More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0737 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_0737  thioredoxin  100 
 
 
104 aa  207  5e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0942767  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2664  thioredoxin  54.9 
 
 
104 aa  118  3e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0156  thioredoxin  50 
 
 
108 aa  110  5e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03659  thioredoxin  46.08 
 
 
109 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000771604  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4196  thioredoxin  46.08 
 
 
109 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000515955  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4004  thioredoxin  46.08 
 
 
109 aa  109  1.0000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.897528  decreased coverage  0.00429034 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4196  thioredoxin  46.08 
 
 
109 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5214  thioredoxin  46.08 
 
 
109 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4222  thioredoxin  46.08 
 
 
109 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00219843  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4245  thioredoxin  46.08 
 
 
109 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.775484  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4145  thioredoxin  46.08 
 
 
109 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4140  thioredoxin  46.08 
 
 
109 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03608  hypothetical protein  46.08 
 
 
109 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000236523  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4142  thioredoxin  46.08 
 
 
109 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4292  thioredoxin  46.08 
 
 
109 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3997  thioredoxin  46.08 
 
 
109 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0203  thioredoxin  49.02 
 
 
108 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4127  thioredoxin  46.08 
 
 
109 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4304  thioredoxin  46.08 
 
 
109 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.234233  normal  0.940905 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0076  thioredoxin  48.08 
 
 
106 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0551582  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0091  thioredoxin 1, redox factor  46.15 
 
 
106 aa  108  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal  0.939622 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4012  thioredoxin  47.06 
 
 
108 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0630  thioredoxin  47.12 
 
 
106 aa  107  5e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.367457 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0388  thioredoxin  48.08 
 
 
106 aa  107  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155079  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0201  thioredoxin  47.12 
 
 
106 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0051  thioredoxin  48.08 
 
 
106 aa  107  8.000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.155345 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0810  thioredoxin  47.52 
 
 
107 aa  107  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195011 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4035  thioredoxin  44.12 
 
 
108 aa  106  9.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0966495  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0513  thioredoxin  50 
 
 
108 aa  106  9.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00420648 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0510  thioredoxin 1  44.12 
 
 
108 aa  106  9.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0310601 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2350  thioredoxin  54.9 
 
 
104 aa  106  9.000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0179  thioredoxin  44.12 
 
 
108 aa  106  9.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  48.04 
 
 
108 aa  106  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0059  thioredoxin  48.08 
 
 
106 aa  105  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4204  thioredoxin  46.08 
 
 
108 aa  106  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  46.53 
 
 
107 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3241  thioredoxin  48.51 
 
 
107 aa  105  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0156  thioredoxin  47.12 
 
 
106 aa  104  4e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.534304 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  48.96 
 
 
108 aa  103  6e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4110  thioredoxin  49.02 
 
 
108 aa  103  7e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.465308  hitchhiker  0.0000724164 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  44.12 
 
 
107 aa  103  8e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  47.92 
 
 
107 aa  103  8e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3311  thioredoxin  45.19 
 
 
125 aa  103  8e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105882  normal  0.0734612 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0159  thioredoxin  45.1 
 
 
108 aa  103  9e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.447164 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2682  thioredoxin  46.15 
 
 
106 aa  103  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.899838  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0175  thioredoxin  47.06 
 
 
108 aa  102  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1294  thioredoxin  45.54 
 
 
108 aa  103  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316672  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0398  thioredoxin  47.06 
 
 
108 aa  102  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0811  thioredoxin  49 
 
 
105 aa  102  2e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03717  thioredoxin  45.19 
 
 
113 aa  102  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0646  thioredoxin  38.1 
 
 
111 aa  102  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.755097  normal  0.893544 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0338  thioredoxin  48.51 
 
 
108 aa  102  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1896  thioredoxin  46.53 
 
 
102 aa  101  3e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00263225  hitchhiker  0.00000000000000449088 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5457  thioredoxin  41.9 
 
 
109 aa  101  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0195643 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31565  predicted protein  44.55 
 
 
123 aa  101  3e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2323  thioredoxin  41.9 
 
 
110 aa  101  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11291  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  43.56 
 
 
148 aa  101  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.554772 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0816  thioredoxin  46 
 
 
107 aa  101  4e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5215  thioredoxin  41.9 
 
 
109 aa  100  5e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5124  thioredoxin  41.9 
 
 
109 aa  100  5e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.855003 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  43.56 
 
 
107 aa  100  5e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  43.56 
 
 
107 aa  100  6e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1358  thioredoxin  51.49 
 
 
107 aa  100  6e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  44.23 
 
 
107 aa  100  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3877  thioredoxin  46.08 
 
 
108 aa  100  7e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000866569 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3929  thioredoxin  46.08 
 
 
108 aa  100  7e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  44.12 
 
 
107 aa  100  7e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4115  thioredoxin  44.12 
 
 
107 aa  100  7e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4070  thioredoxin  46.08 
 
 
108 aa  100  7e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.282643 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3952  thioredoxin  46.08 
 
 
108 aa  100  7e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  43.56 
 
 
107 aa  100  8e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0028  thioredoxin  49.48 
 
 
106 aa  100  8e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  43.56 
 
 
107 aa  100  8e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3500  thioredoxin  44.12 
 
 
107 aa  99.8  1e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0406  thioredoxin 1  46.08 
 
 
108 aa  99.8  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5243  thioredoxin  41.9 
 
 
109 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1206  thioredoxin  45.83 
 
 
109 aa  99.8  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.232039  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0147  thioredoxin 1  43.27 
 
 
108 aa  99.8  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000169587  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3022  thioredoxin  48 
 
 
108 aa  100  1e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  42.57 
 
 
124 aa  99.8  1e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3433  thioredoxin  42.31 
 
 
104 aa  99.8  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.513588  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1996  thioredoxin  42.72 
 
 
106 aa  99.4  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2289  thioredoxin  43.27 
 
 
108 aa  99.4  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000876713  normal  0.363166 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0373  thioredoxin  45 
 
 
105 aa  99.4  1e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3582  thioredoxin  45.54 
 
 
107 aa  99.4  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.968394  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0410  thioredoxin  46.08 
 
 
108 aa  99.8  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3615  thioredoxin  46.08 
 
 
108 aa  99.8  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  41.9 
 
 
110 aa  99.4  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000000131883  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3658  thioredoxin  42.59 
 
 
110 aa  99.4  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00522541  normal  0.779583 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0409  thioredoxin  46.08 
 
 
108 aa  99.8  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00884025 
 
 
-
 
NC_002620  TC0826  thioredoxin  45.1 
 
 
102 aa  98.6  2e-20  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.000363889  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0057  thioredoxin  42.16 
 
 
109 aa  99  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2105  thioredoxin  45 
 
 
107 aa  98.6  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0422234  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  42.57 
 
 
107 aa  99  2e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  42.57 
 
 
107 aa  99  2e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  42.57 
 
 
107 aa  99  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0448  thioredoxin  44.12 
 
 
108 aa  99  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2021  thioredoxin  45 
 
 
107 aa  98.6  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000945216  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3216  thioredoxin  46.53 
 
 
108 aa  99  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.604019  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1501  thioredoxin  41.9 
 
 
110 aa  99  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>