More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1133 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_1133  thioredoxin  100 
 
 		 98 aa  199  9.999999999999999e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.114517  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2310  thioredoxin  58.62 
 
 		 88 aa  118  3e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0316182  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1798  thioredoxin domain-containing protein  62.96 
 
 		 90 aa  108  2.0000000000000002e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.317909  normal  0.703085 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0311  hypothetical protein  51.69 
 
 		 102 aa  106  1e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1024  Thioredoxin domain protein  52.94 
 
 		 91 aa  103  8e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7155  thioredoxin  52.22 
 
 		 98 aa  103  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3175  thioredoxin-related  49.44 
 
 		 90 aa  99  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1679  thioredoxin  46.94 
 
 		 98 aa  98.6  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0984  thioredoxin  45.35 
 
 		 110 aa  98.2  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1851  thioredoxin-related  47.06 
 
 		 89 aa  98.2  4e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.378293  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  44.33 
 
 		 105 aa  97.4  6e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000201022  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0301  thioredoxin  45.98 
 
 		 106 aa  95.9  1e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1307  thioredoxin  47.37 
 
 		 108 aa  96.7  1e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  45.16 
 
 		 108 aa  95.9  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3919  thioredoxin  44.57 
 
 		 103 aa  95.5  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.566246  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0858  thioredoxin  39.58 
 
 		 106 aa  95.5  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.782394  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2134  thioredoxin  44.32 
 
 		 108 aa  95.1  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0459983  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1188  thioredoxin 1 (redox factor) protein  44.33 
 
 		 108 aa  94.4  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.945237  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1200  Thioredoxin domain protein  45.88 
 
 		 98 aa  94.4  5e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2208  thioredoxin  44.33 
 
 		 108 aa  94  6e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155117  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1445  thioredoxin  44.33 
 
 		 108 aa  94  6e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0251303  normal  0.275114 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1739  thioredoxin  44.33 
 
 		 108 aa  94  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146348  normal  0.112507 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1364  thioredoxin  44.33 
 
 		 108 aa  94  6e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283304  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2246  thioredoxin  44.33 
 
 		 108 aa  94  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2117  thioredoxin  44.33 
 
 		 108 aa  94  6e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124376  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1124  thioredoxin  45.36 
 
 		 108 aa  94  6e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0722597  normal  0.17575 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5129  thioredoxin  44.33 
 
 		 108 aa  94  6e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025918  normal  0.808925 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0044  thioredoxin  44.33 
 
 		 108 aa  94  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0410527  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1032  thioredoxin  45.36 
 
 		 108 aa  94  6e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0280338  normal  0.216175 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6251  thioredoxin  44.33 
 
 		 108 aa  94  6e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.040042  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1852  thioredoxin  44.33 
 
 		 108 aa  94  6e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0771172  normal  0.135016 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1766  thioredoxin  44.33 
 
 		 108 aa  94  6e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.37558  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0639  thioredoxin  46.39 
 
 		 108 aa  94  6e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2805  thioredoxin  46.59 
 
 		 109 aa  94  6e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.686799 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1828  thioredoxin  44.33 
 
 		 108 aa  94  6e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0156587  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1125  thioredoxin  44.33 
 
 		 108 aa  94  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1853  thioredoxin  44.33 
 
 		 108 aa  94  6e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0570457  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2374  thioredoxin 1  44.33 
 
 		 146 aa  93.6  8e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2065  thioredoxin  44.09 
 
 		 110 aa  93.6  8e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.568423 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1658  thioredoxin domain-containing protein  47.31 
 
 		 95 aa  93.6  8e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0579498  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  44.09 
 
 		 105 aa  93.6  8e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5402  thioredoxin  43.18 
 
 		 107 aa  93.6  8e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04950  thioredoxin  44.32 
 
 		 105 aa  93.6  9e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  43.96 
 
 		 109 aa  93.2  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2218  thioredoxin  44.33 
 
 		 146 aa  92.8  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.312249  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0360  thioredoxin  45.74 
 
 		 109 aa  92.8  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2211  thioredoxin  47.42 
 
 		 108 aa  93.2  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0210  thioredoxin  45.16 
 
 		 108 aa  92.8  1e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  42.27 
 
 		 110 aa  92.4  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000000131883  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0093  thioredoxin  43.75 
 
 		 106 aa  92.8  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00548015 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2784  thioredoxin  46.81 
 
 		 127 aa  92.4  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0698118 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0462  thioredoxin  44.09 
 
 		 109 aa  91.7  3e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000041281  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1563  Thioredoxin domain protein  44.58 
 
 		 100 aa  91.7  3e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.851055  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4105  thioredoxin  41.49 
 
 		 109 aa  90.9  5e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.031473  normal  0.0324646 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3655  thioredoxin  47.42 
 
 		 108 aa  90.9  6e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000417679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2548  thioredoxin  46.59 
 
 		 109 aa  90.9  6e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.543523  normal  0.158534 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1129  thioredoxin  46.99 
 
 		 137 aa  90.5  6e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2158  thioredoxin  43.3 
 
 		 105 aa  90.5  6e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1908  thioredoxin  48.31 
 
 		 106 aa  90.5  7e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00177252  normal  0.288463 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  42.55 
 
 		 108 aa  90.5  7e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3301  thioredoxin  43.62 
 
 		 106 aa  90.5  7e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00133271  normal  0.624218 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0136  thioredoxin  43.96 
 
 		 107 aa  90.5  8e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000946631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  40.43 
 
 		 107 aa  90.1  9e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4580  thioredoxin  47.31 
 
 		 107 aa  90.1  9e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.90902  hitchhiker  0.00134414 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2362  thioredoxin  43.3 
 
 		 108 aa  90.1  9e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0224789  normal  0.140308 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0950  thioredoxin  43.3 
 
 		 108 aa  90.1  9e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.263431  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1825  thioredoxin  43.3 
 
 		 108 aa  90.1  9e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0606148  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  44.33 
 
 		 107 aa  89.7  1e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1476  thioredoxin  46.81 
 
 		 223 aa  89.7  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00459132  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  44.33 
 
 		 107 aa  89.7  1e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  43.02 
 
 		 107 aa  89.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3675  thioredoxin  43.02 
 
 		 109 aa  89.7  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.852228 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1353  thioredoxin C-2  41.84 
 
 		 98 aa  89.7  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.114748  normal  0.184208 
 
 
-
 
NC_002950  PG0034  thioredoxin  41.67 
 
 		 104 aa  89.4  2e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0649  hypothetical protein  42.39 
 
 		 109 aa  89.4  2e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.698912 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  43.3 
 
 		 124 aa  89  2e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2185  thioredoxin  38.71 
 
 		 112 aa  88.6  2e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.0000121318  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3540  Thioredoxin domain protein  42.17 
 
 		 89 aa  89  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39680  thioredoxin  43.02 
 
 		 108 aa  89  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.333633 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0630  thioredoxin  41.94 
 
 		 107 aa  89  2e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000762931  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2149  thioredoxin  44.94 
 
 		 108 aa  89.4  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2211  thioredoxin  38.71 
 
 		 112 aa  88.6  2e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000765425  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0661  thioredoxin  43.01 
 
 		 107 aa  88.6  3e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0695  thioredoxin  43.01 
 
 		 107 aa  88.6  3e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2340  thioredoxin  41.49 
 
 		 108 aa  88.2  3e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0697906  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6430  thioredoxin  43.75 
 
 		 106 aa  88.2  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0187  thioredoxin  38.95 
 
 		 108 aa  88.6  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00849594 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  43.3 
 
 		 107 aa  88.6  3e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4860  thioredoxin  41.49 
 
 		 107 aa  88.6  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.110096  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2898  thioredoxin  41.49 
 
 		 133 aa  88.6  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.34978  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2289  thioredoxin  42.39 
 
 		 108 aa  88.6  3e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000876713  normal  0.363166 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2518  thioredoxin  38.37 
 
 		 141 aa  88.2  3e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3294  thioredoxin  40.43 
 
 		 109 aa  88.2  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00620964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  43.62 
 
 		 115 aa  88.6  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3190  thioredoxin  42.11 
 
 		 108 aa  88.2  3e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.425401  hitchhiker  0.00537167 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0832  thioredoxin  45.78 
 
 		 105 aa  87.8  4e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  37.23 
 
 		 107 aa  88.2  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1996  thioredoxin  40.23 
 
 		 106 aa  87.8  4e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3067  thioredoxin  40.91 
 
 		 109 aa  87.8  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.788534  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3022  thioredoxin  42.22 
 
 		 112 aa  87.8  4e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>