More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2110 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_2110  thioredoxin  100 
 
 
107 aa  218  1.9999999999999999e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00000269278  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1625  thioredoxin  52.34 
 
 
107 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0473  thioredoxin  52.94 
 
 
107 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.319728  normal  0.0128632 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4174  thioredoxin  51.4 
 
 
107 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3582  thioredoxin  52.34 
 
 
107 aa  122  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.968394  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4956  thioredoxin  50 
 
 
106 aa  118  3e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.183907 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3378  thioredoxin  50.98 
 
 
107 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4442  thioredoxin  49.02 
 
 
119 aa  117  6e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.553221 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2176  thioredoxin  49.06 
 
 
106 aa  117  6e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.275071 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4906  thioredoxin  49.02 
 
 
106 aa  117  6e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.803641  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0156  thioredoxin  48.04 
 
 
106 aa  117  7e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.534304 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3241  thioredoxin  47.66 
 
 
107 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1456  thioredoxin  49.5 
 
 
108 aa  114  5e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.724668  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0203  thioredoxin  50.51 
 
 
108 aa  114  6e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3933  thioredoxin  50 
 
 
107 aa  113  8.999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4285  thioredoxin  50.98 
 
 
106 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.395722  normal  0.497891 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5011  thioredoxin  50 
 
 
107 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2583  thioredoxin  49.48 
 
 
110 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3958  thioredoxin  50 
 
 
106 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2682  thioredoxin  47.06 
 
 
106 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.899838  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2340  thioredoxin  48.45 
 
 
108 aa  111  4.0000000000000004e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0697906  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0513  thioredoxin  46.46 
 
 
108 aa  110  5e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00420648 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1501  thioredoxin  47.06 
 
 
110 aa  110  5e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2357  thioredoxin  47.06 
 
 
110 aa  110  5e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.565357  normal  0.741235 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0057  thioredoxin  49.49 
 
 
109 aa  110  6e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0139  thioredoxin  47.06 
 
 
106 aa  110  6e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0406  thioredoxin 1  49.48 
 
 
108 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3439  thioredoxin  44.34 
 
 
106 aa  110  7.000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0410  thioredoxin  49.48 
 
 
108 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3615  thioredoxin  49.48 
 
 
108 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0409  thioredoxin  49.48 
 
 
108 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00884025 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2021  thioredoxin  46.73 
 
 
107 aa  109  1.0000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000945216  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2105  thioredoxin  46.73 
 
 
107 aa  109  1.0000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0422234  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0300  thioredoxin  48.45 
 
 
116 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0051  thioredoxin  45.1 
 
 
106 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.155345 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1529  thioredoxin  45.1 
 
 
106 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.643867  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1908  thioredoxin  48 
 
 
106 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00177252  normal  0.288463 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0816  thioredoxin  46.73 
 
 
107 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1138  thioredoxin  45.1 
 
 
106 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.898127  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0087  thioredoxin  43.4 
 
 
106 aa  109  1.0000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.950509 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0179  thioredoxin  45.1 
 
 
106 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.292519  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4110  thioredoxin  48.45 
 
 
108 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.465308  hitchhiker  0.0000724164 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1323  thioredoxin  43 
 
 
107 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.131811  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3929  thioredoxin  47.42 
 
 
108 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3952  thioredoxin  47.42 
 
 
108 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1199  thioredoxin  50.53 
 
 
107 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0000534537  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2548  thioredoxin  51.04 
 
 
109 aa  108  2.0000000000000002e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.543523  normal  0.158534 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3433  thioredoxin  49.02 
 
 
104 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.513588  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1996  thioredoxin  48.04 
 
 
106 aa  109  2.0000000000000002e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0388  thioredoxin  47.96 
 
 
106 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155079  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2950  thioredoxin  44.12 
 
 
106 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.184197  normal  0.155868 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4070  thioredoxin  47.42 
 
 
108 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.282643 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3877  thioredoxin  47.42 
 
 
108 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000866569 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2793  thioredoxin  47.52 
 
 
107 aa  108  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.526009  normal  0.619101 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0059  thioredoxin  45.1 
 
 
106 aa  108  3e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1358  thioredoxin  39.62 
 
 
107 aa  108  3e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0368  thioredoxin  50 
 
 
108 aa  108  3e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.27502 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3433  thioredoxin  48.45 
 
 
108 aa  108  3e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0475  thioredoxin  47.47 
 
 
108 aa  108  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03659  thioredoxin  46.15 
 
 
109 aa  107  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000771604  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4196  thioredoxin  46.15 
 
 
109 aa  107  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000515955  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4127  thioredoxin  46.15 
 
 
109 aa  107  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4196  thioredoxin  46.15 
 
 
109 aa  107  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0338  thioredoxin  46.46 
 
 
108 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5214  thioredoxin  46.15 
 
 
109 aa  107  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3997  thioredoxin  46.15 
 
 
109 aa  107  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3584  thioredoxin  47.92 
 
 
108 aa  107  4.0000000000000004e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0328783  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4145  thioredoxin  46.15 
 
 
109 aa  107  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23390  thioredoxin  48.48 
 
 
107 aa  107  4.0000000000000004e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4222  thioredoxin  46.15 
 
 
109 aa  107  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00219843  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4140  thioredoxin  46.15 
 
 
109 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4304  thioredoxin  46.15 
 
 
109 aa  107  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.234233  normal  0.940905 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4142  thioredoxin  46.15 
 
 
109 aa  107  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4245  thioredoxin  46.15 
 
 
109 aa  107  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.775484  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03608  hypothetical protein  46.15 
 
 
109 aa  107  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000236523  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4292  thioredoxin  46.15 
 
 
109 aa  107  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3301  thioredoxin  45.1 
 
 
106 aa  107  5e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00133271  normal  0.624218 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5038  thioredoxin  48.45 
 
 
109 aa  107  5e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0028  thioredoxin  47.06 
 
 
106 aa  107  5e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1294  thioredoxin  44.23 
 
 
108 aa  107  5e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316672  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4004  thioredoxin  46.15 
 
 
109 aa  107  6e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.897528  decreased coverage  0.00429034 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4012  thioredoxin  45.45 
 
 
108 aa  107  6e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0398  thioredoxin  46.39 
 
 
108 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0402  thioredoxin  42.16 
 
 
107 aa  107  7.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3369  thioredoxin  49 
 
 
106 aa  107  7.000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0365156  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4067  thioredoxin  44.34 
 
 
106 aa  107  7.000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.153402 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0159  thioredoxin  44.44 
 
 
108 aa  106  8.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.447164 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2149  thioredoxin  50.54 
 
 
108 aa  106  8.000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4213  thioredoxin  54.74 
 
 
109 aa  106  9.000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5276  thioredoxin  48.45 
 
 
108 aa  106  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3336  thioredoxin  52.08 
 
 
259 aa  106  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17955  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0076  thioredoxin  46.94 
 
 
106 aa  105  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0551582  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0357  thioredoxin  46.6 
 
 
108 aa  106  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2468  thioredoxin  48.96 
 
 
108 aa  106  1e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2898  thioredoxin  44.12 
 
 
133 aa  106  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.34978  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3312  thioredoxin  49.46 
 
 
109 aa  105  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124332  normal  0.074373 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1411  thioredoxin  50 
 
 
107 aa  106  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0922  thioredoxin  47.37 
 
 
108 aa  105  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2289  thioredoxin  46.39 
 
 
108 aa  105  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000876713  normal  0.363166 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0806  thioredoxin  48.48 
 
 
108 aa  105  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>