200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1751 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1751  thioredoxin  100 
 
 		 98 aa  194  3e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01370  thioredoxin C-2  45.05 
 
 		 98 aa  92.4  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.602659  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1624  thioredoxin domain-containing protein  43.96 
 
 		 100 aa  89.4  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1353  thioredoxin C-2  31.63 
 
 		 98 aa  69.7  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.114748  normal  0.184208 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2784  thioredoxin  30.61 
 
 		 127 aa  64.7  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0698118 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1679  thioredoxin  36.14 
 
 		 98 aa  63.2  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3559  thioredoxin  31.91 
 
 		 229 aa  62.8  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.254418 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6383  thioredoxin  30.95 
 
 		 101 aa  59.7  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.920622 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3763  thioredoxin  32.56 
 
 		 105 aa  55.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000512539  normal  0.0469932 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1436  thioredoxin  31.18 
 
 		 107 aa  55.5  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3437  thioredoxin  33.33 
 
 		 107 aa  53.9  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7155  thioredoxin  28.92 
 
 		 98 aa  53.5  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1160  thioredoxin  31.11 
 
 		 105 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0193016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1129  thioredoxin  31.11 
 
 		 105 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2158  thioredoxin  29.55 
 
 		 105 aa  50.8  0.000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6430  thioredoxin  31.43 
 
 		 106 aa  50.4  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2624  thioredoxin  29.76 
 
 		 104 aa  50.1  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000156705  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1151  thioredoxin  29.59 
 
 		 105 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.951665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2176  thioredoxin  28.99 
 
 		 106 aa  48.9  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.275071 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  26.6 
 
 		 110 aa  48.9  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000000131883  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3433  thioredoxin  28.99 
 
 		 104 aa  48.5  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.513588  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5011  thioredoxin  26.03 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2149  thioredoxin  25.53 
 
 		 108 aa  48.9  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3378  thioredoxin  27.54 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3933  thioredoxin  26.03 
 
 		 107 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0921  thioredoxin  25.81 
 
 		 107 aa  48.1  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000445063  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1854  thioredoxin  24.49 
 
 		 102 aa  47.8  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5402  thioredoxin  24.73 
 
 		 107 aa  47.4  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4260  thioredoxin  30.21 
 
 		 105 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.910277 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0530  thioredoxin  28 
 
 		 114 aa  46.6  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.303131  normal  0.878071 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1625  thioredoxin  26.39 
 
 		 107 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0473  thioredoxin  26.39 
 
 		 107 aa  47  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.319728  normal  0.0128632 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0858  thioredoxin  28.42 
 
 		 106 aa  46.6  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.782394  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2134  thioredoxin  28.57 
 
 		 108 aa  46.2  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0459983  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5098  thioredoxin  27.54 
 
 		 107 aa  46.2  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.590945  hitchhiker  0.000000265159 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1976  thioredoxin  31.34 
 
 		 109 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4906  thioredoxin  27.78 
 
 		 106 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.803641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00569  thioredoxin  31.17 
 
 		 112 aa  46.2  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.181003  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4442  thioredoxin  27.78 
 
 		 119 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.553221 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13949  thioredoxin trxC  27.78 
 
 		 116 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0373  thioredoxin  28.24 
 
 		 105 aa  45.8  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4174  thioredoxin  27.78 
 
 		 107 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0832  thioredoxin  25.88 
 
 		 105 aa  45.4  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2357  thioredoxin  24.66 
 
 		 110 aa  45.4  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.565357  normal  0.741235 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2056  thioredoxin  27.78 
 
 		 108 aa  45.8  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1501  thioredoxin  24.66 
 
 		 110 aa  45.4  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1333  Thioredoxin domain protein  28.99 
 
 		 311 aa  46.2  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0816  thioredoxin  27.78 
 
 		 107 aa  46.2  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3582  thioredoxin  27.54 
 
 		 107 aa  45.1  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.968394  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2633  thioredoxin 2  28 
 
 		 144 aa  45.4  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0747279  normal  0.647766 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6068  thioredoxin  25.27 
 
 		 110 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150927 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2195  thioredoxin  24.66 
 
 		 110 aa  45.1  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.173373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2682  thioredoxin  27.54 
 
 		 106 aa  45.1  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.899838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2117  thioredoxin  25.71 
 
 		 108 aa  44.7  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124376  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5403  thioredoxin  25.81 
 
 		 109 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1003  thioredoxin  28.99 
 
 		 110 aa  44.7  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0352077  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5492  thioredoxin  25.81 
 
 		 109 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0447616  normal  0.275979 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5779  thioredoxin  25.81 
 
 		 109 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0581674  normal  0.154246 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  26.88 
 
 		 108 aa  45.1  0.0004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4956  thioredoxin  26.39 
 
 		 106 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.183907 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2805  thioredoxin  24.66 
 
 		 109 aa  44.3  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.686799 
 
 
-
 
NC_004310  BR2105  thioredoxin  26.39 
 
 		 107 aa  44.7  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0422234  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2847  thioredoxin  22.97 
 
 		 106 aa  44.7  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.300873 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0888  thioredoxin  27.47 
 
 		 141 aa  44.7  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.747507  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4860  thioredoxin  24.73 
 
 		 107 aa  44.7  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.110096  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0308  thioredoxin  26.39 
 
 		 108 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.717076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2021  thioredoxin  26.39 
 
 		 107 aa  44.7  0.0005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000945216  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1798  thioredoxin domain-containing protein  30.77 
 
 		 90 aa  44.3  0.0005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.317909  normal  0.703085 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0388  thioredoxin  23.53 
 
 		 106 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2793  thioredoxin  28.36 
 
 		 107 aa  44.3  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.526009  normal  0.619101 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  25.81 
 
 		 108 aa  43.9  0.0007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2401  thioredoxin  28.57 
 
 		 142 aa  43.9  0.0007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.85345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  25.88 
 
 		 109 aa  43.9  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5974  thioredoxin domain protein  24.42 
 
 		 102 aa  43.9  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.897668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  25.81 
 
 		 120 aa  43.9  0.0008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0639  thioredoxin  26.09 
 
 		 108 aa  43.9  0.0008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4504  thioredoxin  22.34 
 
 		 108 aa  43.9  0.0008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999375 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4580  thioredoxin  26.09 
 
 		 107 aa  43.5  0.0009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.90902  hitchhiker  0.00134414 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2997  thioredoxin  28.77 
 
 		 108 aa  43.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.140108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5085  thioredoxin  21.51 
 
 		 108 aa  43.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2263  thioredoxin  23.29 
 
 		 110 aa  43.5  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18120  thioredoxin  21.11 
 
 		 106 aa  43.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000183291  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7087  thioredoxin  25.81 
 
 		 108 aa  43.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0114  thioredoxin  30 
 
 		 104 aa  42.7  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1719  thioredoxin  23.47 
 
 		 102 aa  43.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00129431  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5108  Thioredoxin domain protein  28.24 
 
 		 110 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0838  thioredoxin  24.72 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.315208 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3241  thioredoxin  30.43 
 
 		 107 aa  43.5  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7329  thioredoxin  23.4 
 
 		 108 aa  43.5  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.231985  normal  0.658106 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3917  thioredoxin domain protein  24.36 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00595323  normal  0.342893 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1364  thioredoxin  24.64 
 
 		 108 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283304  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3003  hypothetical protein  27.54 
 
 		 108 aa  42.4  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2864  hypothetical protein  27.54 
 
 		 108 aa  42.4  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2374  thioredoxin 1  24.64 
 
 		 146 aa  42  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3711  thioredoxin-related  30 
 
 		 312 aa  42.4  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1996  thioredoxin  26.09 
 
 		 106 aa  42.4  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3655  thioredoxin  24.73 
 
 		 108 aa  42.7  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000417679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0945  thioredoxin domain-containing protein  27.85 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.148607 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14280  thioredoxin  22.35 
 
 		 102 aa  42.4  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.978477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08920  thioredoxin  23.53 
 
 		 102 aa  42.7  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000942681  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>