174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_09500 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_09500  thioredoxin domain-containing protein  100 
 
 		 346 aa  679    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.460116  normal  0.88242 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2594  thioredoxin domain-containing protein  39.37 
 
 		 339 aa  192  9e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.238157  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2327  thioredoxin domain protein  36.86 
 
 		 334 aa  186  5e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000128937 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1333  Thioredoxin domain protein  36.69 
 
 		 311 aa  176  5e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2422  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  42.16 
 
 		 319 aa  175  9.999999999999999e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1730  putative thioredoxin domain-containing protein  36.99 
 
 		 313 aa  174  2.9999999999999996e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1804  thioredoxin domain-containing protein  38.04 
 
 		 314 aa  170  3e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1092  Thioredoxin domain protein  41.11 
 
 		 310 aa  169  6e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.509026  normal  0.582988 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10300  thioredoxin domain-containing protein  40.34 
 
 		 313 aa  157  2e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1276  thioredoxin domain protein  37.91 
 
 		 337 aa  155  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1704  thioredoxin domain protein  35.34 
 
 		 310 aa  153  5e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.143587 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19060  thioredoxin domain-containing protein  36.08 
 
 		 299 aa  152  5.9999999999999996e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.595284  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1282  Thioredoxin domain  40.96 
 
 		 319 aa  148  1.0000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00790933  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28500  thioredoxin  36.36 
 
 		 299 aa  141  1.9999999999999998e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.173246 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0675  thioredoxin domain-containing protein  33.63 
 
 		 297 aa  135  8e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.357396  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0364  putative thioredoxin  37.71 
 
 		 320 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.163537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0139  hypothetical protein  30.06 
 
 		 340 aa  132  1.0000000000000001e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1925  Thioredoxin domain-containing protein  34.89 
 
 		 299 aa  130  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0921  thioredoxin domain-containing protein  33.24 
 
 		 301 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.460441 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08240  thioredoxin domain-containing protein  35.98 
 
 		 324 aa  125  1e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6079  thioredoxin domain protein  36.24 
 
 		 326 aa  125  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3886  Thioredoxin domain protein  33.43 
 
 		 312 aa  124  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.54182  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3862  thioredoxin domain-containing protein  34.53 
 
 		 299 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3936  thioredoxin domain-containing protein  34.53 
 
 		 299 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3848  thioredoxin domain-containing protein  34.53 
 
 		 299 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00807359 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4105  Thioredoxin domain protein  36.81 
 
 		 321 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.118303  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1954  Thioredoxin domain protein  32.64 
 
 		 313 aa  116  6e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0686118  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2342  thioredoxin domain-containing protein  30.99 
 
 		 298 aa  113  5e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.299917  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2392  putative thioredoxin  38.49 
 
 		 309 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4303  thioredoxin domain-containing protein  32.86 
 
 		 297 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.408854  normal  0.611787 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11356  thioredoxin  30.59 
 
 		 304 aa  108  1e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000675127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1117  thioredoxin-related protein  31.41 
 
 		 324 aa  104  2e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3607  thioredoxin domain-containing protein  30.84 
 
 		 300 aa  103  6e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.150797 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3988  thioredoxin domain-containing protein  33.21 
 
 		 300 aa  102  8e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000709703 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1268  Thioredoxin domain protein  34.25 
 
 		 323 aa  102  9e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1048  thioredoxin domain-containing protein  33.09 
 
 		 331 aa  102  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.157412  normal  0.991017 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3098  thioredoxin  34.52 
 
 		 333 aa  84.3  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000000032408  hitchhiker  0.0000022841 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3683  thioredoxin-related  31.56 
 
 		 329 aa  79.7  0.00000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.418332  normal  0.641891 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3331  thioredoxin  24.82 
 
 		 287 aa  69.7  0.00000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.108459  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0726  thioredoxin  24.65 
 
 		 281 aa  67.4  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0681266  normal  0.772091 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0318  thioredoxin  27.36 
 
 		 287 aa  67.4  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3711  thioredoxin-related  23.8 
 
 		 312 aa  65.5  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3232  thioredoxin domain-containing protein  26.39 
 
 		 285 aa  65.1  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.941804  normal  0.328637 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0796  thioredoxin  24.3 
 
 		 281 aa  64.7  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0505807  normal  0.147714 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4464  thioredoxin  25.43 
 
 		 302 aa  63.5  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.980457  hitchhiker  0.00575685 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1595  thioredoxin  22.79 
 
 		 287 aa  63.2  0.000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.385204  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0779  putative thioredoxin protein  26.13 
 
 		 280 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.297357  decreased coverage  0.00262303 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1041  thioredoxin  24.32 
 
 		 289 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1982  thioredoxin  24.37 
 
 		 317 aa  60.8  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00653306  normal  0.106397 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2938  thioredoxin  22.89 
 
 		 315 aa  59.7  0.00000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0519  thioredoxin  26.09 
 
 		 280 aa  58.5  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5188  thioredoxin  25.33 
 
 		 302 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0516  thioredoxin  26.91 
 
 		 282 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.695523 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2208  Thioredoxin domain  26.38 
 
 		 300 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.210633  normal  0.190287 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2527  thioredoxin  25.4 
 
 		 293 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2251  thioredoxin domain-containing protein  24.64 
 
 		 302 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.285443 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0893  thioredoxin  24.09 
 
 		 324 aa  57.4  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0822  thioredoxin  25 
 
 		 310 aa  57.4  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.606093  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0081  thioredoxin-related  23.61 
 
 		 310 aa  57.4  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3272  thioredoxin  24.48 
 
 		 326 aa  57.4  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.315754  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0730  thioredoxin  24.77 
 
 		 282 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1063  thioredoxin  28.57 
 
 		 918 aa  57  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.460797  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0903  thioredoxin  24.43 
 
 		 282 aa  57  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0906  thioredoxin  24.43 
 
 		 282 aa  57  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06670  Thioredoxin protein  26.19 
 
 		 289 aa  56.6  0.0000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.697288  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2614  thioredoxin  25.68 
 
 		 282 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1818  thioredoxin  25.17 
 
 		 293 aa  56.6  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0314014 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2485  thioredoxin  25.68 
 
 		 282 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.194267 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2526  Thioredoxin domain  24.91 
 
 		 302 aa  56.2  0.0000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2254  Thioredoxin domain  25.68 
 
 		 338 aa  56.6  0.0000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.708544  normal  0.526752 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3775  thioredoxin  24.78 
 
 		 324 aa  56.2  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.467472 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3284  thioredoxin  25.36 
 
 		 320 aa  56.2  0.0000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4245  thioredoxin  22.12 
 
 		 334 aa  55.5  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.902531  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0719  thioredoxin  23.53 
 
 		 282 aa  55.5  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0060777  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2102  thioredoxin  22.57 
 
 		 291 aa  55.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0661  thioredoxin domain-containing protein  23.98 
 
 		 301 aa  55.8  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0837  thioredoxin  23.89 
 
 		 329 aa  55.8  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24068  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4099  thioredoxin  22.18 
 
 		 324 aa  55.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.809641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2636  thioredoxin  27.41 
 
 		 280 aa  55.1  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3195  Thioredoxin domain protein  30.63 
 
 		 286 aa  55.1  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.64186  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1547  thioredoxin  29.2 
 
 		 302 aa  54.7  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  hitchhiker  0.00479598 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0886  putative thioredoxin protein  25.35 
 
 		 287 aa  54.3  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5898  thioredoxin  24.43 
 
 		 282 aa  54.7  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.769716  normal  0.516195 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1865  thioredoxin  24.91 
 
 		 306 aa  54.3  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.938725 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00581  Thioredoxin domain-containing protein  28.07 
 
 		 289 aa  54.3  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1374  thioredoxin  23.21 
 
 		 286 aa  53.9  0.000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.187591  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0686  thioredoxin  23.57 
 
 		 290 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3864  thioredoxin domain-containing protein  34.38 
 
 		 295 aa  52.8  0.000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0306  putative thioredoxin  23.47 
 
 		 305 aa  53.1  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.351153 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1312  thioredoxin  23.51 
 
 		 302 aa  52.8  0.000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.968155  hitchhiker  0.00158392 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1120  Thioredoxin domain protein  29.09 
 
 		 286 aa  52  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.597878  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2298  thioredoxin domain-containing protein  32.99 
 
 		 287 aa  52.4  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000886101  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3045  thioredoxin  22.83 
 
 		 330 aa  52.4  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1155  thioredoxin domain-containing protein  29.63 
 
 		 294 aa  52.4  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.155818  hitchhiker  0.00000315771 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2017  thioredoxin-like protein  33.66 
 
 		 287 aa  51.6  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2566  thioredoxin  23.53 
 
 		 282 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3023  putative thioredoxin  28.36 
 
 		 289 aa  51.6  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1269  putative thioredoxin  28.36 
 
 		 289 aa  51.6  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.204367 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3161  thioredoxin domain-containing protein  28.36 
 
 		 289 aa  51.6  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.324735  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2590  thioredoxin  22.62 
 
 		 282 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282691  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>