More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0311 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0311  hypothetical protein  100 
 
 		 102 aa  207  4e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1798  thioredoxin domain-containing protein  68.54 
 
 		 90 aa  134  3.0000000000000003e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.317909  normal  0.703085 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1024  Thioredoxin domain protein  57.3 
 
 		 91 aa  113  6.9999999999999995e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3175  thioredoxin-related  53.93 
 
 		 90 aa  110  8.000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1133  thioredoxin  51.69 
 
 		 98 aa  106  1e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.114517  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1658  thioredoxin domain-containing protein  54.84 
 
 		 95 aa  103  7e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0579498  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1851  thioredoxin-related  52.81 
 
 		 89 aa  100  9e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.378293  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2310  thioredoxin  51.72 
 
 		 88 aa  98.6  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0316182  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7155  thioredoxin  47.62 
 
 		 98 aa  90.5  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3849  thioredoxin  43.02 
 
 		 108 aa  89.4  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3540  Thioredoxin domain protein  44.58 
 
 		 89 aa  90.1  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0649  hypothetical protein  44.32 
 
 		 109 aa  89  2e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.698912 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1563  Thioredoxin domain protein  44.58 
 
 		 100 aa  89  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.851055  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2662  thioredoxin  44.05 
 
 		 105 aa  89.4  2e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  6.93824e-25  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1908  thioredoxin  45.12 
 
 		 106 aa  87.4  6e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00177252  normal  0.288463 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  44.58 
 
 		 107 aa  86.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0301  thioredoxin  43.48 
 
 		 106 aa  86.3  1e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08920  thioredoxin  47.44 
 
 		 102 aa  84.7  4e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000942681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0373  thioredoxin  46.34 
 
 		 105 aa  84.3  5e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1129  thioredoxin  44.19 
 
 		 105 aa  84  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1160  thioredoxin  44.19 
 
 		 105 aa  84  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0193016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1138  thioredoxin  41.46 
 
 		 106 aa  83.6  8e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.898127  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2211  thioredoxin  38.2 
 
 		 108 aa  82.8  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0427  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  45.68 
 
 		 103 aa  83.2  0.000000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  1.66857e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  39.13 
 
 		 105 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  42.39 
 
 		 110 aa  82  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000000131883  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1372  thioredoxin  43.02 
 
 		 110 aa  82  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00473089  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04950  thioredoxin  41.3 
 
 		 105 aa  82.4  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2158  thioredoxin  40.7 
 
 		 105 aa  82  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2645  thioredoxin  40.22 
 
 		 150 aa  82  0.000000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.154957  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  39.33 
 
 		 109 aa  81.6  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  44.94 
 
 		 109 aa  82  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  43.02 
 
 		 105 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000201022  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0143  thioredoxin  35.58 
 
 		 104 aa  80.9  0.000000000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3230  thioredoxin  42.7 
 
 		 109 aa  80.9  0.000000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000930614  normal  0.223494 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0183  thioredoxin  35.58 
 
 		 104 aa  80.9  0.000000000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1200  Thioredoxin domain protein  44.44 
 
 		 98 aa  80.5  0.000000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2518  thioredoxin  40.24 
 
 		 141 aa  80.5  0.000000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0372  Thioredoxin domain protein  43.75 
 
 		 89 aa  80.5  0.000000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.652561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  42.68 
 
 		 107 aa  80.1  0.000000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  42.68 
 
 		 107 aa  80.1  0.000000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  42.68 
 
 		 107 aa  80.1  0.000000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3312  thioredoxin  41.86 
 
 		 109 aa  80.1  0.000000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124332  normal  0.074373 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  42.68 
 
 		 107 aa  80.1  0.000000000000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0312  Thioredoxin domain protein  42.68 
 
 		 88 aa  79.7  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  41.46 
 
 		 107 aa  80.1  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0326  Thioredoxin domain protein  45.12 
 
 		 88 aa  80.1  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1978  thioredoxin  39.33 
 
 		 111 aa  80.1  0.00000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.274716  normal  0.21653 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  42.39 
 
 		 108 aa  79.7  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0162  thioredoxin  35.58 
 
 		 104 aa  80.1  0.00000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1412  thioredoxin  34.62 
 
 		 104 aa  79.3  0.00000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1320  thioredoxin  43.53 
 
 		 105 aa  79.3  0.00000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.113501  normal  0.148362 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1513  thioredoxin  43.02 
 
 		 109 aa  79  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000429326  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0034  thioredoxin  40.23 
 
 		 104 aa  79  0.00000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  41.46 
 
 		 107 aa  79  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0691  thioredoxin  39.53 
 
 		 105 aa  79.3  0.00000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3500  thioredoxin  42.17 
 
 		 107 aa  79  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1456  thioredoxin  39.56 
 
 		 109 aa  78.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1359  thioredoxin  39.56 
 
 		 109 aa  78.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0473  thioredoxin  37.78 
 
 		 107 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.319728  normal  0.0128632 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1625  thioredoxin  37.78 
 
 		 107 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4105  thioredoxin  40.7 
 
 		 109 aa  79.3  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.031473  normal  0.0324646 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  41.46 
 
 		 107 aa  79  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3336  thioredoxin  41.67 
 
 		 259 aa  78.2  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  40.24 
 
 		 124 aa  78.6  0.00000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  43.02 
 
 		 115 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11291  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  40.7 
 
 		 148 aa  78.2  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.554772 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0428  thioredoxin  42.53 
 
 		 110 aa  78.2  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0404  thioredoxin  41.57 
 
 		 109 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.986075 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0539  thioredoxin  42.86 
 
 		 104 aa  78.2  0.00000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000729683  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0402  thioredoxin  37.5 
 
 		 107 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0136  thioredoxin  36.96 
 
 		 107 aa  78.2  0.00000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000946631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3437  thioredoxin  36.47 
 
 		 107 aa  78.2  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1358  thioredoxin  37.08 
 
 		 107 aa  78.2  0.00000000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0410  thioredoxin  40 
 
 		 141 aa  77.8  0.00000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0363  thioredoxin  39.53 
 
 		 109 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000145924  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1353  thioredoxin C-2  41.38 
 
 		 98 aa  77.8  0.00000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.114748  normal  0.184208 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1675  thioredoxin  40.22 
 
 		 110 aa  77.8  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.140064  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6068  thioredoxin  40.48 
 
 		 110 aa  77.8  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150927 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1323  thioredoxin  37.8 
 
 		 107 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.131811  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3281  thioredoxin  40.96 
 
 		 109 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2067  thioredoxin  36.59 
 
 		 107 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2496  thioredoxin  39.56 
 
 		 109 aa  77.4  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.182202  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0404  thioredoxin  40.45 
 
 		 109 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000190247  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2664  thioredoxin  42.39 
 
 		 104 aa  77.4  0.00000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3919  thioredoxin  39.29 
 
 		 103 aa  77  0.00000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.566246  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0816  thioredoxin  35.56 
 
 		 107 aa  77.4  0.00000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  40.96 
 
 		 107 aa  77  0.00000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0215  thioredoxin  35.24 
 
 		 105 aa  77  0.00000000000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.370161  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1717  thioredoxin  40 
 
 		 104 aa  77  0.00000000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.589398  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4222  thioredoxin  39.13 
 
 		 108 aa  77  0.00000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0161465  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0462  thioredoxin  39.02 
 
 		 109 aa  77  0.00000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000041281  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5402  thioredoxin  40.48 
 
 		 107 aa  77  0.00000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1142  thioredoxin  34.62 
 
 		 104 aa  76.3  0.0000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2021  thioredoxin  35.56 
 
 		 107 aa  76.6  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000945216  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2105  thioredoxin  35.56 
 
 		 107 aa  76.6  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0422234  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3070  thioredoxin  43.53 
 
 		 105 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.990711  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6383  thioredoxin  45.35 
 
 		 101 aa  76.6  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.920622 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1837  thioredoxin  38.82 
 
 		 110 aa  76.6  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4260  thioredoxin  40.7 
 
 		 105 aa  76.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.910277 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>