More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_A2497 on replicon NC_008836
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_1063  thioredoxin  98.55 
 
 
918 aa  152  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.460797  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0661  thioredoxin domain-containing protein  100 
 
 
301 aa  149  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2497  thioredoxin  100 
 
 
69 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.224383  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0903  thioredoxin  100 
 
 
282 aa  110  9e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0906  thioredoxin  100 
 
 
282 aa  110  9e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0719  thioredoxin  98 
 
 
282 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0060777  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5898  thioredoxin  92 
 
 
282 aa  101  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.769716  normal  0.516195 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2614  thioredoxin  90 
 
 
282 aa  101  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2485  thioredoxin  90 
 
 
282 aa  101  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.194267 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0730  thioredoxin  90 
 
 
282 aa  100  8e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0516  thioredoxin  86 
 
 
282 aa  99  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.695523 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2590  thioredoxin  88 
 
 
282 aa  98.2  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282691  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1955  thioredoxin  88 
 
 
282 aa  97.8  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180401  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2566  thioredoxin  88 
 
 
282 aa  97.8  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3219  thioredoxin  82 
 
 
282 aa  90.9  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0743  thioredoxin  82 
 
 
282 aa  90.9  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.328705  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3931  thioredoxin  72 
 
 
302 aa  84.7  4e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3279  thioredoxin  72 
 
 
302 aa  84.3  5e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0993  thioredoxin  70 
 
 
318 aa  83.6  9e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.766287 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4561  thioredoxin  70 
 
 
302 aa  82.4  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.712523  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0822  thioredoxin  73.47 
 
 
310 aa  81.6  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.606093  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0198  thioredoxin  66 
 
 
326 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4628  thioredoxin  66 
 
 
341 aa  82  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0779  putative thioredoxin protein  67.35 
 
 
280 aa  79.7  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.297357  decreased coverage  0.00262303 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1547  thioredoxin  68 
 
 
302 aa  80.1  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  hitchhiker  0.00479598 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2636  thioredoxin  71.43 
 
 
280 aa  79.7  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0294  putative thioredoxin protein  64 
 
 
314 aa  79  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.918989  normal  0.0369237 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2914  thioredoxin  69.39 
 
 
285 aa  79  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0796  thioredoxin  65.31 
 
 
281 aa  77.4  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0505807  normal  0.147714 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1305  thioredoxin  68 
 
 
235 aa  77.8  0.00000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.277929  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0726  thioredoxin  65.31 
 
 
281 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0681266  normal  0.772091 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0364  thioredoxin domain-containing protein  64 
 
 
312 aa  76.3  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000110184 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5094  thioredoxin  64 
 
 
306 aa  75.9  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.443129  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1276  thioredoxin domain protein  66 
 
 
337 aa  75.5  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1038  thioredoxin  69.77 
 
 
277 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3775  thioredoxin  67.35 
 
 
324 aa  75.1  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.467472 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3045  thioredoxin  65.31 
 
 
330 aa  74.7  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2371  thioredoxin domain-containing protein  65.31 
 
 
303 aa  73.9  0.0000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.880736 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4099  thioredoxin  65.31 
 
 
324 aa  73.2  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.809641  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3232  thioredoxin domain-containing protein  64.44 
 
 
285 aa  72.4  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.941804  normal  0.328637 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01872  thioredoxin  63.27 
 
 
285 aa  71.6  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0664  Thioredoxin domain protein  50.88 
 
 
282 aa  72  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000362321  hitchhiker  0.00000255831 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0519  thioredoxin  58.18 
 
 
280 aa  71.2  0.000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0835  thioredoxin  64.58 
 
 
304 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0466449 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3272  thioredoxin  65.31 
 
 
326 aa  70.9  0.000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.315754  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2894  thioredoxin  63.27 
 
 
304 aa  70.5  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.225286  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0422  thioredoxin-related  63.27 
 
 
306 aa  70.5  0.000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3886  Thioredoxin domain protein  60 
 
 
312 aa  70.5  0.000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.54182  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0675  thioredoxin domain-containing protein  46.77 
 
 
297 aa  70.5  0.000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.357396  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1489  thioredoxin domain-containing protein  63.27 
 
 
304 aa  70.5  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.481302  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0139  thioredoxin  63.27 
 
 
304 aa  70.5  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.115095  normal  0.47686 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0054  thioredoxin domain-containing protein  72.5 
 
 
311 aa  70.1  0.000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.621806 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1312  thioredoxin  60.38 
 
 
302 aa  70.1  0.000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.968155  hitchhiker  0.00158392 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2208  Thioredoxin domain  61.22 
 
 
300 aa  69.3  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.210633  normal  0.190287 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0035  thioredoxin domain protein  75 
 
 
303 aa  69.7  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000613737 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2376  thioredoxin-related  54.55 
 
 
286 aa  69.3  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.036483  normal  0.757224 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1865  thioredoxin  63.27 
 
 
306 aa  69.3  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.938725 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2127  thioredoxin domain-containing protein  54.39 
 
 
311 aa  68.9  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2251  thioredoxin domain-containing protein  61.22 
 
 
302 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.285443 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2526  Thioredoxin domain  61.22 
 
 
302 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0318  thioredoxin  59.18 
 
 
287 aa  69.3  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1755  thioredoxin  56 
 
 
287 aa  69.3  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0267329  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1452  thioredoxin  60 
 
 
272 aa  68.6  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0296  thioredoxin  61.22 
 
 
306 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0166723 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0306  putative thioredoxin  51.72 
 
 
305 aa  68.2  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.351153 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1982  thioredoxin  57.69 
 
 
317 aa  68.6  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00653306  normal  0.106397 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4464  thioredoxin  49.21 
 
 
302 aa  67.8  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.980457  hitchhiker  0.00575685 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1323  thioredoxin  52.94 
 
 
107 aa  67.8  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.131811  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0893  thioredoxin  62.5 
 
 
324 aa  67.8  0.00000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1374  thioredoxin  61.22 
 
 
286 aa  67.8  0.00000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.187591  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1307  thioredoxin  61.22 
 
 
286 aa  67.4  0.00000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.334323  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0456  thioredoxin  59.18 
 
 
306 aa  67.4  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.666195  normal  0.0589835 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0402  thioredoxin  50.98 
 
 
107 aa  67.4  0.00000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4245  thioredoxin  57.14 
 
 
334 aa  67.4  0.00000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.902531  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2527  thioredoxin  57.14 
 
 
293 aa  66.6  0.00000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5188  thioredoxin  47.62 
 
 
302 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1818  thioredoxin  55.1 
 
 
293 aa  66.6  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0314014 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0268  thioredoxin  59.18 
 
 
306 aa  66.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.223768  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  54 
 
 
108 aa  66.6  0.0000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0943  thioredoxin domain-containing protein  54.9 
 
 
286 aa  66.6  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5023  thioredoxin  56.25 
 
 
290 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.929168  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1595  thioredoxin  54 
 
 
287 aa  66.2  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.385204  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1513  thioredoxin  49.09 
 
 
109 aa  66.2  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000429326  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  54 
 
 
120 aa  66.6  0.0000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0837  thioredoxin  60.42 
 
 
329 aa  66.2  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24068  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  50.98 
 
 
107 aa  65.9  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1908  thioredoxin  54.9 
 
 
106 aa  65.5  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00177252  normal  0.288463 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0577  thioredoxin domain protein  54.17 
 
 
272 aa  65.5  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2645  thioredoxin  63.64 
 
 
150 aa  65.9  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.154957  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0265  thioredoxin  64.29 
 
 
110 aa  65.9  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.28448  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0081  thioredoxin-related  65.85 
 
 
310 aa  65.9  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3284  thioredoxin  60.42 
 
 
320 aa  65.9  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6113  thioredoxin  63.83 
 
 
406 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0560  Thioredoxin domain protein  54.17 
 
 
272 aa  65.5  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2254  Thioredoxin domain  58 
 
 
338 aa  65.5  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.708544  normal  0.526752 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0556  thioredoxin  60.42 
 
 
290 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3864  thioredoxin domain-containing protein  59.18 
 
 
295 aa  65.1  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31565  predicted protein  52.94 
 
 
123 aa  65.1  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2938  thioredoxin  58.33 
 
 
315 aa  65.5  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3331  thioredoxin  52 
 
 
287 aa  65.5  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.108459  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>