More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0456 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0456  thioredoxin  100 
 
 
165 aa  342  1e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3583  thioredoxin  47.59 
 
 
149 aa  137  7e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.029416  normal  0.0374075 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1995  thioredoxin  43.26 
 
 
144 aa  133  9.999999999999999e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2362  thioredoxin  43.26 
 
 
144 aa  133  9.999999999999999e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2645  thioredoxin  41.78 
 
 
150 aa  131  5e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.154957  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2134  thioredoxin  44.2 
 
 
139 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.408487  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2861  thioredoxin 2  41.43 
 
 
139 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.350907  normal  0.503198 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2759  thioredoxin 2  41.43 
 
 
139 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00143779  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2977  thioredoxin 2  41.43 
 
 
139 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0978039  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2843  thioredoxin 2  41.43 
 
 
139 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2865  thioredoxin 2  41.43 
 
 
139 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0216262  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1524  thioredoxin  40 
 
 
148 aa  124  6e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0659124 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3067  thioredoxin 2  41.13 
 
 
139 aa  124  8.000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00110629 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02476  thioredoxin 2  40.43 
 
 
139 aa  123  1e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.953967  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1086  thioredoxin  40.43 
 
 
139 aa  123  1e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0403998  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2954  thioredoxin 2  40.43 
 
 
139 aa  123  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0189312  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2869  thioredoxin 2  40.43 
 
 
139 aa  123  1e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.162737  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02440  hypothetical protein  40.43 
 
 
139 aa  123  1e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.934703  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2735  thioredoxin 2  40.43 
 
 
139 aa  123  1e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0139217  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3819  thioredoxin 2  40.43 
 
 
139 aa  123  1e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00147303  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2739  thioredoxin 2  40.43 
 
 
139 aa  123  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.025352  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1095  thioredoxin 2  40.43 
 
 
139 aa  123  1e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0753217  normal  0.13577 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0448  thioredoxin  38.78 
 
 
145 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.925505 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0377  thioredoxin  38.78 
 
 
145 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.655114  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3746  thioredoxin 2  40 
 
 
139 aa  121  5e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0426418  normal  0.35545 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3335  thioredoxin 2  41.73 
 
 
139 aa  121  5e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4107  thioredoxin  41.43 
 
 
141 aa  120  9.999999999999999e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000794835 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3491  thioredoxin 2  40.29 
 
 
139 aa  120  9.999999999999999e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05698  thioredoxin 2  38.12 
 
 
162 aa  119  3e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0452  thioredoxin 2  38.57 
 
 
140 aa  118  3.9999999999999996e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3204  thioredoxin 2  38.13 
 
 
145 aa  118  3.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3341  thioredoxin 2  38.13 
 
 
145 aa  118  3.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.142551  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2518  thioredoxin  45.52 
 
 
141 aa  118  3.9999999999999996e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3463  thioredoxin 2  38.13 
 
 
145 aa  118  3.9999999999999996e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.305081  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0854  thioredoxin 2  42.25 
 
 
141 aa  118  3.9999999999999996e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.615191  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0520  thioredoxin  38.19 
 
 
145 aa  118  4.9999999999999996e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.609436  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0504  thioredoxin  38.19 
 
 
145 aa  117  7e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0235096 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000083  thioredoxin 2  38.41 
 
 
144 aa  117  7.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.396729  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0410  thioredoxin  44.12 
 
 
141 aa  116  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3723  thioredoxin  38.03 
 
 
146 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.122043  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0928  thioredoxin  40.97 
 
 
147 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1430  thioredoxin  42.55 
 
 
140 aa  116  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000656365 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  50.49 
 
 
110 aa  115  3e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000000131883  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3596  thioredoxin  41.67 
 
 
150 aa  115  3e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.854397  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0335  thioredoxin domain-containing protein  37.67 
 
 
150 aa  114  6e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3312  thioredoxin  48.04 
 
 
109 aa  114  6e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124332  normal  0.074373 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2304  thioredoxin  39.86 
 
 
145 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.258464  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0867  thioredoxin  38.03 
 
 
140 aa  114  6.9999999999999995e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3508  thioredoxin  41.67 
 
 
150 aa  114  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3665  thioredoxin  41.67 
 
 
150 aa  114  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  50.5 
 
 
107 aa  113  1.0000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5905  thioredoxin  40.29 
 
 
144 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0810  thioredoxin  50.5 
 
 
107 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195011 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  50.5 
 
 
124 aa  112  2.0000000000000002e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3906  thioredoxin  35.62 
 
 
170 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0651  thioredoxin  38.89 
 
 
145 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3500  thioredoxin  51.04 
 
 
107 aa  112  2.0000000000000002e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4029  thioredoxin  35.62 
 
 
170 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45140  thioredoxin 2, TxrC  38.62 
 
 
144 aa  112  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4438  thioredoxin  39.57 
 
 
150 aa  112  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.102034  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  48.51 
 
 
107 aa  112  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  51.49 
 
 
107 aa  112  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4115  thioredoxin  48.51 
 
 
107 aa  112  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  49.5 
 
 
107 aa  112  3e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1908  thioredoxin  43.43 
 
 
106 aa  112  3e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00177252  normal  0.288463 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  55.68 
 
 
107 aa  111  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7798  thioredoxin  39.71 
 
 
146 aa  112  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.449565  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0428  thioredoxin  35.62 
 
 
170 aa  112  3e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0452  thioredoxin  36.43 
 
 
140 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.531645  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00610  thioredoxin  37.93 
 
 
150 aa  111  5e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0618  thioredoxin  38.89 
 
 
146 aa  111  5e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.300495 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  49.5 
 
 
107 aa  111  5e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3584  thioredoxin  43.69 
 
 
108 aa  111  5e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0328783  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  49.5 
 
 
107 aa  111  5e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2633  thioredoxin 2  35.42 
 
 
144 aa  111  5e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0747279  normal  0.647766 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3369  thioredoxin  38.51 
 
 
145 aa  111  6e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0887  thioredoxin 2  39.86 
 
 
141 aa  110  8.000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00834128  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2347  thioredoxin  40.14 
 
 
147 aa  110  8.000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0135047  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3416  thioredoxin  39.46 
 
 
146 aa  110  8.000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3573  thioredoxin  36.43 
 
 
140 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  49.5 
 
 
107 aa  110  8.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0888  thioredoxin  42.19 
 
 
141 aa  110  8.000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.747507  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0456  thioredoxin  36.43 
 
 
140 aa  110  9e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2067  thioredoxin  42.57 
 
 
107 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0053  thioredoxin  38.03 
 
 
146 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000803765  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0500  thioredoxin  39.57 
 
 
144 aa  110  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.874633 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0373  thioredoxin  50 
 
 
105 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2105  thioredoxin  49 
 
 
107 aa  109  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0422234  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11291  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  49 
 
 
148 aa  109  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.554772 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2021  thioredoxin  49 
 
 
107 aa  109  2.0000000000000002e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000945216  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3833  thioredoxin  34.93 
 
 
170 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0690  thioredoxin 2  38.85 
 
 
144 aa  109  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.555698  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0102  thioredoxin  37.06 
 
 
140 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3392  thioredoxin  34.25 
 
 
178 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0816  thioredoxin  49 
 
 
107 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1199  thioredoxin  44.9 
 
 
107 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0000534537  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2259  thioredoxin  38.03 
 
 
148 aa  109  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  48.51 
 
 
107 aa  109  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3283  thioredoxin  37.84 
 
 
147 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3451  thioredoxin  38.1 
 
 
147 aa  108  3e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.560369  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>