More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0945 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_0945  thioredoxin domain-containing protein  100 
 
 		 109 aa  221  3e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.148607 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0160  thioredoxin-related  63.89 
 
 		 111 aa  147  6e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3868  Thioredoxin domain protein  62.96 
 
 		 118 aa  144  5e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3917  thioredoxin domain protein  62.04 
 
 		 109 aa  142  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00595323  normal  0.342893 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0912  thioredoxin domain-containing protein  59.26 
 
 		 111 aa  142  2e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2121  Thioredoxin domain protein  59.43 
 
 		 112 aa  138  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.427267 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2143  Thioredoxin domain protein  57.55 
 
 		 108 aa  133  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1793  thioredoxin  48.51 
 
 		 107 aa  113  8.999999999999998e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.99578  decreased coverage  0.00274383 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0589  thioredoxin  44.44 
 
 		 111 aa  109  1.0000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4004  thioredoxin  38.53 
 
 		 109 aa  104  4e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.897528  decreased coverage  0.00429034 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0806  thioredoxin  41.67 
 
 		 108 aa  104  4e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0657  thioredoxin  41.67 
 
 		 108 aa  104  4e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2056  thioredoxin  42.59 
 
 		 108 aa  104  5e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0127  thioredoxin  40.74 
 
 		 108 aa  103  6e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000655412  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5038  thioredoxin  42.2 
 
 		 109 aa  103  8e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2805  thioredoxin  41.28 
 
 		 109 aa  103  8e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.686799 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0156  thioredoxin  38.89 
 
 		 108 aa  103  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03659  thioredoxin  37.61 
 
 		 109 aa  102  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000771604  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4196  thioredoxin  37.61 
 
 		 109 aa  102  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000515955  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4292  thioredoxin  37.61 
 
 		 109 aa  102  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4127  thioredoxin  37.61 
 
 		 109 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03608  hypothetical protein  37.61 
 
 		 109 aa  102  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000236523  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4304  thioredoxin  37.61 
 
 		 109 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.234233  normal  0.940905 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4245  thioredoxin  37.61 
 
 		 109 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.775484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4196  thioredoxin  37.61 
 
 		 109 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5214  thioredoxin  37.61 
 
 		 109 aa  102  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4222  thioredoxin  37.61 
 
 		 109 aa  102  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00219843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4142  thioredoxin  37.61 
 
 		 109 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4145  thioredoxin  37.61 
 
 		 109 aa  102  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3997  thioredoxin  37.61 
 
 		 109 aa  102  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4140  thioredoxin  37.61 
 
 		 109 aa  102  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5276  thioredoxin  39.81 
 
 		 108 aa  101  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0368  thioredoxin  39.81 
 
 		 108 aa  101  3e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27502 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0357  thioredoxin  37.96 
 
 		 108 aa  101  4e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5124  thioredoxin  40.37 
 
 		 109 aa  100  5e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.855003 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5215  thioredoxin  40.37 
 
 		 109 aa  100  5e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2149  thioredoxin  42.16 
 
 		 108 aa  100  7e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1739  thioredoxin  39.81 
 
 		 108 aa  99.4  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146348  normal  0.112507 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3584  thioredoxin  40.74 
 
 		 108 aa  100  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0328783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1852  thioredoxin  39.81 
 
 		 108 aa  99.4  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0771172  normal  0.135016 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5129  thioredoxin  39.81 
 
 		 108 aa  99.4  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025918  normal  0.808925 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6251  thioredoxin  39.81 
 
 		 108 aa  99.4  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.040042  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  44.44 
 
 		 115 aa  99.8  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1766  thioredoxin  39.81 
 
 		 108 aa  99.4  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.37558  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1828  thioredoxin  39.81 
 
 		 108 aa  99.4  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0156587  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1445  thioredoxin  39.81 
 
 		 108 aa  99.4  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0251303  normal  0.275114 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0475  thioredoxin  38.89 
 
 		 108 aa  99.8  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1125  thioredoxin  39.81 
 
 		 108 aa  99.4  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1364  thioredoxin  39.81 
 
 		 108 aa  99.4  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283304  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2997  thioredoxin  37.96 
 
 		 108 aa  99  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.140108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1853  thioredoxin  39.81 
 
 		 108 aa  99.4  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0570457  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2374  thioredoxin 1  39.81 
 
 		 146 aa  99  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2246  thioredoxin  39.81 
 
 		 108 aa  99.4  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2218  thioredoxin  39.81 
 
 		 146 aa  99.4  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.312249  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0203  thioredoxin  37.96 
 
 		 108 aa  99  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2208  thioredoxin  39.81 
 
 		 108 aa  99.4  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155117  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0044  thioredoxin  39.81 
 
 		 108 aa  99.4  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0410527  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2117  thioredoxin  37.04 
 
 		 108 aa  98.2  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124376  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4012  thioredoxin  37.96 
 
 		 108 aa  98.2  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3190  thioredoxin  37.04 
 
 		 108 aa  98.2  3e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.425401  hitchhiker  0.00537167 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0057  thioredoxin  39.45 
 
 		 109 aa  97.8  4e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0639  thioredoxin  38.89 
 
 		 108 aa  98.2  4e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2340  thioredoxin  36.11 
 
 		 108 aa  97.8  4e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0697906  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1150  thioredoxin  37.61 
 
 		 109 aa  97.8  4e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000755865  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2084  thioredoxin  41.58 
 
 		 107 aa  97.8  4e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4204  thioredoxin  37.04 
 
 		 108 aa  97.8  5e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2468  thioredoxin  36.11 
 
 		 108 aa  97.8  5e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4688  thioredoxin  38.32 
 
 		 108 aa  97.8  5e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.376387  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5243  thioredoxin  36.7 
 
 		 109 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39680  thioredoxin  39.25 
 
 		 108 aa  97.4  6e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.333633 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00569  thioredoxin  39.81 
 
 		 112 aa  97.4  6e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.181003  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0159  thioredoxin  35.19 
 
 		 108 aa  97.1  8e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.447164 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0646  thioredoxin  39.22 
 
 		 111 aa  97.1  8e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.755097  normal  0.893544 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1294  thioredoxin  37.96 
 
 		 108 aa  97.1  8e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316672  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1188  thioredoxin 1 (redox factor) protein  36.11 
 
 		 108 aa  96.7  9e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.945237  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0175  thioredoxin  38.89 
 
 		 108 aa  96.7  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2583  thioredoxin  39.81 
 
 		 110 aa  96.3  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2134  thioredoxin  36.11 
 
 		 108 aa  96.3  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0459983  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69200  thioredoxin  37.96 
 
 		 108 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1196  thioredoxin  36.7 
 
 		 109 aa  96.3  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5983  thioredoxin  37.96 
 
 		 108 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0300  thioredoxin  37.96 
 
 		 116 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0338  thioredoxin  37.96 
 
 		 108 aa  95.9  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0448  thioredoxin  38.89 
 
 		 108 aa  95.5  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0950  thioredoxin  38.89 
 
 		 108 aa  95.5  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.263431  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3080  thioredoxin  37.04 
 
 		 108 aa  95.9  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4035  thioredoxin  35.19 
 
 		 108 aa  94.7  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0966495  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0510  thioredoxin 1  35.19 
 
 		 108 aa  94.7  3e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0310601 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5457  thioredoxin  37.61 
 
 		 109 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0195643 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0179  thioredoxin  35.19 
 
 		 108 aa  94.7  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2898  thioredoxin  36.27 
 
 		 133 aa  95.1  3e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.34978  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2362  thioredoxin  38.89 
 
 		 108 aa  95.1  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0224789  normal  0.140308 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4905  thioredoxin  40.2 
 
 		 110 aa  95.1  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4580  thioredoxin  41.58 
 
 		 107 aa  94.7  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.90902  hitchhiker  0.00134414 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3433  thioredoxin  37.96 
 
 		 108 aa  94.7  3e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5085  thioredoxin  37.04 
 
 		 108 aa  95.1  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3658  thioredoxin  42.2 
 
 		 110 aa  95.1  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00522541  normal  0.779583 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1825  thioredoxin  38.89 
 
 		 108 aa  95.1  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0606148  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0406  thioredoxin 1  37.04 
 
 		 108 aa  94.4  4e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7087  thioredoxin  38.89 
 
 		 108 aa  94.7  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>