More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2606 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2606  putative thioredoxin-like protein  100 
 
 		 136 aa  279  9e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.888104  normal  0.656305 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1755  thioredoxin  50.91 
 
 		 287 aa  114  3e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0267329  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1452  thioredoxin  47.12 
 
 		 272 aa  108  4.0000000000000004e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3045  thioredoxin  45.19 
 
 		 330 aa  104  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5023  thioredoxin  43.75 
 
 		 290 aa  104  5e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.929168  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2125  thioredoxin  44.55 
 
 		 286 aa  104  5e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0519  thioredoxin  47.66 
 
 		 280 aa  103  7e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3861  thioredoxin  43.86 
 
 		 290 aa  103  9e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.339067  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0686  thioredoxin  43.52 
 
 		 290 aa  103  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4466  thioredoxin  43.52 
 
 		 290 aa  102  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1041  thioredoxin  42.98 
 
 		 289 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11340  putative thioredoxin  42.98 
 
 		 289 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000384652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3775  thioredoxin  43.27 
 
 		 324 aa  101  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.467472 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1547  thioredoxin  42.59 
 
 		 302 aa  101  4e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  hitchhiker  0.00479598 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1038  thioredoxin  50 
 
 		 277 aa  100  6e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1276  thioredoxin domain protein  43.48 
 
 		 337 aa  100  8e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0556  thioredoxin  41.96 
 
 		 290 aa  100  9e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01872  thioredoxin  41.96 
 
 		 285 aa  100  9e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0835  thioredoxin  42.86 
 
 		 304 aa  100  9e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0466449 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0545  thioredoxin  41.96 
 
 		 290 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0563  thioredoxin  41.96 
 
 		 290 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06670  Thioredoxin protein  41.74 
 
 		 289 aa  99.4  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.697288  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0510  thioredoxin  41.07 
 
 		 290 aa  99  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4099  thioredoxin  43.27 
 
 		 324 aa  99.4  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.809641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3931  thioredoxin  42.59 
 
 		 302 aa  99  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1865  thioredoxin  40.8 
 
 		 306 aa  99.4  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.938725 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3331  thioredoxin  39.47 
 
 		 287 aa  99.4  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.108459  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0822  thioredoxin  45.71 
 
 		 310 aa  98.2  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.606093  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0265  thioredoxin  46 
 
 		 110 aa  98.2  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.28448  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0837  thioredoxin  42.45 
 
 		 329 aa  98.2  3e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24068  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4628  thioredoxin  42.48 
 
 		 341 aa  98.2  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3284  thioredoxin  41.51 
 
 		 320 aa  97.8  5e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2636  thioredoxin  46.08 
 
 		 280 aa  97.8  5e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0318  thioredoxin  37.84 
 
 		 287 aa  97.8  5e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0675  thioredoxin domain-containing protein  42.24 
 
 		 297 aa  97.4  6e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.357396  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0893  thioredoxin  41.51 
 
 		 324 aa  97.1  7e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1374  thioredoxin  43.75 
 
 		 286 aa  97.1  8e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.187591  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3232  thioredoxin domain-containing protein  41.67 
 
 		 285 aa  97.1  8e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.941804  normal  0.328637 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3279  thioredoxin  41.67 
 
 		 302 aa  96.3  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2614  thioredoxin family protein  47.92 
 
 		 271 aa  95.9  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4561  thioredoxin  40.74 
 
 		 302 aa  95.5  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.712523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0743  thioredoxin  45.19 
 
 		 282 aa  95.1  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.328705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1307  thioredoxin  42.86 
 
 		 286 aa  95.5  2e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.334323  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3219  thioredoxin  45.19 
 
 		 282 aa  95.1  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5188  thioredoxin  40.34 
 
 		 302 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0456  thioredoxin  39.52 
 
 		 306 aa  95.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.666195  normal  0.0589835 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0268  thioredoxin  38.71 
 
 		 306 aa  94.7  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.223768  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2792  thioredoxin  46.88 
 
 		 307 aa  94.7  4e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.336164  normal  0.284427 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2914  thioredoxin  41.12 
 
 		 285 aa  94.7  4e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3272  thioredoxin  40.38 
 
 		 326 aa  94.4  5e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.315754  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1982  thioredoxin  41.67 
 
 		 317 aa  94  6e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00653306  normal  0.106397 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4464  thioredoxin  39.5 
 
 		 302 aa  94  7e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.980457  hitchhiker  0.00575685 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0943  thioredoxin domain-containing protein  37.72 
 
 		 286 aa  93.6  8e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0516  thioredoxin  44.66 
 
 		 282 aa  92.8  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.695523 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0993  thioredoxin  39.81 
 
 		 318 aa  93.2  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.766287 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4245  thioredoxin  39.62 
 
 		 334 aa  93.2  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.902531  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0087  thioredoxin  41.58 
 
 		 106 aa  93.2  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.950509 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3472  thioredoxin  43.27 
 
 		 246 aa  92.8  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.110554  normal  0.0143649 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3336  thioredoxin  46.3 
 
 		 259 aa  92.4  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0296  thioredoxin  38.71 
 
 		 306 aa  92.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0166723 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1305  thioredoxin  40 
 
 		 235 aa  92.4  2e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.277929  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0294  putative thioredoxin protein  39.09 
 
 		 314 aa  91.7  3e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.918989  normal  0.0369237 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0198  thioredoxin  38.18 
 
 		 326 aa  91.7  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1955  thioredoxin  44.66 
 
 		 282 aa  91.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180401  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2566  thioredoxin  44.66 
 
 		 282 aa  91.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00569  thioredoxin  41.58 
 
 		 112 aa  91.7  3e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.181003  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0661  thioredoxin domain-containing protein  43.69 
 
 		 301 aa  91.3  4e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0903  thioredoxin  43.69 
 
 		 282 aa  91.3  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0906  thioredoxin  43.69 
 
 		 282 aa  91.3  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0306  putative thioredoxin  36.67 
 
 		 305 aa  91.3  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.351153 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0979  thioredoxin domain-containing protein  46 
 
 		 263 aa  91.3  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.248497  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1229  thioredoxin  41.96 
 
 		 268 aa  90.9  5e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.223518 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0264  thioredoxin-related  36.36 
 
 		 305 aa  90.9  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.569758 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0081  thioredoxin-related  38.21 
 
 		 310 aa  90.9  5e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1467  thioredoxin  43 
 
 		 268 aa  90.9  5e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2468  thioredoxin  37.96 
 
 		 108 aa  90.9  5e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0664  Thioredoxin domain protein  41.28 
 
 		 282 aa  90.5  6e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000362321  hitchhiker  0.00000255831 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1331  putative thioredoxin  38.89 
 
 		 285 aa  90.9  6e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1048  thioredoxin domain-containing protein  40 
 
 		 331 aa  90.9  6e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.157412  normal  0.991017 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2590  thioredoxin  43.69 
 
 		 282 aa  90.5  8e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0730  thioredoxin  44.66 
 
 		 282 aa  90.1  8e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2485  thioredoxin  43.69 
 
 		 282 aa  90.1  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.194267 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0364  thioredoxin domain-containing protein  38.18 
 
 		 312 aa  89.4  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000110184 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0719  thioredoxin  43.69 
 
 		 282 aa  89.7  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0060777  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0505  thioredoxin  40.2 
 
 		 109 aa  90.1  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000129794  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2614  thioredoxin  43.69 
 
 		 282 aa  90.1  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1063  thioredoxin  43.69 
 
 		 918 aa  89.4  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.460797  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1093  thioredoxin  41.9 
 
 		 268 aa  89  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0251638  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00581  Thioredoxin domain-containing protein  33.33 
 
 		 289 aa  88.2  3e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5898  thioredoxin  42.72 
 
 		 282 aa  88.6  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.769716  normal  0.516195 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2848  thioredoxin, putative  39.09 
 
 		 289 aa  88.2  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.126765  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2469  thioredoxin  39.09 
 
 		 289 aa  88.2  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.744001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  43.33 
 
 		 110 aa  88.2  3e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000000131883  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1445  thioredoxin  39.22 
 
 		 108 aa  87.8  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0251303  normal  0.275114 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1852  thioredoxin  39.22 
 
 		 108 aa  87.8  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0771172  normal  0.135016 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4110  thioredoxin  38.61 
 
 		 108 aa  88.2  4e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.465308  hitchhiker  0.0000724164 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0422  thioredoxin-related  38.68 
 
 		 306 aa  88.2  4e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2898  thioredoxin  36.27 
 
 		 133 aa  88.2  4e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.34978  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1828  thioredoxin  39.22 
 
 		 108 aa  87.8  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0156587  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3190  thioredoxin  39.22 
 
 		 108 aa  87.8  4e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.425401  hitchhiker  0.00537167 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>