More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1679 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1679  thioredoxin  100 
 
 		 98 aa  198  1.9999999999999998e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2784  thioredoxin  70.41 
 
 		 127 aa  150  4e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0698118 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7155  thioredoxin  70.21 
 
 		 98 aa  142  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1353  thioredoxin C-2  52.04 
 
 		 98 aa  122  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.114748  normal  0.184208 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1307  thioredoxin  54.08 
 
 		 108 aa  109  1.0000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0639  thioredoxin  52.04 
 
 		 108 aa  107  4.0000000000000004e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2117  thioredoxin  51.04 
 
 		 108 aa  104  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124376  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2134  thioredoxin  50 
 
 		 108 aa  103  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0459983  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6383  thioredoxin  51.58 
 
 		 101 aa  104  5e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.920622 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1188  thioredoxin 1 (redox factor) protein  50 
 
 		 108 aa  103  6e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.945237  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3437  thioredoxin  53.93 
 
 		 107 aa  103  8e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0093  thioredoxin  49.47 
 
 		 106 aa  102  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00548015 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1124  thioredoxin  48.98 
 
 		 108 aa  102  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0722597  normal  0.17575 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5129  thioredoxin  47.96 
 
 		 108 aa  102  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025918  normal  0.808925 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1445  thioredoxin  47.96 
 
 		 108 aa  102  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0251303  normal  0.275114 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1852  thioredoxin  47.96 
 
 		 108 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0771172  normal  0.135016 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1739  thioredoxin  47.96 
 
 		 108 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146348  normal  0.112507 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6251  thioredoxin  47.96 
 
 		 108 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.040042  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1766  thioredoxin  47.96 
 
 		 108 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.37558  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1828  thioredoxin  47.96 
 
 		 108 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0156587  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1032  thioredoxin  48.98 
 
 		 108 aa  102  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0280338  normal  0.216175 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2682  thioredoxin  45.83 
 
 		 106 aa  101  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.899838  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1364  thioredoxin  46.94 
 
 		 108 aa  101  4e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283304  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2246  thioredoxin  46.94 
 
 		 108 aa  101  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0044  thioredoxin  46.94 
 
 		 108 aa  101  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0410527  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1125  thioredoxin  46.94 
 
 		 108 aa  101  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2208  thioredoxin  46.94 
 
 		 108 aa  101  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155117  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1853  thioredoxin  46.94 
 
 		 108 aa  101  4e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0570457  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2374  thioredoxin 1  46.94 
 
 		 146 aa  100  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2340  thioredoxin  44.68 
 
 		 108 aa  100  5e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0697906  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0530  thioredoxin  48.42 
 
 		 114 aa  100  6e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.303131  normal  0.878071 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0127  thioredoxin  46.15 
 
 		 108 aa  100  7e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000655412  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2218  thioredoxin  46.94 
 
 		 146 aa  100  9e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.312249  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4580  thioredoxin  46.81 
 
 		 107 aa  99  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.90902  hitchhiker  0.00134414 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0950  thioredoxin  46.88 
 
 		 108 aa  99  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.263431  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1825  thioredoxin  46.88 
 
 		 108 aa  98.6  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0606148  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2362  thioredoxin  46.88 
 
 		 108 aa  98.6  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0224789  normal  0.140308 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4260  thioredoxin  50 
 
 		 105 aa  99  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.910277 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0357  thioredoxin  45.26 
 
 		 108 aa  98.6  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01370  thioredoxin C-2  41.84 
 
 		 98 aa  98.6  2e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.602659  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3003  hypothetical protein  43.75 
 
 		 108 aa  98.6  3e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2864  hypothetical protein  43.75 
 
 		 108 aa  98.6  3e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2357  thioredoxin  47.37 
 
 		 110 aa  98.6  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.565357  normal  0.741235 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1501  thioredoxin  47.37 
 
 		 110 aa  98.6  3e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1133  thioredoxin  46.94 
 
 		 98 aa  98.6  3e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.114517  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0858  thioredoxin  54.67 
 
 		 106 aa  97.8  4e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.782394  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2805  thioredoxin  47.31 
 
 		 109 aa  97.8  4e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.686799 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5098  thioredoxin  44.68 
 
 		 107 aa  98.2  4e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.590945  hitchhiker  0.000000265159 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0806  thioredoxin  43.96 
 
 		 108 aa  97.4  6e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0657  thioredoxin  43.96 
 
 		 108 aa  97.4  6e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2158  thioredoxin  47.42 
 
 		 105 aa  97.1  8e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2056  thioredoxin  42.86 
 
 		 108 aa  97.1  8e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3655  thioredoxin  46.88 
 
 		 108 aa  95.9  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000417679  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0203  thioredoxin  44.94 
 
 		 108 aa  96.3  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3301  thioredoxin  43.62 
 
 		 106 aa  96.7  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00133271  normal  0.624218 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3190  thioredoxin  44.9 
 
 		 108 aa  95.5  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.425401  hitchhiker  0.00537167 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3763  thioredoxin  46.39 
 
 		 105 aa  95.5  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000512539  normal  0.0469932 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1160  thioredoxin  50 
 
 		 105 aa  95.9  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0193016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1283  thioredoxin 1  45.92 
 
 		 109 aa  95.5  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.149215  normal  0.0874847 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0159  thioredoxin  42.86 
 
 		 108 aa  95.9  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.447164 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1129  thioredoxin  50 
 
 		 105 aa  95.9  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2847  thioredoxin  47.78 
 
 		 106 aa  95.5  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.300873 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1854  thioredoxin  43.96 
 
 		 102 aa  95.9  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03659  thioredoxin  42.86 
 
 		 109 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000771604  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4196  thioredoxin  42.86 
 
 		 109 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000515955  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03608  hypothetical protein  42.86 
 
 		 109 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000236523  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4245  thioredoxin  42.86 
 
 		 109 aa  95.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.775484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4127  thioredoxin  42.86 
 
 		 109 aa  95.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4854  thioredoxin  53.33 
 
 		 112 aa  95.1  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4142  thioredoxin  42.86 
 
 		 109 aa  95.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3997  thioredoxin  42.86 
 
 		 109 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4140  thioredoxin  42.86 
 
 		 109 aa  95.1  3e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0589  thioredoxin  41.3 
 
 		 111 aa  95.1  3e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4222  thioredoxin  42.86 
 
 		 109 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00219843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4196  thioredoxin  42.86 
 
 		 109 aa  95.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4304  thioredoxin  42.86 
 
 		 109 aa  95.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.234233  normal  0.940905 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2084  thioredoxin  44.09 
 
 		 107 aa  95.1  3e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3433  thioredoxin  43.33 
 
 		 104 aa  95.1  3e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.513588  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4145  thioredoxin  42.86 
 
 		 109 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5214  thioredoxin  42.86 
 
 		 109 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4292  thioredoxin  42.86 
 
 		 109 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7329  thioredoxin  52.11 
 
 		 108 aa  94.4  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.231985  normal  0.658106 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3919  thioredoxin  45.65 
 
 		 103 aa  94.4  4e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.566246  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0475  thioredoxin  42.71 
 
 		 108 aa  94.4  5e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4004  thioredoxin  42.86 
 
 		 109 aa  94.4  5e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.897528  decreased coverage  0.00429034 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6430  thioredoxin  45.92 
 
 		 106 aa  94  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2468  thioredoxin  42.11 
 
 		 108 aa  94  6e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2639  thioredoxin  47.37 
 
 		 110 aa  94  6e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0886828  hitchhiker  0.00590655 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4220  thioredoxin  40.62 
 
 		 119 aa  93.6  7e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2149  thioredoxin  52.11 
 
 		 108 aa  93.6  8e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4070  thioredoxin  46.24 
 
 		 108 aa  93.2  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.282643 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0338  thioredoxin  46.15 
 
 		 108 aa  93.2  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2401  thioredoxin  48.24 
 
 		 142 aa  92.8  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.85345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00569  thioredoxin  44.44 
 
 		 112 aa  92.8  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.181003  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3952  thioredoxin  46.24 
 
 		 108 aa  93.2  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3433  thioredoxin  46.24 
 
 		 108 aa  92.8  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13949  thioredoxin trxC  46.88 
 
 		 116 aa  93.2  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1624  thioredoxin domain-containing protein  41.49 
 
 		 100 aa  93.2  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3929  thioredoxin  46.24 
 
 		 108 aa  93.2  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3877  thioredoxin  46.24 
 
 		 108 aa  93.2  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000866569 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>