More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3098 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3098  thioredoxin  100 
 
 		 333 aa  625  1e-178  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000000032408  hitchhiker  0.0000022841 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6079  thioredoxin domain protein  52.21 
 
 		 326 aa  244  9.999999999999999e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28500  thioredoxin  47.47 
 
 		 299 aa  244  9.999999999999999e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.173246 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1704  thioredoxin domain protein  39.69 
 
 		 310 aa  199  5e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.143587 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1954  Thioredoxin domain protein  42.28 
 
 		 313 aa  192  5e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0686118  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2342  thioredoxin domain-containing protein  42.34 
 
 		 298 aa  188  1e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.299917  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2594  thioredoxin domain-containing protein  42.32 
 
 		 339 aa  187  3e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.238157  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0675  thioredoxin domain-containing protein  40.68 
 
 		 297 aa  186  5e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.357396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3886  Thioredoxin domain protein  41.39 
 
 		 312 aa  186  6e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.54182  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3988  thioredoxin domain-containing protein  43.09 
 
 		 300 aa  182  5.0000000000000004e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000709703 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11356  thioredoxin  38.11 
 
 		 304 aa  180  2e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000675127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1925  Thioredoxin domain-containing protein  40.29 
 
 		 299 aa  179  4.999999999999999e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3607  thioredoxin domain-containing protein  43.71 
 
 		 300 aa  179  4.999999999999999e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.150797 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1268  Thioredoxin domain protein  41.94 
 
 		 323 aa  179  5.999999999999999e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1333  Thioredoxin domain protein  42.68 
 
 		 311 aa  177  3e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4303  thioredoxin domain-containing protein  40.42 
 
 		 297 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.408854  normal  0.611787 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3848  thioredoxin domain-containing protein  41.62 
 
 		 299 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00807359 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3862  thioredoxin domain-containing protein  41.62 
 
 		 299 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3936  thioredoxin domain-containing protein  41.62 
 
 		 299 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2327  thioredoxin domain protein  39.77 
 
 		 334 aa  163  3e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000128937 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0921  thioredoxin domain-containing protein  40.73 
 
 		 301 aa  160  2e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.460441 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0364  putative thioredoxin  38.83 
 
 		 320 aa  159  7e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.163537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4105  Thioredoxin domain protein  42.66 
 
 		 321 aa  155  6e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.118303  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1276  thioredoxin domain protein  35.74 
 
 		 337 aa  154  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3683  thioredoxin-related  40.89 
 
 		 329 aa  145  8.000000000000001e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.418332  normal  0.641891 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1804  thioredoxin domain-containing protein  39.75 
 
 		 314 aa  142  7e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1048  thioredoxin domain-containing protein  40.87 
 
 		 331 aa  142  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.157412  normal  0.991017 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1092  Thioredoxin domain protein  39.77 
 
 		 310 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.509026  normal  0.582988 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09500  thioredoxin domain-containing protein  36.07 
 
 		 346 aa  134  1.9999999999999998e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.460116  normal  0.88242 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1730  putative thioredoxin domain-containing protein  35.83 
 
 		 313 aa  130  3e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1282  Thioredoxin domain  37.13 
 
 		 319 aa  127  3e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00790933  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2392  putative thioredoxin  37.41 
 
 		 309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10300  thioredoxin domain-containing protein  35.36 
 
 		 313 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08240  thioredoxin domain-containing protein  35.17 
 
 		 324 aa  102  9e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1818  thioredoxin  28.62 
 
 		 293 aa  100  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0314014 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0139  hypothetical protein  29.01 
 
 		 340 aa  99.8  7e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2527  thioredoxin  28.97 
 
 		 293 aa  97.8  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19060  thioredoxin domain-containing protein  34.38 
 
 		 299 aa  96.3  7e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.595284  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0318  thioredoxin  30.67 
 
 		 287 aa  95.9  8e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2422  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.68 
 
 		 319 aa  95.9  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0726  thioredoxin  28.47 
 
 		 281 aa  90.5  4e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0681266  normal  0.772091 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0796  thioredoxin  28.83 
 
 		 281 aa  89.4  8e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0505807  normal  0.147714 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0266  thioredoxin  31.33 
 
 		 301 aa  88.2  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0456  thioredoxin  27.92 
 
 		 306 aa  86.7  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.666195  normal  0.0589835 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1467  thioredoxin  26.43 
 
 		 268 aa  86.3  7e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2665  thioredoxin-related  32.57 
 
 		 303 aa  85.9  9e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0943  thioredoxin domain-containing protein  28.81 
 
 		 286 aa  85.9  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4464  thioredoxin  27.19 
 
 		 302 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.980457  hitchhiker  0.00575685 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1117  thioredoxin-related protein  30.96 
 
 		 324 aa  84.7  0.000000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0664  Thioredoxin domain protein  30.58 
 
 		 282 aa  84  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000362321  hitchhiker  0.00000255831 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0835  thioredoxin  25.93 
 
 		 304 aa  83.6  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0466449 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0422  thioredoxin-related  28.9 
 
 		 306 aa  83.6  0.000000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5188  thioredoxin  28.12 
 
 		 302 aa  83.6  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0054  thioredoxin domain-containing protein  29.93 
 
 		 311 aa  82.8  0.000000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.621806 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3219  thioredoxin  28.33 
 
 		 282 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0296  thioredoxin  28.25 
 
 		 306 aa  82.8  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0166723 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0779  putative thioredoxin protein  29.43 
 
 		 280 aa  82.4  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.297357  decreased coverage  0.00262303 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3667  thioredoxin domain-containing protein  29.32 
 
 		 298 aa  82  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4245  thioredoxin  25.59 
 
 		 334 aa  82  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.902531  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3035  thioredoxin-related  28.33 
 
 		 274 aa  80.5  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2254  Thioredoxin domain  29.11 
 
 		 338 aa  79.7  0.00000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.708544  normal  0.526752 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4590  thioredoxin  31.48 
 
 		 304 aa  79.7  0.00000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.315091 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3775  thioredoxin  25.24 
 
 		 324 aa  79  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.467472 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2636  thioredoxin  29.54 
 
 		 280 aa  79  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0743  thioredoxin  28.06 
 
 		 282 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.328705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3045  thioredoxin  26.22 
 
 		 330 aa  78.2  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0035  thioredoxin domain protein  27.86 
 
 		 303 aa  77.8  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000613737 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2102  thioredoxin  27.99 
 
 		 291 aa  77.4  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0545  thioredoxin  28.04 
 
 		 290 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0556  thioredoxin  28.19 
 
 		 290 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1312  thioredoxin  26.95 
 
 		 302 aa  75.9  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.968155  hitchhiker  0.00158392 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3583  thioredoxin  33.58 
 
 		 149 aa  74.7  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.029416  normal  0.0374075 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1041  thioredoxin  30.26 
 
 		 289 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01872  thioredoxin  27.85 
 
 		 285 aa  75.1  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00581  Thioredoxin domain-containing protein  25.08 
 
 		 289 aa  74.7  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0730  thioredoxin  30.66 
 
 		 282 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2127  thioredoxin domain-containing protein  29.3 
 
 		 311 aa  73.9  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0822  thioredoxin  25.68 
 
 		 310 aa  74.3  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.606093  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2914  thioredoxin  37.38 
 
 		 285 aa  74.3  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1547  thioredoxin  31.02 
 
 		 302 aa  73.9  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  hitchhiker  0.00479598 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4099  thioredoxin  26.21 
 
 		 324 aa  73.9  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.809641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0306  putative thioredoxin  25.24 
 
 		 305 aa  73.9  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.351153 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0516  thioredoxin  28.67 
 
 		 282 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.695523 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2371  thioredoxin domain-containing protein  30.14 
 
 		 303 aa  73.6  0.000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.880736 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2125  thioredoxin  34.19 
 
 		 286 aa  73.2  0.000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0510  thioredoxin  27.03 
 
 		 290 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0661  thioredoxin domain-containing protein  29.63 
 
 		 301 aa  72  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0563  thioredoxin  27.18 
 
 		 290 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3232  thioredoxin domain-containing protein  24.91 
 
 		 285 aa  71.2  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.941804  normal  0.328637 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6432  thioredoxin  33.33 
 
 		 160 aa  70.9  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.432921 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0577  thioredoxin domain protein  24.58 
 
 		 272 aa  70.5  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0560  Thioredoxin domain protein  24.58 
 
 		 272 aa  70.5  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0268  thioredoxin  26.12 
 
 		 306 aa  70.9  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.223768  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2469  thioredoxin  24.92 
 
 		 289 aa  70.5  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.744001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1955  thioredoxin  28.01 
 
 		 282 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180401  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2848  thioredoxin, putative  24.92 
 
 		 289 aa  70.5  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.126765  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0686  thioredoxin  25.57 
 
 		 290 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0198  thioredoxin  27.76 
 
 		 326 aa  70.1  0.00000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2566  thioredoxin  28.01 
 
 		 282 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0906  thioredoxin  30.28 
 
 		 282 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>