More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_00610 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012803  Mlut_00610  thioredoxin  100 
 
 
150 aa  300  5.000000000000001e-81  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4438  thioredoxin  66.19 
 
 
150 aa  192  9e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.102034  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6432  thioredoxin  64.44 
 
 
160 aa  186  8e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.432921 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5905  thioredoxin  67.15 
 
 
144 aa  186  8e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0500  thioredoxin  67.41 
 
 
144 aa  185  2e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.874633 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1430  thioredoxin  63.24 
 
 
140 aa  171  5e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000656365 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3583  thioredoxin  55.63 
 
 
149 aa  164  5e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.029416  normal  0.0374075 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1420  thioredoxin  56.2 
 
 
157 aa  159  1e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.669095  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4027  thioredoxin  52.74 
 
 
148 aa  154  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0913338  normal  0.121576 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0652  thioredoxin  46.58 
 
 
150 aa  145  3e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0410  thioredoxin  46.76 
 
 
141 aa  127  6e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2518  thioredoxin  50.39 
 
 
141 aa  126  1.0000000000000001e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0888  thioredoxin  44.53 
 
 
141 aa  123  1e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.747507  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0456  thioredoxin  37.93 
 
 
165 aa  111  4.0000000000000004e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2347  thioredoxin  36.96 
 
 
147 aa  109  1.0000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0135047  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3596  thioredoxin  41.67 
 
 
150 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.854397  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1161  thioredoxin  37.32 
 
 
146 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.403386  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3665  thioredoxin  40.97 
 
 
150 aa  107  5e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3416  thioredoxin  37.76 
 
 
146 aa  107  5e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3508  thioredoxin  40.97 
 
 
150 aa  107  6e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0388  thioredoxin  49.49 
 
 
106 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155079  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2304  thioredoxin  36.43 
 
 
145 aa  106  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.258464  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0091  thioredoxin 1, redox factor  47.47 
 
 
106 aa  106  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal  0.939622 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3301  thioredoxin  46.46 
 
 
106 aa  104  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00133271  normal  0.624218 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0102  thioredoxin  32.62 
 
 
140 aa  104  3e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2645  thioredoxin  42.11 
 
 
150 aa  104  4e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.154957  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0076  thioredoxin  48.48 
 
 
106 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0551582  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1524  thioredoxin  35.51 
 
 
148 aa  103  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0659124 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0201  thioredoxin  47.47 
 
 
106 aa  102  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2977  thioredoxin  36.76 
 
 
146 aa  103  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000101834  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1332  thioredoxin  38.03 
 
 
159 aa  103  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.636016  normal  0.90337 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2134  thioredoxin  39.42 
 
 
139 aa  102  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.408487  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3369  thioredoxin  37.32 
 
 
145 aa  102  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4107  thioredoxin  37.41 
 
 
141 aa  102  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000794835 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2793  thioredoxin  45.45 
 
 
107 aa  102  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.526009  normal  0.619101 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0618  thioredoxin  36.3 
 
 
146 aa  101  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.300495 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45140  thioredoxin 2, TxrC  38.85 
 
 
144 aa  101  4e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1995  thioredoxin  34.31 
 
 
144 aa  101  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0368  thioredoxin  44.23 
 
 
108 aa  101  4e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.27502 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2362  thioredoxin  34.31 
 
 
144 aa  101  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0051  thioredoxin  46.32 
 
 
106 aa  100  5e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.155345 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13949  thioredoxin trxC  50.52 
 
 
116 aa  100  5e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3491  thioredoxin 2  36.03 
 
 
139 aa  100  6e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0630  thioredoxin  46.46 
 
 
106 aa  100  7e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.367457 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1254  thioredoxin  38.24 
 
 
144 aa  100  9e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0473  thioredoxin  43.14 
 
 
107 aa  100  9e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.319728  normal  0.0128632 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5119  thioredoxin  37.04 
 
 
144 aa  99.4  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.402757  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1625  thioredoxin  43.43 
 
 
107 aa  99.4  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4442  thioredoxin  42.11 
 
 
119 aa  99.4  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.553221 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0816  thioredoxin  43.43 
 
 
107 aa  99.8  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0443  thioredoxin-like  35.77 
 
 
144 aa  99  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.478708  normal  0.838572 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3584  thioredoxin  46.6 
 
 
108 aa  99.4  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0328783  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3335  thioredoxin 2  36.03 
 
 
139 aa  98.6  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0210  thioredoxin  50.59 
 
 
108 aa  99  2e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0059  thioredoxin  46.32 
 
 
106 aa  99  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0405  thioredoxin  37.86 
 
 
146 aa  99.4  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4906  thioredoxin  44.44 
 
 
106 aa  99  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.803641  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0928  thioredoxin  37.32 
 
 
147 aa  98.2  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5779  thioredoxin  46.6 
 
 
109 aa  98.2  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0581674  normal  0.154246 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3378  thioredoxin  43.43 
 
 
107 aa  98.2  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0335  thioredoxin domain-containing protein  35.46 
 
 
150 aa  98.6  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5403  thioredoxin  46.6 
 
 
109 aa  98.2  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0690  thioredoxin 2  35.37 
 
 
144 aa  98.6  3e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.555698  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3658  thioredoxin  42.31 
 
 
110 aa  98.2  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00522541  normal  0.779583 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5492  thioredoxin  46.6 
 
 
109 aa  98.2  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0447616  normal  0.275979 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5069  thioredoxin  36.3 
 
 
144 aa  98.2  4e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14280  thioredoxin  49.45 
 
 
102 aa  97.8  4e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.978477  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2633  thioredoxin 2  36.05 
 
 
144 aa  97.8  4e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0747279  normal  0.647766 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3392  thioredoxin  30.71 
 
 
178 aa  97.4  5e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0867  thioredoxin  32.61 
 
 
140 aa  97.4  5e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4942  thioredoxin  35.56 
 
 
144 aa  97.1  6e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4956  thioredoxin  43.43 
 
 
106 aa  97.4  6e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.183907 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3746  thioredoxin 2  36.57 
 
 
139 aa  96.7  9e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0426418  normal  0.35545 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2185  thioredoxin  43.14 
 
 
112 aa  96.7  9e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.0000121318  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4174  thioredoxin  40.78 
 
 
107 aa  96.7  9e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2211  thioredoxin  43.14 
 
 
112 aa  96.7  9e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000765425  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2468  thioredoxin  42.31 
 
 
108 aa  96.3  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000083  thioredoxin 2  36.73 
 
 
144 aa  96.3  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.396729  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0452  thioredoxin 2  32.12 
 
 
140 aa  96.3  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3727  Thioredoxin domain  37.04 
 
 
156 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2997  thioredoxin  46.46 
 
 
108 aa  96.3  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.140108  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2401  thioredoxin  35.07 
 
 
142 aa  96.3  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.85345  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4029  thioredoxin  32.14 
 
 
170 aa  96.3  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  44.23 
 
 
120 aa  96.3  1e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0428  thioredoxin  32.14 
 
 
170 aa  95.9  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3582  thioredoxin  43.43 
 
 
107 aa  96.7  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.968394  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0093  thioredoxin  41.75 
 
 
106 aa  96.3  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00548015 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39680  thioredoxin  41.35 
 
 
108 aa  95.9  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.333633 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3906  thioredoxin  32.14 
 
 
170 aa  96.3  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6068  thioredoxin  44.66 
 
 
110 aa  96.3  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.150927 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0504  thioredoxin  37.96 
 
 
145 aa  96.7  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0235096 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3241  thioredoxin  40.78 
 
 
107 aa  96.3  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2056  thioredoxin  42.31 
 
 
108 aa  96.3  1e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3283  thioredoxin  36.17 
 
 
147 aa  95.5  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3446  thioredoxin family protein, selenocysteine-containing  38.19 
 
 
150 aa  95.5  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.238909  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1529  thioredoxin  45.45 
 
 
106 aa  95.9  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.643867  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  41.35 
 
 
108 aa  95.5  2e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2950  thioredoxin  45.45 
 
 
106 aa  95.9  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.184197  normal  0.155868 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2847  thioredoxin  43.43 
 
 
106 aa  95.9  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.300873 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0179  thioredoxin  45.45 
 
 
106 aa  95.9  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.292519  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>