More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3540 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_3540  Thioredoxin domain protein  100 
 
 		 89 aa  181  3e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1563  Thioredoxin domain protein  93.26 
 
 		 100 aa  174  4e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.851055  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0312  Thioredoxin domain protein  84.27 
 
 		 88 aa  153  7e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0372  Thioredoxin domain protein  75.28 
 
 		 89 aa  143  6e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.652561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0326  Thioredoxin domain protein  76.4 
 
 		 88 aa  139  9.999999999999999e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0311  hypothetical protein  44.58 
 
 		 102 aa  90.1  9e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1133  thioredoxin  42.17 
 
 		 98 aa  89  2e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.114517  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3919  thioredoxin  43.37 
 
 		 103 aa  87.4  6e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.566246  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3175  thioredoxin-related  47.06 
 
 		 90 aa  86.7  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0922  thioredoxin  41.67 
 
 		 108 aa  86.3  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1024  Thioredoxin domain protein  48.15 
 
 		 91 aa  85.9  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5898  thioredoxin  54.29 
 
 		 282 aa  85.9  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.769716  normal  0.516195 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1955  thioredoxin  52.05 
 
 		 282 aa  85.5  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180401  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0730  thioredoxin  50.68 
 
 		 282 aa  85.5  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2566  thioredoxin  52.05 
 
 		 282 aa  85.5  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0836  thioredoxin  42.86 
 
 		 104 aa  85.1  3e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2310  thioredoxin  48.68 
 
 		 88 aa  85.1  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0316182  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2485  thioredoxin  50.7 
 
 		 282 aa  85.1  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.194267 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2614  thioredoxin  50.7 
 
 		 282 aa  85.1  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2590  thioredoxin  52.05 
 
 		 282 aa  85.1  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1142  thioredoxin  42.86 
 
 		 104 aa  85.1  3e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0473  thioredoxin  40.96 
 
 		 107 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.319728  normal  0.0128632 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0143  thioredoxin  42.86 
 
 		 104 aa  84.3  4e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0183  thioredoxin  42.86 
 
 		 104 aa  84.3  4e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0215  thioredoxin  42.17 
 
 		 105 aa  84  7e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.370161  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0516  thioredoxin  47.3 
 
 		 282 aa  84  7e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.695523 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0162  thioredoxin  41.67 
 
 		 104 aa  83.6  8e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0903  thioredoxin  51.43 
 
 		 282 aa  83.6  8e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0906  thioredoxin  51.43 
 
 		 282 aa  83.6  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0661  thioredoxin domain-containing protein  51.43 
 
 		 301 aa  83.6  9e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1625  thioredoxin  39.76 
 
 		 107 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  41.25 
 
 		 105 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0295  thioredoxin  41.67 
 
 		 104 aa  82.8  0.000000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0171  thioredoxin  38.1 
 
 		 105 aa  82  0.000000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.620565  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0719  thioredoxin  51.43 
 
 		 282 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0060777  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  41.98 
 
 		 108 aa  82  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1908  thioredoxin  39.02 
 
 		 106 aa  82  0.000000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00177252  normal  0.288463 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A34  Thiol-disulfide isomerase  41.18 
 
 		 108 aa  81.6  0.000000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0201899  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0649  hypothetical protein  40.24 
 
 		 109 aa  81.6  0.000000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.698912 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1206  thioredoxin  39.29 
 
 		 109 aa  81.3  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.232039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3584  thioredoxin  41.67 
 
 		 108 aa  81.6  0.000000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0328783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1798  thioredoxin domain-containing protein  46.25 
 
 		 90 aa  81.3  0.000000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.317909  normal  0.703085 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1150  thioredoxin  39.76 
 
 		 109 aa  81.3  0.000000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000755865  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0743  thioredoxin  42.35 
 
 		 282 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.328705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1200  Thioredoxin domain protein  36.47 
 
 		 98 aa  80.9  0.000000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1372  thioredoxin  38.1 
 
 		 110 aa  80.9  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00473089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3219  thioredoxin  42.35 
 
 		 282 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0452  thioredoxin 2  41.77 
 
 		 140 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3849  thioredoxin  34.12 
 
 		 108 aa  80.5  0.000000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0818  thioredoxin  43.68 
 
 		 136 aa  79.7  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1226  thioredoxin  42.17 
 
 		 104 aa  80.1  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0813  thioredoxin  37.35 
 
 		 109 aa  80.1  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4035  thioredoxin  38.1 
 
 		 108 aa  80.1  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0966495  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  38.27 
 
 		 107 aa  79.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1867  thioredoxin  35.71 
 
 		 106 aa  79.7  0.00000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.115873  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4174  thioredoxin  38.55 
 
 		 107 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0510  thioredoxin 1  38.1 
 
 		 108 aa  80.1  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0310601 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0179  thioredoxin  38.1 
 
 		 108 aa  80.1  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1851  thioredoxin-related  42.86 
 
 		 89 aa  80.1  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.378293  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1837  thioredoxin  42.17 
 
 		 110 aa  79.7  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1204  thioredoxin  42.17 
 
 		 104 aa  80.1  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3336  thioredoxin  41.98 
 
 		 259 aa  79.7  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0210  thioredoxin  39.76 
 
 		 108 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  39.51 
 
 		 107 aa  79  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2645  thioredoxin  40.24 
 
 		 150 aa  79  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.154957  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  39.51 
 
 		 107 aa  79  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1261  thioredoxin  36.14 
 
 		 109 aa  79  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.262262  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1412  thioredoxin  38.1 
 
 		 104 aa  79  0.00000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  40 
 
 		 107 aa  79  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  39.51 
 
 		 107 aa  79  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  40 
 
 		 107 aa  79  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  40 
 
 		 107 aa  79  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01872  thioredoxin  40.23 
 
 		 285 aa  78.6  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0136  thioredoxin  40.24 
 
 		 107 aa  79.3  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000946631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1196  thioredoxin  37.35 
 
 		 109 aa  79  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2914  thioredoxin  39.08 
 
 		 285 aa  79.3  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4442  thioredoxin  37.04 
 
 		 119 aa  78.2  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.553221 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2067  thioredoxin  35.8 
 
 		 107 aa  78.2  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04950  thioredoxin  38.55 
 
 		 105 aa  78.2  0.00000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1063  thioredoxin  51.43 
 
 		 918 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.460797  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  38.55 
 
 		 105 aa  77.8  0.00000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000201022  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4956  thioredoxin  36.59 
 
 		 106 aa  77.8  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.183907 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0888  thioredoxin  38.55 
 
 		 141 aa  78.2  0.00000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.747507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0318  thioredoxin  41.46 
 
 		 287 aa  77.8  0.00000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5927  thioredoxin  38.55 
 
 		 110 aa  78.2  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3584  thioredoxin  40.24 
 
 		 109 aa  77.8  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00016677  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1708  thioredoxin  38.1 
 
 		 110 aa  78.2  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00102285  normal  0.772138 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1129  thioredoxin  43.84 
 
 		 137 aa  77.8  0.00000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4906  thioredoxin  36.59 
 
 		 106 aa  77.8  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.803641  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0728  thioredoxin  40.96 
 
 		 104 aa  77.8  0.00000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1374  thioredoxin  41.38 
 
 		 286 aa  77.4  0.00000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.187591  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0530  thioredoxin  36.9 
 
 		 114 aa  77.4  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.303131  normal  0.878071 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1546  thioredoxin  36.14 
 
 		 114 aa  77.8  0.00000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.350487  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0360  thioredoxin  32.93 
 
 		 109 aa  77.4  0.00000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1307  thioredoxin  41.38 
 
 		 286 aa  77.4  0.00000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.334323  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0993  thioredoxin  42.17 
 
 		 318 aa  77.4  0.00000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.766287 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1138  thioredoxin  35.37 
 
 		 106 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.898127  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2636  thioredoxin  40.24 
 
 		 280 aa  77.4  0.00000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2518  thioredoxin  40.74 
 
 		 141 aa  77.4  0.00000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3312  thioredoxin  39.51 
 
 		 109 aa  77.4  0.00000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124332  normal  0.074373 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>