  0.772091 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0603  thioredoxin domain-containing protein  32 
 
 		 287 aa  135  5e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0802586  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5188  thioredoxin  35.48 
 
 		 302 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0563  thioredoxin  31.65 
 
 		 290 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4464  thioredoxin  32.85 
 
 		 302 aa  135  8e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.980457  hitchhiker  0.00575685 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0556  thioredoxin  31.8 
 
 		 290 aa  135  8e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5023  thioredoxin  32.25 
 
 		 290 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.929168  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0743  thioredoxin  32.47 
 
 		 282 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.328705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1755  thioredoxin  32.47 
 
 		 287 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0267329  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0268  thioredoxin  33.09 
 
 		 306 aa  133  3e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.223768  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0265  thioredoxin  57.28 
 
 		 110 aa  133  3e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.28448  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0835  thioredoxin  32.74 
 
 		 304 aa  133  3e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0466449 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3775  thioredoxin  30.1 
 
 		 324 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.467472 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0675  thioredoxin domain-containing protein  31.46 
 
 		 297 aa  133  3.9999999999999996e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.357396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0318  thioredoxin  33.58 
 
 		 287 aa  131  9e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1955  thioredoxin  33.09 
 
 		 282 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180401  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2566  thioredoxin  33.45 
 
 		 282 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0296  thioredoxin  34.55 
 
 		 306 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0166723 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4099  thioredoxin  31.25 
 
 		 324 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.809641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3232  thioredoxin domain-containing protein  29.96 
 
 		 285 aa  130  2.0000000000000002e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.941804  normal  0.328637 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3331  thioredoxin  30.26 
 
 		 287 aa  130  3e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.108459  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2590  thioredoxin  32 
 
 		 282 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282691  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06670  Thioredoxin protein  31.6 
 
 		 289 aa  128  1.0000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.697288  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0456  thioredoxin  32.49 
 
 		 306 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.666195  normal  0.0589835 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2376  thioredoxin-related  33.21 
 
 		 286 aa  126  3e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.036483  normal  0.757224 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0516  thioredoxin  31.97 
 
 		 282 aa  126  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.695523 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2864  thioredoxin domain-containing protein  29.66 
 
 		 272 aa  125  5e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.499317  normal  0.13279 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1547  thioredoxin  32.46 
 
 		 302 aa  124  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  hitchhiker  0.00479598 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0560  Thioredoxin domain protein  26.89 
 
 		 272 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0577  thioredoxin domain protein  26.89 
 
 		 272 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4245  thioredoxin  31.43 
 
 		 334 aa  124  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.902531  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0306  putative thioredoxin  32.01 
 
 		 305 aa  124  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.351153 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3035  thioredoxin-related  29.56 
 
 		 274 aa  124  2e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3045  thioredoxin  29.17 
 
 		 330 aa  123  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2938  thioredoxin  31.62 
 
 		 315 aa  123  4e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2125  thioredoxin  31.62 
 
 		 286 aa  122  9e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1312  thioredoxin  31.99 
 
 		 302 aa  121  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.968155  hitchhiker  0.00158392 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0035  thioredoxin domain protein  31.37 
 
 		 303 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000613737 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01872  thioredoxin  31.23 
 
 		 285 aa  119  4.9999999999999996e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0837  thioredoxin  31.41 
 
 		 329 aa  119  7e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24068  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5272  Thioredoxin domain protein  29.96 
 
 		 272 aa  118  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.127007 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1865  thioredoxin  30.99 
 
 		 306 aa  118  7.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.938725 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0893  thioredoxin  31.41 
 
 		 324 aa  118  9.999999999999999e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0519  thioredoxin  32.45 
 
 		 280 aa  118  9.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28500  thioredoxin  29.33 
 
 		 299 aa  117  9.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.173246 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1982  thioredoxin  30.07 
 
 		 317 aa  116  3.9999999999999997e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00653306  normal  0.106397 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0081  thioredoxin-related  31.14 
 
 		 310 aa  116  3.9999999999999997e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1307  thioredoxin  31.97 
 
 		 286 aa  115  7.999999999999999e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.334323  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1331  putative thioredoxin  29.52 
 
 		 285 aa  115  8.999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1374  thioredoxin  31.6 
 
 		 286 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.187591  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4105  Thioredoxin domain protein  30.18 
 
 		 321 aa  113  3e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.118303  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3284  thioredoxin  31.65 
 
 		 320 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0264  thioredoxin-related  30.28 
 
 		 305 aa  112  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.569758 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1305  thioredoxin  42.18 
 
 		 235 aa  112  6e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.277929  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2526  Thioredoxin domain  31.16 
 
 		 302 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2251  thioredoxin domain-containing protein  31.16 
 
 		 302 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.285443 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2208  Thioredoxin domain  31.41 
 
 		 300 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.210633  normal  0.190287 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1048  thioredoxin domain-containing protein  29.89 
 
 		 331 aa  110  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.157412  normal  0.991017 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1925  Thioredoxin domain-containing protein  27.27 
 
 		 299 aa  110  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0422  thioredoxin-related  30.4 
 
 		 306 aa  110  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00581  Thioredoxin domain-containing protein  28.46 
 
 		 289 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3931  thioredoxin  29.43 
 
 		 302 aa  110  3e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0886  putative thioredoxin protein  30.22 
 
 		 287 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3279  thioredoxin  29.43 
 
 		 302 aa  109  5e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4590  thioredoxin  28.36 
 
 		 304 aa  108  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.315091 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>