More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1719 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1719  thioredoxin  100 
 
 		 102 aa  211  2.9999999999999995e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00129431  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1854  thioredoxin  88.12 
 
 		 102 aa  186  7e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0862  thioredoxin  72.55 
 
 		 102 aa  162  1.0000000000000001e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.48028  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0756  thioredoxin  73.27 
 
 		 101 aa  154  4e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0861  Thioredoxin domain  64.65 
 
 		 104 aa  149  1e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.305166 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3336  thioredoxin  47.47 
 
 		 259 aa  102  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0300  thioredoxin  46.15 
 
 		 116 aa  102  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1006  thioredoxin  47.96 
 
 		 259 aa  101  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0159  thioredoxin  43.33 
 
 		 108 aa  101  4e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.447164 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1138  thioredoxin  48.78 
 
 		 106 aa  100  5e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.898127  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0189  thioredoxin 1  51.32 
 
 		 108 aa  100  7e-21  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.345183  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0203  thioredoxin  45.56 
 
 		 108 aa  100  7e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0210  thioredoxin  46.46 
 
 		 108 aa  99.4  1e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2340  thioredoxin  41.76 
 
 		 108 aa  99.8  1e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0697906  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0448  thioredoxin  46.15 
 
 		 108 aa  98.6  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1708  thioredoxin  40.82 
 
 		 110 aa  98.2  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00102285  normal  0.772138 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4110  thioredoxin  42.86 
 
 		 108 aa  97.8  4e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.465308  hitchhiker  0.0000724164 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3433  thioredoxin  47.73 
 
 		 108 aa  98.2  4e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4012  thioredoxin  47.44 
 
 		 108 aa  97.4  5e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1908  thioredoxin  46.25 
 
 		 106 aa  97.4  5e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00177252  normal  0.288463 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1229  thioredoxin  48.86 
 
 		 268 aa  97.4  6e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.223518 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0179  thioredoxin  46.59 
 
 		 108 aa  97.4  6e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0510  thioredoxin 1  46.59 
 
 		 108 aa  97.4  6e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0310601 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4035  thioredoxin  46.59 
 
 		 108 aa  97.4  6e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0966495  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0406  thioredoxin 1  43.96 
 
 		 108 aa  97.1  7e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3877  thioredoxin  43.96 
 
 		 108 aa  97.1  7e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000866569 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4204  thioredoxin  42.86 
 
 		 108 aa  97.1  7e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3952  thioredoxin  43.96 
 
 		 108 aa  97.1  7e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0410  thioredoxin  43.96 
 
 		 108 aa  97.1  7e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3615  thioredoxin  43.96 
 
 		 108 aa  97.1  7e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4070  thioredoxin  43.96 
 
 		 108 aa  97.1  7e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.282643 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0409  thioredoxin  43.96 
 
 		 108 aa  97.1  7e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00884025 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3929  thioredoxin  43.96 
 
 		 108 aa  97.1  7e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3109  thioredoxin  46.99 
 
 		 107 aa  97.1  8e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.168274  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4004  thioredoxin  44.83 
 
 		 109 aa  97.1  8e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.897528  decreased coverage  0.00429034 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0513  thioredoxin  42.86 
 
 		 108 aa  96.7  9e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420648 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2134  thioredoxin  48.86 
 
 		 139 aa  96.3  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.408487  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03717  thioredoxin  45.92 
 
 		 113 aa  96.3  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2067  thioredoxin  43.96 
 
 		 107 aa  96.3  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2289  thioredoxin  41.76 
 
 		 108 aa  96.3  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000876713  normal  0.363166 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0338  thioredoxin  43.96 
 
 		 108 aa  96.7  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0460  thioredoxin  43.96 
 
 		 108 aa  95.9  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.810082  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0398  thioredoxin  42.86 
 
 		 108 aa  96.3  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03659  thioredoxin  41.76 
 
 		 109 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000771604  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4196  thioredoxin  41.76 
 
 		 109 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000515955  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3281  thioredoxin  41.84 
 
 		 109 aa  95.9  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4245  thioredoxin  41.76 
 
 		 109 aa  95.9  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.775484  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03608  hypothetical protein  41.76 
 
 		 109 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000236523  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3997  thioredoxin  41.76 
 
 		 109 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4145  thioredoxin  41.76 
 
 		 109 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  42.86 
 
 		 107 aa  95.5  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  42.86 
 
 		 107 aa  95.5  2e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  42.27 
 
 		 124 aa  95.9  2e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  42.86 
 
 		 107 aa  95.5  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4142  thioredoxin  41.76 
 
 		 109 aa  95.9  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4222  thioredoxin  41.76 
 
 		 109 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00219843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4304  thioredoxin  41.76 
 
 		 109 aa  95.9  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.234233  normal  0.940905 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4127  thioredoxin  41.76 
 
 		 109 aa  95.9  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5214  thioredoxin  41.76 
 
 		 109 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4196  thioredoxin  41.76 
 
 		 109 aa  95.9  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0031  thioredoxin  42.86 
 
 		 110 aa  95.9  2e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4140  thioredoxin  41.76 
 
 		 109 aa  95.9  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4292  thioredoxin  41.76 
 
 		 109 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  42.86 
 
 		 107 aa  95.5  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3216  thioredoxin  43.96 
 
 		 108 aa  95.9  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.604019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3594  thioredoxin  43.88 
 
 		 257 aa  95.1  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0521557 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2583  thioredoxin  38.46 
 
 		 110 aa  95.1  3e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2468  thioredoxin  41.57 
 
 		 108 aa  94.7  3e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  42.55 
 
 		 109 aa  95.1  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26950  thioredoxin  39.8 
 
 		 108 aa  94.7  3e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.766392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  42.27 
 
 		 107 aa  95.1  3e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0057  thioredoxin  43.33 
 
 		 109 aa  94.7  4e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1323  thioredoxin  43.9 
 
 		 107 aa  94.7  4e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.131811  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4107  thioredoxin  45.36 
 
 		 141 aa  94.4  5e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000794835 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3596  thioredoxin  46.67 
 
 		 150 aa  94.4  5e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.854397  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3500  thioredoxin  44.66 
 
 		 107 aa  94.4  5e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  46.59 
 
 		 107 aa  94  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  50 
 
 		 108 aa  94  6e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3437  thioredoxin  40.21 
 
 		 107 aa  94  6e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37950  thioredoxin  43.69 
 
 		 113 aa  94  6e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0657  thioredoxin  44.32 
 
 		 108 aa  94  7e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2110  thioredoxin  41.11 
 
 		 107 aa  93.6  7e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00000269278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0368  thioredoxin  39.13 
 
 		 108 aa  94  7e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27502 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3080  thioredoxin  40.66 
 
 		 108 aa  94  7e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0806  thioredoxin  44.32 
 
 		 108 aa  94  7e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5276  thioredoxin  45.78 
 
 		 108 aa  93.6  8e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5038  thioredoxin  45.78 
 
 		 109 aa  93.6  8e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3067  thioredoxin  38.14 
 
 		 109 aa  93.6  8e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.788534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0402  thioredoxin  42.68 
 
 		 107 aa  93.6  8e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3311  thioredoxin  42.86 
 
 		 125 aa  93.6  9e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105882  normal  0.0734612 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  39.8 
 
 		 107 aa  92.8  1e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  47.19 
 
 		 107 aa  93.2  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3230  thioredoxin  39.8 
 
 		 109 aa  93.2  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000930614  normal  0.223494 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0127  thioredoxin  41.76 
 
 		 108 aa  92.8  1e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000655412  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31565  predicted protein  43.82 
 
 		 123 aa  93.2  1e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3508  thioredoxin  45.56 
 
 		 150 aa  93.2  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0404  thioredoxin  43.82 
 
 		 109 aa  93.2  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000190247  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0357  thioredoxin  39.56 
 
 		 108 aa  93.2  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  39.8 
 
 		 107 aa  92.8  1e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3849  thioredoxin  37.89 
 
 		 108 aa  92.8  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>