More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6113 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6113  thioredoxin  100 
 
 		 406 aa  815    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1188  thioredoxin 1 (redox factor) protein  50.96 
 
 		 108 aa  116  7.999999999999999e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.945237  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1124  thioredoxin  50.96 
 
 		 108 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0722597  normal  0.17575 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1032  thioredoxin  50.96 
 
 		 108 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0280338  normal  0.216175 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2898  thioredoxin  45.71 
 
 		 133 aa  112  9e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.34978  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3312  thioredoxin  43.93 
 
 		 109 aa  112  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124332  normal  0.074373 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  43.93 
 
 		 107 aa  112  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0513  thioredoxin  50 
 
 		 108 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420648 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  43.93 
 
 		 107 aa  112  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  44.86 
 
 		 107 aa  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  44.86 
 
 		 107 aa  111  3e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4110  thioredoxin  50 
 
 		 108 aa  111  3e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.465308  hitchhiker  0.0000724164 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002097  thioredoxin  49.5 
 
 		 108 aa  111  3e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00313258  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0646  thioredoxin  44.34 
 
 		 111 aa  110  3e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.755097  normal  0.893544 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3311  thioredoxin  42.06 
 
 		 125 aa  110  3e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105882  normal  0.0734612 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00337  thioredoxin  49.5 
 
 		 108 aa  111  3e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11291  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  42.99 
 
 		 148 aa  111  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.554772 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2323  thioredoxin  46.67 
 
 		 110 aa  110  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0398  thioredoxin  51.02 
 
 		 108 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  49 
 
 		 108 aa  110  5e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  50.46 
 
 		 109 aa  109  7.000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  42.99 
 
 		 107 aa  109  7.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  42.99 
 
 		 107 aa  109  7.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  42.99 
 
 		 107 aa  109  7.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  42.06 
 
 		 107 aa  109  9.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1138  thioredoxin  48.42 
 
 		 106 aa  109  9.000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.898127  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2195  thioredoxin  46.67 
 
 		 110 aa  109  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.173373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2374  thioredoxin 1  44.76 
 
 		 146 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  42.99 
 
 		 107 aa  108  1e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  42.99 
 
 		 107 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3500  thioredoxin  42.99 
 
 		 107 aa  108  1e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0147  thioredoxin 1  48.51 
 
 		 108 aa  108  1e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000169587  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  45.37 
 
 		 120 aa  108  1e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  43.93 
 
 		 107 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  42.06 
 
 		 107 aa  108  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  42.06 
 
 		 124 aa  108  2e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  51.16 
 
 		 108 aa  108  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2263  thioredoxin  46.67 
 
 		 110 aa  108  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  43.14 
 
 		 110 aa  107  3e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000000131883  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  45.37 
 
 		 108 aa  107  4e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2218  thioredoxin  43.81 
 
 		 146 aa  107  4e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.312249  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3190  thioredoxin  45.71 
 
 		 108 aa  107  4e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.425401  hitchhiker  0.00537167 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0475  thioredoxin  42.86 
 
 		 108 aa  107  4e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3929  thioredoxin  48.98 
 
 		 108 aa  107  5e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3281  thioredoxin  44.04 
 
 		 109 aa  107  5e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2997  thioredoxin  44.55 
 
 		 108 aa  107  5e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.140108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3877  thioredoxin  48.98 
 
 		 108 aa  107  5e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000866569 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0462  thioredoxin  44.04 
 
 		 109 aa  107  5e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000041281  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4070  thioredoxin  48.98 
 
 		 108 aa  107  5e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.282643 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3216  thioredoxin  48.57 
 
 		 108 aa  107  5e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.604019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3952  thioredoxin  48.98 
 
 		 108 aa  107  5e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2246  thioredoxin  45.19 
 
 		 108 aa  106  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4561  thioredoxin  45.71 
 
 		 302 aa  106  6e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.712523  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1364  thioredoxin  45.19 
 
 		 108 aa  106  6e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283304  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2208  thioredoxin  45.19 
 
 		 108 aa  106  6e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155117  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1501  thioredoxin  44.23 
 
 		 110 aa  106  6e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2357  thioredoxin  44.23 
 
 		 110 aa  106  6e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.565357  normal  0.741235 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1125  thioredoxin  45.19 
 
 		 108 aa  106  6e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2698  thioredoxin  47.52 
 
 		 108 aa  107  6e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0171911  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2134  thioredoxin  46.15 
 
 		 108 aa  106  6e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0459983  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0044  thioredoxin  45.19 
 
 		 108 aa  106  6e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0410527  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1853  thioredoxin  45.19 
 
 		 108 aa  106  6e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0570457  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4407  thioredoxin  47.83 
 
 		 113 aa  106  7e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1445  thioredoxin  45.19 
 
 		 108 aa  106  7e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0251303  normal  0.275114 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5129  thioredoxin  45.19 
 
 		 108 aa  106  7e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025918  normal  0.808925 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1739  thioredoxin  45.19 
 
 		 108 aa  106  7e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146348  normal  0.112507 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1852  thioredoxin  45.19 
 
 		 108 aa  106  7e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0771172  normal  0.135016 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1547  thioredoxin  45.95 
 
 		 302 aa  106  7e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  hitchhiker  0.00479598 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2289  thioredoxin  41.58 
 
 		 108 aa  106  7e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000876713  normal  0.363166 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6251  thioredoxin  45.19 
 
 		 108 aa  106  7e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.040042  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1766  thioredoxin  45.19 
 
 		 108 aa  106  7e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.37558  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1828  thioredoxin  45.19 
 
 		 108 aa  106  7e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0156587  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0338  thioredoxin  47.62 
 
 		 108 aa  105  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1307  thioredoxin  44.34 
 
 		 108 aa  105  1e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0404  thioredoxin  44.76 
 
 		 109 aa  105  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.986075 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5276  thioredoxin  47.12 
 
 		 108 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3931  thioredoxin  43.81 
 
 		 302 aa  106  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1344  thioredoxin  44.34 
 
 		 107 aa  105  1e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00788637  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0810  thioredoxin  41.12 
 
 		 107 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195011 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0404  thioredoxin  43.81 
 
 		 109 aa  105  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000190247  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  40.19 
 
 		 107 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0179  thioredoxin  44.9 
 
 		 108 aa  105  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2583  thioredoxin  43.56 
 
 		 110 aa  104  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0639  thioredoxin  44.34 
 
 		 108 aa  104  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2211  thioredoxin  43.88 
 
 		 112 aa  105  2e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000765425  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3279  thioredoxin  43.81 
 
 		 302 aa  105  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0510  thioredoxin 1  44.9 
 
 		 108 aa  105  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0310601 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2805  thioredoxin  45.19 
 
 		 109 aa  105  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.686799 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2185  thioredoxin  43.88 
 
 		 112 aa  105  2e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.0000121318  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4115  thioredoxin  40.19 
 
 		 107 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4035  thioredoxin  44.9 
 
 		 108 aa  105  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0966495  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47420  Thioredoxin 1, trx1  44.55 
 
 		 108 aa  104  3e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0993  thioredoxin  46.67 
 
 		 318 aa  104  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.766287 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0360  thioredoxin  41.58 
 
 		 109 aa  104  4e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0406  thioredoxin 1  47.96 
 
 		 108 aa  103  4e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2117  thioredoxin  45.19 
 
 		 108 aa  104  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124376  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2084  thioredoxin  39.25 
 
 		 107 aa  103  4e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0410  thioredoxin  47.96 
 
 		 108 aa  103  4e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3615  thioredoxin  47.96 
 
 		 108 aa  103  4e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3433  thioredoxin  49.47 
 
 		 108 aa  104  4e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>