More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1268 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1268  Thioredoxin domain protein  100 
 
 		 323 aa  605  9.999999999999999e-173  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28500  thioredoxin  48.89 
 
 		 299 aa  233  4.0000000000000004e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.173246 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1954  Thioredoxin domain protein  45.71 
 
 		 313 aa  215  7e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0686118  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11356  thioredoxin  42.72 
 
 		 304 aa  210  3e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000675127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2342  thioredoxin domain-containing protein  45.72 
 
 		 298 aa  205  7e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.299917  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4303  thioredoxin domain-containing protein  46.56 
 
 		 297 aa  199  6e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.408854  normal  0.611787 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6079  thioredoxin domain protein  47.37 
 
 		 326 aa  196  3e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3848  thioredoxin domain-containing protein  44.33 
 
 		 299 aa  195  7e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00807359 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3862  thioredoxin domain-containing protein  44.33 
 
 		 299 aa  195  7e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3936  thioredoxin domain-containing protein  44.33 
 
 		 299 aa  195  7e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1704  thioredoxin domain protein  39.22 
 
 		 310 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.143587 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1925  Thioredoxin domain-containing protein  39.23 
 
 		 299 aa  163  4.0000000000000004e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4105  Thioredoxin domain protein  44.63 
 
 		 321 aa  162  9e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.118303  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0921  thioredoxin domain-containing protein  38.28 
 
 		 301 aa  159  5e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.460441 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1333  Thioredoxin domain protein  42.49 
 
 		 311 aa  159  9e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1048  thioredoxin domain-containing protein  41.74 
 
 		 331 aa  155  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.157412  normal  0.991017 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3988  thioredoxin domain-containing protein  40.21 
 
 		 300 aa  153  5e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000709703 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3607  thioredoxin domain-containing protein  40.49 
 
 		 300 aa  150  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.150797 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3886  Thioredoxin domain protein  38.44 
 
 		 312 aa  145  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.54182  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1276  thioredoxin domain protein  37.08 
 
 		 337 aa  142  8e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0675  thioredoxin domain-containing protein  37.1 
 
 		 297 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.357396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2594  thioredoxin domain-containing protein  38.51 
 
 		 339 aa  137  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.238157  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3683  thioredoxin-related  38.82 
 
 		 329 aa  134  3e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.418332  normal  0.641891 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1092  Thioredoxin domain protein  42.91 
 
 		 310 aa  132  6.999999999999999e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.509026  normal  0.582988 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0364  putative thioredoxin  33.86 
 
 		 320 aa  125  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.163537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2327  thioredoxin domain protein  34.46 
 
 		 334 aa  125  1e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000128937 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3098  thioredoxin  41.06 
 
 		 333 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000000032408  hitchhiker  0.0000022841 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09500  thioredoxin domain-containing protein  34.21 
 
 		 346 aa  117  3.9999999999999997e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.460116  normal  0.88242 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0139  hypothetical protein  30.35 
 
 		 340 aa  116  3.9999999999999997e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2422  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.42 
 
 		 319 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1730  putative thioredoxin domain-containing protein  33.12 
 
 		 313 aa  107  2e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10300  thioredoxin domain-containing protein  34.18 
 
 		 313 aa  105  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1804  thioredoxin domain-containing protein  32.04 
 
 		 314 aa  102  8e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4245  thioredoxin  28.04 
 
 		 334 aa  99.8  6e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.902531  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3045  thioredoxin  29.84 
 
 		 330 aa  97.8  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5188  thioredoxin  31.6 
 
 		 302 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4464  thioredoxin  28.04 
 
 		 302 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.980457  hitchhiker  0.00575685 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2527  thioredoxin  31.1 
 
 		 293 aa  95.1  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3775  thioredoxin  30.43 
 
 		 324 aa  94.7  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.467472 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1865  thioredoxin  30.77 
 
 		 306 aa  93.6  4e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.938725 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2392  putative thioredoxin  33.09 
 
 		 309 aa  93.2  5e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0822  thioredoxin  32.83 
 
 		 310 aa  92  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.606093  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2636  thioredoxin  39.35 
 
 		 280 aa  92  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4099  thioredoxin  29.77 
 
 		 324 aa  91.7  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.809641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1818  thioredoxin  27.76 
 
 		 293 aa  91.3  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0314014 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0837  thioredoxin  27.04 
 
 		 329 aa  89.4  8e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24068  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1305  thioredoxin  30.92 
 
 		 235 aa  89  9e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.277929  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0893  thioredoxin  28.29 
 
 		 324 aa  88.6  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3284  thioredoxin  30.39 
 
 		 320 aa  88.2  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1282  Thioredoxin domain  36.36 
 
 		 319 aa  87  4e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00790933  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1038  thioredoxin  32.6 
 
 		 277 aa  86.7  4e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1117  thioredoxin-related protein  29.02 
 
 		 324 aa  85.1  0.000000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0296  thioredoxin  29.35 
 
 		 306 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0166723 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0318  thioredoxin  28.11 
 
 		 287 aa  84  0.000000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0686  thioredoxin  30.63 
 
 		 290 aa  82.8  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0456  thioredoxin  28.62 
 
 		 306 aa  82.8  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.666195  normal  0.0589835 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2938  thioredoxin  29.43 
 
 		 315 aa  82.8  0.000000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1312  thioredoxin  27.36 
 
 		 302 aa  82.4  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.968155  hitchhiker  0.00158392 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08240  thioredoxin domain-containing protein  36.56 
 
 		 324 aa  80.9  0.00000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0268  thioredoxin  27.7 
 
 		 306 aa  80.5  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.223768  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1982  thioredoxin  29.15 
 
 		 317 aa  80.1  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00653306  normal  0.106397 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4590  thioredoxin  34.02 
 
 		 304 aa  80.1  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.315091 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2127  thioredoxin domain-containing protein  31.05 
 
 		 311 aa  79.7  0.00000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0510  thioredoxin  27.74 
 
 		 290 aa  79.7  0.00000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3711  thioredoxin-related  27.89 
 
 		 312 aa  79.3  0.00000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0545  thioredoxin  26.69 
 
 		 290 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3272  thioredoxin  27.48 
 
 		 326 aa  79  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.315754  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2614  thioredoxin  35.9 
 
 		 282 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2485  thioredoxin  35.9 
 
 		 282 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.194267 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4466  thioredoxin  30.28 
 
 		 290 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0556  thioredoxin  27.03 
 
 		 290 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0779  putative thioredoxin protein  34.39 
 
 		 280 aa  77.8  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.297357  decreased coverage  0.00262303 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0993  thioredoxin  37.74 
 
 		 318 aa  77.4  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.766287 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2526  Thioredoxin domain  30.41 
 
 		 302 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0796  thioredoxin  31.85 
 
 		 281 aa  77  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0505807  normal  0.147714 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2251  thioredoxin domain-containing protein  30.41 
 
 		 302 aa  77  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.285443 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0726  thioredoxin  32.48 
 
 		 281 aa  77  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0681266  normal  0.772091 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1547  thioredoxin  31.06 
 
 		 302 aa  76.6  0.0000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  hitchhiker  0.00479598 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2102  thioredoxin  28.01 
 
 		 291 aa  76.3  0.0000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0306  putative thioredoxin  26.14 
 
 		 305 aa  76.3  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.351153 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2208  Thioredoxin domain  29.8 
 
 		 300 aa  76.3  0.0000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.210633  normal  0.190287 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0664  Thioredoxin domain protein  31.98 
 
 		 282 aa  75.9  0.0000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000362321  hitchhiker  0.00000255831 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0035  thioredoxin domain protein  28.29 
 
 		 303 aa  75.5  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000613737 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1955  thioredoxin  39.05 
 
 		 282 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180401  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1041  thioredoxin  28.38 
 
 		 289 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0516  thioredoxin  35 
 
 		 282 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.695523 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0563  thioredoxin  26.35 
 
 		 290 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2914  thioredoxin  30.28 
 
 		 285 aa  73.9  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1063  thioredoxin  37.14 
 
 		 918 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.460797  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0943  thioredoxin domain-containing protein  36.27 
 
 		 286 aa  74.3  0.000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0730  thioredoxin  38.1 
 
 		 282 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0661  thioredoxin domain-containing protein  38.24 
 
 		 301 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0054  thioredoxin domain-containing protein  27.65 
 
 		 311 aa  72.8  0.000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.621806 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2792  thioredoxin  29.89 
 
 		 307 aa  72.8  0.000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.336164  normal  0.284427 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00581  Thioredoxin domain-containing protein  31.54 
 
 		 289 aa  72.4  0.000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19060  thioredoxin domain-containing protein  30.19 
 
 		 299 aa  72.4  0.000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.595284  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3331  thioredoxin  25.25 
 
 		 287 aa  72.4  0.000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.108459  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0081  thioredoxin-related  33.91 
 
 		 310 aa  72.4  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1452  thioredoxin  35.58 
 
 		 272 aa  71.6  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0903  thioredoxin  38.24 
 
 		 282 aa  72  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>