More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1624 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1624  thioredoxin domain-containing protein  100 
 
 		 100 aa  204  4e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01370  thioredoxin C-2  79.17 
 
 		 98 aa  164  5e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.602659  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2784  thioredoxin  47.92 
 
 		 127 aa  107  7.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0698118 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1353  thioredoxin C-2  42.11 
 
 		 98 aa  94.7  3e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.114748  normal  0.184208 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1679  thioredoxin  41.49 
 
 		 98 aa  93.2  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7155  thioredoxin  39.58 
 
 		 98 aa  92.4  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1751  thioredoxin  43.96 
 
 		 98 aa  89.4  1e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6383  thioredoxin  43.01 
 
 		 101 aa  86.7  9e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.920622 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3584  thioredoxin  37.08 
 
 		 108 aa  78.6  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0328783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3559  thioredoxin  39.76 
 
 		 229 aa  77  0.00000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.254418 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1344  thioredoxin  31.87 
 
 		 107 aa  76.6  0.00000000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00788637  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0076  thioredoxin  39.74 
 
 		 106 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0551582  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1129  thioredoxin  41.3 
 
 		 105 aa  74.7  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1160  thioredoxin  41.3 
 
 		 105 aa  74.7  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0193016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2185  thioredoxin  29.79 
 
 		 112 aa  73.9  0.0000000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.0000121318  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2211  thioredoxin  29.79 
 
 		 112 aa  73.9  0.0000000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000765425  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2847  thioredoxin  33.33 
 
 		 106 aa  73.9  0.0000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.300873 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0388  thioredoxin  37.18 
 
 		 106 aa  73.6  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  36.05 
 
 		 110 aa  72.8  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000000131883  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2158  thioredoxin  39.13 
 
 		 105 aa  72.8  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0530  thioredoxin  37.08 
 
 		 114 aa  72.4  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.303131  normal  0.878071 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2134  thioredoxin  32.98 
 
 		 108 aa  72.4  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0459983  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2056  thioredoxin  33.71 
 
 		 108 aa  72.4  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0201  thioredoxin  37.18 
 
 		 106 aa  71.2  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2633  thioredoxin 2  34.38 
 
 		 144 aa  71.6  0.000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0747279  normal  0.647766 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0921  thioredoxin  37.23 
 
 		 107 aa  70.1  0.000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000445063  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0059  thioredoxin  35.9 
 
 		 106 aa  70.1  0.000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0036  thioredoxin  35.96 
 
 		 108 aa  70.1  0.000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0705575 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3433  thioredoxin  35.56 
 
 		 104 aa  70.1  0.000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.513588  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0238  thioredoxin, selenocysteine-containing  33.33 
 
 		 107 aa  69.7  0.00000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2195  thioredoxin  28.72 
 
 		 110 aa  69.3  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.173373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0373  thioredoxin  37.18 
 
 		 105 aa  69.7  0.00000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0091  thioredoxin 1, redox factor  34.62 
 
 		 106 aa  69.7  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal  0.939622 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1798  thioredoxin domain-containing protein  42.31 
 
 		 90 aa  69.3  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.317909  normal  0.703085 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3437  thioredoxin  35.87 
 
 		 107 aa  69.7  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3640  thioredoxin  36.59 
 
 		 120 aa  69.3  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0051  thioredoxin  34.62 
 
 		 106 aa  69.3  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.155345 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0428  thioredoxin  37.08 
 
 		 110 aa  68.6  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  34.12 
 
 		 107 aa  68.9  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2084  thioredoxin  31.52 
 
 		 107 aa  69.3  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0630  thioredoxin  35.9 
 
 		 106 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.367457 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4260  thioredoxin  37.89 
 
 		 105 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.910277 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3763  thioredoxin  34.38 
 
 		 105 aa  67.8  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000512539  normal  0.0469932 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1151  thioredoxin  37.65 
 
 		 105 aa  68.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.951665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1476  thioredoxin  34.04 
 
 		 223 aa  67.8  0.00000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00459132  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0053  thioredoxin  31.96 
 
 		 146 aa  67.8  0.00000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000803765  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0102  thioredoxin  35.71 
 
 		 140 aa  67.4  0.00000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1501  thioredoxin  28.72 
 
 		 110 aa  67.4  0.00000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3311  thioredoxin  30.85 
 
 		 125 aa  67.4  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105882  normal  0.0734612 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2357  thioredoxin  28.72 
 
 		 110 aa  67.4  0.00000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.565357  normal  0.741235 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18120  thioredoxin  32.56 
 
 		 106 aa  67.4  0.00000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000183291  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0368  thioredoxin  32.26 
 
 		 108 aa  67.4  0.00000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27502 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3080  thioredoxin  33.71 
 
 		 108 aa  67.4  0.00000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0861  Thioredoxin domain  39.51 
 
 		 104 aa  67  0.00000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.305166 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2117  thioredoxin  31.11 
 
 		 108 aa  67  0.00000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124376  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4580  thioredoxin  28.89 
 
 		 107 aa  66.6  0.00000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.90902  hitchhiker  0.00134414 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0862  thioredoxin  29.49 
 
 		 102 aa  66.2  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.48028  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3919  thioredoxin  34.78 
 
 		 103 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.566246  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6432  thioredoxin  30.61 
 
 		 160 aa  66.2  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.432921 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1436  thioredoxin  34.88 
 
 		 107 aa  66.6  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3500  thioredoxin  35.29 
 
 		 107 aa  66.2  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0639  thioredoxin  29.03 
 
 		 108 aa  66.6  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2263  thioredoxin  26.6 
 
 		 110 aa  66.6  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2518  thioredoxin  33.71 
 
 		 141 aa  66.2  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  34.12 
 
 		 107 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37354  predicted protein  35.11 
 
 		 131 aa  66.6  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0644454  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0690  thioredoxin 2  35.06 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.555698  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2997  thioredoxin  32.22 
 
 		 108 aa  65.9  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.140108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  35.29 
 
 		 107 aa  65.9  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2323  thioredoxin  26.6 
 
 		 110 aa  65.9  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1854  thioredoxin  31.71 
 
 		 102 aa  66.2  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  30.11 
 
 		 107 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2898  thioredoxin  24.47 
 
 		 133 aa  65.9  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.34978  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2149  thioredoxin  33.78 
 
 		 108 aa  65.5  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0810  thioredoxin  32.94 
 
 		 107 aa  65.5  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195011 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3190  thioredoxin  30.23 
 
 		 108 aa  65.9  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.425401  hitchhiker  0.00537167 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5276  thioredoxin  30.85 
 
 		 108 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2208  thioredoxin  29.03 
 
 		 108 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155117  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1125  thioredoxin  29.03 
 
 		 108 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1364  thioredoxin  29.03 
 
 		 108 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283304  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4115  thioredoxin  31.87 
 
 		 107 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2374  thioredoxin 1  29.03 
 
 		 146 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0044  thioredoxin  29.03 
 
 		 108 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0410527  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1283  thioredoxin 1  29.21 
 
 		 109 aa  65.1  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.149215  normal  0.0874847 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4220  thioredoxin  34.15 
 
 		 119 aa  65.1  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1853  thioredoxin  29.03 
 
 		 108 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0570457  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2246  thioredoxin  29.03 
 
 		 108 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  31.87 
 
 		 107 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2176  thioredoxin  32.18 
 
 		 106 aa  65.1  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.275071 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0456  thioredoxin  33.75 
 
 		 165 aa  65.1  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05698  thioredoxin 2  36 
 
 		 162 aa  65.1  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00569  thioredoxin  31.91 
 
 		 112 aa  65.1  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.181003  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1852  thioredoxin  29.03 
 
 		 108 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0771172  normal  0.135016 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1739  thioredoxin  29.03 
 
 		 108 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146348  normal  0.112507 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  31.18 
 
 		 107 aa  64.7  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5129  thioredoxin  29.03 
 
 		 108 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025918  normal  0.808925 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2218  thioredoxin  29.03 
 
 		 146 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.312249  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11291  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  31.52 
 
 		 148 aa  64.7  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.554772 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1766  thioredoxin  29.03 
 
 		 108 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.37558  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1445  thioredoxin  29.03 
 
 		 108 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0251303  normal  0.275114 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>