More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_5108 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_5108  Thioredoxin domain protein  100 
 
 
110 aa  219  7e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3437  thioredoxin  38.53 
 
 
107 aa  94.4  4e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3763  thioredoxin  38.18 
 
 
105 aa  93.6  7e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000512539  normal  0.0469932 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1151  thioredoxin  39.09 
 
 
105 aa  92.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.951665  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1129  thioredoxin  36.36 
 
 
105 aa  89.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1160  thioredoxin  36.36 
 
 
105 aa  89.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0193016  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2158  thioredoxin  37.27 
 
 
105 aa  89.4  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4260  thioredoxin  35.45 
 
 
105 aa  84.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.910277 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0373  thioredoxin  33.72 
 
 
105 aa  74.3  0.0000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  34.29 
 
 
107 aa  73.9  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  36.08 
 
 
115 aa  73.2  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1320  thioredoxin  31.76 
 
 
105 aa  73.6  0.000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.113501  normal  0.148362 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  34.29 
 
 
107 aa  72.8  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  36.23 
 
 
107 aa  72  0.000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3849  thioredoxin  33.75 
 
 
108 aa  71.6  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  36.23 
 
 
107 aa  71.2  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  36.23 
 
 
107 aa  71.2  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  36.23 
 
 
107 aa  71.2  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0621  thioredoxin  34.72 
 
 
108 aa  71.2  0.000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000184635  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  36.23 
 
 
107 aa  71.2  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3500  thioredoxin  36.11 
 
 
107 aa  70.9  0.000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2347  thioredoxin  32.43 
 
 
147 aa  71.2  0.000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0135047  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1199  thioredoxin  31.82 
 
 
107 aa  71.2  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0000534537  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3583  thioredoxin  31.08 
 
 
149 aa  70.5  0.000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.029416  normal  0.0374075 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  34.78 
 
 
124 aa  70.5  0.000000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  34.78 
 
 
107 aa  70.5  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  36.23 
 
 
107 aa  70.1  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1353  thioredoxin C-2  29.09 
 
 
98 aa  70.1  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.114748  normal  0.184208 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1358  thioredoxin  31.87 
 
 
107 aa  70.1  0.00000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  36.23 
 
 
107 aa  70.1  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1138  thioredoxin  34.67 
 
 
106 aa  69.7  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.898127  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3294  thioredoxin  27.91 
 
 
109 aa  69.3  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00620964  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11291  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  34.78 
 
 
148 aa  68.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.554772 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  31.43 
 
 
107 aa  68.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10788  predicted protein  32.18 
 
 
117 aa  68.9  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1908  thioredoxin  34.74 
 
 
106 aa  68.9  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00177252  normal  0.288463 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0652  thioredoxin  33.33 
 
 
150 aa  69.3  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3312  thioredoxin  33.33 
 
 
109 aa  69.3  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124332  normal  0.074373 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7798  thioredoxin  26.74 
 
 
146 aa  68.6  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.449565  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7155  thioredoxin  34.72 
 
 
98 aa  68.6  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  31.88 
 
 
107 aa  68.6  0.00000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2682  thioredoxin  34.25 
 
 
106 aa  68.6  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.899838  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0810  thioredoxin  31.43 
 
 
107 aa  68.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195011 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2304  thioredoxin  33.78 
 
 
145 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.258464  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4115  thioredoxin  33.33 
 
 
107 aa  68.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4105  thioredoxin  26.74 
 
 
109 aa  67.8  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.031473  normal  0.0324646 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3919  thioredoxin  33.33 
 
 
103 aa  68.2  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.566246  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  33.33 
 
 
107 aa  68.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0504  thioredoxin  30.67 
 
 
145 aa  67.8  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0235096 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0410  thioredoxin  30.43 
 
 
141 aa  67.8  0.00000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3369  thioredoxin  32.43 
 
 
145 aa  67.8  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1679  thioredoxin  37.5 
 
 
98 aa  67.8  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3723  thioredoxin  33.33 
 
 
146 aa  67.4  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.122043  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3301  thioredoxin  32.39 
 
 
106 aa  67.4  0.00000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00133271  normal  0.624218 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0520  thioredoxin  30.67 
 
 
145 aa  67.4  0.00000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.609436  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6430  thioredoxin  28.89 
 
 
106 aa  67.4  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3727  Thioredoxin domain  29.73 
 
 
156 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3109  thioredoxin  35.53 
 
 
107 aa  67.4  0.00000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.168274  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3311  thioredoxin  30 
 
 
125 aa  67.4  0.00000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105882  normal  0.0734612 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2977  thioredoxin  27.47 
 
 
146 aa  67  0.00000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000101834  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14280  thioredoxin  33.82 
 
 
102 aa  66.6  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.978477  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1229  thioredoxin  26.36 
 
 
268 aa  66.6  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.223518 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  32.61 
 
 
109 aa  66.6  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2340  thioredoxin  36.76 
 
 
108 aa  66.6  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0697906  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0156  thioredoxin  30.56 
 
 
106 aa  66.2  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.534304 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0405  thioredoxin  31.94 
 
 
146 aa  66.2  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5098  thioredoxin  32.18 
 
 
107 aa  66.2  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.590945  hitchhiker  0.000000265159 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2401  thioredoxin  29.33 
 
 
142 aa  65.5  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.85345  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1144  thioredoxin  35.9 
 
 
421 aa  65.5  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3466  thioredoxin  32.56 
 
 
110 aa  65.5  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.086218  normal  0.618776 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3416  thioredoxin  32.18 
 
 
146 aa  65.5  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  31.94 
 
 
108 aa  65.9  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4854  thioredoxin  35.71 
 
 
112 aa  65.9  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1323  thioredoxin  34.78 
 
 
107 aa  66.2  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.131811  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1332  thioredoxin  32.43 
 
 
159 aa  65.9  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.636016  normal  0.90337 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1093  thioredoxin  29.41 
 
 
268 aa  65.1  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0251638  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1161  thioredoxin  33.8 
 
 
146 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.403386  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6432  thioredoxin  28 
 
 
160 aa  65.5  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.432921 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0091  thioredoxin 1, redox factor  29.11 
 
 
106 aa  65.1  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal  0.939622 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0500  thioredoxin  29.11 
 
 
144 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.874633 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13949  thioredoxin trxC  31.51 
 
 
116 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0051  thioredoxin  29.41 
 
 
106 aa  64.7  0.0000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.155345 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1625  thioredoxin  29.17 
 
 
108 aa  64.7  0.0000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4857  thioredoxin  31.08 
 
 
149 aa  64.7  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0651815  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0618  thioredoxin  31.08 
 
 
146 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.300495 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1978  thioredoxin  32.86 
 
 
111 aa  64.7  0.0000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.274716  normal  0.21653 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0059  thioredoxin  29.41 
 
 
106 aa  64.7  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0888  thioredoxin  28.4 
 
 
141 aa  64.7  0.0000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.747507  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0651  thioredoxin  31.08 
 
 
145 aa  64.7  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5905  thioredoxin  29.11 
 
 
144 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4107  thioredoxin  30.77 
 
 
141 aa  64.3  0.0000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000794835 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4580  thioredoxin  32.18 
 
 
107 aa  64.3  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.90902  hitchhiker  0.00134414 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0473  thioredoxin  30.88 
 
 
107 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.319728  normal  0.0128632 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0456  thioredoxin  30.11 
 
 
165 aa  64.3  0.0000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1625  thioredoxin  30.88 
 
 
107 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0556  thioredoxin  36.62 
 
 
144 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000127919 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2121  Thioredoxin domain protein  32.56 
 
 
112 aa  64.3  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.427267 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2429  thioredoxin  28 
 
 
107 aa  64.3  0.0000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4438  thioredoxin  26.58 
 
 
150 aa  64.3  0.0000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.102034  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0087  thioredoxin  32 
 
 
106 aa  64.3  0.0000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.950509 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>