More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A2861 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011149  SeAg_B2759  thioredoxin 2  100 
 
 
139 aa  289  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00143779  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2843  thioredoxin 2  100 
 
 
139 aa  289  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2861  thioredoxin 2  100 
 
 
139 aa  289  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.350907  normal  0.503198 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2977  thioredoxin 2  100 
 
 
139 aa  289  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0978039  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2865  thioredoxin 2  100 
 
 
139 aa  289  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0216262  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02476  thioredoxin 2  94.96 
 
 
139 aa  280  6.000000000000001e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.953967  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1086  thioredoxin  94.96 
 
 
139 aa  280  6.000000000000001e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0403998  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1095  thioredoxin 2  94.96 
 
 
139 aa  280  6.000000000000001e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0753217  normal  0.13577 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2739  thioredoxin 2  94.96 
 
 
139 aa  280  6.000000000000001e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.025352  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2735  thioredoxin 2  94.96 
 
 
139 aa  280  6.000000000000001e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0139217  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3819  thioredoxin 2  94.96 
 
 
139 aa  280  6.000000000000001e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00147303  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2869  thioredoxin 2  94.96 
 
 
139 aa  280  6.000000000000001e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.162737  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02440  hypothetical protein  94.96 
 
 
139 aa  280  6.000000000000001e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.934703  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2954  thioredoxin 2  94.96 
 
 
139 aa  280  6.000000000000001e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0189312  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3067  thioredoxin 2  87.77 
 
 
139 aa  261  3e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00110629 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3204  thioredoxin 2  76.26 
 
 
145 aa  234  2e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3341  thioredoxin 2  76.26 
 
 
145 aa  234  2e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.142551  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3463  thioredoxin 2  76.26 
 
 
145 aa  234  2e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.305081  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3746  thioredoxin 2  78.1 
 
 
139 aa  232  1.0000000000000001e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0426418  normal  0.35545 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3491  thioredoxin 2  71.94 
 
 
139 aa  223  9e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0854  thioredoxin 2  73.05 
 
 
141 aa  222  1e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.615191  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3335  thioredoxin 2  72.66 
 
 
139 aa  221  2e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0887  thioredoxin 2  70.92 
 
 
141 aa  211  2.9999999999999995e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00834128  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05698  thioredoxin 2  57.66 
 
 
162 aa  186  5.999999999999999e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000083  thioredoxin 2  56.83 
 
 
144 aa  184  3e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.396729  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0690  thioredoxin 2  55.4 
 
 
144 aa  179  1e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.555698  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1845  thioredoxin 2  58.52 
 
 
144 aa  167  5e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.227505  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2633  thioredoxin 2  49.3 
 
 
144 aa  163  9e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0747279  normal  0.647766 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0738  thioredoxin 2  49.28 
 
 
140 aa  154  6e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0867  thioredoxin  46.32 
 
 
140 aa  147  5e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4107  thioredoxin  43.57 
 
 
141 aa  146  7e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000794835 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0452  thioredoxin 2  45.26 
 
 
140 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3416  thioredoxin  48.57 
 
 
146 aa  145  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3573  thioredoxin  44.93 
 
 
140 aa  144  3e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0456  thioredoxin  44.93 
 
 
140 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0928  thioredoxin  47.86 
 
 
147 aa  144  5e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0452  thioredoxin  45.65 
 
 
140 aa  143  6e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.531645  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3392  thioredoxin  44.2 
 
 
178 aa  142  1e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7798  thioredoxin  46.67 
 
 
146 aa  142  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.449565  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1161  thioredoxin  47.86 
 
 
146 aa  141  3e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.403386  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1524  thioredoxin  46.43 
 
 
148 aa  141  4e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0659124 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2304  thioredoxin  45.71 
 
 
145 aa  140  7e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.258464  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2347  thioredoxin  44.93 
 
 
147 aa  140  7e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0135047  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0102  thioredoxin  44.29 
 
 
140 aa  140  7e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3833  thioredoxin  42.65 
 
 
170 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3906  thioredoxin  42.03 
 
 
170 aa  137  3e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4029  thioredoxin  42.03 
 
 
170 aa  137  3e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0618  thioredoxin  48.03 
 
 
146 aa  137  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.300495 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0405  thioredoxin  43.07 
 
 
146 aa  137  3.9999999999999997e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0428  thioredoxin  42.65 
 
 
170 aa  137  6e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0377  thioredoxin  40.58 
 
 
145 aa  134  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.655114  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2362  thioredoxin  43.28 
 
 
144 aa  134  4e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1995  thioredoxin  43.28 
 
 
144 aa  134  4e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2401  thioredoxin  41.91 
 
 
142 aa  134  5e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.85345  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0335  thioredoxin  43.57 
 
 
140 aa  134  5e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0651  thioredoxin  42.86 
 
 
145 aa  133  7.000000000000001e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0397  thioredoxin  43.51 
 
 
144 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5069  thioredoxin  41.35 
 
 
144 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4481  thioredoxin  42.22 
 
 
140 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0556  thioredoxin  43.61 
 
 
144 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000127919 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45140  thioredoxin 2, TxrC  42.11 
 
 
144 aa  131  3e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4942  thioredoxin  41.22 
 
 
144 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0448  thioredoxin  40.58 
 
 
145 aa  130  5e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.925505 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5119  thioredoxin  41.22 
 
 
144 aa  130  5e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.402757  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0520  thioredoxin  42.03 
 
 
145 aa  130  5e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.609436  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0504  thioredoxin  41.3 
 
 
145 aa  129  1.0000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0235096 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0443  thioredoxin-like  41.98 
 
 
144 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.478708  normal  0.838572 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2099  thioredoxin  44.36 
 
 
140 aa  127  4.0000000000000003e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0053  thioredoxin  41.48 
 
 
146 aa  127  4.0000000000000003e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000803765  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2977  thioredoxin  41.61 
 
 
146 aa  126  9.000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000101834  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0420  thioredoxin  37.86 
 
 
142 aa  125  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0456  thioredoxin  41.43 
 
 
165 aa  125  2.0000000000000002e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2236  thioredoxin  40 
 
 
144 aa  125  3e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.773662  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2259  thioredoxin  40.3 
 
 
148 aa  124  4.0000000000000003e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3727  Thioredoxin domain  40.3 
 
 
156 aa  123  8.000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3369  thioredoxin  42.14 
 
 
145 aa  123  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1582  thioredoxin  40 
 
 
145 aa  121  4e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.137556  normal  0.0376163 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2518  thioredoxin  40.15 
 
 
141 aa  120  5e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2134  thioredoxin  38.85 
 
 
139 aa  120  8e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.408487  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3283  thioredoxin  38.13 
 
 
147 aa  119  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1254  thioredoxin  37.86 
 
 
144 aa  119  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3451  thioredoxin  43.57 
 
 
147 aa  119  1.9999999999999998e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.560369  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1332  thioredoxin  40 
 
 
159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.636016  normal  0.90337 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4857  thioredoxin  42.03 
 
 
149 aa  118  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0651815  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  51.61 
 
 
107 aa  116  9e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  49.52 
 
 
107 aa  116  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3723  thioredoxin  37.41 
 
 
146 aa  116  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.122043  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0054  thioredoxin, putative  40.58 
 
 
142 aa  115  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1389  thioredoxin domain-containing protein  41.27 
 
 
148 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.276518  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  50 
 
 
107 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4115  thioredoxin  50 
 
 
107 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3742  thioredoxin  42.03 
 
 
147 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  51 
 
 
107 aa  114  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  51 
 
 
107 aa  114  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  51 
 
 
107 aa  114  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  51 
 
 
107 aa  114  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  50.54 
 
 
107 aa  114  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3500  thioredoxin  50 
 
 
107 aa  114  5e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3583  thioredoxin  41.91 
 
 
149 aa  114  6e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.029416  normal  0.0374075 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0810  thioredoxin  50.54 
 
 
107 aa  113  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195011 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>