More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4438 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4438  thioredoxin  100 
 
 		 150 aa  303  7e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.102034  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0500  thioredoxin  74.65 
 
 		 144 aa  218  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.874633 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5905  thioredoxin  73.24 
 
 		 144 aa  213  7e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6432  thioredoxin  65.28 
 
 		 160 aa  206  7e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.432921 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00610  thioredoxin  66.19 
 
 		 150 aa  192  9e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4027  thioredoxin  60.14 
 
 		 148 aa  176  8e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0913338  normal  0.121576 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1420  thioredoxin  63.77 
 
 		 157 aa  175  2e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.669095  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3583  thioredoxin  54.93 
 
 		 149 aa  171  2.9999999999999996e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.029416  normal  0.0374075 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1430  thioredoxin  65.67 
 
 		 140 aa  168  2e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000656365 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0652  thioredoxin  50 
 
 		 150 aa  146  8e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2518  thioredoxin  47.66 
 
 		 141 aa  120  7e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2347  thioredoxin  40.58 
 
 		 147 aa  119  9e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0135047  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0410  thioredoxin  44.37 
 
 		 141 aa  118  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0888  thioredoxin  44.96 
 
 		 141 aa  115  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.747507  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45140  thioredoxin 2, TxrC  41.48 
 
 		 144 aa  113  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0456  thioredoxin  39.57 
 
 		 165 aa  112  1.0000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2977  thioredoxin  40.3 
 
 		 146 aa  112  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000101834  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2362  thioredoxin  37.41 
 
 		 144 aa  110  6e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1995  thioredoxin  37.41 
 
 		 144 aa  110  6e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0928  thioredoxin  40.43 
 
 		 147 aa  110  7.000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3416  thioredoxin  37.5 
 
 		 146 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4107  thioredoxin  40.85 
 
 		 141 aa  109  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000794835 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2134  thioredoxin  42.75 
 
 		 139 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.408487  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2304  thioredoxin  37.59 
 
 		 145 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.258464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0053  thioredoxin  38.57 
 
 		 146 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000803765  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1161  thioredoxin  38.57 
 
 		 146 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.403386  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4857  thioredoxin  41.3 
 
 		 149 aa  108  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0651815  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3596  thioredoxin  40.56 
 
 		 150 aa  107  5e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.854397  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1332  thioredoxin  39.01 
 
 		 159 aa  107  6e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.636016  normal  0.90337 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0556  thioredoxin  39.26 
 
 		 144 aa  106  8.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000127919 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1254  thioredoxin  41.13 
 
 		 144 aa  107  8.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3665  thioredoxin  40.56 
 
 		 150 aa  106  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3508  thioredoxin  40.56 
 
 		 150 aa  106  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1524  thioredoxin  34.53 
 
 		 148 aa  106  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659124 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05698  thioredoxin 2  38.62 
 
 		 162 aa  106  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0443  thioredoxin-like  38.06 
 
 		 144 aa  105  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.478708  normal  0.838572 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  48.08 
 
 		 120 aa  105  2e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  48.08 
 
 		 108 aa  105  3e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0377  thioredoxin  40 
 
 		 145 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.655114  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1123  thioredoxin  38.97 
 
 		 145 aa  104  4e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0388  thioredoxin  41.35 
 
 		 106 aa  104  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3369  thioredoxin  37.59 
 
 		 145 aa  104  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0816  thioredoxin  47.37 
 
 		 107 aa  104  5e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0618  thioredoxin  37.04 
 
 		 146 aa  103  6e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.300495 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0867  thioredoxin  34.53 
 
 		 140 aa  103  6e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  44.23 
 
 		 108 aa  103  7e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2977  thioredoxin 2  34.78 
 
 		 139 aa  103  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0978039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0405  thioredoxin  38.36 
 
 		 146 aa  103  8e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2861  thioredoxin 2  34.78 
 
 		 139 aa  103  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.350907  normal  0.503198 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2865  thioredoxin 2  34.78 
 
 		 139 aa  103  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0216262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2843  thioredoxin 2  34.78 
 
 		 139 aa  103  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3584  thioredoxin  45.45 
 
 		 108 aa  103  8e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0328783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2759  thioredoxin 2  34.78 
 
 		 139 aa  103  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00143779  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2185  thioredoxin  42.31 
 
 		 112 aa  103  9e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.0000121318  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2211  thioredoxin  42.31 
 
 		 112 aa  103  9e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000765425  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0091  thioredoxin 1, redox factor  40.38 
 
 		 106 aa  103  9e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal  0.939622 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3491  thioredoxin 2  34.75 
 
 		 139 aa  102  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3833  thioredoxin  35.07 
 
 		 170 aa  102  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02476  thioredoxin 2  33.33 
 
 		 139 aa  102  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.953967  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1086  thioredoxin  33.33 
 
 		 139 aa  102  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0403998  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2645  thioredoxin  42.31 
 
 		 150 aa  102  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.154957  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2869  thioredoxin 2  33.33 
 
 		 139 aa  102  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.162737  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1529  thioredoxin  46.46 
 
 		 106 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.643867  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1095  thioredoxin 2  33.33 
 
 		 139 aa  102  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0753217  normal  0.13577 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0179  thioredoxin  46.46 
 
 		 106 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.292519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0102  thioredoxin  31.43 
 
 		 140 aa  102  2e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02440  hypothetical protein  33.33 
 
 		 139 aa  102  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.934703  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2847  thioredoxin  44.44 
 
 		 106 aa  102  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.300873 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2954  thioredoxin 2  33.33 
 
 		 139 aa  102  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0189312  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7798  thioredoxin  35.46 
 
 		 146 aa  102  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.449565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3819  thioredoxin 2  33.33 
 
 		 139 aa  102  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00147303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3067  thioredoxin 2  34.07 
 
 		 139 aa  102  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00110629 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2735  thioredoxin 2  33.33 
 
 		 139 aa  102  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0139217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2739  thioredoxin 2  33.33 
 
 		 139 aa  102  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.025352  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0452  thioredoxin  35.77 
 
 		 140 aa  102  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.531645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4029  thioredoxin  35.07 
 
 		 170 aa  101  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3335  thioredoxin 2  35.46 
 
 		 139 aa  101  3e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3301  thioredoxin  41.35 
 
 		 106 aa  102  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00133271  normal  0.624218 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3906  thioredoxin  35.07 
 
 		 170 aa  101  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0201  thioredoxin  40.38 
 
 		 106 aa  101  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0210  thioredoxin  43.96 
 
 		 108 aa  101  3e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0428  thioredoxin  35.07 
 
 		 170 aa  101  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0690  thioredoxin 2  35.86 
 
 		 144 aa  101  3e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.555698  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3658  thioredoxin  40.95 
 
 		 110 aa  101  3e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00522541  normal  0.779583 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0520  thioredoxin  38.41 
 
 		 145 aa  101  4e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.609436  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2633  thioredoxin 2  33.1 
 
 		 144 aa  101  4e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0747279  normal  0.647766 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0504  thioredoxin  38.41 
 
 		 145 aa  100  5e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0235096 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1389  thioredoxin domain-containing protein  38.46 
 
 		 148 aa  100  5e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.276518  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0301  thioredoxin  45 
 
 		 106 aa  100  5e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000083  thioredoxin 2  37.5 
 
 		 144 aa  100  5e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.396729  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0076  thioredoxin  40.38 
 
 		 106 aa  100  6e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0551582  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0651  thioredoxin  42.11 
 
 		 145 aa  100  7e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2950  thioredoxin  45.45 
 
 		 106 aa  100  7e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.184197  normal  0.155868 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0630  thioredoxin  40.38 
 
 		 106 aa  100  7e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.367457 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3283  thioredoxin  37.93 
 
 		 147 aa  100  9e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2021  thioredoxin  45.26 
 
 		 107 aa  99.8  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000945216  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2105  thioredoxin  45.26 
 
 		 107 aa  99.8  1e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0422234  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2401  thioredoxin  37.32 
 
 		 142 aa  99.8  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.85345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1452  thioredoxin  48.39 
 
 		 272 aa  99.8  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0475  thioredoxin  42.31 
 
 		 108 aa  99.8  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>