More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_3472 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_3472  thioredoxin  100 
 
 
246 aa  475  1e-133  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.110554  normal  0.0143649 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1305  thioredoxin  41.87 
 
 
235 aa  157  2e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.277929  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1818  thioredoxin  39.24 
 
 
293 aa  154  9e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0314014 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2527  thioredoxin  39.58 
 
 
293 aa  150  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0664  Thioredoxin domain protein  38.58 
 
 
282 aa  142  7e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000362321  hitchhiker  0.00000255831 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2938  thioredoxin  34.93 
 
 
315 aa  137  2e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0675  thioredoxin domain-containing protein  48.82 
 
 
297 aa  135  7.000000000000001e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.357396  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0726  thioredoxin  38.3 
 
 
281 aa  135  8e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0681266  normal  0.772091 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2848  thioredoxin, putative  34.74 
 
 
289 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.126765  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0796  thioredoxin  37.14 
 
 
281 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0505807  normal  0.147714 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2469  thioredoxin  34.74 
 
 
289 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.744001  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3232  thioredoxin domain-containing protein  34.89 
 
 
285 aa  129  4.0000000000000003e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.941804  normal  0.328637 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0519  thioredoxin  37.91 
 
 
280 aa  128  8.000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1535  thioredoxin  32.35 
 
 
269 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000141662  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0603  thioredoxin domain-containing protein  32.28 
 
 
287 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0802586  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4105  Thioredoxin domain protein  55.83 
 
 
321 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.118303  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1312  thioredoxin  34.38 
 
 
302 aa  127  2.0000000000000002e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.968155  hitchhiker  0.00158392 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1755  thioredoxin  34.91 
 
 
287 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0267329  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28500  thioredoxin  33.93 
 
 
299 aa  126  3e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.173246 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1038  thioredoxin  36 
 
 
277 aa  126  3e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1041  thioredoxin  34.86 
 
 
289 aa  126  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3331  thioredoxin  31.32 
 
 
287 aa  126  3e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.108459  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2636  thioredoxin  36.92 
 
 
280 aa  125  8.000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1048  thioredoxin domain-containing protein  51.08 
 
 
331 aa  124  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.157412  normal  0.991017 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1925  Thioredoxin domain-containing protein  36.33 
 
 
299 aa  124  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0822  thioredoxin  34.89 
 
 
310 aa  124  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.606093  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3683  thioredoxin-related  39.63 
 
 
329 aa  123  3e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.418332  normal  0.641891 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0422  thioredoxin-related  35.07 
 
 
306 aa  123  3e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11340  putative thioredoxin  33.8 
 
 
289 aa  123  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000384652  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2614  thioredoxin family protein  36.23 
 
 
271 aa  122  6e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0779  putative thioredoxin protein  36.43 
 
 
280 aa  122  6e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.297357  decreased coverage  0.00262303 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0563  thioredoxin  33.45 
 
 
290 aa  122  6e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2254  Thioredoxin domain  32.43 
 
 
338 aa  120  9.999999999999999e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.708544  normal  0.526752 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1276  thioredoxin domain protein  53.27 
 
 
337 aa  121  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0686  thioredoxin  33.1 
 
 
290 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4466  thioredoxin  33.45 
 
 
290 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5188  thioredoxin  29.37 
 
 
302 aa  119  6e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0510  thioredoxin  32.04 
 
 
290 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0516  thioredoxin  49.59 
 
 
282 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.695523 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0456  thioredoxin  38.76 
 
 
306 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.666195  normal  0.0589835 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0545  thioredoxin  32.04 
 
 
290 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0081  thioredoxin-related  31.86 
 
 
310 aa  116  3e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0556  thioredoxin  32.75 
 
 
290 aa  116  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1199  thioredoxin  49.09 
 
 
268 aa  116  3.9999999999999997e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0450617 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4464  thioredoxin  31.25 
 
 
302 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.980457  hitchhiker  0.00575685 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0265  thioredoxin  55.56 
 
 
110 aa  115  6e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.28448  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5023  thioredoxin  33.1 
 
 
290 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.929168  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4590  thioredoxin  34.36 
 
 
304 aa  114  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.315091 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3279  thioredoxin  39.52 
 
 
302 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0743  thioredoxin  33.69 
 
 
282 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.328705  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06670  Thioredoxin protein  33.92 
 
 
289 aa  114  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.697288  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5898  thioredoxin  40.48 
 
 
282 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.769716  normal  0.516195 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01872  thioredoxin  47.75 
 
 
285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1052  Thioredoxin domain protein  31.1 
 
 
286 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.846317  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0306  putative thioredoxin  31.96 
 
 
305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.351153 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1547  thioredoxin  42.07 
 
 
302 aa  113  3e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  hitchhiker  0.00479598 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1452  thioredoxin  46.79 
 
 
272 aa  113  3e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1954  Thioredoxin domain protein  33.82 
 
 
313 aa  112  4.0000000000000004e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0686118  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1489  thioredoxin domain-containing protein  46.23 
 
 
304 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.481302  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0139  thioredoxin  46.23 
 
 
304 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.115095  normal  0.47686 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3988  thioredoxin domain-containing protein  51.89 
 
 
300 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000709703 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0979  thioredoxin domain-containing protein  41.88 
 
 
263 aa  112  4.0000000000000004e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.248497  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3219  thioredoxin  33.1 
 
 
282 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00581  Thioredoxin domain-containing protein  27.96 
 
 
289 aa  112  5e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0719  thioredoxin  49.53 
 
 
282 aa  112  5e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0060777  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0296  thioredoxin  38.76 
 
 
306 aa  112  5e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0166723 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3607  thioredoxin domain-containing protein  51.89 
 
 
300 aa  112  5e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.150797 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1093  thioredoxin  30.34 
 
 
268 aa  112  6e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0251638  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2914  thioredoxin  43.38 
 
 
285 aa  112  6e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4245  thioredoxin  29.79 
 
 
334 aa  112  8.000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.902531  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1307  thioredoxin  47.32 
 
 
286 aa  112  8.000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.334323  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2485  thioredoxin  39.29 
 
 
282 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.194267 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1374  thioredoxin  43.18 
 
 
286 aa  111  1.0000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.187591  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3931  thioredoxin  38.92 
 
 
302 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2614  thioredoxin  39.29 
 
 
282 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0541  protein YbbN  31.8 
 
 
284 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0268  thioredoxin  37.21 
 
 
306 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.223768  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0571  protein YbbN  31.8 
 
 
284 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0903  thioredoxin  48.6 
 
 
282 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5094  thioredoxin  40.7 
 
 
306 aa  110  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.443129  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2894  thioredoxin  46.23 
 
 
304 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.225286  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0596  protein YbbN  31.8 
 
 
284 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0054  thioredoxin domain-containing protein  37.75 
 
 
311 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.621806 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0427  protein YbbN  31.8 
 
 
284 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0661  thioredoxin domain-containing protein  48.6 
 
 
301 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0906  thioredoxin  48.6 
 
 
282 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2371  thioredoxin domain-containing protein  45.79 
 
 
303 aa  110  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.880736 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0531  protein YbbN  31.8 
 
 
284 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.735174  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3775  thioredoxin  36.52 
 
 
324 aa  109  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.467472 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2102  thioredoxin  36.99 
 
 
291 aa  110  3e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00443  predicted thioredoxin domain-containing protein  31.27 
 
 
284 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3118  Thioredoxin domain protein  31.27 
 
 
284 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3124  thioredoxin domain-containing protein  31.27 
 
 
284 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000112242 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00448  hypothetical protein  31.27 
 
 
284 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4099  thioredoxin  35.96 
 
 
324 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.809641  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3861  thioredoxin  32.04 
 
 
290 aa  108  6e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.339067  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1063  thioredoxin  48.15 
 
 
918 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.460797  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0943  thioredoxin domain-containing protein  31.79 
 
 
286 aa  108  7.000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1982  thioredoxin  33.1 
 
 
317 aa  108  7.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00653306  normal  0.106397 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0730  thioredoxin  47.66 
 
 
282 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>