More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_3917 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_3917  thioredoxin domain protein  100 
 
 
109 aa  225  1e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00595323  normal  0.342893 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3868  Thioredoxin domain protein  99.08 
 
 
118 aa  224  3e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2143  Thioredoxin domain protein  68.81 
 
 
108 aa  159  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0945  thioredoxin domain-containing protein  62.04 
 
 
109 aa  142  1e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.148607 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0160  thioredoxin-related  60.38 
 
 
111 aa  133  7.000000000000001e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2121  Thioredoxin domain protein  51.38 
 
 
112 aa  127  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.427267 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0912  thioredoxin domain-containing protein  56.19 
 
 
111 aa  126  8.000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0589  thioredoxin  50 
 
 
111 aa  111  3e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1793  thioredoxin  48.15 
 
 
107 aa  110  7.000000000000001e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.99578  decreased coverage  0.00274383 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3584  thioredoxin  46.39 
 
 
108 aa  105  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0328783  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2149  thioredoxin  44.95 
 
 
108 aa  105  2e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4084  thioredoxin  45.87 
 
 
112 aa  105  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3311  thioredoxin  47.17 
 
 
125 aa  103  6e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105882  normal  0.0734612 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2847  thioredoxin  46.46 
 
 
106 aa  102  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.300873 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2805  thioredoxin  41.75 
 
 
109 aa  102  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.686799 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2056  thioredoxin  45.36 
 
 
108 aa  101  3e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  43.52 
 
 
107 aa  100  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0357  thioredoxin  42.71 
 
 
108 aa  100  6e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0127  thioredoxin  44.33 
 
 
108 aa  100  7e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000655412  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0300  thioredoxin  45.74 
 
 
116 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0159  thioredoxin  40.82 
 
 
108 aa  99.8  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.447164 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2468  thioredoxin  40.95 
 
 
108 aa  99.4  1e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1908  thioredoxin  42.72 
 
 
106 aa  99.4  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00177252  normal  0.288463 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03659  thioredoxin  42.71 
 
 
109 aa  99  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000771604  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4196  thioredoxin  42.71 
 
 
109 aa  99  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000515955  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4142  thioredoxin  42.71 
 
 
109 aa  99  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2117  thioredoxin  41.94 
 
 
108 aa  99  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124376  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0179  thioredoxin  46.46 
 
 
106 aa  99  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.292519  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1529  thioredoxin  46.46 
 
 
106 aa  99  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.643867  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4222  thioredoxin  42.71 
 
 
109 aa  99  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00219843  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4304  thioredoxin  42.71 
 
 
109 aa  99  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.234233  normal  0.940905 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2084  thioredoxin  44.44 
 
 
107 aa  99  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4140  thioredoxin  42.71 
 
 
109 aa  99  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0203  thioredoxin  42.71 
 
 
108 aa  98.6  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4245  thioredoxin  42.71 
 
 
109 aa  99  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.775484  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2134  thioredoxin  41.94 
 
 
108 aa  99  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0459983  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5214  thioredoxin  42.71 
 
 
109 aa  99  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4145  thioredoxin  42.71 
 
 
109 aa  99  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3997  thioredoxin  42.71 
 
 
109 aa  99  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4292  thioredoxin  42.71 
 
 
109 aa  99  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4127  thioredoxin  42.71 
 
 
109 aa  99  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0368  thioredoxin  43.75 
 
 
108 aa  99  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.27502 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03608  hypothetical protein  42.71 
 
 
109 aa  99  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000236523  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4196  thioredoxin  42.71 
 
 
109 aa  99  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1364  thioredoxin  41.75 
 
 
108 aa  98.6  3e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283304  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5129  thioredoxin  42.72 
 
 
108 aa  98.2  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025918  normal  0.808925 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1739  thioredoxin  42.72 
 
 
108 aa  98.2  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146348  normal  0.112507 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1852  thioredoxin  42.72 
 
 
108 aa  98.2  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0771172  normal  0.135016 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2208  thioredoxin  41.75 
 
 
108 aa  98.6  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155117  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0044  thioredoxin  41.75 
 
 
108 aa  98.6  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0410527  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4004  thioredoxin  42.71 
 
 
109 aa  98.2  3e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.897528  decreased coverage  0.00429034 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2246  thioredoxin  41.75 
 
 
108 aa  98.6  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6251  thioredoxin  42.72 
 
 
108 aa  98.2  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.040042  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1445  thioredoxin  42.72 
 
 
108 aa  98.2  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0251303  normal  0.275114 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1766  thioredoxin  42.72 
 
 
108 aa  98.2  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.37558  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1828  thioredoxin  42.72 
 
 
108 aa  98.2  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0156587  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1125  thioredoxin  41.75 
 
 
108 aa  98.6  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1853  thioredoxin  41.75 
 
 
108 aa  98.6  3e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0570457  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0057  thioredoxin  43.75 
 
 
109 aa  97.8  4e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2340  thioredoxin  43.01 
 
 
108 aa  98.2  4e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0697906  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5038  thioredoxin  43.69 
 
 
109 aa  98.2  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2374  thioredoxin 1  40.95 
 
 
146 aa  97.8  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  43.52 
 
 
107 aa  98.2  4e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2218  thioredoxin  40.95 
 
 
146 aa  97.8  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.312249  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5927  thioredoxin  44.44 
 
 
110 aa  97.8  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365173  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0657  thioredoxin  41.24 
 
 
108 aa  97.1  7e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1188  thioredoxin 1 (redox factor) protein  40.2 
 
 
108 aa  97.1  7e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.945237  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4204  thioredoxin  41.67 
 
 
108 aa  97.1  7e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0806  thioredoxin  41.24 
 
 
108 aa  97.1  7e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2793  thioredoxin  43.43 
 
 
107 aa  97.1  7e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.526009  normal  0.619101 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3080  thioredoxin  41.67 
 
 
108 aa  96.7  8e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0475  thioredoxin  40.82 
 
 
108 aa  97.1  8e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2950  thioredoxin  45.45 
 
 
106 aa  96.7  9e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.184197  normal  0.155868 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5276  thioredoxin  42.72 
 
 
108 aa  96.7  9e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0639  thioredoxin  39.22 
 
 
108 aa  96.7  9e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  41.67 
 
 
107 aa  96.7  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5243  thioredoxin  42.55 
 
 
109 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3439  thioredoxin  45.45 
 
 
106 aa  96.7  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1775  thioredoxin  54.55 
 
 
92 aa  96.3  1e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0388  thioredoxin  42.27 
 
 
106 aa  96.3  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155079  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5098  thioredoxin  47 
 
 
107 aa  95.9  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.590945  hitchhiker  0.000000265159 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0505  thioredoxin  44.33 
 
 
109 aa  95.9  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000129794  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0308  thioredoxin  41.67 
 
 
108 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.717076  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0406  thioredoxin 1  41.67 
 
 
108 aa  95.5  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0950  thioredoxin  42.55 
 
 
108 aa  95.9  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.263431  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  41.12 
 
 
109 aa  95.9  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4067  thioredoxin  45.45 
 
 
106 aa  95.5  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.153402 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1825  thioredoxin  42.55 
 
 
108 aa  95.9  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0606148  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2362  thioredoxin  42.55 
 
 
108 aa  95.9  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0224789  normal  0.140308 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3433  thioredoxin  41.67 
 
 
108 aa  95.9  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0410  thioredoxin  41.67 
 
 
108 aa  95.5  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3615  thioredoxin  41.67 
 
 
108 aa  95.5  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0409  thioredoxin  41.67 
 
 
108 aa  95.5  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00884025 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3929  thioredoxin  40.62 
 
 
108 aa  94.7  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5215  thioredoxin  41.75 
 
 
109 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  41.67 
 
 
107 aa  94.7  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3952  thioredoxin  40.62 
 
 
108 aa  94.7  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3433  thioredoxin  39.58 
 
 
104 aa  95.1  3e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.513588  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2289  thioredoxin  41.67 
 
 
108 aa  95.1  3e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000876713  normal  0.363166 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69200  thioredoxin  40.62 
 
 
108 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>