More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0756 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0756  thioredoxin  100 
 
 
101 aa  207  3e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1854  thioredoxin  74.26 
 
 
102 aa  156  8e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1719  thioredoxin  73.27 
 
 
102 aa  154  4e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00129431  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0862  thioredoxin  71.29 
 
 
102 aa  153  7e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.48028  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0861  Thioredoxin domain  65.31 
 
 
104 aa  139  9.999999999999999e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.305166 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  48.98 
 
 
109 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2793  thioredoxin  52.17 
 
 
107 aa  108  3e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.526009  normal  0.619101 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2645  thioredoxin  45.92 
 
 
150 aa  107  6e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.154957  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03717  thioredoxin  51.61 
 
 
113 aa  107  6e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  48.45 
 
 
107 aa  106  1e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  48.45 
 
 
124 aa  106  1e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0025  thioredoxin  54.44 
 
 
238 aa  106  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1294  thioredoxin  47.42 
 
 
108 aa  106  1e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316672  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3500  thioredoxin  50 
 
 
107 aa  106  1e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31565  predicted protein  46.39 
 
 
123 aa  105  2e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  45.92 
 
 
107 aa  105  3e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3336  thioredoxin  48.98 
 
 
259 aa  105  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17955  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  46.94 
 
 
108 aa  105  3e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  45.92 
 
 
107 aa  105  3e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3311  thioredoxin  47.47 
 
 
125 aa  104  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105882  normal  0.0734612 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  46.94 
 
 
107 aa  104  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0888  thioredoxin  51.69 
 
 
141 aa  104  4e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.747507  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  49.44 
 
 
107 aa  104  5e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3675  thioredoxin  46.94 
 
 
109 aa  103  5e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.852228 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11291  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  45.83 
 
 
148 aa  103  7e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.554772 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  47.42 
 
 
107 aa  103  7e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0057  thioredoxin  49.46 
 
 
109 aa  103  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  48.31 
 
 
107 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  52.17 
 
 
108 aa  102  2e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  45.92 
 
 
107 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  44.9 
 
 
107 aa  102  2e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  44.9 
 
 
107 aa  102  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4115  thioredoxin  48.31 
 
 
107 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  53.93 
 
 
120 aa  102  2e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  44.9 
 
 
107 aa  102  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0810  thioredoxin  46.39 
 
 
107 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195011 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  44.9 
 
 
107 aa  102  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0404  thioredoxin  45.36 
 
 
109 aa  101  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.986075 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3312  thioredoxin  44.33 
 
 
109 aa  101  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124332  normal  0.074373 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3594  thioredoxin  46.94 
 
 
257 aa  101  4e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0521557 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2247  thioredoxin  43.88 
 
 
113 aa  101  4e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.203984  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2898  thioredoxin  44.33 
 
 
133 aa  101  4e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.34978  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  50 
 
 
107 aa  101  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1456  thioredoxin  47.78 
 
 
108 aa  100  5e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.724668  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0203  thioredoxin  53.16 
 
 
108 aa  100  5e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0368  thioredoxin  43.3 
 
 
108 aa  100  5e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.27502 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0159  thioredoxin  50.63 
 
 
108 aa  100  5e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.447164 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0404  thioredoxin  44.33 
 
 
109 aa  100  6e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000190247  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1006  thioredoxin  46.94 
 
 
259 aa  100  6e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3849  thioredoxin  45.26 
 
 
108 aa  100  6e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0475  thioredoxin  44.33 
 
 
108 aa  100  6e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0816  thioredoxin  45.56 
 
 
107 aa  100  7e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2195  thioredoxin  45.45 
 
 
110 aa  100  8e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.173373  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4012  thioredoxin  52.56 
 
 
108 aa  100  8e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2105  thioredoxin  45.56 
 
 
107 aa  99.4  1e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0422234  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2997  thioredoxin  43.3 
 
 
108 aa  99.4  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.140108  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2021  thioredoxin  45.56 
 
 
107 aa  99.4  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000945216  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2583  thioredoxin  41.24 
 
 
110 aa  99.4  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3230  thioredoxin  46.74 
 
 
109 aa  99.8  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000930614  normal  0.223494 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0127  thioredoxin  46.74 
 
 
108 aa  99.8  1e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000655412  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2263  thioredoxin  44.33 
 
 
110 aa  99.8  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0357  thioredoxin  43.16 
 
 
108 aa  99.8  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2157  thioredoxin  42.86 
 
 
113 aa  99.8  1e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.336694  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3658  thioredoxin  47.96 
 
 
110 aa  99.4  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00522541  normal  0.779583 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3190  thioredoxin  47.19 
 
 
108 aa  99.4  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.425401  hitchhiker  0.00537167 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0156  thioredoxin  46.67 
 
 
108 aa  99.4  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2056  thioredoxin  42.27 
 
 
108 aa  99  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2084  thioredoxin  44.68 
 
 
107 aa  98.6  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2468  thioredoxin  43.16 
 
 
108 aa  99.4  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0513  thioredoxin  43.3 
 
 
108 aa  99  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00420648 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0156  thioredoxin  43.3 
 
 
106 aa  99  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.534304 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4204  thioredoxin  52.56 
 
 
108 aa  99.4  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2323  thioredoxin  42.42 
 
 
110 aa  99  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0460  thioredoxin  45.74 
 
 
108 aa  98.6  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.810082  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3466  thioredoxin  45.36 
 
 
110 aa  98.2  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.086218  normal  0.618776 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  50 
 
 
109 aa  98.6  3e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1501  thioredoxin  44.33 
 
 
110 aa  98.2  3e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2289  thioredoxin  46.51 
 
 
108 aa  98.6  3e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000876713  normal  0.363166 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0338  thioredoxin  44.33 
 
 
108 aa  98.6  3e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3301  thioredoxin  47.19 
 
 
106 aa  98.6  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00133271  normal  0.624218 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2357  thioredoxin  44.33 
 
 
110 aa  98.2  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.565357  normal  0.741235 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3216  thioredoxin  45.36 
 
 
108 aa  98.2  3e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.604019  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3439  thioredoxin  44.33 
 
 
106 aa  98.2  4e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0398  thioredoxin  43.3 
 
 
108 aa  97.8  4e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1199  thioredoxin  45.56 
 
 
107 aa  98.2  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0000534537  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2682  thioredoxin  40.82 
 
 
106 aa  98.2  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.899838  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0657  thioredoxin  45.36 
 
 
108 aa  98.2  4e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2847  thioredoxin  45.65 
 
 
106 aa  97.8  4e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.300873 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0806  thioredoxin  45.36 
 
 
108 aa  98.2  4e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0136  thioredoxin  42.71 
 
 
107 aa  97.8  4e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000946631  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0505  thioredoxin  47.83 
 
 
109 aa  97.8  5e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000129794  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3582  thioredoxin  45.05 
 
 
107 aa  97.4  5e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.968394  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47420  Thioredoxin 1, trx1  43.96 
 
 
108 aa  97.8  5e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1513  thioredoxin  44.33 
 
 
109 aa  97.4  5e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000429326  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3281  thioredoxin  44.33 
 
 
109 aa  97.4  6e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3952  thioredoxin  43.62 
 
 
108 aa  97.4  6e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4070  thioredoxin  43.62 
 
 
108 aa  97.4  6e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.282643 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2950  thioredoxin  43.3 
 
 
106 aa  97.4  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.184197  normal  0.155868 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3929  thioredoxin  43.62 
 
 
108 aa  97.4  6e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3877  thioredoxin  43.62 
 
 
108 aa  97.4  6e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000866569 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>