More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3665 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_3665  thioredoxin  100 
 
 		 150 aa  298  2e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3508  thioredoxin  98 
 
 		 150 aa  292  9e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3596  thioredoxin  97.33 
 
 		 150 aa  291  2e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.854397  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1254  thioredoxin  46.81 
 
 		 144 aa  126  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2362  thioredoxin  42.86 
 
 		 144 aa  123  8.000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1995  thioredoxin  42.86 
 
 		 144 aa  123  8.000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0335  thioredoxin  47.37 
 
 		 140 aa  123  9e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000083  thioredoxin 2  43.75 
 
 		 144 aa  121  3e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.396729  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0504  thioredoxin  44.83 
 
 		 145 aa  121  4e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0235096 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05698  thioredoxin 2  42.07 
 
 		 162 aa  120  5e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0520  thioredoxin  44.83 
 
 		 145 aa  120  5e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.609436  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3369  thioredoxin  43.36 
 
 		 145 aa  120  7e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2347  thioredoxin  46.97 
 
 		 147 aa  119  9.999999999999999e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0135047  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2633  thioredoxin 2  41.96 
 
 		 144 aa  119  9.999999999999999e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0747279  normal  0.647766 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7798  thioredoxin  42.22 
 
 		 146 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.449565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1524  thioredoxin  39.13 
 
 		 148 aa  119  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659124 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3283  thioredoxin  47.58 
 
 		 147 aa  118  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0410  thioredoxin  47.73 
 
 		 141 aa  117  3.9999999999999996e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2304  thioredoxin  40.56 
 
 		 145 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.258464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2645  thioredoxin  41.61 
 
 		 150 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.154957  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0618  thioredoxin  40.56 
 
 		 146 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.300495 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3723  thioredoxin  42.47 
 
 		 146 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.122043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0888  thioredoxin  44.03 
 
 		 141 aa  115  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.747507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0690  thioredoxin 2  39.44 
 
 		 144 aa  115  3e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.555698  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2518  thioredoxin  44.78 
 
 		 141 aa  114  3e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2259  thioredoxin  43.18 
 
 		 148 aa  114  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1332  thioredoxin  40.56 
 
 		 159 aa  114  3.9999999999999997e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.636016  normal  0.90337 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0456  thioredoxin  41.67 
 
 		 165 aa  114  6e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4107  thioredoxin  43.41 
 
 		 141 aa  113  6.9999999999999995e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000794835 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4857  thioredoxin  42.45 
 
 		 149 aa  113  7.999999999999999e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0651815  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3336  thioredoxin  56.52 
 
 		 259 aa  113  8.999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0928  thioredoxin  42.14 
 
 		 147 aa  112  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0652  thioredoxin  45.39 
 
 		 150 aa  112  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3335  thioredoxin 2  43.18 
 
 		 139 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0651  thioredoxin  43.26 
 
 		 145 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3416  thioredoxin  39.16 
 
 		 146 aa  111  3e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3491  thioredoxin 2  41.67 
 
 		 139 aa  110  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0377  thioredoxin  39.72 
 
 		 145 aa  110  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.655114  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5119  thioredoxin  39.42 
 
 		 144 aa  110  5e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.402757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1430  thioredoxin  48.2 
 
 		 140 aa  110  7.000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000656365 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1161  thioredoxin  39.16 
 
 		 146 aa  110  8.000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.403386  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02476  thioredoxin 2  40.8 
 
 		 139 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.953967  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1086  thioredoxin  40.8 
 
 		 139 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0403998  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02440  hypothetical protein  40.8 
 
 		 139 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.934703  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2739  thioredoxin 2  40.8 
 
 		 139 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.025352  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1095  thioredoxin 2  40.8 
 
 		 139 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0753217  normal  0.13577 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3594  thioredoxin  46.22 
 
 		 257 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0521557 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3819  thioredoxin 2  40.8 
 
 		 139 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00147303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2954  thioredoxin 2  40.8 
 
 		 139 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0189312  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2869  thioredoxin 2  40.8 
 
 		 139 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.162737  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2735  thioredoxin 2  40.8 
 
 		 139 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0139217  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5069  thioredoxin  39.42 
 
 		 144 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2134  thioredoxin  44.19 
 
 		 139 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.408487  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0887  thioredoxin 2  45.67 
 
 		 141 aa  108  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00834128  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0854  thioredoxin 2  44.09 
 
 		 141 aa  108  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.615191  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0420  thioredoxin  37.5 
 
 		 142 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0397  thioredoxin  37.23 
 
 		 144 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0053  thioredoxin  34.69 
 
 		 146 aa  108  3e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000803765  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4942  thioredoxin  38.69 
 
 		 144 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0102  thioredoxin  36.96 
 
 		 140 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0448  thioredoxin  39.85 
 
 		 145 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.925505 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00610  thioredoxin  40.97 
 
 		 150 aa  107  5e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4407  thioredoxin  54.35 
 
 		 113 aa  107  5e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2099  thioredoxin  40.3 
 
 		 140 aa  107  5e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45140  thioredoxin 2, TxrC  41.61 
 
 		 144 aa  107  5e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2977  thioredoxin 2  40.8 
 
 		 139 aa  106  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0978039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2861  thioredoxin 2  40.8 
 
 		 139 aa  106  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.350907  normal  0.503198 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2865  thioredoxin 2  40.8 
 
 		 139 aa  106  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0216262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2843  thioredoxin 2  40.8 
 
 		 139 aa  106  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4438  thioredoxin  40.56 
 
 		 150 aa  106  9.000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.102034  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2759  thioredoxin 2  40.8 
 
 		 139 aa  106  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00143779  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2401  thioredoxin  41.48 
 
 		 142 aa  105  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.85345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3067  thioredoxin 2  41.6 
 
 		 139 aa  106  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00110629 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5905  thioredoxin  43.61 
 
 		 144 aa  106  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3746  thioredoxin 2  44 
 
 		 139 aa  105  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0426418  normal  0.35545 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1420  thioredoxin  45.38 
 
 		 157 aa  105  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.669095  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3583  thioredoxin  42.65 
 
 		 149 aa  105  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.029416  normal  0.0374075 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0500  thioredoxin  43.28 
 
 		 144 aa  104  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.874633 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3500  thioredoxin  51.14 
 
 		 107 aa  105  3e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  51.09 
 
 		 120 aa  104  3e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  51.09 
 
 		 108 aa  104  4e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0443  thioredoxin-like  38.13 
 
 		 144 aa  104  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.478708  normal  0.838572 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3573  thioredoxin  37.5 
 
 		 140 aa  104  4e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1006  thioredoxin  50 
 
 		 259 aa  103  5e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0428  thioredoxin  36.76 
 
 		 170 aa  104  5e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  50 
 
 		 124 aa  103  6e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  48.89 
 
 		 108 aa  103  6e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  50 
 
 		 107 aa  103  8e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3463  thioredoxin 2  40.8 
 
 		 145 aa  103  8e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.305081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4029  thioredoxin  36.76 
 
 		 170 aa  103  8e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1845  thioredoxin 2  38.89 
 
 		 144 aa  103  8e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.227505  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3341  thioredoxin 2  40.8 
 
 		 145 aa  103  8e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.142551  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3906  thioredoxin  36.76 
 
 		 170 aa  103  8e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  46.67 
 
 		 107 aa  103  1e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3204  thioredoxin 2  40.8 
 
 		 145 aa  103  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0405  thioredoxin  39.26 
 
 		 146 aa  103  1e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0456  thioredoxin  36.76 
 
 		 140 aa  103  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1323  thioredoxin  42 
 
 		 107 aa  103  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.131811  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  43.27 
 
 		 107 aa  102  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1123  thioredoxin  37.67 
 
 		 145 aa  102  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>