More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0862 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0862  thioredoxin  100 
 
 		 102 aa  209  9e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.48028  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1854  thioredoxin  77.23 
 
 		 102 aa  168  2e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1719  thioredoxin  72.55 
 
 		 102 aa  162  1.0000000000000001e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00129431  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0756  thioredoxin  71.29 
 
 		 101 aa  153  7e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0861  Thioredoxin domain  63.64 
 
 		 104 aa  146  9e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.305166 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0460  thioredoxin  51.69 
 
 		 108 aa  107  6e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.810082  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3433  thioredoxin  50.56 
 
 		 108 aa  106  9.000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0203  thioredoxin  52.5 
 
 		 108 aa  106  9.000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0338  thioredoxin  49.44 
 
 		 108 aa  106  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3594  thioredoxin  46.94 
 
 		 257 aa  105  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0521557 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0159  thioredoxin  50 
 
 		 108 aa  106  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.447164 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0513  thioredoxin  49.44 
 
 		 108 aa  106  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420648 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0406  thioredoxin 1  49.44 
 
 		 108 aa  105  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3929  thioredoxin  49.44 
 
 		 108 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3877  thioredoxin  49.44 
 
 		 108 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000866569 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0448  thioredoxin  50.56 
 
 		 108 aa  105  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0410  thioredoxin  49.44 
 
 		 108 aa  105  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3615  thioredoxin  49.44 
 
 		 108 aa  105  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3952  thioredoxin  49.44 
 
 		 108 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0409  thioredoxin  49.44 
 
 		 108 aa  105  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00884025 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4070  thioredoxin  49.44 
 
 		 108 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.282643 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3216  thioredoxin  50.56 
 
 		 108 aa  105  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.604019  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4012  thioredoxin  51.9 
 
 		 108 aa  105  3e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4110  thioredoxin  49.44 
 
 		 108 aa  105  3e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.465308  hitchhiker  0.0000724164 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0398  thioredoxin  49.44 
 
 		 108 aa  104  5e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4204  thioredoxin  51.9 
 
 		 108 aa  104  5e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0888  thioredoxin  49.47 
 
 		 141 aa  103  6e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.747507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2698  thioredoxin  47.19 
 
 		 108 aa  102  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0171911  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3336  thioredoxin  45.45 
 
 		 259 aa  102  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00337  thioredoxin  47.19 
 
 		 108 aa  102  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002097  thioredoxin  47.19 
 
 		 108 aa  102  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00313258  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03659  thioredoxin  48.1 
 
 		 109 aa  101  3e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000771604  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4196  thioredoxin  48.1 
 
 		 109 aa  101  3e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000515955  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5214  thioredoxin  48.1 
 
 		 109 aa  101  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4304  thioredoxin  48.1 
 
 		 109 aa  101  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.234233  normal  0.940905 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4140  thioredoxin  48.1 
 
 		 109 aa  101  3e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4222  thioredoxin  48.1 
 
 		 109 aa  101  3e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00219843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4127  thioredoxin  48.1 
 
 		 109 aa  101  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4292  thioredoxin  48.1 
 
 		 109 aa  101  3e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4245  thioredoxin  48.1 
 
 		 109 aa  101  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.775484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4196  thioredoxin  48.1 
 
 		 109 aa  101  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03608  hypothetical protein  48.1 
 
 		 109 aa  101  3e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000236523  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4142  thioredoxin  48.1 
 
 		 109 aa  101  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3997  thioredoxin  48.1 
 
 		 109 aa  101  3e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4004  thioredoxin  43.82 
 
 		 109 aa  101  3e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.897528  decreased coverage  0.00429034 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4145  thioredoxin  48.1 
 
 		 109 aa  101  3e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6068  thioredoxin  47.47 
 
 		 110 aa  101  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150927 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1294  thioredoxin  51.25 
 
 		 108 aa  101  4e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1006  thioredoxin  45.92 
 
 		 259 aa  101  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0179  thioredoxin  46.59 
 
 		 108 aa  100  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0510  thioredoxin 1  46.59 
 
 		 108 aa  100  5e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0310601 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4035  thioredoxin  46.59 
 
 		 108 aa  100  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0966495  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0087  thioredoxin  46.32 
 
 		 106 aa  100  5e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.950509 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2645  thioredoxin  41 
 
 		 150 aa  100  7e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.154957  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3596  thioredoxin  50 
 
 		 150 aa  100  8e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.854397  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0838  thioredoxin  46.46 
 
 		 109 aa  100  8e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.315208 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3665  thioredoxin  50 
 
 		 150 aa  100  9e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0156  thioredoxin  45.45 
 
 		 108 aa  100  9e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0057  thioredoxin  46.59 
 
 		 109 aa  99.8  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0410  thioredoxin  52.81 
 
 		 141 aa  99.8  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3508  thioredoxin  49.45 
 
 		 150 aa  99.8  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0300  thioredoxin  52.56 
 
 		 116 aa  98.6  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3466  thioredoxin  51.09 
 
 		 110 aa  99  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.086218  normal  0.618776 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0147  thioredoxin 1  45.24 
 
 		 108 aa  99  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000169587  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0657  thioredoxin  49.43 
 
 		 108 aa  99  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0806  thioredoxin  49.43 
 
 		 108 aa  99  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4222  thioredoxin  47.73 
 
 		 108 aa  98.6  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0161465  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37950  thioredoxin  42 
 
 		 113 aa  98.6  3e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3190  thioredoxin  45.05 
 
 		 108 aa  98.6  3e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.425401  hitchhiker  0.00537167 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0475  thioredoxin  48.15 
 
 		 108 aa  98.2  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0025  thioredoxin  53.16 
 
 		 238 aa  97.8  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1323  thioredoxin  43.96 
 
 		 107 aa  98.2  4e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.131811  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2793  thioredoxin  53.85 
 
 		 107 aa  97.8  5e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.526009  normal  0.619101 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  44.68 
 
 		 109 aa  97.4  6e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2211  thioredoxin  43.52 
 
 		 108 aa  97.4  6e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1353  thioredoxin C-2  50.59 
 
 		 98 aa  97.4  6e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.114748  normal  0.184208 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03717  thioredoxin  47.78 
 
 		 113 aa  97.4  6e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0210  thioredoxin  46.32 
 
 		 108 aa  97.1  7e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3109  thioredoxin  41.41 
 
 		 107 aa  97.1  8e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.168274  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2805  thioredoxin  48.84 
 
 		 109 aa  97.1  8e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.686799 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00569  thioredoxin  47.73 
 
 		 112 aa  96.7  9e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.181003  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0175  thioredoxin  44.68 
 
 		 108 aa  96.7  9e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2340  thioredoxin  46.91 
 
 		 108 aa  96.7  1e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0697906  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  46.67 
 
 		 107 aa  96.3  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  46.81 
 
 		 107 aa  96.3  1e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  46.81 
 
 		 124 aa  96.3  1e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0127  thioredoxin  49.38 
 
 		 108 aa  96.7  1e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000655412  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1595  thioredoxin  47.13 
 
 		 287 aa  96.3  1e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.385204  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0810  thioredoxin  42.42 
 
 		 107 aa  96.3  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195011 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  46.74 
 
 		 109 aa  96.7  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2468  thioredoxin  47.44 
 
 		 108 aa  95.9  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3301  thioredoxin  52.5 
 
 		 106 aa  95.9  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00133271  normal  0.624218 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2259  thioredoxin  48.86 
 
 		 148 aa  96.7  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0368  thioredoxin  41.76 
 
 		 108 aa  96.3  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27502 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0227  thioredoxin  51.19 
 
 		 138 aa  96.3  1e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.589442  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2950  thioredoxin  48.19 
 
 		 106 aa  95.5  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.184197  normal  0.155868 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1529  thioredoxin  48.19 
 
 		 106 aa  95.9  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.643867  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1476  thioredoxin  47.62 
 
 		 223 aa  95.5  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00459132  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0179  thioredoxin  48.19 
 
 		 106 aa  95.9  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.292519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0816  thioredoxin  46.07 
 
 		 107 aa  95.5  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>